國(guó)內(nèi)豬源牛病毒性腹瀉病原學(xué)調(diào)查匯總

2017-06-05 15:02徐國(guó)棟

中國(guó)動(dòng)物保健 2017年3期

關(guān)鍵詞：匯總病豬陽性率

徐國(guó)棟

（天津市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心天津300402）

國(guó)內(nèi)豬源牛病毒性腹瀉病原學(xué)調(diào)查匯總

徐國(guó)棟

（天津市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心天津300402）

筆者對(duì)中國(guó)知網(wǎng)中檢索到的國(guó)內(nèi)豬源牛病毒性腹瀉病原學(xué)調(diào)查進(jìn)行了匯總，結(jié)果發(fā)現(xiàn)：1996年-2016年6月期間的27篇文獻(xiàn)所載數(shù)據(jù)中，調(diào)查范圍涉及19個(gè)以上省份（主要有上海、江西、山東、浙江、湖南、河南等），調(diào)查者主要應(yīng)用核酸法或ELISA法檢測(cè)樣品，樣品主要有疑似豬瘟病豬組織、血清、臨床病豬組織、全血等共9類，樣品的總陽性率為15.58%（927/5949），在15個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)中，有兩個(gè)高峰期，第2個(gè)高峰（2006年-2012年內(nèi)的7個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)）內(nèi)所載數(shù)據(jù)占全部數(shù)據(jù)的權(quán)重較大，其篇次占全部篇次的75%（33/44），其樣品數(shù)和陽性樣品數(shù)分別占全部合計(jì)數(shù)的80.25%（4774/5949）和89.54%（830/927）。

豬；牛病毒性腹瀉病毒；病原學(xué)；調(diào)查

牛病毒性腹瀉病毒（Bovine viral diarrhea virus，BVDV）、豬瘟病毒（Classical swine fever virus,CSFV）和綿羊邊界病毒（Border disease virus,BDV）同屬于黃病毒科、瘟病毒屬，BVDV的宿主范圍包括了牛、羊、多種野生反芻動(dòng)物和豬，F(xiàn)emelius等于1973年首次從病原學(xué)上證實(shí)了BVDV對(duì)豬具有感染性以來，豬群中BVDV感染的現(xiàn)象受到更多的關(guān)注。在國(guó)內(nèi)，王新平等于1996年首次從內(nèi)蒙古自治區(qū)（哲盟）疑似CSF的病料中檢出BVDV，在病原學(xué)上證實(shí)了BVDV在國(guó)內(nèi)豬群中的存在。此后，不斷有關(guān)于在國(guó)內(nèi)豬群中檢出BVDV的報(bào)道，筆者為理清國(guó)內(nèi)豬群BVDV的感染狀況，對(duì)1996年以來豬群BVDV感染的病原學(xué)調(diào)查進(jìn)行了匯總，以期能為國(guó)內(nèi)豬群中該病防控提供可借鑒的數(shù)據(jù)。

1 匯總方法

1.1 檢索和遴選文獻(xiàn)的方法和條件

檢索中國(guó)知網(wǎng)中文數(shù)據(jù)庫（碩博、期刊、重要會(huì)議論文）中公開發(fā)表的國(guó)內(nèi)豬群BVDV感染狀況調(diào)查的文獻(xiàn)，主題是“豬＋牛病毒性腹瀉”，其后通過以下5個(gè)約束條件遴選得到目的文獻(xiàn)：文獻(xiàn)發(fā)表時(shí)間段為1996年-2016年6月；論文所載內(nèi)容詳實(shí)可信；③調(diào)查動(dòng)物是國(guó)內(nèi)豬群；④檢測(cè)方向是BVDV的病原學(xué)檢測(cè)；⑤對(duì)所載內(nèi)容重復(fù)、數(shù)據(jù)反復(fù)利用的個(gè)別文獻(xiàn)，酌情選取最初發(fā)表的或檢測(cè)數(shù)據(jù)較完整的文獻(xiàn)作為參考文獻(xiàn)。

