牛江婷 , 伊淑帥 , 胡桂學(xué) , 郭衍冰, 2 , 張 雙 , 郭夢茹 , 董國英
(1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院 , 吉林 長春 130118 ; 2.吉林省畜牧獸醫(yī)科學(xué)研究院 , 吉林 長春 130062 ;3.北京師范大學(xué) 全球變化與地球系統(tǒng)科學(xué)研究院 , 北京 海淀 100875)
豬流行性腹瀉(PED)是由豬流行性腹瀉病毒(PEDV)感染引起的一種以急性腹瀉、嘔吐、嚴(yán)重脫水為主要臨床癥狀的急性、高度傳染性、高致死性病毒性腸道傳染病。PEDV可感染各年齡段的豬,以哺乳仔豬最易感,經(jīng)口鼻感染后病毒直接進(jìn)入小腸,在腸絨毛上皮細(xì)胞增殖進(jìn)而對細(xì)胞器造成損傷,導(dǎo)致的細(xì)胞功能障礙引起腸黏膜細(xì)胞壞死、腸絨毛脫落,從而引起腹瀉,脫水,小腸臌氣、擴(kuò)張、積液等臨床癥狀,嚴(yán)重者可導(dǎo)致仔豬死亡[1]。自PEDV首次報(bào)道至今的近40年內(nèi),已經(jīng)給亞洲、歐洲等國家和地區(qū)的養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,是制約養(yǎng)豬業(yè)發(fā)展的重要病毒性傳染病之一。
2010年,PEDV變異毒株首次在我國出現(xiàn),并迅速在免疫豬群內(nèi)流行,造成了大規(guī)模的PED暴發(fā),至今仍未得到有效的控制[2]。2013年,美國首次暴發(fā)大規(guī)模的PEDV變異毒株流行并迅速傳播到美國各大洲,蔓延至加拿大、墨西哥等北美國家,造成約10%豬群的死亡,累計(jì)死亡仔豬超過700萬頭[3-4]。2014年初,韓國、臺灣、日本等亞洲國家與地區(qū)相繼暴發(fā)嚴(yán)重的PED疫情,經(jīng)毒株分離與基因序列分析證明與中國、美國流行的變異毒株同源性極高,同屬PEDV變異毒株[5]。截止2016年12月,PEDV變異毒株已經(jīng)席卷亞洲、歐洲、美洲的大部分國家與地區(qū),對世界養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。因此,了解PED的病原學(xué)、流行病學(xué)、流行現(xiàn)狀以及分子流行病學(xué)特點(diǎn),對該病的診斷與防治至關(guān)重要。本文綜合近年來的相關(guān)研究對PED流行病學(xué)進(jìn)行了簡要論述,并分析了2010年以來中國與其他國家PEDV變異毒株的分子流行病學(xué)特點(diǎn),以期為PED有效防控策略的制定提供理論依據(jù)。
PEDV屬于尼多病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒屬成員,與豬傳染性胃腸炎病毒、人類新發(fā)冠狀病毒NL63同屬于α-冠狀病毒。PED病毒粒子多呈球形,直徑約120~160 nm,有囊膜,囊膜表面有長約15~23 nm的花瓣樣纖突,呈放射狀分布[6]。PEDV為單股正鏈RNA病毒,基因組全長約28 kb,基因組結(jié)構(gòu)為5′UTR - ORF1a/1b - S - ORF3-E-M-N-3′poly(A)[1]。ORF1a/1b編碼的復(fù)制酶多糖蛋白在病毒感染早期與病毒復(fù)制過程中發(fā)揮作用;ORF3與PEDV細(xì)胞適應(yīng)性與病毒毒力有關(guān),可用于區(qū)分強(qiáng)弱毒株;S、M、E、N基因分別編碼結(jié)構(gòu)蛋白纖突糖蛋白、小包膜糖蛋白、膜糖蛋白與核衣殼蛋白,參與PEDV與宿主細(xì)胞的融合、病毒復(fù)制以及機(jī)體的免疫應(yīng)答,決定病毒性狀[1, 7]。其中,S與M蛋白是決定病毒侵襲與增殖的主要糖蛋白,也包含誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生中和抗體的主要抗原表位。此外,S與M基因也被廣泛應(yīng)用于PEDV的分子流行病學(xué)調(diào)查。
PEDV對有機(jī)溶劑的抵抗力較弱,乙醚、氯仿、甲醛等均可以使PEDV失去感染性;pH值<4的酸性消毒液與pH值>9的堿性消毒液處理也可使病毒滅活;但PEDV對溫度的抵抗力相對較強(qiáng),4 ℃~50 ℃環(huán)境中保存6 h,仍具有感染性[5]。
