林祁,楊志榮*,包伯堅(jiān),林云,張小冰,班勤,秘樹(shù)青,曹子余,陳淑榮,陳雅麗,杜青,杜玉芬,傅連中,高玳,何東東,何珊珊,敬璇,李安仁,李紅麗,李敏,李倩云,劉文群,馬欣堂,石青春,宋莉,孫苗,孫茜,王明瓊,王忠濤,吳慧冰,吳佳麗,吳婷婷,云映霞,趙慧娟
1. 中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館,北京 100093 2. 湖南省醫(yī)藥技工學(xué)校,湖南食品藥品職業(yè)學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410014 3. 太原師范學(xué)院生物系,山西 太原 030031 4. 河北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河北 石家莊 050024 5. 海淀區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,北京 100080
植物分類學(xué)是研究植物物種多樣性的科學(xué),命名物種是植物分類學(xué)的重要工作之一,與植物名稱 (學(xué)名) 關(guān)系最密切的是模式標(biāo)本。模式標(biāo)本是最重要的植物標(biāo)本,是確定植物學(xué)名的依據(jù),對(duì)名稱的穩(wěn)定意義重大,在植物分類學(xué)研究中有著不可替代的價(jià)值,是植物分類學(xué)家從事植物系統(tǒng)分類研究必不可少的科學(xué)材料,也是開(kāi)展??茖傺芯俊⒕帉?xiě)國(guó)家或地方植物志、進(jìn)行植物區(qū)系調(diào)查研究、開(kāi)發(fā)利用和保護(hù)植物資源的重要基本資料。但模式標(biāo)本的人為和自然毀損難以避免,模式標(biāo)本及其標(biāo)簽信息的數(shù)字化使得模式標(biāo)本的形態(tài)、地理分布、采集等主要信息得到最大限度的永久保存,可以極大地方便模式標(biāo)本信息的共享,可以為科學(xué)研究人員或相關(guān)人員提供植物形態(tài)、地理分布、歷史變遷等多方面的信息。
當(dāng)代計(jì)算機(jī)技術(shù)及網(wǎng)絡(luò)信息技術(shù)的快速發(fā)展使標(biāo)本館標(biāo)本 (含模式) 的信息化及共享化成為可能。從覆蓋國(guó)家和地區(qū)甚至全球性的生物標(biāo)本基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得可信的、新穎的、有效的信息,以能被人們理解和感受的形式表現(xiàn)出來(lái),并使這些原始材料和數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)資源信息共享,已經(jīng)成為國(guó)際上的發(fā)展趨勢(shì)。自20世紀(jì)七、八十年代起,歐美發(fā)達(dá)國(guó)家就開(kāi)始植物標(biāo)本(含模式標(biāo)本) 圖像及資料的電子化、信息化建設(shè),實(shí)現(xiàn)標(biāo)本數(shù)據(jù)記錄、存儲(chǔ)及傳輸和共享的電子化及網(wǎng)絡(luò)化。目前,數(shù)字植物標(biāo)本館建設(shè)已經(jīng)成為大多數(shù)標(biāo)本館日常工作不可或缺的部分。其中比較成功的例子包括美國(guó)哈佛大學(xué)標(biāo)本館 (包括 A,GH,F(xiàn)H),它在 20世紀(jì) 90 年代就實(shí)現(xiàn)館藏模式標(biāo)本及其重要參考文獻(xiàn)的數(shù)字化及網(wǎng)絡(luò)化共享,目前該館已完成 10 萬(wàn)份模式標(biāo)本的數(shù)字化工作?!鞍拇罄麃啍?shù)字植物標(biāo)本館”(AVH) 則是全球首個(gè)實(shí)現(xiàn)全國(guó)性標(biāo)本 (含模式) 數(shù)字化共享的生物多樣性大國(guó),它使用統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)軟件對(duì)全澳十余家主要標(biāo)本館的數(shù)百萬(wàn)份標(biāo)本實(shí)施數(shù)字化,并通過(guò)網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)標(biāo)本信息與環(huán)境信息的關(guān)聯(lián)及共享。法國(guó)巴黎國(guó)家自然歷史博物館 (P) 是全球最大的標(biāo)本館,館藏標(biāo)本超過(guò) 888 萬(wàn)份,該館完成了 20 萬(wàn)份模式標(biāo)本的數(shù)字化,但一些模式標(biāo)本的數(shù)字化內(nèi)容中缺少原始文獻(xiàn)信息。
進(jìn)入本世紀(jì)以來(lái),在國(guó)家科技部的支助下,在國(guó)家標(biāo)本資源共享平臺(tái)的直接領(lǐng)導(dǎo)下,我國(guó)有80余個(gè)科研教學(xué)單位的標(biāo)本館 (室) 開(kāi)展了模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)工作,對(duì)本館 (室) 收藏的模式標(biāo)本進(jìn)行掃描或高像素?cái)?shù)碼照相,對(duì)采集信息和命名鑒定信息進(jìn)行文字錄入,制成具有植物標(biāo)本構(gòu)成和標(biāo)本標(biāo)簽數(shù)據(jù)的信息集成數(shù)據(jù)庫(kù)。據(jù)有關(guān)資料 (Chiou et al. 2000; Li et al. 