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植物模式標(biāo)本的考證與數(shù)字化:以中國(guó)國(guó)家植物標(biāo)本館為例

2017-03-07 00:12:25林祁楊志榮包伯堅(jiān)林云張小冰班勤秘樹(shù)青曹子余陳淑榮陳雅麗杜青杜玉芬傅連中高玳何東東何珊珊敬璇李安仁李紅麗李敏李倩云劉文群馬欣堂石青春宋莉孫苗孫茜王明瓊王忠濤吳慧冰吳佳麗吳婷婷云映霞趙慧娟
關(guān)鍵詞:名稱合格標(biāo)簽

林祁,楊志榮*,包伯堅(jiān),林云,張小冰,班勤,秘樹(shù)青,曹子余,陳淑榮,陳雅麗,杜青,杜玉芬,傅連中,高玳,何東東,何珊珊,敬璇,李安仁,李紅麗,李敏,李倩云,劉文群,馬欣堂,石青春,宋莉,孫苗,孫茜,王明瓊,王忠濤,吳慧冰,吳佳麗,吳婷婷,云映霞,趙慧娟

1. 中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館,北京 100093 2. 湖南省醫(yī)藥技工學(xué)校,湖南食品藥品職業(yè)學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410014 3. 太原師范學(xué)院生物系,山西 太原 030031 4. 河北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河北 石家莊 050024 5. 海淀區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,北京 100080

引言

植物分類學(xué)是研究植物物種多樣性的科學(xué),命名物種是植物分類學(xué)的重要工作之一,與植物名稱 (學(xué)名) 關(guān)系最密切的是模式標(biāo)本。模式標(biāo)本是最重要的植物標(biāo)本,是確定植物學(xué)名的依據(jù),對(duì)名稱的穩(wěn)定意義重大,在植物分類學(xué)研究中有著不可替代的價(jià)值,是植物分類學(xué)家從事植物系統(tǒng)分類研究必不可少的科學(xué)材料,也是開(kāi)展??茖傺芯俊⒕帉?xiě)國(guó)家或地方植物志、進(jìn)行植物區(qū)系調(diào)查研究、開(kāi)發(fā)利用和保護(hù)植物資源的重要基本資料。但模式標(biāo)本的人為和自然毀損難以避免,模式標(biāo)本及其標(biāo)簽信息的數(shù)字化使得模式標(biāo)本的形態(tài)、地理分布、采集等主要信息得到最大限度的永久保存,可以極大地方便模式標(biāo)本信息的共享,可以為科學(xué)研究人員或相關(guān)人員提供植物形態(tài)、地理分布、歷史變遷等多方面的信息。

當(dāng)代計(jì)算機(jī)技術(shù)及網(wǎng)絡(luò)信息技術(shù)的快速發(fā)展使標(biāo)本館標(biāo)本 (含模式) 的信息化及共享化成為可能。從覆蓋國(guó)家和地區(qū)甚至全球性的生物標(biāo)本基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得可信的、新穎的、有效的信息,以能被人們理解和感受的形式表現(xiàn)出來(lái),并使這些原始材料和數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)資源信息共享,已經(jīng)成為國(guó)際上的發(fā)展趨勢(shì)。自20世紀(jì)七、八十年代起,歐美發(fā)達(dá)國(guó)家就開(kāi)始植物標(biāo)本(含模式標(biāo)本) 圖像及資料的電子化、信息化建設(shè),實(shí)現(xiàn)標(biāo)本數(shù)據(jù)記錄、存儲(chǔ)及傳輸和共享的電子化及網(wǎng)絡(luò)化。目前,數(shù)字植物標(biāo)本館建設(shè)已經(jīng)成為大多數(shù)標(biāo)本館日常工作不可或缺的部分。其中比較成功的例子包括美國(guó)哈佛大學(xué)標(biāo)本館 (包括 A,GH,F(xiàn)H),它在 20世紀(jì) 90 年代就實(shí)現(xiàn)館藏模式標(biāo)本及其重要參考文獻(xiàn)的數(shù)字化及網(wǎng)絡(luò)化共享,目前該館已完成 10 萬(wàn)份模式標(biāo)本的數(shù)字化工作?!鞍拇罄麃啍?shù)字植物標(biāo)本館”(AVH) 則是全球首個(gè)實(shí)現(xiàn)全國(guó)性標(biāo)本 (含模式) 數(shù)字化共享的生物多樣性大國(guó),它使用統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)軟件對(duì)全澳十余家主要標(biāo)本館的數(shù)百萬(wàn)份標(biāo)本實(shí)施數(shù)字化,并通過(guò)網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)標(biāo)本信息與環(huán)境信息的關(guān)聯(lián)及共享。法國(guó)巴黎國(guó)家自然歷史博物館 (P) 是全球最大的標(biāo)本館,館藏標(biāo)本超過(guò) 888 萬(wàn)份,該館完成了 20 萬(wàn)份模式標(biāo)本的數(shù)字化,但一些模式標(biāo)本的數(shù)字化內(nèi)容中缺少原始文獻(xiàn)信息。