1.2 文獻(xiàn)中原始數(shù)據(jù)的錄入方法

以樣品采集時(shí)間節(jié)點(diǎn)為序，依次錄入文獻(xiàn)中所載原始數(shù)據(jù)，包括：①采樣時(shí)間；②采樣地點(diǎn)（省、市、自治區(qū)）；③檢測(cè)方法；④樣品種類；⑤樣品陽性相關(guān)數(shù)據(jù)，包括檢測(cè)樣品份數(shù)、陽性份數(shù)；⑥調(diào)查者，即參考文獻(xiàn)中的第1調(diào)查者或調(diào)查者（調(diào)查者為碩博論文作者）。

1.2.1 采樣時(shí)間的錄入方法采樣時(shí)間的錄入以文獻(xiàn)所載調(diào)查者的采樣時(shí)間段（年）為準(zhǔn)，若數(shù)篇文獻(xiàn)為同年份采樣則不分先后順序錄入，但先期已被錄入的文獻(xiàn)在同一時(shí)間段中應(yīng)排列在前；若文獻(xiàn)未記載采樣時(shí)間則以文獻(xiàn)投稿日期為假定采樣時(shí)間，其次，若文獻(xiàn)未記載投稿日期則以文獻(xiàn)發(fā)表日期為假定采樣時(shí)間；若同篇文獻(xiàn)中同時(shí)記載了不同時(shí)間段的檢測(cè)結(jié)果，則分別錄入不同時(shí)間段及其相關(guān)數(shù)據(jù)；若某文獻(xiàn)所載采樣時(shí)間段為連續(xù)的時(shí)間段，不能按每年記錄時(shí)間段，則按連續(xù)時(shí)間段錄入，例如某調(diào)查者在2014年-2015年的時(shí)間段連續(xù)采樣，但檢測(cè)數(shù)據(jù)中不能區(qū)分2014年、2015年中每年份中的檢測(cè)結(jié)果，則以2014年-2015年為采樣時(shí)間錄入。

1.2.2 采樣地點(diǎn)的錄入方法以樣品采集時(shí)間為序，依次錄入文獻(xiàn)所載采樣地點(diǎn)。采樣地點(diǎn)錄入時(shí)以被采樣品豬群所在省份（或自治區(qū)、直轄市）為準(zhǔn)；若文獻(xiàn)中記載的采樣地點(diǎn)較模糊或未記載采樣地點(diǎn)則記為“不清”，其中記載源于全國(guó)范圍內(nèi)采集樣品但未明確具體省份的仍記為“不清”；若某個(gè)文獻(xiàn)所載的某個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)內(nèi)的樣品源于多個(gè)省份，不能在原始匯總表中全部錄入，則以代碼形式錄入。

1.2.3 樣品種類的錄入方法以采樣時(shí)間為序，依次錄入文獻(xiàn)所載采集樣品的種類，錄入時(shí)，依據(jù)所記載樣品的種類，分別按種類代碼形式錄入。

1.2.4 檢測(cè)方法的錄入方法以采樣時(shí)間為序，依次錄入文獻(xiàn)所載的檢測(cè)方法。

1.2.5 樣品數(shù)量、陽性樣品數(shù)量的錄入及陽性率的計(jì)算方法以采樣時(shí)間為序，依次錄入文獻(xiàn)所載的樣品采集數(shù)量、陽性樣品數(shù)，并按“陽性率＝陽性樣品數(shù)/樣品數(shù)×100%”計(jì)算陽性率（精確到0.01%）。

1.2.6 調(diào)查者的錄入方法以采樣時(shí)間為序，依次錄入每篇文獻(xiàn)的第1作者或作者，同時(shí)記錄文獻(xiàn)序號(hào)。

1.3 原始數(shù)據(jù)的匯總方法

1.3.1 采樣時(shí)間節(jié)點(diǎn)頻次的匯總方法以匯總的采樣時(shí)間段為原始數(shù)據(jù)，累計(jì)每個(gè)年份或每個(gè)連續(xù)時(shí)間段中樣品采集的頻次，即為該時(shí)間段的時(shí)間節(jié)點(diǎn)頻次。如2006年間有4次調(diào)查結(jié)果，則該時(shí)間節(jié)點(diǎn)內(nèi)的采樣頻次記為“4”，即為樣品采集的頻次，并按出現(xiàn)頻次高低在表格中降序排列。