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2010; 曹偉, 2011; 方鼎, 2012; 楊永, 2012) 和筆者咨詢統(tǒng)計(jì),我國(guó)主要館藏的維管束植物模式標(biāo)本數(shù)量排名依次是中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館 (PE;22,000 份)、中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所標(biāo)本館 (KUN;12,000 份)、中國(guó)科學(xué)院華南植物園標(biāo)本館 (IBSC;7,000 份)、江蘇省中國(guó)科學(xué)院植物研究所 (中山植物園) 標(biāo)本館 (NAS;5,000)、廣西植物研究所標(biāo)本館 (IBK;4,000)、四川大學(xué)植物標(biāo)本館 (SZ;1,000)、臺(tái)灣大學(xué)植物學(xué)系標(biāo)本館 (TAI;1,000)、臺(tái)灣省林業(yè)試驗(yàn)研究所植物標(biāo)本館 (TAIF;810 份)、貴州科學(xué)院生物研究所植物標(biāo)本館 (HGAS;500 份)、江西省中國(guó)科學(xué)院廬山植物園標(biāo)本館 (LBG;472 份)、中國(guó)科學(xué)院沈陽(yáng)應(yīng)用生態(tài)所東北生物標(biāo)本館 (IFP;414 份)、廣西中醫(yī)藥研究院植物標(biāo)本館 (GXMI;357 份)、西北農(nóng)林科技大學(xué)植物標(biāo)本館 (WUK;300 份)、香港植物標(biāo)本室 (HK;278 份)、中國(guó)科學(xué)院武漢植物園標(biāo)本館 (HIB;200 份)、中國(guó)科學(xué)院新疆生物土壤沙漠研究所植物標(biāo)本館 (XJBI;93份) 等,其中 PE、TAIF、IFP、GXMI 等少數(shù)標(biāo)本館對(duì)本館模式標(biāo)本統(tǒng)計(jì)時(shí),將原始文獻(xiàn)的信息也集成至數(shù)據(jù)庫(kù)中。由于核對(duì)了原始文獻(xiàn),使得標(biāo)本的模式類型有據(jù)可查,其模式標(biāo)本數(shù)量數(shù)據(jù)可信。
在 2017 年 2 月 23-24 日召開(kāi)的“第一屆國(guó)家標(biāo)本資源共享平臺(tái)建設(shè)研究會(huì)”期間,筆者咨詢了國(guó)內(nèi)一些標(biāo)本館模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)情況,得知大部分標(biāo)本館 (室) 只是根據(jù)標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽的信息而做模式標(biāo)本數(shù)字化工作,并沒(méi)有核對(duì)原始文獻(xiàn)以確認(rèn)所錄入的標(biāo)本為模式。這樣,有可能出現(xiàn)將一些沒(méi)有有效合格發(fā)表名稱的標(biāo)本當(dāng)作模式標(biāo)本做了數(shù)字化輸錄。以 PE 標(biāo)本館蕨類植物標(biāo)本為例,為了管理好蕨類植物模式標(biāo)本,標(biāo)本管理人員專門將貼有模式標(biāo)簽、或蓋有模式章、或?qū)懹行路诸惾好Q標(biāo)簽的標(biāo)本當(dāng)作模式標(biāo)本抽提出來(lái),制作紅色模式標(biāo)本夾,并用專柜單獨(dú)存放,共有 7 柜。但是,筆者根據(jù)原始文獻(xiàn),依據(jù)《國(guó)際藻類、菌物、植物命名法規(guī)》 (McNeill et al.,2012) (以下簡(jiǎn)稱《法規(guī)》) 的相關(guān)原則進(jìn)行系統(tǒng)的整理、核對(duì)、考訂等后,確認(rèn) PE 蕨類植物模式標(biāo)本不到 4 柜,原 7 柜標(biāo)本中有幾乎近一半不是模式標(biāo)本。例如,在《中國(guó)蕨類植物孢子形態(tài)》 (張玉龍等, 1976)一書(shū)中,不合格發(fā)表了 200 余個(gè)蕨類植物新分類群。經(jīng)后人研究,其中絕大部分新植物不成立,也沒(méi)人再將它們合格發(fā)表,但這些標(biāo)本卻被蓋上模式章而置于模式柜中了。
筆者從 2005 起,一直在做 PE 模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)工作,在工作中遇到一系列問(wèn)題與國(guó)內(nèi)外標(biāo)本館在做模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中存在一些共性,歸納起來(lái)主要有以下 8 點(diǎn):
(1) 有些標(biāo)本曾被某些學(xué)者在臺(tái)紙上貼有命名標(biāo)簽,給予了新分類群 (新種、新亞種、新變種、新變型等) 的名字 (designation),但這些名字一直未被正式發(fā)表,不屬于模式標(biāo)本。
(2) 部分標(biāo)本雖然貼有原作者的命名標(biāo)簽,但在該學(xué)名正式發(fā)表時(shí),原始文獻(xiàn)中并未引證這份標(biāo)本,不屬于模式標(biāo)本。
(3) 部分標(biāo)本是根據(jù)原始文獻(xiàn)信息,以后在原產(chǎn)地所采的產(chǎn)地模式 (topotype),根據(jù)《法規(guī)》的規(guī)定,不屬于模式標(biāo)本范疇。
(4) 有些標(biāo)本雖然被某些學(xué)者在臺(tái)紙上貼有命名標(biāo)簽,給予了新分類群的名字,但這些名字為不合格發(fā)表,仍不屬于模式標(biāo)本,需要做進(jìn)一步的工作。