進(jìn)入本世紀(jì)以來(lái),在國(guó)家科技部的支助下,在國(guó)家標(biāo)本資源共享平臺(tái)的直接領(lǐng)導(dǎo)下,我國(guó)有80余個(gè)科研教學(xué)單位的標(biāo)本館 (室) 開(kāi)展了模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)工作,對(duì)本館 (室) 收藏的模式標(biāo)本進(jìn)行掃描或高像素?cái)?shù)碼照相,對(duì)采集信息和命名鑒定信息進(jìn)行文字錄入,制成具有植物標(biāo)本構(gòu)成和標(biāo)本標(biāo)簽數(shù)據(jù)的信息集成數(shù)據(jù)庫(kù)。據(jù)有關(guān)資料 (Chiou et al. 2000; Li et al. 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2010; 曹偉, 2011; 方鼎, 2012; 楊永, 2012) 和筆者咨詢統(tǒng)計(jì),我國(guó)主要館藏的維管束植物模式標(biāo)本數(shù)量排名依次是中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館 (PE;22,000 份)、中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所標(biāo)本館 (KUN;12,000 份)、中國(guó)科學(xué)院華南植物園標(biāo)本館 (IBSC;7,000 份)、江蘇省中國(guó)科學(xué)院植物研究所 (中山植物園) 標(biāo)本館 (NAS;5,000)、廣西植物研究所標(biāo)本館 (IBK;4,000)、四川大學(xué)植物標(biāo)本館 (SZ;1,000)、臺(tái)灣大學(xué)植物學(xué)系標(biāo)本館 (TAI;1,000)、臺(tái)灣省林業(yè)試驗(yàn)研究所植物標(biāo)本館 (TAIF;810 份)、貴州科學(xué)院生物研究所植物標(biāo)本館 (HGAS;500 份)、江西省中國(guó)科學(xué)院廬山植物園標(biāo)本館 (LBG;472 份)、中國(guó)科學(xué)院沈陽(yáng)應(yīng)用生態(tài)所東北生物標(biāo)本館 (IFP;414 份)、廣西中醫(yī)藥研究院植物標(biāo)本館 (GXMI;357 份)、西北農(nóng)林科技大學(xué)植物標(biāo)本館 (WUK;300 份)、香港植物標(biāo)本室 (HK;278 份)、中國(guó)科學(xué)院武漢植物園標(biāo)本館 (HIB;200 份)、中國(guó)科學(xué)院新疆生物土壤沙漠研究所植物標(biāo)本館 (XJBI;93份) 等,其中 PE、TAIF、IFP、GXMI 等少數(shù)標(biāo)本館對(duì)本館模式標(biāo)本統(tǒng)計(jì)時(shí),將原始文獻(xiàn)的信息也集成至數(shù)據(jù)庫(kù)中。由于核對(duì)了原始文獻(xiàn),使得標(biāo)本的模式類型有據(jù)可查,其模式標(biāo)本數(shù)量數(shù)據(jù)可信。

在 2017 年 2 月 23-24 日召開(kāi)的“第一屆國(guó)家標(biāo)本資源共享平臺(tái)建設(shè)研究會(huì)”期間,筆者咨詢了國(guó)內(nèi)一些標(biāo)本館模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)情況,得知大部分標(biāo)本館 (室) 只是根據(jù)標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽的信息而做模式標(biāo)本數(shù)字化工作,并沒(méi)有核對(duì)原始文獻(xiàn)以確認(rèn)所錄入的標(biāo)本為模式。這樣,有可能出現(xiàn)將一些沒(méi)有有效合格發(fā)表名稱的標(biāo)本當(dāng)作模式標(biāo)本做了數(shù)字化輸錄。以 PE 標(biāo)本館蕨類植物標(biāo)本為例,為了管理好蕨類植物模式標(biāo)本,標(biāo)本管理人員專門將貼有模式標(biāo)簽、或蓋有模式章、或?qū)懹行路诸惾好Q標(biāo)簽的標(biāo)本當(dāng)作模式標(biāo)本抽提出來(lái),制作紅色模式標(biāo)本夾,并用專柜單獨(dú)存放,共有 7 柜。但是,筆者根據(jù)原始文獻(xiàn),依據(jù)《國(guó)際藻類、菌物、植物命名法規(guī)》 (McNeill et al.,2012) (以下簡(jiǎn)稱《法規(guī)》) 的相關(guān)原則進(jìn)行系統(tǒng)的整理、核對(duì)、考訂等后,確認(rèn) PE 蕨類植物模式標(biāo)本不到 4 柜,原 7 柜標(biāo)本中有幾乎近一半不是模式標(biāo)本。例如,在《中國(guó)蕨類植物孢子形態(tài)》 (張玉龍等, 1976)一書(shū)中,不合格發(fā)表了 200 余個(gè)蕨類植物新分類群。經(jīng)后人研究,其中絕大部分新植物不成立,也沒(méi)人再將它們合格發(fā)表,但這些標(biāo)本卻被蓋上模式章而置于模式柜中了。

筆者從 2005 起,一直在做 PE 模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)工作,在工作中遇到一系列問(wèn)題與國(guó)內(nèi)外標(biāo)本館在做模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中存在一些共性,歸納起來(lái)主要有以下 8 點(diǎn):

(1) 有些標(biāo)本曾被某些學(xué)者在臺(tái)紙上貼有命名標(biāo)簽,給予了新分類群 (新種、新亞種、新變種、新變型等) 的名字 (designation),但這些名字一直未被正式發(fā)表,不屬于模式標(biāo)本。

(2) 部分標(biāo)本雖然貼有原作者的命名標(biāo)簽,但在該學(xué)名正式發(fā)表時(shí),原始文獻(xiàn)中并未引證這份標(biāo)本,不屬于模式標(biāo)本。