1.3.2 采樣地點(diǎn)頻次的匯總方法以匯總的采樣省份為原始數(shù)據(jù)，依次對(duì)文獻(xiàn)中所載的采樣省份依次累加，若某篇文獻(xiàn)出現(xiàn)了某省份則累計(jì)頻次1次，最終得出采樣省份的頻次，并按出現(xiàn)頻次高低在表格中降序排列。

1.3.3 不同樣品種類采集頻次及其陽性率的匯總方法以匯總的樣品種類為原始數(shù)據(jù)，依次對(duì)文獻(xiàn)中所載樣品種類的采集頻次及其陽性率（精確到0.01%）進(jìn)行分類累加。累計(jì)樣品采集頻次時(shí)，若某篇文獻(xiàn)出現(xiàn)了某類樣品則累計(jì)頻次1次；計(jì)算某類樣品合計(jì)陽性率時(shí)，對(duì)調(diào)查文獻(xiàn)中所載的某類樣品的樣品數(shù)、陽性數(shù)進(jìn)行累加，并以此得出該類樣品的合計(jì)陽性率。累計(jì)頻次和陽性率分別在表格中降序排列。

1.3.4 檢測(cè)方法頻次的匯總方法以匯總的檢測(cè)方法為原始數(shù)據(jù)，依次對(duì)每篇文獻(xiàn)中所載檢測(cè)方法進(jìn)行分類累加，累計(jì)得出各種檢測(cè)方法的應(yīng)用頻次，并按出現(xiàn)頻次高低在表格中降排列，并以對(duì)不同檢測(cè)方法中樣品的檢出率進(jìn)行匯總（精確到0.01%）。

1.3.5 樣品陽性率的匯總方法以匯總的調(diào)查結(jié)果為原始數(shù)據(jù)，以每個(gè)年份或連續(xù)年份為時(shí)間節(jié)點(diǎn)，以累加的方法對(duì)“表1時(shí)間節(jié)點(diǎn)”的調(diào)查結(jié)果進(jìn)行匯總，包括樣品數(shù)、陽性樣品數(shù)、樣品陽性率（精確到0.01%）。

2 結(jié)果

2.1 BVDV病原學(xué)調(diào)查原始數(shù)據(jù)錄入結(jié)果

共有27篇文獻(xiàn)內(nèi)的數(shù)據(jù)作為原始數(shù)據(jù)被錄入，結(jié)果見表1，表中P、S代碼的意義見表后注釋。

2.2 BVDV病原學(xué)調(diào)查匯總結(jié)果

2.2.1 采樣時(shí)間節(jié)點(diǎn)匯總結(jié)果所有文獻(xiàn)的樣品采集時(shí)間匯總后共有15個(gè)節(jié)點(diǎn)，涉及44個(gè)篇次，其中2006年-2012年節(jié)點(diǎn)內(nèi)的篇次較集中，依時(shí)間節(jié)點(diǎn)排列的統(tǒng)計(jì)頻次見表2。

2.2.2 采樣地點(diǎn)匯總結(jié)果44篇次中有10篇次的具體取樣省份不清，其中朱紫祥等、張志等、祖立闖等[、李晶梅等的采樣地點(diǎn)未記載，其余均為全國(guó)范圍內(nèi)采集樣品；其它34篇次中共記載有19個(gè)省份，這些省份的合計(jì)取樣頻次為77，按頻次降序排列見表3。

2.2.3 不同樣品種類采集頻次及其率的匯總結(jié)果被調(diào)查的樣品代碼見“2.1”，合計(jì)取樣頻次為44，匯總后共分為9類，所有種類中以S1（疑似豬瘟病豬組織）、S2（血清）、S3（臨床病豬組織）和S6（全血）的采集頻次較高，按降序排列樣品種類出現(xiàn)頻次見表4。

所有種類樣品中，以S3（臨床病豬組織）、S4（樣品種類不清）、S2（血清）和S1（疑似豬瘟病豬組織）檢測(cè)結(jié)果陽性率較高，按降序排列的樣品陽性率與類別見表5。

2.2.4 檢測(cè)方法的匯總結(jié)果調(diào)查應(yīng)用的44頻次檢測(cè)方法主要有3種：①核酸法檢測(cè)BVDV遺傳物質(zhì)，共計(jì)4種31頻次；②ELISA法檢測(cè)BVDV抗原，共計(jì)10頻次；③檢測(cè)方法不清，共計(jì)3頻次。結(jié)果見表6。