(5) 有的標(biāo)本雖然標(biāo)注為模式標(biāo)本,但沒(méi)注明是何種模式類型,如:主模式 holotype、等模式isotype、副模式 paratype、合模式 syntype、后選模式lectotype、新模式 neotype、附加模式 epitype 等等。
(6) 有的新分類群的名稱 (name) 列舉了 2 個(gè)或 2個(gè)以上采集號(hào)的標(biāo)本,但未指定主模式,或同時(shí)指定 2 個(gè)或 2 個(gè)以上采集號(hào)的標(biāo)本為模式。對(duì)這類標(biāo)本需做進(jìn)一步的工作,如后選模式指定,或合格發(fā)表等等。
(7) 有的臺(tái)紙上命名標(biāo)簽上的名字與合格發(fā)表名稱不一致,對(duì)這類標(biāo)本要給予標(biāo)注說(shuō)明。
(8) 有些原始文獻(xiàn)中排印的采集信息 (采集人、采集號(hào)、采集時(shí)間、采集地點(diǎn)等) 與野外采集記錄簽上所記錄的采集信息不符,需進(jìn)一步核查后進(jìn)行更正。
鑒于這些共性問(wèn)題,既為了促進(jìn)標(biāo)本館管理的數(shù)字化進(jìn)程,又為了保證其數(shù)據(jù)的科學(xué)性,本文擬以 PE 維管束植物模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)為例,介紹規(guī)范化整理模式標(biāo)本的方法、模式標(biāo)本數(shù)字化的操作流程,并通過(guò)實(shí)例介紹模式標(biāo)本考訂的過(guò)程、常見(jiàn)問(wèn)題的處理方法等,以期為其他單位開(kāi)展模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)提供經(jīng)驗(yàn)。
模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)所依據(jù)的材料是現(xiàn)行《法規(guī)》中所確認(rèn)的、各種類型的維管束植物模式標(biāo)本,包含以下類型 (不論該名稱是接受名還是異名) :
(1) 主模式 (holotype) 是名稱作者使用過(guò)的或指定為命名模式的那份標(biāo)本或插圖。
(2) 等模式 (isotype) 是主模式的復(fù)份標(biāo)本。
(3) 合模式 (syntype) 是當(dāng)沒(méi)有指定主模式時(shí)原始資料中所引證的任何一份標(biāo)本,或是兩份或兩份以上的標(biāo)本同時(shí)被指定為模式時(shí)其中的任何一份標(biāo)本。
(4) 副模式 (paratype) 是指原始文獻(xiàn)中所引證的標(biāo)本,但它既不是主模式,也不是等模式,還不是兩份或兩份以上的標(biāo)本同時(shí)被指定為模式時(shí)的合模式之一。
(5) 后選模式 (lectotype) 是當(dāng)名稱發(fā)表時(shí)沒(méi)有指明主模式或主模式失蹤或主模式包含一個(gè)以上分類群時(shí),從原始材料中指定的作為命名模式的標(biāo)本或插圖。
(6) 新模式 (neotype) 是指當(dāng)原始材料均不復(fù)存在或失蹤時(shí)被選作命名模式的一份標(biāo)本或插圖。
(7) 附加模式 (epitype) 是指當(dāng)主模式、后選模式、先前指定的新模式、所有與合格發(fā)表名稱有關(guān)的原始材料均不明確而不能為了分類群名稱的精確應(yīng)用而被嚴(yán)格的鑒定時(shí),用來(lái)作為解釋性模式的一份標(biāo)本或插圖。
根據(jù)以上定義,還可引伸出其它類型,如:等合模式 (isosyntype) 是指合模式的復(fù)份標(biāo)本,等副模式 (isoparatype) 是指副模式的復(fù)份標(biāo)本,等后選模式 (isolectotype) 是指后選模式的復(fù)份標(biāo)本,等新模式 (isoneotype) 是指新模式的復(fù)份標(biāo)本,等附加模式(isoepitype) 是指附加模式的復(fù)份標(biāo)本。
其它,如產(chǎn)地模式 (topotype) 是指從該植物的模式標(biāo)本產(chǎn)地采集到的相同植物的標(biāo)本,它在現(xiàn)行《法規(guī)》 (McNeill et al. 2012) 中已不再屬于模式范疇。
在模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中,所需設(shè)備包括用于數(shù)據(jù)輸錄的普通臺(tái)式計(jì)算機(jī);用于掃描原始文獻(xiàn)的普通掃描儀 (能掃描 B5、A4 紙);用于掃描模式標(biāo)本的較大型掃描儀 (能掃描 A3 紙,如 Epson Expression 10000 XL 型彩色圖像掃描儀),但需要將掃描儀改裝成倒置,將掃描儀鏡面朝下,并固定。將標(biāo)本置于掃描平臺(tái)上,標(biāo)本面朝上,并配有標(biāo)本支架,使標(biāo)本能上下升降 (圖 1),從而起到保護(hù)標(biāo)本不掉花、掉果、掉葉或掉渣的作用;用于粗枝、大果模式標(biāo)本拍照的照相機(jī)和翻拍架 (圖 2),以及 PE 標(biāo)本館條形碼、色卡比例尺等。
PE 采用中國(guó)科學(xué)院植物研究所國(guó)家植物標(biāo)本館設(shè)計(jì)的軟件界面,數(shù)據(jù)庫(kù)所用軟件為 SQL-Server,計(jì)算機(jī)語(yǔ)言為 VB.Net。為了得到清晰的圖像,通常將模式標(biāo)本圖片掃描的分辨率調(diào)為 400,圖片保存格式為 JPG,命名格式為條形碼。