(3) 部分標(biāo)本是根據(jù)原始文獻(xiàn)信息,以后在原產(chǎn)地所采的產(chǎn)地模式 (topotype),根據(jù)《法規(guī)》的規(guī)定,不屬于模式標(biāo)本范疇。

(4) 有些標(biāo)本雖然被某些學(xué)者在臺(tái)紙上貼有命名標(biāo)簽,給予了新分類群的名字,但這些名字為不合格發(fā)表,仍不屬于模式標(biāo)本,需要做進(jìn)一步的工作。

(5) 有的標(biāo)本雖然標(biāo)注為模式標(biāo)本,但沒(méi)注明是何種模式類型,如:主模式 holotype、等模式isotype、副模式 paratype、合模式 syntype、后選模式lectotype、新模式 neotype、附加模式 epitype 等等。

(6) 有的新分類群的名稱 (name) 列舉了 2 個(gè)或 2個(gè)以上采集號(hào)的標(biāo)本,但未指定主模式,或同時(shí)指定 2 個(gè)或 2 個(gè)以上采集號(hào)的標(biāo)本為模式。對(duì)這類標(biāo)本需做進(jìn)一步的工作,如后選模式指定,或合格發(fā)表等等。

(7) 有的臺(tái)紙上命名標(biāo)簽上的名字與合格發(fā)表名稱不一致,對(duì)這類標(biāo)本要給予標(biāo)注說(shuō)明。

(8) 有些原始文獻(xiàn)中排印的采集信息 (采集人、采集號(hào)、采集時(shí)間、采集地點(diǎn)等) 與野外采集記錄簽上所記錄的采集信息不符,需進(jìn)一步核查后進(jìn)行更正。

鑒于這些共性問(wèn)題,既為了促進(jìn)標(biāo)本館管理的數(shù)字化進(jìn)程,又為了保證其數(shù)據(jù)的科學(xué)性,本文擬以 PE 維管束植物模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)為例,介紹規(guī)范化整理模式標(biāo)本的方法、模式標(biāo)本數(shù)字化的操作流程,并通過(guò)實(shí)例介紹模式標(biāo)本考訂的過(guò)程、常見(jiàn)問(wèn)題的處理方法等,以期為其他單位開(kāi)展模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)提供經(jīng)驗(yàn)。

1 材料、設(shè)備與方法

模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)所依據(jù)的材料是現(xiàn)行《法規(guī)》中所確認(rèn)的、各種類型的維管束植物模式標(biāo)本,包含以下類型 (不論該名稱是接受名還是異名) :

(1) 主模式 (holotype) 是名稱作者使用過(guò)的或指定為命名模式的那份標(biāo)本或插圖。

(2) 等模式 (isotype) 是主模式的復(fù)份標(biāo)本。

(3) 合模式 (syntype) 是當(dāng)沒(méi)有指定主模式時(shí)原始資料中所引證的任何一份標(biāo)本,或是兩份或兩份以上的標(biāo)本同時(shí)被指定為模式時(shí)其中的任何一份標(biāo)本。

(4) 副模式 (paratype) 是指原始文獻(xiàn)中所引證的標(biāo)本,但它既不是主模式,也不是等模式,還不是兩份或兩份以上的標(biāo)本同時(shí)被指定為模式時(shí)的合模式之一。

(5) 后選模式 (lectotype) 是當(dāng)名稱發(fā)表時(shí)沒(méi)有指明主模式或主模式失蹤或主模式包含一個(gè)以上分類群時(shí),從原始材料中指定的作為命名模式的標(biāo)本或插圖。

(6) 新模式 (neotype) 是指當(dāng)原始材料均不復(fù)存在或失蹤時(shí)被選作命名模式的一份標(biāo)本或插圖。

(7) 附加模式 (epitype) 是指當(dāng)主模式、后選模式、先前指定的新模式、所有與合格發(fā)表名稱有關(guān)的原始材料均不明確而不能為了分類群名稱的精確應(yīng)用而被嚴(yán)格的鑒定時(shí),用來(lái)作為解釋性模式的一份標(biāo)本或插圖。

根據(jù)以上定義,還可引伸出其它類型,如:等合模式 (isosyntype) 是指合模式的復(fù)份標(biāo)本,等副模式 (isoparatype) 是指副模式的復(fù)份標(biāo)本,等后選模式 (isolectotype) 是指后選模式的復(fù)份標(biāo)本,等新模式 (isoneotype) 是指新模式的復(fù)份標(biāo)本,等附加模式(isoepitype) 是指附加模式的復(fù)份標(biāo)本。

其它,如產(chǎn)地模式 (topotype) 是指從該植物的模式標(biāo)本產(chǎn)地采集到的相同植物的標(biāo)本,它在現(xiàn)行《法規(guī)》 (McNeill et al. 2012) 中已不再屬于模式范疇。

在模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中,所需設(shè)備包括用于數(shù)據(jù)輸錄的普通臺(tái)式計(jì)算機(jī);用于掃描原始文獻(xiàn)的普通掃描儀 (能掃描 B5、A4 紙);用于掃描模式標(biāo)本的較大型掃描儀 (能掃描 A3 紙,如 Epson Expression 10000 XL 型彩色圖像掃描儀),但需要將掃描儀改裝成倒置,將掃描儀鏡面朝下,并固定。將標(biāo)本置于掃描平臺(tái)上,標(biāo)本面朝上,并配有標(biāo)本支架,使標(biāo)本能上下升降 (圖 1),從而起到保護(hù)標(biāo)本不掉花、掉果、掉葉或掉渣的作用;用于粗枝、大果模式標(biāo)本拍照的照相機(jī)和翻拍架 (圖 2),以及 PE 標(biāo)本館條形碼、色卡比例尺等。