應(yīng)用不同方法檢測(cè)樣品的結(jié)果有較大差異，其中以“方法不清”檢出的陽性率最高，核酸法檢出的陽性率最低，按降序排列的樣品陽性率與檢測(cè)方法見表7。

2.2.5 樣品陽性率匯總結(jié)果按逐年匯總時(shí)間節(jié)點(diǎn)后發(fā)現(xiàn)：15個(gè)節(jié)點(diǎn)中陽性率在0.6%～33.33%間，平均陽性率為15.58%（927/5 939），結(jié)果見表8。

依據(jù)表8數(shù)據(jù)繪制的陽性率趨勢(shì)圖中，可見2個(gè)陽性率高峰波：①1996年、2001年和2002年節(jié)點(diǎn)高峰波。共有3篇次記載的數(shù)據(jù)，占全部篇次6.8%（3/44）；樣品數(shù)合計(jì)77份，陽性樣品數(shù)22份，分別占樣品總數(shù)和陽性樣品總數(shù)1.3%（77/5 949）、2.4%（22/927）；此高峰波內(nèi)陽性率在20%～33.33%間，平均陽性率為28.57%（22/77）。②2006年-2012年節(jié)點(diǎn)高峰波。共有33篇次記載的數(shù)據(jù)，占全部篇次75%（33/44）；樣品數(shù)合計(jì)4 774份，陽性樣品數(shù)合計(jì)為830份，分別占樣品總數(shù)和陽性樣品總數(shù)的80.25%（4 774/5 949）、89.54%（830/927）；此高峰波內(nèi)陽性率在0～80.77%間，平均陽性率為17.39%（830/4 774）。此外，2012年后共有5個(gè)篇次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，占全部篇次的11.4%（5/44）；樣品數(shù)合計(jì)921份，陽性樣品數(shù)合計(jì)73份，分別占樣品總數(shù)和陽性樣品總數(shù)15.48%（921/5949）、7.88%（73/927）；3個(gè)節(jié)點(diǎn)中的陽性率在5.61%～10.04%間，平均陽性率為7.91%（73/921）。

3 結(jié)論

筆者對(duì)1996年-2016年6月間數(shù)據(jù)庫中的國(guó)內(nèi)豬源BVDV感染病原學(xué)調(diào)查文獻(xiàn)進(jìn)行遴選，結(jié)果發(fā)現(xiàn)可供利用文獻(xiàn)偏少（27篇）、樣品數(shù)偏少（5 949份）。對(duì)遴選的27篇文獻(xiàn)所載相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總后可以得出以下結(jié)論：

3.1 樣品來源廣泛

從表3可以得出：近20年來有源于19個(gè)以上省份的樣品被調(diào)查，主要有上海、江西、山東、浙江、湖南、河南等省，取樣范圍幾乎覆蓋全國(guó)。

3.2 樣品中以疑似豬瘟病豬組織和臨床病豬組織最受關(guān)注

從表4和表5可以得出：調(diào)查的9類樣中以疑似豬瘟病豬組織、血清、臨床病豬組織、全血4類為主（共計(jì)38頻次、5 200份）；9類樣品中陽性率較高的是臨床病豬組織、樣品種類不清、血清和疑似豬瘟組織，其中在某篇文獻(xiàn)中不能檢出陽性的有血清、種公豬精液、組織3類樣品。

3.3 檢測(cè)方法以核酸檢測(cè)法為主

從表6、表7可以得出：3類檢測(cè)方法中以核酸法或ELISA法為主，其中使用頻次最高的是核酸檢測(cè)法（16/44），而“方法不清”檢測(cè)出的陽性率最高（60.39%，218/361）。