PE 模式標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù)的標(biāo)本數(shù)據(jù)包括:標(biāo)本館代碼、標(biāo)本館條形碼號(hào)、標(biāo)本館號(hào) (流水號(hào))、模式類型、標(biāo)本狀態(tài)、采集人/隊(duì)、采集號(hào)、采集日期、國(guó)家名稱、省市名稱、區(qū)縣名稱、地名 (縣以下小地名或山名)、海拔、地形、生境、分布、經(jīng)度、緯度、習(xí)性、體高、胸徑、莖、葉、花、果實(shí)、種子、用途、附記、中文名稱、科名、屬名、種加詞、亞種加詞、變種加詞、變型加詞、命名人、命名日期、錄入員、錄入日期、校對(duì)人、標(biāo)本掃描照片、原始文獻(xiàn) (子窗口)、歷史模式 (子窗口)、備注等字段。
圖1 輸錄掃描設(shè)備Fig. 1 Transmission scanning equipment
圖2 照相設(shè)備Fig. 2 Photographic equipment
若有的標(biāo)本模式類型發(fā)生了改變,則原模式類型錄在歷史模式 (子窗口) 中,原始文獻(xiàn)錄在原始文獻(xiàn) (子窗口) 中。如將合模式選為后選模式后,合模式錄在歷史模式 (子窗口) 中,合模式的原始文獻(xiàn)錄在原始文獻(xiàn) (子窗口) 中。
原始文獻(xiàn) (子窗口) 采用雙語(yǔ)輸錄,主要字段包括作者、論文題目、刊名/書(shū)名/文集名、版本、編者、出版地、出版社、發(fā)表年份/出版年份、卷 (期)、分類群頁(yè)碼、論文頁(yè)碼、圖版或插圖頁(yè)碼、文獻(xiàn)掃描照片等。
建設(shè)流程有 15 個(gè)步驟,如圖 3 所示。
首先對(duì)植物標(biāo)本進(jìn)行模式考訂,確認(rèn)它屬于哪一模式類型,然后將此模式的標(biāo)本信息和原始文獻(xiàn)信息全部錄入數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)系統(tǒng),并將模式標(biāo)本圖像掃描上傳入數(shù)據(jù)庫(kù),以便于讀者查閱及研究。具體方法如下:
圖3 建設(shè)流程Fig. 3 The construction process
(1) 模式柜中的標(biāo)本基本上都貼有新植物命名標(biāo)簽或類似的標(biāo)識(shí),其中一些是有效合格發(fā)表的名稱(name),一些是不合格發(fā)表的名字 (invalid name),還有相當(dāng)多的是前人僅給了新名字而沒(méi)將它們發(fā)表。首先,對(duì)模式柜中標(biāo)本上的新名稱和名字進(jìn)行名錄錄入。
(2) 根據(jù)錄入名錄上的名稱或名字,通過(guò)查閱《中國(guó)植物志》、《中國(guó)高等植物模式標(biāo)本匯編》、《Flora of China》等文獻(xiàn),以及由英國(guó)邱園 (Royal Botanic Gardens, Kew)、美國(guó)哈佛大學(xué)標(biāo)本館 (Harvard University Herbaria) (Gray Herbarium Index) 和澳大利亞國(guó)家標(biāo)本館 (the Australian National Herbarium(APNI) 聯(lián)合創(chuàng)建的IPNI檢索系統(tǒng) (Http://www.ipni.org/) 和美國(guó)密蘇里植物園 (Missouri Botanical Garden)創(chuàng)建的 Http://www.tropicos.org/ 檢索系統(tǒng),查找其名稱的原始文獻(xiàn)出處,或確定其為不合格發(fā)表的名字,或確定其僅為前人給出的新名字。
(3) 在中國(guó)科學(xué)院植物研究所書(shū)目數(shù)據(jù)檢索系統(tǒng)(http://192.168.70.65/nweb/default.aspx.) 查詢并記錄原始文獻(xiàn)的索書(shū)號(hào),通過(guò)索書(shū)號(hào)在中國(guó)科學(xué)院植物研究所圖書(shū)館中查找、借閱相關(guān)原始文獻(xiàn),或利用國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行原始文獻(xiàn)查找,其中重要的專業(yè)網(wǎng)站有 http://www.sciencedirect.com/、http://onlinelibrary.wiley.com/、http://link.springer.com/、 http://www.jstor.org/、http://www.tandfonline.com/、https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 等。
(4) 復(fù)印借閱到的原始文獻(xiàn) (包括名稱所在頁(yè)碼、描述此植物的相關(guān)內(nèi)容及其圖版或插圖、論文首頁(yè)或書(shū)刊首頁(yè),等等),并在論文首頁(yè)標(biāo)注論文起始頁(yè)碼。
(5) 對(duì)于不便于外借的圖書(shū)文獻(xiàn),則對(duì)它們進(jìn)行翻拍照相。經(jīng)修圖后,打印留存紙質(zhì)件和上傳電子版圖進(jìn)數(shù)據(jù)庫(kù)。
(6) 根據(jù)《法規(guī)》的相關(guān)內(nèi)容,通過(guò)核對(duì)原始文獻(xiàn)信息,確定是否為模式標(biāo)本及其模式類型,并蓋上相應(yīng)模式類型的章。