PE 采用中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館設(shè)計(jì)的軟件界面,數(shù)據(jù)庫(kù)所用軟件為 SQL-Server,計(jì)算機(jī)語(yǔ)言為 VB.Net。為了得到清晰的圖像,通常將模式標(biāo)本圖片掃描的分辨率調(diào)為 400,圖片保存格式為 JPG,命名格式為條形碼。

PE 模式標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù)的標(biāo)本數(shù)據(jù)包括:標(biāo)本館代碼、標(biāo)本館條形碼號(hào)、標(biāo)本館號(hào) (流水號(hào))、模式類型、標(biāo)本狀態(tài)、采集人/隊(duì)、采集號(hào)、采集日期、國(guó)家名稱、省市名稱、區(qū)縣名稱、地名 (縣以下小地名或山名)、海拔、地形、生境、分布、經(jīng)度、緯度、習(xí)性、體高、胸徑、莖、葉、花、果實(shí)、種子、用途、附記、中文名稱、科名、屬名、種加詞、亞種加詞、變種加詞、變型加詞、命名人、命名日期、錄入員、錄入日期、校對(duì)人、標(biāo)本掃描照片、原始文獻(xiàn) (子窗口)、歷史模式 (子窗口)、備注等字段。

圖1 輸錄掃描設(shè)備Fig. 1 Transmission scanning equipment

圖2 照相設(shè)備Fig. 2 Photographic equipment

若有的標(biāo)本模式類型發(fā)生了改變,則原模式類型錄在歷史模式 (子窗口) 中,原始文獻(xiàn)錄在原始文獻(xiàn) (子窗口) 中。如將合模式選為后選模式后,合模式錄在歷史模式 (子窗口) 中,合模式的原始文獻(xiàn)錄在原始文獻(xiàn) (子窗口) 中。

原始文獻(xiàn) (子窗口) 采用雙語(yǔ)輸錄,主要字段包括作者、論文題目、刊名/書(shū)名/文集名、版本、編者、出版地、出版社、發(fā)表年份/出版年份、卷 (期)、分類群頁(yè)碼、論文頁(yè)碼、圖版或插圖頁(yè)碼、文獻(xiàn)掃描照片等。

建設(shè)流程有 15 個(gè)步驟,如圖 3 所示。

2 操作方法

2.1 模式標(biāo)本考訂方法

首先對(duì)植物標(biāo)本進(jìn)行模式考訂,確認(rèn)它屬于哪一模式類型,然后將此模式的標(biāo)本信息和原始文獻(xiàn)信息全部錄入數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)系統(tǒng),并將模式標(biāo)本圖像掃描上傳入數(shù)據(jù)庫(kù),以便于讀者查閱及研究。具體方法如下:

圖3 建設(shè)流程Fig. 3 The construction process

(1) 模式柜中的標(biāo)本基本上都貼有新植物命名標(biāo)簽或類似的標(biāo)識(shí),其中一些是有效合格發(fā)表的名稱(name),一些是不合格發(fā)表的名字 (invalid name),還有相當(dāng)多的是前人僅給了新名字而沒(méi)將它們發(fā)表。首先,對(duì)模式柜中標(biāo)本上的新名稱和名字進(jìn)行名錄錄入。

(2) 根據(jù)錄入名錄上的名稱或名字,通過(guò)查閱《中國(guó)植物志》、《中國(guó)高等植物模式標(biāo)本匯編》、《Flora of China》等文獻(xiàn),以及由英國(guó)邱園 (Royal Botanic Gardens, Kew)、美國(guó)哈佛大學(xué)標(biāo)本館 (Harvard University Herbaria) (Gray Herbarium Index) 和澳大利亞國(guó)家標(biāo)本館 (the Australian National Herbarium(APNI) 聯(lián)合創(chuàng)建的IPNI檢索系統(tǒng) (Http://www.ipni.org/) 和美國(guó)密蘇里植物園 (Missouri Botanical Garden)創(chuàng)建的 Http://www.tropicos.org/ 檢索系統(tǒng),查找其名稱的原始文獻(xiàn)出處,或確定其為不合格發(fā)表的名字,或確定其僅為前人給出的新名字。

(3) 在中國(guó)科學(xué)院植物研究所書(shū)目數(shù)據(jù)檢索系統(tǒng)(http://192.168.70.65/nweb/default.aspx.) 查詢并記錄原始文獻(xiàn)的索書(shū)號(hào),通過(guò)索書(shū)號(hào)在中國(guó)科學(xué)院植物研究所圖書(shū)館中查找、借閱相關(guān)原始文獻(xiàn),或利用國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行原始文獻(xiàn)查找,其中重要的專業(yè)網(wǎng)站有 http://www.sciencedirect.com/、http://onlinelibrary.wiley.com/、http://link.springer.com/、 http://www.jstor.org/、http://www.tandfonline.com/、https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 等。

(4) 復(fù)印借閱到的原始文獻(xiàn) (包括名稱所在頁(yè)碼、描述此植物的相關(guān)內(nèi)容及其圖版或插圖、論文首頁(yè)或書(shū)刊首頁(yè),等等),并在論文首頁(yè)標(biāo)注論文起始頁(yè)碼。