2.1 流行特征 PEDV感染全球分布廣泛,但并未形成大規(guī)模的流行,主要以散發(fā)或地方流行為主。流行病學(xué)調(diào)查顯示,PED的發(fā)生存在明顯的季節(jié)性,多發(fā)于寒冷的冬季與冬春交接月份,其他季節(jié)也可發(fā)病,但不會造成大規(guī)模的流行[5]。PEDV只感染豬,各年齡段的豬均可感染發(fā)病,其中以哺乳仔豬最為嚴(yán)重。歐美地區(qū)PEDV引起的腹瀉主要集中于架子豬、育肥豬與青年仔豬,發(fā)病率可達(dá)到20%,我國在內(nèi)的亞洲國家PEDV主要感染哺乳仔豬、斷奶仔豬與育肥豬,發(fā)病率達(dá)到100%,病死率約50%,部分地區(qū)與豬場病死率可達(dá)到90%以上[1,5-6]。
2.2 傳染源與傳播途徑 PEDV感染的發(fā)病豬、陰性帶毒豬以及臨床康復(fù)豬均可成為傳染源散播病毒。PEDV帶毒豬主要通過糞便排毒,也可通過口腔分泌物排出病毒。糞口傳播是PEDV的主要傳播途徑,糞便污染的飼料、飲水、器具以及飼養(yǎng)員的衣物、鞋、用具等都可以散播病毒,通過消化道感染后引起豬群發(fā)病。帶毒豬與健康豬的直接接觸也可以傳播病毒。此外,哺乳母豬乳汁PEDV病原學(xué)調(diào)查結(jié)果顯示帶毒豬乳汁中也攜帶有PEDV,并可以通過哺乳垂直傳播。PEDV是否可以通過呼吸道進(jìn)行傳播一直存在爭議,但PEDV帶毒豬可以通過口腔分泌物排毒,健康豬也可以通過口腔感染空氣環(huán)境中的PEDV“氣溶膠”而發(fā)病[8]。
2.3 發(fā)病機(jī)理 PEDV感染的首要條件是病毒粒子表面的纖突糖蛋白與細(xì)胞表面的特異性受體結(jié)合。豬氨基肽N(porcine aminopeptidase N,pAPN)是PEDV的跨膜受體,在仔豬小腸黏膜中表達(dá)量豐富,可達(dá)到腸細(xì)胞膜蛋白總量的8%以上,主要分布于仔豬空腸、回腸的刷狀緣[9]。PEDV經(jīng)口鼻感染后,直接進(jìn)入小腸,病毒表面的S蛋白受體結(jié)合域與pAPN特異性結(jié)合,進(jìn)入腸上皮細(xì)胞內(nèi),進(jìn)而在胞漿內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等細(xì)胞器內(nèi)膜上復(fù)制、組裝,最后在E蛋白與M蛋白的相互作用下促進(jìn)成熟的病毒粒子以出芽方式釋放到細(xì)胞外[10]。PEDV在增殖過程中造成細(xì)胞器的損傷,繼而出現(xiàn)細(xì)胞功能障礙,導(dǎo)致腸絨毛萎縮、吸收面積減少、小腸堿性磷酸酶含量顯著減少,從而引起營養(yǎng)物質(zhì)吸收障礙,導(dǎo)致仔豬腹瀉、脫水、死亡。此外,PEDV在疫苗免疫壓力與病毒進(jìn)化過程中形成了某些特定的機(jī)制來逃逸機(jī)體的抗病毒天然免疫,通過躲避、偽裝、攻擊等方式拮抗干擾素的產(chǎn)生,抑制宿主的抗病毒免疫應(yīng)答[11]。
世界范圍內(nèi)PEDV造成的流行主要可以分為5個階段,分別為英國、比利時小范圍流行(1977-1988年),歐洲與亞洲東部流行(1990-2000年),泰國PED暴發(fā)(2007-2008年),中國PEDV變異毒株流行(2010-2013年)與世界PEDV變異毒株流行(2013-2016年)。
PED于20世紀(jì)70年代初期在英國、比利時出現(xiàn)并造成小范圍流行,1978年首次從腹瀉仔豬體內(nèi)分離到該病病原,并命名為PEDV[12]。此后,朝鮮、韓國、日本、中國等國家與地區(qū)相繼分離到PEDV毒株,但并未形成大范圍的流行[1]。
1990-2000年,日本、韓國與中國等亞洲東部國家暴發(fā)PED,對當(dāng)?shù)仞B(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。1993年日本暴發(fā)的PED導(dǎo)致14 000只豬死亡,哺乳仔豬死亡率達(dá)到100%;韓國腹瀉仔豬病原學(xué)調(diào)查結(jié)果顯示,約56.3%的腹瀉豬群是由PEDV感染引起的,并造成10日齡仔豬的大量死亡;2001年,我國暴發(fā)PED,造成多個省份約50.4%的哺乳仔豬感染發(fā)病[5-6]。同時期,荷蘭、匈牙利、英格蘭等歐洲國家雖沒有出現(xiàn)PED的大規(guī)模流行,但病原學(xué)調(diào)查結(jié)果顯示,豬群中PEDV陽性率高達(dá)50%以上,分析發(fā)現(xiàn)病毒以一種特有的形式在豬群中持續(xù)傳播并不斷發(fā)生變異[5]。
2007年,泰國暴發(fā)PED,新生仔豬的死亡率高達(dá)100%,流行毒株基因的遺傳進(jìn)化分析證明,泰國流行毒株與2006年中國多地區(qū)流行毒株同源性達(dá)到96.5%~99.7%,提示一種新型PEDV在亞洲地區(qū)出現(xiàn),并威脅著養(yǎng)豬業(yè)發(fā)展[13]。