a. 若標(biāo)本信息與原始文獻(xiàn)信息一致,則將其名稱發(fā)表的原始文獻(xiàn)信息錄入模式標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù),并將復(fù)印的原始文獻(xiàn)裝訂,與模式標(biāo)本一起收藏于相應(yīng)的模式標(biāo)本夾中,依照秦仁昌 (Ching, 1978) 蕨類植物分類系統(tǒng)和恩格勒 (Engler, 1936) 種子植物分類系統(tǒng)中科的編號(hào)及屬種的字母順序,將植物模式標(biāo)本排列后存放在模式柜中,以方便專業(yè)人員查閱。
圖4 技術(shù)路線Fig. 4 Technical route
b. 在原始文獻(xiàn)中,有些模式標(biāo)本的采集信息會(huì)出現(xiàn)排印錯(cuò)誤或其它錯(cuò)誤,如采集人、采集號(hào),采集時(shí)間、采集地點(diǎn)與野外采集記錄標(biāo)簽上的原始信息不一致,則通過(guò)校對(duì)而確定其錯(cuò)誤,并貼上更正標(biāo)簽,給予注明。
c. 若此名稱雖然是合格發(fā)表,但標(biāo)本屬于產(chǎn)地模式,或是二手文獻(xiàn)引證的標(biāo)本,或原始文獻(xiàn)中未引證此號(hào)標(biāo)本,則將其從模式標(biāo)本柜中抽出,貼上說(shuō)明標(biāo)簽,置于普通標(biāo)本柜中。
d. 若經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)是不合格發(fā)表名字的模式標(biāo)本,則對(duì)它進(jìn)行相應(yīng)處理:或?qū)⑵浜细癜l(fā)表(如:好種等),或?qū)⑵鋸哪J綐?biāo)本柜中抽出,置于普通標(biāo)本柜中 (如:此植物已被另一名稱發(fā)表) ,并貼上標(biāo)簽注明。
e. 若經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)是合模式標(biāo)本,則經(jīng)研究后,可根據(jù)《法規(guī)》的相關(guān)要求,進(jìn)行后選模式指定。
f. 有些標(biāo)本信息與原始文獻(xiàn)信息核對(duì)后仍然無(wú)法確定其模式類型 (特別是早期發(fā)表的名稱及其標(biāo)本),但此標(biāo)本可能為模式標(biāo)本,則將其作為存疑模式標(biāo)本放置,留待該類群專家確定。
技術(shù)路線如圖 4 所示。
在此以模式標(biāo)本考訂中遇到的一些具體問(wèn)題,及采用的處理方法,作如下說(shuō)明。
(1) 對(duì)未發(fā)表名字標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有Smilax gracilentaChun 名字的標(biāo)本。搜索 Missouri Botanical Garden (Http://www.ipni.org/index.gtml/) 和Royal Botanic Gardens, Kew (Http://www.tropicos.org/)兩個(gè)網(wǎng)站,查閱《中國(guó)植物志》、《中國(guó)高等植物模式標(biāo)本匯編》等文獻(xiàn),均未見(jiàn)此名稱發(fā)表。因此,該標(biāo)本 (圖 5) 為非模式,貼上“經(jīng)查閱相關(guān)文獻(xiàn),未見(jiàn)此名稱發(fā)表”的標(biāo)簽,從模式柜中剔除。
(2) 對(duì)未引證標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有厚苞樓梯草Elatostema apicicrassumW. T. Wang 金效華等 0429 號(hào)標(biāo)本。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Wang, 2010),作者引證金效華等 0428 號(hào)標(biāo)本為主模式,在副模式中只引證有高黎貢山隊(duì) 32691 號(hào)標(biāo)本,此兩份標(biāo)本均在,故確定金效華等 0428 號(hào)標(biāo)本 (圖 6) 未被引證,為非模式。貼上“經(jīng)查閱原始文獻(xiàn),未引證此號(hào)標(biāo)本,為非模式”的標(biāo)簽,從模式柜中剔除。
(3) 對(duì)產(chǎn)地模式標(biāo)本的處理 在模式標(biāo)本柜中存有廬山堇菜Viola stewardianaW. Bckr. 的標(biāo)本,該份標(biāo)本采于 1942 年,而該名稱發(fā)表于 1925 年。因此,該份標(biāo)本是從該名稱發(fā)表后在模式標(biāo)本產(chǎn)地采到的同種植物的標(biāo)本,雖完全符合于原始形態(tài)描述,但在現(xiàn)行法規(guī)中,產(chǎn)地模式已不再屬于模式范疇,為非模式,故將此份標(biāo)本 (圖 7) 從模式柜中剔除。
圖5 未見(jiàn)此名稱發(fā)表標(biāo)本Fig. 5 No specimens have been published
圖6 未引證此號(hào)標(biāo)本Fig. 6 The specimen not quoted