(5) 對(duì)于不便于外借的圖書(shū)文獻(xiàn),則對(duì)它們進(jìn)行翻拍照相。經(jīng)修圖后,打印留存紙質(zhì)件和上傳電子版圖進(jìn)數(shù)據(jù)庫(kù)。

(6) 根據(jù)《法規(guī)》的相關(guān)內(nèi)容,通過(guò)核對(duì)原始文獻(xiàn)信息,確定是否為模式標(biāo)本及其模式類型,并蓋上相應(yīng)模式類型的章。

a. 若標(biāo)本信息與原始文獻(xiàn)信息一致,則將其名稱發(fā)表的原始文獻(xiàn)信息錄入模式標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù),并將復(fù)印的原始文獻(xiàn)裝訂,與模式標(biāo)本一起收藏于相應(yīng)的模式標(biāo)本夾中,依照秦仁昌 (Ching, 1978) 蕨類植物分類系統(tǒng)和恩格勒 (Engler, 1936) 種子植物分類系統(tǒng)中科的編號(hào)及屬種的字母順序,將植物模式標(biāo)本排列后存放在模式柜中,以方便專業(yè)人員查閱。

圖4 技術(shù)路線Fig. 4 Technical route

b. 在原始文獻(xiàn)中,有些模式標(biāo)本的采集信息會(huì)出現(xiàn)排印錯(cuò)誤或其它錯(cuò)誤,如采集人、采集號(hào),采集時(shí)間、采集地點(diǎn)與野外采集記錄標(biāo)簽上的原始信息不一致,則通過(guò)校對(duì)而確定其錯(cuò)誤,并貼上更正標(biāo)簽,給予注明。

c. 若此名稱雖然是合格發(fā)表,但標(biāo)本屬于產(chǎn)地模式,或是二手文獻(xiàn)引證的標(biāo)本,或原始文獻(xiàn)中未引證此號(hào)標(biāo)本,則將其從模式標(biāo)本柜中抽出,貼上說(shuō)明標(biāo)簽,置于普通標(biāo)本柜中。

d. 若經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)是不合格發(fā)表名字的模式標(biāo)本,則對(duì)它進(jìn)行相應(yīng)處理:或?qū)⑵浜细癜l(fā)表(如:好種等),或?qū)⑵鋸哪J綐?biāo)本柜中抽出,置于普通標(biāo)本柜中 (如:此植物已被另一名稱發(fā)表) ,并貼上標(biāo)簽注明。

e. 若經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)是合模式標(biāo)本,則經(jīng)研究后,可根據(jù)《法規(guī)》的相關(guān)要求,進(jìn)行后選模式指定。

f. 有些標(biāo)本信息與原始文獻(xiàn)信息核對(duì)后仍然無(wú)法確定其模式類型 (特別是早期發(fā)表的名稱及其標(biāo)本),但此標(biāo)本可能為模式標(biāo)本,則將其作為存疑模式標(biāo)本放置,留待該類群專家確定。

技術(shù)路線如圖 4 所示。

2.2 模式標(biāo)本考訂中常見(jiàn)問(wèn)題及其處理辦法

在此以模式標(biāo)本考訂中遇到的一些具體問(wèn)題,及采用的處理方法,作如下說(shuō)明。

(1) 對(duì)未發(fā)表名字標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有Smilax gracilentaChun 名字的標(biāo)本。搜索 Missouri Botanical Garden (Http://www.ipni.org/index.gtml/) 和Royal Botanic Gardens, Kew (Http://www.tropicos.org/)兩個(gè)網(wǎng)站,查閱《中國(guó)植物志》、《中國(guó)高等植物模式標(biāo)本匯編》等文獻(xiàn),均未見(jiàn)此名稱發(fā)表。因此,該標(biāo)本 (圖 5) 為非模式,貼上“經(jīng)查閱相關(guān)文獻(xiàn),未見(jiàn)此名稱發(fā)表”的標(biāo)簽,從模式柜中剔除。

(2) 對(duì)未引證標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有厚苞樓梯草Elatostema apicicrassumW. T. Wang 金效華等 0429 號(hào)標(biāo)本。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Wang, 2010),作者引證金效華等 0428 號(hào)標(biāo)本為主模式,在副模式中只引證有高黎貢山隊(duì) 32691 號(hào)標(biāo)本,此兩份標(biāo)本均在,故確定金效華等 0428 號(hào)標(biāo)本 (圖 6) 未被引證,為非模式。貼上“經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),未引證此號(hào)標(biāo)本,為非模式”的標(biāo)簽,從模式柜中剔除。

(3) 對(duì)產(chǎn)地模式標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有廬山堇菜Viola stewardianaW. Bckr. 的標(biāo)本,該份標(biāo)本采于 1942 年,而該名稱發(fā)表于 1925 年。因此,該份標(biāo)本是從該名稱發(fā)表后在模式標(biāo)本產(chǎn)地采到的同種植物的標(biāo)本,雖完全符合于原始形態(tài)描述,但在現(xiàn)行法規(guī)中,產(chǎn)地模式已不再屬于模式范疇,為非模式,故將此份標(biāo)本 (圖 7) 從模式柜中剔除。