2010年,中國廣東、廣西、四川等南部省份先后暴發(fā)PED,在免疫豬群中造成了大規(guī)模流行,經(jīng)毒株分離與基因分析,證明新流行毒株為不同于以往經(jīng)典毒株的PEDV變異毒株[2]。2010-2013年,PEDV變異毒株逐漸向北散播,在我國29個省造成大范圍流行,發(fā)病率達(dá)到57.8%~92.7%,對我國豬養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。
2013年,美國23個州相繼發(fā)生PEDV變異毒株的流行,并蔓延至加拿大、墨西哥等北美國家;2014年,PEDV變異毒株在世界范圍內(nèi)大規(guī)模流行,導(dǎo)致德國、意大利、法國等歐洲國家與日本、朝鮮、韓國等亞洲國家哺乳仔豬與育肥豬的大面積死亡,對全球養(yǎng)豬業(yè)造成嚴(yán)重的威脅[1, 5, 14-15]。
S、M、ORF3基因以及PEDV全基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析常用于衡量不同地區(qū)與不同階段PEDV變異毒株的親緣關(guān)系。2001年以前,世界范圍內(nèi)流行的PEDV毒株主要以經(jīng)典毒株CV777及其親緣關(guān)系較近的毒株為主。2001-2010年,PEDV毒株的不斷變異形成各地區(qū)特有的流行毒株,如我國流行的JS-2004-2、LJB/03、JS2008毒株,泰國07NP01、08NP04、08RB04毒株,韓國BI1482、KNU-0802、MF3809毒株等[5-6, 16]。雖然各地區(qū)的流行毒株存在穩(wěn)定的遺傳變異并形成特有的基因型,但經(jīng)典毒株的相關(guān)疫苗仍可發(fā)揮充分的保護(hù)作用。S、M與ORF3基因遺傳進(jìn)化分析表明,2001-2010年,我國PEDV流行毒株與韓國毒株、泰國流行毒株具有較近的親緣關(guān)系,并與JS-2004-2毒株形成了一個單獨(dú)的分支,進(jìn)一步證明亞洲地區(qū)出現(xiàn)了新型PEDV流行毒株[5, 17]。2010年,PEDV變異毒株的再次大規(guī)模暴發(fā)致使疫苗株CV777免疫失敗,基因比對發(fā)現(xiàn)PEDV變異毒株相比經(jīng)典毒株,S基因出現(xiàn)了15個堿基的插入與6個堿基的缺失,并伴有大量點(diǎn)突變。其中S基因突變率最高,為6.1%,其次為E基因(4.0%),N基因突變率達(dá)到3.6%[18]。根據(jù)S基因高變區(qū)S1區(qū)的基因序列差異,將PEDV毒株劃分為兩個基因組:GⅠ與GⅡ。GⅠ基因組包括PEDV疫苗株CV777、DR13,2001-2010年亞洲流行毒株;GⅡ基因組主要是2010年以后世界范圍內(nèi)流行的PEDV變異毒株以及2001-2010年流行的部分毒株(JS-2004-2株等)。GⅡ基因組又分為兩個分支,我國2010-2013年流行的變異毒株HB-2012-1、GHGD-01毒株形成了GⅡa分支;2013-2016年我國流行的毒株CH/GD-22/2014、CH-SHC-12-2014、CH-JPYC-02-2015,美國Colordo毒株以及歐洲、韓國、日本流行的變異毒株形成了GⅡb分支[18-19]。進(jìn)一步的基因分析發(fā)現(xiàn),2010年出現(xiàn)的變異毒株與JS-2004-2、07NP01、08NP04、KNU-0802等亞洲流行毒株同源關(guān)系較近,存在相同的基因變異,進(jìn)一步說明PEDV變異毒株的出現(xiàn)并非偶然,而是經(jīng)過長期的不斷變異進(jìn)化而來的。此外,GⅡb分支的毒株與GⅡa、GⅠ均具有較高的同源性,可能為兩個基因組毒株發(fā)生基因重組的結(jié)果,提示PEDV變異毒株仍在發(fā)生基因變異與基因重組,可能形成新的毒株再次引起PED的暴發(fā)流行。
PEDV作為豬的一種急性、高度傳染性、高致死性病毒性傳染病病原,對世界養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的威脅。目前,2010年出現(xiàn)的PEDV變異毒株已得到了階段性的控制,但PEDV高頻的基因變異與基因重組仍會進(jìn)化出新的變異毒株造成再次流行或暴發(fā)。因此,進(jìn)行全面而廣泛的PEDV流行病學(xué)與病原學(xué)研究,對PEDV新型毒株的預(yù)警與PED綜合防控策略的制定至關(guān)重要。此外,與其他冠狀病毒相比,PEDV的研究相對比較落后,PEDV新型疫苗、反向遺傳操作、黏膜免疫機(jī)理、病毒變異機(jī)制以及抗PEDV藥物靶標(biāo)等方面都有待進(jìn)一步深入的研究。
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