3.4 樣品陽性率差別較大

從表1、表8可以得出：各文獻(xiàn)所載的陽性率在0～100%間不等；順序整理時(shí)間節(jié)點(diǎn)后的15個(gè)節(jié)點(diǎn)中陽性率在0.6%～33.33%間，全部樣品的平均陽性率為15.58%（927/5 949）。筆者認(rèn)為各文獻(xiàn)所載陽性率差別較大的原因可能與采樣時(shí)間、樣品種類、檢測(cè)方法的差異相關(guān)，例如在匯總檢測(cè)方法對(duì)陽性率的影響中，以“方法不清”和“ELISA法”對(duì)樣品的檢出率較高，而專一性和靈敏度較高的“核酸法”對(duì)其檢出率卻偏低，從理論上推測(cè)可能與BVDV、CSFV抗原具有較高交叉性所致假陽性相關(guān)。因每篇文獻(xiàn)中樣品采集時(shí)間和地點(diǎn)、檢測(cè)試劑和條件、樣品種類等數(shù)據(jù)均處于相對(duì)獨(dú)立的事件中，且本文對(duì)同篇文獻(xiàn)中的不同時(shí)間節(jié)點(diǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行了拆分，這都將影響陽性率所指示的現(xiàn)實(shí)意義，故筆者認(rèn)為應(yīng)用其它統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)“不同檢測(cè)方法對(duì)陽性率影響的差異性”進(jìn)行比較分析沒有更現(xiàn)實(shí)的意義，同理，應(yīng)用其它統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)“不同省份對(duì)陽性率影響的差異性”進(jìn)行比較分析也沒有更現(xiàn)實(shí)的意義。

3.5 BVDV的預(yù)測(cè)

趨勢(shì)圖中2006年-2012年節(jié)點(diǎn)高峰波的數(shù)據(jù)在全部匯總數(shù)據(jù)中較大，尚不能從趨勢(shì)圖中預(yù)測(cè)出2015年后國(guó)內(nèi)豬群BVDV的感染趨勢(shì)。從表8和圖1可以得出：在2006年-2012年節(jié)點(diǎn)高峰波中，時(shí)間數(shù)占節(jié)點(diǎn)數(shù)的40%（6/15）、樣品數(shù)占全部樣品數(shù)的80.25%（4 774/5 949）、陽性樣品數(shù)占全部陽性樣品數(shù)的89.54%（830/927），因此，該高峰波中的平均陽性率（17.39%，830/4 774）更接近于全部樣品的平均陽性率（15.58%，927/5 939），即該高峰波中的數(shù)據(jù)在總樣品數(shù)、總陽性樣品數(shù)和總陽性率中所占權(quán)重較大。而2012年后的數(shù)據(jù)較少（5篇次、3個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)、921份樣品、73份陽性樣品），尚不能從這3個(gè)節(jié)點(diǎn)中推知出2015年后的國(guó)內(nèi)豬群BVDV感染趨勢(shì)。

若能同時(shí)在全國(guó)范圍內(nèi)對(duì)豬源BVDV的豬場(chǎng)陽性率、樣品陽性率調(diào)查結(jié)果進(jìn)行匯總，將更真實(shí)地能反映出國(guó)內(nèi)豬群感染的狀況，但記載豬場(chǎng)陽性率的調(diào)查文獻(xiàn)較少，只有少量文獻(xiàn)記載了相關(guān)數(shù)據(jù)，如衛(wèi)秀余等的調(diào)查結(jié)果，故本文略去了豬場(chǎng)陽性的匯總分析。

（略）■

表1 B V D V病原學(xué)調(diào)查結(jié)果匯總表

注1采集樣品所在多個(gè)省份（Province）時(shí)的代碼：P1：吉林、內(nèi)蒙，等。P2：吉林、廣東，等；P3：浙江、安徽、湖南、江西、廣西、遼寧，等。P4：北京、河南、河北、新疆、山東、江西、浙江、安徽、湖南、廣西、福建、吉林、江蘇、上海，等。P5：江蘇、浙江、上海、安徽、江西、四川、河南、北京、山東、福建、河南、湖北，等。P6:包括河北、黑龍江、吉林、遼寧、山東、內(nèi)蒙古，江蘇等?。▍^(qū)、市）。P7：上海、浙江、江蘇、江西、山東、福建、廣西，等。P8：江蘇、江西、浙江，等。P9：河北、河南、山東，等。注2不同樣品種類（Sample）統(tǒng)一命名的代碼：S1：疑似豬瘟病豬組織；S2：血清；S3：臨床病豬組織；S4：樣品種類不清；S5：種公豬精液；S6：全血；S7：組織（病豬病豬組織或臨床健康豬組織不清）；S8：糞便；S9：臨床健康豬全血。