圖5 未見(jiàn)此名稱發(fā)表標(biāo)本Fig. 5 No specimens have been published

圖6 未引證此號(hào)標(biāo)本Fig. 6 The specimen not quoted

(4) 對(duì)不合格發(fā)表名稱標(biāo)本的處理 ① 在模式標(biāo)本柜中存有扁糙果茶Camellia oblataH. T. Chang 的標(biāo)本。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Chang, 1981),該名稱發(fā)表時(shí)作者指定左景烈 23646 號(hào)標(biāo)本為果模式,廣西林科所 5357 號(hào)標(biāo)本為花模式。由于該名稱發(fā)表于 1958年 1 月 1 日之后,且指定了兩號(hào)標(biāo)本為模式,根據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 40.1 和 40.2,該名稱為不合格發(fā)表。經(jīng)專家研究,此植物是老種Camellia furfuraea(Merr.)Coh. St.,因此不必要作為新分類群發(fā)表,故貼上“不合格發(fā)表,為非模式”標(biāo)簽,將此份標(biāo)本 (圖 8) 從模式柜中剔除。② 在模式標(biāo)本柜中存有毛果船形翠雀DelphiniumnaviculareW. T. Wang var.lasiocarpumW. T. Wang 的標(biāo)本 (圖 9)。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Wang,1962),該名稱發(fā)表時(shí)作者引證了林業(yè)部調(diào)查隊(duì) 521號(hào)標(biāo)本和關(guān)克儉 2559 號(hào)標(biāo)本,但沒(méi)指定模式。由于該名稱發(fā)表于 1958 年 1 月 1 日之后,根據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 40.1 和 40.2,該名稱為不合格發(fā)表。此植物以后被收錄入《中國(guó)植物志》和《Flora of China》,是好變種。因此,我們撰文指定關(guān)克儉 2559 為主模式標(biāo)本,將其合格發(fā)表 (林祁等, 2009)。

圖7 產(chǎn)地模式標(biāo)本Fig. 7 Pattern specimen

圖8 不合格發(fā)表為非模式標(biāo)本Fig. 8 Non-conformity published as a non-type specimen

圖9 不合格發(fā)表,后將其合格發(fā)表標(biāo)本Fig. 9 Unquali fi ed publication and then quali fi ed publication of the specimen

圖10 主模式標(biāo)本Fig. 10 Master type specimen

(5) 各種不同類型模式標(biāo)本的確定 在模式標(biāo)本柜中,許多標(biāo)本只標(biāo)注為模式“Type”或“Typus”,并沒(méi)標(biāo)注為模式的何種類型,如:主模式 holotype、等模式 isotype、后選模式 lectotype、等后選模式 isolectotype、新模式 neotype、等新模式isoneotype、合模式 syntype、等合模式 isosyntype、副模式 paratype、等副模式 isoparatype、附加模式epitype、等附加模式 isoepitype。如果仍只將模式“Type”或“Typus”輸錄入數(shù)據(jù)庫(kù)中,模式數(shù)據(jù)仍不具體、不明確。因此,必須根據(jù)《法規(guī)》中關(guān)于各種模式類型的表述,將其具體化,標(biāo)出此份標(biāo)本所隸模式的終極類型,蓋上相應(yīng)模式類型的章。如 F.T. Wang 22605 號(hào)標(biāo)本 (圖 10) 最初只標(biāo)注為“Type”和“Typus”,后經(jīng)考證后為名稱Schizophragma obtusifoliumHu 的主模式,最終蓋上“主模式/Holotype”章。

(6) 對(duì)合模式標(biāo)本的處理 在規(guī)范化整理時(shí),通過(guò)將標(biāo)本與原始文獻(xiàn)核對(duì),發(fā)現(xiàn)一些名稱的模式為合模式。對(duì)此,我們首先選擇在原始文獻(xiàn)中說(shuō)明保存于PE的合模式標(biāo)本,或根據(jù)《法規(guī)》的精神能說(shuō)明是保存于 PE 的合模式標(biāo)本,或原作者的工作單位已于抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期疏散解體,最終由原作者或原采集人輾轉(zhuǎn)遷移保存到 PE 的合模式標(biāo)本,在這些合模式中,為其相關(guān)名稱指定后選模式。在規(guī)范化整理過(guò)程中,我們還注意到:從 16 世紀(jì)末至 20 世紀(jì) 40 年代流落國(guó)外的許多模式標(biāo)本,在中華人民共和國(guó)成立以后,隨著我國(guó)科學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,國(guó)際地位的顯著提高,對(duì)外合作交流的廣泛開(kāi)展,它們得以多種形式回歸祖國(guó),收藏于 PE。例如 1956-1957 年間,PE 安排兩位專家赴前蘇聯(lián)科馬諾夫標(biāo)本館 (LE) 進(jìn)行友好合作研究,經(jīng)與該館聯(lián)系、協(xié)商、交流、交換獲得大量采自中國(guó)的模式標(biāo)本 (含合模式標(biāo)本) 。又如 1990 年受瑞典烏普薩拉大學(xué) (Uppsala University) 標(biāo)本館 (UPS) 之邀請(qǐng),PE 專家赴該館進(jìn)行合作研究,經(jīng)協(xié)商、交流獲得大量采自中國(guó)的植物標(biāo)本 (含模式標(biāo)本)。另外,PE 還與英國(guó)邱園植物標(biāo)本館 (K),英國(guó)愛(ài)丁堡植物園標(biāo)本館 (E)、法國(guó)巴黎自然博物館植物標(biāo)本館 (P) 等收藏有大量中國(guó)植物標(biāo)本的國(guó)際性大標(biāo)本館聯(lián)系、合作、交流、交換獲得大量采自中國(guó)模式標(biāo)本。對(duì)于回歸模式標(biāo)本中的合模式標(biāo)本,理應(yīng)盡快將它們進(jìn)行規(guī)范化處理,使中國(guó)人在研究中掌握主動(dòng)權(quán)。我們遵循《規(guī)則》規(guī)則 8.1、9.5、9.11、9.12 和輔則 9A.3 的要求和相關(guān)原則,對(duì)這些名稱做出后選模式指定,以期規(guī)范這些名稱的模式,為它們的名稱確定永久依附的、保存于中國(guó)的成分 (單份標(biāo)本),并完成它們的數(shù)字化建設(shè),如對(duì)奇異杜鵑RhododendronaberransTagg& Forrest 合模式標(biāo)本的處理 (Lin, 2016) (圖 11)。

