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泥蚶遺傳多樣性研究探討

2017-03-28 19:53姚紅偉石磊
河北漁業(yè) 2017年3期
關(guān)鍵詞:遺傳多樣性

姚紅偉 石磊

摘要:本文從形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記和分子標(biāo)記四個(gè)方面對(duì)泥蚶的遺傳多樣性研究進(jìn)展進(jìn)行了詳述。

關(guān)鍵詞:泥蚶;遺傳多樣性;遺傳標(biāo)記

泥蚶(Tegillarca granosa)俗稱血蚶,我國(guó)、韓國(guó)以及東南亞等國(guó)家地區(qū)都有分布,是一種肉質(zhì)鮮美且營(yíng)養(yǎng)豐富的經(jīng)濟(jì)貝類,屬軟體動(dòng)物門(Mollusca)、雙殼綱(Bivalvia)、翼形亞綱(Pterimorphia)、蚶目(Arcoida)、蚶科(Arcidae),雌雄異體,貝殼較厚,其貝殼的放射肋粗壯,肋上具明顯的結(jié)節(jié),如圖1所示。近年來隨著國(guó)內(nèi)外捕撈需求的提高和泥蚶養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大,為充分了解其遺傳背景,建立標(biāo)記輔助育種,有關(guān)泥蚶遺傳多樣性方面的研究也在不斷地進(jìn)行著。

圖1泥蚶的殼體特征

1泥蚶遺傳多樣性研究概況

在遺傳學(xué)的建立和發(fā)展過程中,遺傳標(biāo)記(Genetic markers)是研究生物遺傳多樣性的合適指標(biāo)。遺傳標(biāo)記是指與目標(biāo)性狀緊密連鎖,同該性狀共同分離且易于識(shí)別的可遺傳的等位基因變異[1]。遺傳標(biāo)記主要經(jīng)歷了形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記和分子標(biāo)記四個(gè)階段。因此,泥蚶的遺傳多樣性研究也經(jīng)歷了這四個(gè)階段。

1.1形態(tài)學(xué)標(biāo)記

形態(tài)學(xué)標(biāo)記(morphological markers)是與目標(biāo)性狀緊密連鎖,表型上可識(shí)別的等位基因突變體[2]。自然界生物存在著許多非常明顯的形態(tài)標(biāo)記。張永普[3]等人對(duì)4個(gè)地理種群泥蚶的形態(tài)差異進(jìn)行了研究,結(jié)果表明各形態(tài)性狀差異顯著,貝殼形狀是決定泥蚶不同地理種群的主要性狀,其次為咬合齒。蔣濤濤[4]等人對(duì)450個(gè)泥蚶成貝定量分析了殼形態(tài)性狀對(duì)活體重和軟體部重的影響。結(jié)果表明殼寬是影響活體重的主要因素,而殼高是影響軟體部重的主要因素。姚韓韓[5]等人利用形態(tài)學(xué)標(biāo)記研究了泥蚶奉化種群和韓國(guó)種群的殼形態(tài)差異,結(jié)果表明韓國(guó)種群的殼型比奉化種群更加鼓脹,軟體部含量更高。

1.2細(xì)胞學(xué)標(biāo)記

細(xì)胞學(xué)標(biāo)記(Cytological markers)是指對(duì)經(jīng)過處理的生物染色體數(shù)目和形態(tài)進(jìn)行分析,能明確顯示遺傳多樣性的細(xì)胞學(xué)特征[6]。吳洪喜[7]等人利用胚胎細(xì)胞做成的染色體制片,對(duì)樂清灣泥蚶染色體進(jìn)行了分析。結(jié)果表明樂清灣泥蚶核型為2N=38,32 m+6 sm,NF=76。鄭家聲[8]等人用鰓細(xì)胞空氣干燥法制片,對(duì)泥蚶、毛蚶、魁蚶的染色體組型進(jìn)行了分析研究。它們的染色體數(shù)目2N和總臂數(shù)NF都相同,但是染色體組型不同。陸榮茂[9]等人以毛蚶、泥蚶、橄欖蚶擔(dān)輪幼蟲為材料進(jìn)行染色體制備和核型分析,結(jié)果表明:3種蚶的二倍體染色體數(shù)目都為38,核型公式分別為20 m+12 sm+6 st、22 m+12 sm+4 st、18 m+18 sm+2 st、染色體臂數(shù)NF分別為70、72、74。聚類分析結(jié)果顯示橄欖蚶更接近于毛蚶。