(4) 對(duì)不合格發(fā)表名稱標(biāo)本的處理 ① 在模式標(biāo)本柜中存有扁糙果茶Camellia oblataH. T. Chang 的標(biāo)本。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Chang, 1981),該名稱發(fā)表時(shí)作者指定左景烈 23646 號(hào)標(biāo)本為果模式,廣西林科所 5357 號(hào)標(biāo)本為花模式。由于該名稱發(fā)表于 1958年 1 月 1 日之后,且指定了兩號(hào)標(biāo)本為模式,根據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 40.1 和 40.2,該名稱為不合格發(fā)表。經(jīng)專家研究,此植物是老種Camellia furfuraea(Merr.)Coh. St.,因此不必要作為新分類群發(fā)表,故貼上“不合格發(fā)表,為非模式”標(biāo)簽,將此份標(biāo)本 (圖 8) 從模式柜中剔除。② 在模式標(biāo)本柜中存有毛果船形翠雀DelphiniumnaviculareW. T. Wang var.lasiocarpumW. T. Wang 的標(biāo)本 (圖 9)。經(jīng)查閱原始文獻(xiàn) (Wang,1962),該名稱發(fā)表時(shí)作者引證了林業(yè)部調(diào)查隊(duì) 521號(hào)標(biāo)本和關(guān)克儉 2559 號(hào)標(biāo)本,但沒(méi)指定模式。由于該名稱發(fā)表于 1958 年 1 月 1 日之后,根據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 40.1 和 40.2,該名稱為不合格發(fā)表。此植物以后被收錄入《中國(guó)植物志》和《Flora of China》,是好變種。因此,我們撰文指定關(guān)克儉 2559 為主模式標(biāo)本,將其合格發(fā)表 (林祁等, 2009)。
圖7 產(chǎn)地模式標(biāo)本Fig. 7 Pattern specimen
圖8 不合格發(fā)表為非模式標(biāo)本Fig. 8 Non-conformity published as a non-type specimen
圖9 不合格發(fā)表,后將其合格發(fā)表標(biāo)本Fig. 9 Unquali fi ed publication and then quali fi ed publication of the specimen
圖10 主模式標(biāo)本Fig. 10 Master type specimen
(5) 各種不同類型模式標(biāo)本的確定 在模式標(biāo)本柜中,許多標(biāo)本只標(biāo)注為模式“Type”或“Typus”,并沒(méi)標(biāo)注為模式的何種類型,如:主模式 holotype、等模式 isotype、后選模式 lectotype、等后選模式 isolectotype、新模式 neotype、等新模式isoneotype、合模式 syntype、等合模式 isosyntype、副模式 paratype、等副模式 isoparatype、附加模式epitype、等附加模式 isoepitype。如果仍只將模式“Type”或“Typus”輸錄入數(shù)據(jù)庫(kù)中,模式數(shù)據(jù)仍不具體、不明確。因此,必須根據(jù)《法規(guī)》中關(guān)于各種模式類型的表述,將其具體化,標(biāo)出此份標(biāo)本所隸模式的終極類型,蓋上相應(yīng)模式類型的章。如 F.T. Wang 22605 號(hào)標(biāo)本 (圖 10) 最初只標(biāo)注為“Type”和“Typus”,后經(jīng)考證后為名稱Schizophragma obtusifoliumHu 的主模式,最終蓋上“主模式/Holotype”章。
(6) 對(duì)合模式標(biāo)本的處理 在規(guī)范化整理時(shí),通過(guò)將標(biāo)本與原始文獻(xiàn)核對(duì),發(fā)現(xiàn)一些名稱的模式為合模式。對(duì)此,我們首先選擇在原始文獻(xiàn)中說(shuō)明保存于PE的合模式標(biāo)本,或根據(jù)《法規(guī)》的精神能說(shuō)明是保存于 PE 的合模式標(biāo)本,或原作者的工作單位已于抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期疏散解體,最終由原作者或原采集人輾轉(zhuǎn)遷移保存到 PE 的合模式標(biāo)本,在這些合模式中,為其相關(guān)名稱指定后選模式。在規(guī)范化整理過(guò)程中,我們還注意到:從 16 世紀(jì)末至 20 世紀(jì) 40 年代流落國(guó)外的許多模式標(biāo)本,在中華人民共和國(guó)成立以后,隨著我國(guó)科學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,國(guó)際地位的顯著提高,對(duì)外合作交流的廣泛開(kāi)展,它們得以多種形式回歸祖國(guó),收藏于 PE。例如 1956-1957 年間,PE 安排兩位專家赴前蘇聯(lián)科馬諾夫標(biāo)本館 (LE) 進(jìn)行友好合作研究,經(jīng)與該館聯(lián)系、協(xié)商、交流、交換獲得大量采自中國(guó)的模式標(biāo)本 (含合模式標(biāo)本) 。又如 1990 年受瑞典烏普薩拉大學(xué) (Uppsala University) 標(biāo)本館 (UPS) 之邀請(qǐng),PE 專家赴該館進(jìn)行合作研究,經(jīng)協(xié)商、交流獲得大量采自中國(guó)的植物標(biāo)本 (含模式標(biāo)本)。另外,PE 還與英國(guó)邱園植物標(biāo)本館 (K),英國(guó)愛(ài)丁堡植物園標(biāo)本館 (E)、法國(guó)巴黎自然博物館植物標(biāo)本館 (P) 等收藏有大量中國(guó)植物標(biāo)本的國(guó)際性大標(biāo)本館聯(lián)系、合作、交流、交換獲得大量采自中國(guó)模式標(biāo)本。對(duì)于回歸模式標(biāo)本中的合模式標(biāo)本,理應(yīng)盡快將它們進(jìn)行規(guī)范化處理,使中國(guó)人在研究中掌握主動(dòng)權(quán)。我們遵循《規(guī)則》規(guī)則 8.1、9.5、9.11、9.12 和輔則 9A.3 的要求和相關(guān)原則,對(duì)這些名稱做出后選模式指定,以期規(guī)范這些名稱的模式,為它們的名稱確定永久依附的、保存于中國(guó)的成分 (單份標(biāo)本),并完成它們的數(shù)字化建設(shè),如對(duì)奇異杜鵑RhododendronaberransTagg& Forrest 合模式標(biāo)本的處理 (Lin, 2016) (圖 11)。