(7) 對(duì)合格發(fā)表名稱與命名標(biāo)簽上名字不一致的處理 隨著植物分類學(xué)的發(fā)展,有些種的名稱在合格發(fā)表時(shí)發(fā)生了變化;有的屬名整合到其它屬;有的屬名雖沒(méi)有變,但種加詞改變了;有的甚至屬名與種加詞同時(shí)改變;有的外單位作者在查閱 PE 標(biāo)本時(shí),在標(biāo)本上寫(xiě)有一個(gè)新名字,但回到本人工作單位后所發(fā)表的則又是另一個(gè)名稱等等,最終以另外一個(gè)名稱合格發(fā)表。例如:標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽所寫(xiě)的名字是AbacopterisgracilisChing,而最終合格發(fā)表的名稱是ProneophriumgracillisChing ex Y. X. Lin (林尤興,1999) (圖 12);又如:標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽所寫(xiě)的名字是PolypodiumchingiiC. Chr.,而最終合格發(fā)表的名稱是LemmaphyllumchristenseniiChing (Ching,1933)(圖 13)。

對(duì)于這些情況,在模式標(biāo)本考證過(guò)程中應(yīng)盡可能咨詢簽名的本人或該類群專家,或從作者姓名、命名標(biāo)簽上簽名時(shí)間與名稱合格發(fā)表時(shí)間、作者在簽名時(shí)間以后發(fā)表的有關(guān)類群研究論文、采集人/采集號(hào)、采集地點(diǎn)等方面作綜合考證,才能確定該標(biāo)本是否為模式或?yàn)楹晤愋偷哪J剑@在模式標(biāo)本規(guī)范化整理過(guò)程中是最難考證的內(nèi)容。

圖11 后選模式標(biāo)本Fig. 11 Then select the type specimen

(8) 對(duì)原始文獻(xiàn)與標(biāo)本采集人或采集號(hào)不一致的處理 如果原始文獻(xiàn)中記載的采集人或采集號(hào)與標(biāo)本臺(tái)紙上所貼標(biāo)簽記載的野外采集記錄信息不符,則很可能與其相同采集人或采集號(hào)的標(biāo)本不存在或不是同一植物。這時(shí),要細(xì)心考證,給予糾正。如MonachosorumkweichowenseChing 發(fā)表時(shí) (Ching,1941),作者引證了 Ngo Schio-chien 932 號(hào)標(biāo)本。查閱 PE 標(biāo)本,只有 Hou Shioh Yu 932 號(hào)標(biāo)本,沒(méi)有Ngo Schio-chien 932 號(hào)標(biāo)本。Hou Shioh Yu 932 號(hào)標(biāo)本的野外采集記錄除采集人名稱不同外,其它信息 (采集地、采集號(hào)等) 與原始文獻(xiàn)所記錄的均一致,而且臺(tái)紙上還貼有作者的新種命名標(biāo)簽。因此,原始文獻(xiàn)中標(biāo)本采集人姓名有誤,給予更正 (圖 14)。又如ClematischaohuensisW. T. Wang & L. Q. Huang 發(fā)表時(shí) (王文采和黃璐琦,2014),作者指定收藏于 PE 的王德群 70543 號(hào)標(biāo)本為主模式。查閱與考證其主模式標(biāo)本及相關(guān)資料,發(fā)現(xiàn)實(shí)際是王德群 95043 (圖 15),給予更正 (林云等,2017)。

圖12 名稱與名字屬名不同標(biāo)本Fig. 12 Name and name are different specimens

圖13 名稱與名字屬名種加詞不同標(biāo)本Fig. 13 The name and the name belong to a different type

圖14 采集人排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 14 Collection of human typographical errors

圖15 采集號(hào)排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 15 Collection number typographical error specimen

(9) 對(duì)組合名 (combination) 的考訂 據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 7.3,組合名的模式同于其基名的模式。因此考證組合名的模式就是對(duì)其基名模式的考證。如:Plagiopetalumhainanense(Merr. & Chun) Merr. ex Li即為組合名,F(xiàn). C. How 72967號(hào)標(biāo)本曾被標(biāo)注為HOLOTYPE。經(jīng)查找此組合名出現(xiàn)的文獻(xiàn) Journal of the Arnold Arboretum 25(1): 10. 1944. 后,確定其基名是BrediahainanensisMerr. & Chun。故所要考證的是BrediahainanensisMerr. & Chun. 的模式,經(jīng)查找該基名的原始文獻(xiàn) Sunyatsenia 5: 145. t. 22. 1940. 后,確定此份標(biāo)本為等模式,蓋上“等模式/ISOTYPUS”章(圖 16)。在規(guī)范化過(guò)程中有許多新名稱,包括新地位或新組合,只對(duì)基名的模式作考證,至于其以后的歸屬不作討論或點(diǎn)評(píng)。