1.3生化標(biāo)記

生化標(biāo)記(Biochemical markers)是指以生物體內(nèi)生化性狀為標(biāo)記,主要包括血型標(biāo)記、血清蛋白標(biāo)記和同工酶標(biāo)記等。目前,應(yīng)用較廣泛的生化標(biāo)記主要是同工酶標(biāo)記。喻子牛[10]等人采用水平淀粉凝膠電泳技術(shù)研究了榮成、青島、溫州三個(gè)泥蚶群體的等位基因酶遺傳變異。在12種等位基因酶中共檢測(cè)到了27個(gè)基因位點(diǎn),結(jié)果表明榮成與青島群體遺傳同一性大于與溫州群體的,三個(gè)群體在多個(gè)位點(diǎn)上都存在明顯的雜合子缺失現(xiàn)象。賈守菊[11]等人采用聚丙烯酰胺凝膠電泳方法對(duì)過氧化物酶(POD)、酯酶(EST)及淀粉酶(AMY)進(jìn)行研究,揭示了5個(gè)不同種群泥蚶同工酶的表達(dá)差異性。此外,王日昕[12]等人也對(duì)7個(gè)不同地理群體的泥蚶進(jìn)行過同工酶分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)檢測(cè)的11種同工酶中,除ATPase外其他10種存在差異,特別是汕頭和湛江兩地理群體與其他5個(gè)地理群體之間的差異尤其顯著。

1.4分子標(biāo)記

分子遺傳標(biāo)記(molecular markers)是根據(jù)基因組DNA存在豐富的多態(tài)性而發(fā)展起來的可直接反映生物個(gè)體在DNA水平上的差異的一類新型的遺傳標(biāo)記[13]。目前,(一)在隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(即RAPD)分子標(biāo)記方面:李太武[14]等人對(duì)5個(gè)泥蚶群體的遺傳多樣性進(jìn)行了研究,結(jié)果表明5個(gè)群體遺傳分化不明顯,其余4個(gè)群體的多態(tài)位點(diǎn)比例和遺傳平均雜合度比韓國(guó)群體有所降低。此外,李成華[15]和徐義平[16]等人也分別利用RAPD技術(shù)分析了不同地理泥蚶群體的遺傳多樣性。(二)在限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(即RFLP)分子標(biāo)記方面:戴偉[17]等人對(duì)3個(gè)泥蚶地理群體的核糖體DNA ITS區(qū)進(jìn)行分析,從分子水平探討了三者的遺傳多樣性及親緣關(guān)系。此外,郭永軍[18]等人對(duì)毛蚶、魁蚶和泥蚶核糖體DNA轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)進(jìn)行RFLP分析時(shí)未發(fā)現(xiàn)毛蚶和魁蚶間特異性RFLP標(biāo)記,但6種限制性內(nèi)切酶均能將泥蚶與毛蚶及魁蚶區(qū)別開來。(三)在微衛(wèi)星標(biāo)記方面:顧曉英[19]等人應(yīng)用6個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在奉化泥蚶種群上進(jìn)行擴(kuò)增,以檢測(cè)其遺傳信息。田野[20]等人采用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)人工選育的泥蚶群體進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明連續(xù)的人工選育過程,群體的遺傳多樣性仍然比較高,但選育過程對(duì)群體的遺傳多樣性和遺傳分化有一定程度的影響。此外,程雪艷[21]等人運(yùn)用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記,對(duì)5個(gè)不同泥蚶地理群體分析發(fā)現(xiàn)其呈現(xiàn)出較低的遺傳分化。(四)在擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(即AFLP)分子標(biāo)記方面:姚韓韓[22]等人利用AFLP分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)泥蚶4個(gè)快速生長(zhǎng)家系的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳差異進(jìn)行了分析,預(yù)測(cè)能夠繁育出生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)子代的最佳親本組合,減少近交機(jī)率。劉博[23]等人采用AFLP標(biāo)記技術(shù)結(jié)合“擬測(cè)交”策略,對(duì)泥蚶父、母本和109個(gè)F1全同胞個(gè)體進(jìn)行了遺傳連鎖的分析研究,構(gòu)建了泥蚶的遺傳連鎖圖譜。此外,董迎輝[24]等人利用AFLP標(biāo)記技術(shù)研究了快速生長(zhǎng)品系的遺傳結(jié)構(gòu)并篩查出生長(zhǎng)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記。(五)在以特定序列為核心的分子標(biāo)記技術(shù)方面:鄭文娟[25]等人采用PCR技術(shù)對(duì)我國(guó)沿海地區(qū)7個(gè)泥蚶群體的線粒體COI基因部分序列進(jìn)行了測(cè)定和遺傳分析。結(jié)果表明我國(guó)沿海泥蚶已分化形成福建以南和以北二大類群,二大類群之間的遺傳分化已達(dá)到亞種水平。劉春芳[26]等人以7個(gè)地理群體泥蚶材料,獲取592 bp線粒體COI基因片段序列進(jìn)行遺傳多樣性及分化分析,結(jié)果顯示中國(guó)沿海泥蚶遺傳多樣性和群體內(nèi)遺傳分化系數(shù)由北向南呈升高趨勢(shì)。