(7) 對(duì)合格發(fā)表名稱與命名標(biāo)簽上名字不一致的處理 隨著植物分類學(xué)的發(fā)展,有些種的名稱在合格發(fā)表時(shí)發(fā)生了變化;有的屬名整合到其它屬;有的屬名雖沒(méi)有變,但種加詞改變了;有的甚至屬名與種加詞同時(shí)改變;有的外單位作者在查閱 PE 標(biāo)本時(shí),在標(biāo)本上寫(xiě)有一個(gè)新名字,但回到本人工作單位后所發(fā)表的則又是另一個(gè)名稱等等,最終以另外一個(gè)名稱合格發(fā)表。例如:標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽所寫(xiě)的名字是AbacopterisgracilisChing,而最終合格發(fā)表的名稱是ProneophriumgracillisChing ex Y. X. Lin (林尤興,1999) (圖 12);又如:標(biāo)本臺(tái)紙上命名標(biāo)簽所寫(xiě)的名字是PolypodiumchingiiC. Chr.,而最終合格發(fā)表的名稱是LemmaphyllumchristenseniiChing (Ching,1933)(圖 13)。
對(duì)于這些情況,在模式標(biāo)本考證過(guò)程中應(yīng)盡可能咨詢簽名的本人或該類群專家,或從作者姓名、命名標(biāo)簽上簽名時(shí)間與名稱合格發(fā)表時(shí)間、作者在簽名時(shí)間以后發(fā)表的有關(guān)類群研究論文、采集人/采集號(hào)、采集地點(diǎn)等方面作綜合考證,才能確定該標(biāo)本是否為模式或?yàn)楹晤愋偷哪J剑@在模式標(biāo)本規(guī)范化整理過(guò)程中是最難考證的內(nèi)容。
圖11 后選模式標(biāo)本Fig. 11 Then select the type specimen
(8) 對(duì)原始文獻(xiàn)與標(biāo)本采集人或采集號(hào)不一致的處理 如果原始文獻(xiàn)中記載的采集人或采集號(hào)與標(biāo)本臺(tái)紙上所貼標(biāo)簽記載的野外采集記錄信息不符,則很可能與其相同采集人或采集號(hào)的標(biāo)本不存在或不是同一植物。這時(shí),要細(xì)心考證,給予糾正。如MonachosorumkweichowenseChing 發(fā)表時(shí) (Ching,1941),作者引證了 Ngo Schio-chien 932 號(hào)標(biāo)本。查閱 PE 標(biāo)本,只有 Hou Shioh Yu 932 號(hào)標(biāo)本,沒(méi)有Ngo Schio-chien 932 號(hào)標(biāo)本。Hou Shioh Yu 932 號(hào)標(biāo)本的野外采集記錄除采集人名稱不同外,其它信息 (采集地、采集號(hào)等) 與原始文獻(xiàn)所記錄的均一致,而且臺(tái)紙上還貼有作者的新種命名標(biāo)簽。因此,原始文獻(xiàn)中標(biāo)本采集人姓名有誤,給予更正 (圖 14)。又如ClematischaohuensisW. T. Wang & L. Q. Huang 發(fā)表時(shí) (王文采和黃璐琦,2014),作者指定收藏于 PE 的王德群 70543 號(hào)標(biāo)本為主模式。查閱與考證其主模式標(biāo)本及相關(guān)資料,發(fā)現(xiàn)實(shí)際是王德群 95043 (圖 15),給予更正 (林云等,2017)。
圖12 名稱與名字屬名不同標(biāo)本Fig. 12 Name and name are different specimens
圖13 名稱與名字屬名種加詞不同標(biāo)本Fig. 13 The name and the name belong to a different type
圖14 采集人排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 14 Collection of human typographical errors
圖15 采集號(hào)排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 15 Collection number typographical error specimen
(9) 對(duì)組合名 (combination) 的考訂 據(jù)《法規(guī)》規(guī)則 7.3,組合名的模式同于其基名的模式。因此考證組合名的模式就是對(duì)其基名模式的考證。如:Plagiopetalumhainanense(Merr. & Chun) Merr. ex Li即為組合名,F(xiàn). C. How 72967號(hào)標(biāo)本曾被標(biāo)注為HOLOTYPE。經(jīng)查找此組合名出現(xiàn)的文獻(xiàn) Journal of the Arnold Arboretum 25(1): 10. 1944. 后,確定其基名是BrediahainanensisMerr. & Chun。故所要考證的是BrediahainanensisMerr. & Chun. 的模式,經(jīng)查找該基名的原始文獻(xiàn) Sunyatsenia 5: 145. t. 22. 1940. 后,確定此份標(biāo)本為等模式,蓋上“等模式/ISOTYPUS”章(圖 16)。在規(guī)范化過(guò)程中有許多新名稱,包括新地位或新組合,只對(duì)基名的模式作考證,至于其以后的歸屬不作討論或點(diǎn)評(píng)。