(10) 野外采集信息的考證、規(guī)范與統(tǒng)一 將原始文獻(xiàn)與野外采集信息核對(duì),若二者之間出現(xiàn)采集時(shí)間、采集地點(diǎn)等信息不符時(shí),則以野外采集記錄為準(zhǔn),在標(biāo)本臺(tái)紙上貼上說(shuō)明標(biāo)簽給予注明 (圖 17)。除了原始文獻(xiàn)與標(biāo)本野外采集信息之間問(wèn)題的處理外,還有標(biāo)本臺(tái)紙上所貼不同標(biāo)簽上信息不一致的問(wèn)題。當(dāng)標(biāo)本號(hào)牌信息與野外采集記錄標(biāo)簽信息不一致時(shí),若沒(méi)有其它證明材料,則要求以標(biāo)本號(hào)牌信息為準(zhǔn);當(dāng)采集人只有中文書(shū)寫(xiě)時(shí),其字母拼寫(xiě)以《中國(guó)植物標(biāo)本館索引》 (傅立國(guó), 1993) 為準(zhǔn),此時(shí)要注意建國(guó)前從事標(biāo)本采集人員姓名的拼寫(xiě)往往不同于現(xiàn)代漢語(yǔ)拼音的拼法,如陳煥鏞的拼法為 Chun Woon-Young;當(dāng)采集地只有中文書(shū)寫(xiě)時(shí),其字母拼寫(xiě)以《中國(guó)地名錄—中華人民共和國(guó)地圖集地名索引》 (國(guó)家測(cè)繪局地名研究所, 1997) 為準(zhǔn),此時(shí)要注意部分少數(shù)民族語(yǔ)地名或縣名為特殊拼法,不要用現(xiàn)代漢語(yǔ)拼音直譯,如西藏的墨脫 Mêdog;當(dāng)采集地 (特別是縣名) 為歷史名稱時(shí),以《中國(guó)行政區(qū)劃沿革手冊(cè)》 (陳潮, 2000)為準(zhǔn),但將歷史名稱與現(xiàn)名稱同時(shí)列出,如四川省的灌縣表達(dá)為:灌縣 (=都江堰市)。

圖16 基名標(biāo)本Fig. 16 The base of specimens

(11) 同號(hào)標(biāo)本為多個(gè)名稱的模式時(shí)的處理 若同號(hào)標(biāo)本被當(dāng)作不同類群名稱的模式發(fā)表,或由相同作者或不同作者當(dāng)作相同名稱或不同名稱多次發(fā)表時(shí),則要找出每個(gè)類群名稱的原始文獻(xiàn),標(biāo)注該號(hào)標(biāo)本或該份標(biāo)本在不同原始文獻(xiàn)中的模式類型,將接受名的原始文獻(xiàn)信息均錄入原始文獻(xiàn)窗口,將其它名的原始文獻(xiàn)錄入子窗口。只列出其全部情形,不做任何解釋、評(píng)注或點(diǎn)評(píng)。例如:青藏隊(duì) 74-4540 號(hào)標(biāo)本在 3篇論文中由 5 人次在楝科 Meliaceae 割舌樹(shù)屬Walsura和蕓香科 Rutaceae 山小橘屬Glycosmis作為新類群發(fā)表,則需要將此號(hào)標(biāo)本、不同名稱、不同原始文獻(xiàn)、不同模式類型等信息輸錄入數(shù)據(jù)庫(kù)中,并附上標(biāo)本掃描照片 (圖 17)。

西藏割舌樹(shù)Walsura xizangensisC. Y. Wu & H.Li in Acta Phytotaxon. Sin. 18(1): 110. 1980; Fl. Xizang.3: 41, f. 14: 1-8. 1986. Holotype: China. Xizang: Mêdog,alt. 800 m, 1974-08-26, Qinghai-Xizang Exped. 74-4540.

圖17 采集日期排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 17 Collection date typographical error specimen

圖18 同號(hào)標(biāo)本為多名稱模式標(biāo)本Fig. 18 The same number specimen is a multi-name type specimen

墨脫山小橘Glycosmis moutuoensisD. D. Tao in Acta Bot. Yunnan. 6(3): 286, f. 2. 1984. Isotype: China.Xizang: Mêdog, alt. 800 m, 1974-08-26, Qinghai-Xizang Exped. 74-4540.

以上是我們做模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中常見(jiàn)的問(wèn)題及其處理方法,對(duì)模式標(biāo)本的考訂均依此進(jìn)行。

迄今為止,PE 已系統(tǒng)性地規(guī)范化整理完成了22,000 份維管束植物模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè),涉及8,000 余種及種下類群。今后將對(duì)新發(fā)表類群的模式標(biāo)本、新贈(zèng)送或交換回的模式標(biāo)本、國(guó)內(nèi)外新歸還PE 的模式標(biāo)本、在普通標(biāo)本柜中新查找出的模式標(biāo)本做數(shù)字化處理,為全世界研究與利用 PE 的模式標(biāo)本做好技術(shù)支撐服務(wù)。

圖19 苔蘚植物拼圖Fig. 19 Bryophyte

致謝

參加本工作的還有白如果、姜會(huì)美、姜會(huì)強(qiáng)等同志,在此特致謝忱。

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