2展望

遺傳多樣性與一個(gè)物種的進(jìn)化潛在能力和抵御不利生存環(huán)境的能力緊密相連,如果一個(gè)種群或個(gè)體沒有遺傳多樣性,那么就失去了突變、選擇,失去了進(jìn)化的可能,也就無法適應(yīng)周圍環(huán)境的變化,最終會(huì)被大自然淘汰。目前隨著人類的捕撈和養(yǎng)殖活動(dòng)以及海域環(huán)境的急劇變化,泥蚶雖然在自然或人為因素下,基因流不斷進(jìn)行著,但是長(zhǎng)期的人工育苗和自繁自育,加劇了近交繁殖,使得泥蚶肥滿程度、生長(zhǎng)速度的快慢以及繁殖力的大小等重要指標(biāo)出現(xiàn)下降。另外,盲目的引種和選種,不僅解決不了苗種問題,還有可能進(jìn)步一降低野生群體的遺傳多樣性,卻得不到能穩(wěn)定遺傳的經(jīng)濟(jì)性狀優(yōu)良的后代,可以看出上述問題使得養(yǎng)殖群體以及個(gè)別野生群體不可避免地出現(xiàn)一定程度遺傳多樣性的衰退,泥蚶種質(zhì)資源受到威脅。為防止這種情況的進(jìn)步一蔓延以及更好地實(shí)現(xiàn)對(duì)新發(fā)現(xiàn)種群的開發(fā)利用,就離不開對(duì)泥蚶遺傳多樣性的研究發(fā)展,因此泥蚶遺傳多樣性的研究步伐不會(huì)停滯。作為研究遺傳多樣性指標(biāo)的遺傳標(biāo)記已經(jīng)經(jīng)歷了從簡(jiǎn)單到復(fù)雜、從宏觀到微觀、從定性到定量的發(fā)展過程,即便現(xiàn)在的分子標(biāo)記也沒有一種能完全滿足各類實(shí)驗(yàn)要求的理想標(biāo)記。隨著物種多樣性的發(fā)展和發(fā)掘、科技的進(jìn)步以及人類探索自然步伐的加快,生物遺傳多樣性的研究需求和必要性必將進(jìn)一步加大,這就會(huì)極大地促使人類去探究更快、更精確、更便利的遺傳標(biāo)記用于遺傳多樣性的研究以造福人類。未來,這些新型遺傳標(biāo)記不僅是了解不同泥蚶種群遺傳背景的有力技術(shù)支持,而且會(huì)帶來更大的經(jīng)濟(jì)、科研等方面的價(jià)值,促使泥蚶增養(yǎng)殖和捕撈可持續(xù)健康發(fā)展。

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(收稿日期:2016-10-28)

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