(10) 野外采集信息的考證、規(guī)范與統(tǒng)一 將原始文獻(xiàn)與野外采集信息核對(duì),若二者之間出現(xiàn)采集時(shí)間、采集地點(diǎn)等信息不符時(shí),則以野外采集記錄為準(zhǔn),在標(biāo)本臺(tái)紙上貼上說(shuō)明標(biāo)簽給予注明 (圖 17)。除了原始文獻(xiàn)與標(biāo)本野外采集信息之間問(wèn)題的處理外,還有標(biāo)本臺(tái)紙上所貼不同標(biāo)簽上信息不一致的問(wèn)題。當(dāng)標(biāo)本號(hào)牌信息與野外采集記錄標(biāo)簽信息不一致時(shí),若沒(méi)有其它證明材料,則要求以標(biāo)本號(hào)牌信息為準(zhǔn);當(dāng)采集人只有中文書(shū)寫(xiě)時(shí),其字母拼寫(xiě)以《中國(guó)植物標(biāo)本館索引》 (傅立國(guó), 1993) 為準(zhǔn),此時(shí)要注意建國(guó)前從事標(biāo)本采集人員姓名的拼寫(xiě)往往不同于現(xiàn)代漢語(yǔ)拼音的拼法,如陳煥鏞的拼法為 Chun Woon-Young;當(dāng)采集地只有中文書(shū)寫(xiě)時(shí),其字母拼寫(xiě)以《中國(guó)地名錄—中華人民共和國(guó)地圖集地名索引》 (國(guó)家測(cè)繪局地名研究所, 1997) 為準(zhǔn),此時(shí)要注意部分少數(shù)民族語(yǔ)地名或縣名為特殊拼法,不要用現(xiàn)代漢語(yǔ)拼音直譯,如西藏的墨脫 Mêdog;當(dāng)采集地 (特別是縣名) 為歷史名稱時(shí),以《中國(guó)行政區(qū)劃沿革手冊(cè)》 (陳潮, 2000)為準(zhǔn),但將歷史名稱與現(xiàn)名稱同時(shí)列出,如四川省的灌縣表達(dá)為:灌縣 (=都江堰市)。
圖16 基名標(biāo)本Fig. 16 The base of specimens
(11) 同號(hào)標(biāo)本為多個(gè)名稱的模式時(shí)的處理 若同號(hào)標(biāo)本被當(dāng)作不同類群名稱的模式發(fā)表,或由相同作者或不同作者當(dāng)作相同名稱或不同名稱多次發(fā)表時(shí),則要找出每個(gè)類群名稱的原始文獻(xiàn),標(biāo)注該號(hào)標(biāo)本或該份標(biāo)本在不同原始文獻(xiàn)中的模式類型,將接受名的原始文獻(xiàn)信息均錄入原始文獻(xiàn)窗口,將其它名的原始文獻(xiàn)錄入子窗口。只列出其全部情形,不做任何解釋、評(píng)注或點(diǎn)評(píng)。例如:青藏隊(duì) 74-4540 號(hào)標(biāo)本在 3篇論文中由 5 人次在楝科 Meliaceae 割舌樹(shù)屬Walsura和蕓香科 Rutaceae 山小橘屬Glycosmis作為新類群發(fā)表,則需要將此號(hào)標(biāo)本、不同名稱、不同原始文獻(xiàn)、不同模式類型等信息輸錄入數(shù)據(jù)庫(kù)中,并附上標(biāo)本掃描照片 (圖 17)。
西藏割舌樹(shù)Walsura xizangensisC. Y. Wu & H.Li in Acta Phytotaxon. Sin. 18(1): 110. 1980; Fl. Xizang.3: 41, f. 14: 1-8. 1986. Holotype: China. Xizang: Mêdog,alt. 800 m, 1974-08-26, Qinghai-Xizang Exped. 74-4540.
圖17 采集日期排印錯(cuò)誤標(biāo)本Fig. 17 Collection date typographical error specimen
圖18 同號(hào)標(biāo)本為多名稱模式標(biāo)本Fig. 18 The same number specimen is a multi-name type specimen
墨脫山小橘Glycosmis moutuoensisD. D. Tao in Acta Bot. Yunnan. 6(3): 286, f. 2. 1984. Isotype: China.Xizang: Mêdog, alt. 800 m, 1974-08-26, Qinghai-Xizang Exped. 74-4540.
以上是我們做模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè)中常見(jiàn)的問(wèn)題及其處理方法,對(duì)模式標(biāo)本的考訂均依此進(jìn)行。
迄今為止,PE 已系統(tǒng)性地規(guī)范化整理完成了22,000 份維管束植物模式標(biāo)本數(shù)字化建設(shè),涉及8,000 余種及種下類群。今后將對(duì)新發(fā)表類群的模式標(biāo)本、新贈(zèng)送或交換回的模式標(biāo)本、國(guó)內(nèi)外新歸還PE 的模式標(biāo)本、在普通標(biāo)本柜中新查找出的模式標(biāo)本做數(shù)字化處理,為全世界研究與利用 PE 的模式標(biāo)本做好技術(shù)支撐服務(wù)。
圖19 苔蘚植物拼圖Fig. 19 Bryophyte
致謝
參加本工作的還有白如果、姜會(huì)美、姜會(huì)強(qiáng)等同志,在此特致謝忱。
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數(shù)據(jù)與計(jì)算發(fā)展前沿2017年4期