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鱸魚stat6 cDNA克隆及表達分析

2016-11-08 10:21:34于小娜劉艷杰錢云霞
生物學雜志 2016年5期
關鍵詞:鱸魚弧菌結(jié)構域

于小娜, 劉艷杰, 錢云霞

(寧波大學 海洋學院, 寧波 315211)

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鱸魚stat6 cDNA克隆及表達分析

于小娜, 劉艷杰, 錢云霞

(寧波大學 海洋學院, 寧波 315211)

信號轉(zhuǎn)導和轉(zhuǎn)錄激活因子6(Signal transducers and activators of transcription,STAT6)在白介素IL-4、IL-13誘導的炎癥反應中起關鍵作用。利用RT-PCR和SMART RACE的方法從鱸魚(Lateolabraxjaponicus)肝臟中克隆得到stat6全長cDNA序列。該序列的cDNA為3938 bp,5′ 非翻譯區(qū)295 bp,3′ 非翻譯區(qū)1369 bp,開放閱讀框2274 bp,可編碼757個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為86.43 ku,等電點為5.90。分析STAT6氨基酸序列發(fā)現(xiàn),與鱖魚相似性達93.7%;與人相似性為41.7%。熒光定量PCR結(jié)果表明,stat6在脾、頭腎、大腦、腸和鰓中表達較高。腹腔注射哈維氏弧菌3 h后,stat6在脾、頭腎、腸、鰓組織中的表達均顯著上調(diào)(P<0.05),表明細菌感染會增加stat6的表達。研究結(jié)果為進一步研究魚類stat6在病原菌感染免疫中的分子機制提供一定基礎。

stat6;鱸魚;克?。唤M織表達

信號轉(zhuǎn)導和轉(zhuǎn)錄激活因子(Signal transducers and activators of transcription,STATs)是一種存在于胞漿內(nèi)的轉(zhuǎn)錄因子,能被多種配體激活形成二聚體,隨后從細胞漿轉(zhuǎn)移到細胞核,與目標基因啟動子區(qū)的DNA結(jié)合,從而調(diào)節(jié)該基因的表達[1-2]。在哺乳動物中,STATs家族包含7個成員,即STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5a、STAT5b和STAT6[3]。研究發(fā)現(xiàn)不同的STATs功能不同,在小鼠中證實STAT1在干擾素系統(tǒng)和先天免疫系統(tǒng)上起到至關重要的作用[4],白介素IL-6信號對STAT3在人類造血細胞和抗凋亡中是必需的[5]。STAT5a和STAT5b在小鼠生長、哺乳期和造血中有著重要功能[6]。以上研究表明了STAT1、STAT3和STAT5有廣泛的生物學效應,而偶數(shù)STAT蛋白質(zhì)功能相對受限制,大部分集中在免疫應答上,如STAT2被干擾素α/β激活,STAT4被IL12激活,STAT6被IL4和IL13激活[7-8]。

STAT6作為STATs的重要成員之一,Kaplan等[9]報道STAT6在白介素4(interleukin-4,IL-4)、白介素13(interleukin-13,IL-13)誘導的炎癥反應中起關鍵作用。當IL-4和細胞膜上的IL-4 受體的α鏈發(fā)生結(jié)合后,IL-4 受體形成異二聚體,從而引發(fā)酪氨酸激酶系統(tǒng)JAK的激活,使胞漿內(nèi)STAT6的酪氨酸殘基磷酸化而被激活,繼而進入細胞核內(nèi)與特定的 DNA位點結(jié)合,最終誘導相關炎癥基因,如IgE、IL-4R、Eotaxin、FcR和Ⅱ類MHC等的轉(zhuǎn)錄表達[10-11]。

也有報道STAT6參與了魚類的免疫應答。鯰魚(Pangasiushypophthalmus)白細胞中,STAT6蛋白在生長因子和有絲分裂原刺激下被激活并移到核內(nèi)。此外,鯰魚的非特異性細胞毒性細胞抗原受體NCCRP-1(nonspecific cytotoxic cells antigen receptor)和JAK激酶作用后刺激STAT6的活性和核移位[12]。目前stat6已經(jīng)在鱖魚(Sinipercachuatsi)[13]、東方鲀(Tetraodonfluviatilis)[2]等魚類中被分離克隆以及進行初步功能的研究,在東方鲀中發(fā)現(xiàn)STAT6的N-末端結(jié)構域和卷曲螺旋結(jié)構域在哺乳動物IL-4受體復合體和STAT6之間的相互作用中起著關鍵作用。鱖魚的研究表明,魚類的JAK/STAT信號轉(zhuǎn)錄途徑與哺乳動物相似,并且這種信號轉(zhuǎn)錄途徑在魚類的抗病毒應答調(diào)節(jié)中起著至關重要的作用。

鱸魚(Lateolabraxjaponicus)屬鱸形目,鮨科,花鱸屬。廣泛分布于太平洋西部、中國沿海地區(qū),屬于廣鹽性魚類,其肉質(zhì)細膩,營養(yǎng)豐富,是我國重要的海水養(yǎng)殖經(jīng)濟魚類。本研究從鱸魚肝臟中克隆了鱸魚信號轉(zhuǎn)導及轉(zhuǎn)錄激活因子stat6,并對其進行結(jié)構和特點分析,利用Real-time PCR技術分析哈維氏弧菌感染后鱸魚stat6的表達變化,為今后研究鱸魚stat6在免疫中的作用提供基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

鱸魚采自寧波水產(chǎn)品大世界,大腸桿菌DH5α,由本實驗室保存。Trizol試劑(Invitrogen公司);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit)、SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit、rTaq酶、pMD18-T Vector、SYBR Premix EX TaqTMII購自TaKaRa生物有限公司;凝膠回收試劑盒購于Beyotime公司。

1.2 方法

1.2.1 總RNA提取和cDNA的合成

麻醉后解剖鱸魚,將心臟、肝、脾、頭腎、鰓、眼、脂肪、肌肉、大腦和腸組織,放于液氮中,用Trizol試劑提取總RNA。用ND-2000微量核酸測定儀測定RNA濃度,各取1 μg總RNA按照PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit說明書進行逆轉(zhuǎn)錄反應,將合成的cDNA進行-20℃保存。另取1 μg肝臟總RNA按照SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit說明書合成3′和5′ Ready cDNA,合成的DNA 進行-80℃保存。

1.2.2 鱸魚stat6全長cDNA序列的克隆

實驗室經(jīng)華大基因高通量測序,獲得鱸魚cDNA文庫,BLAST比對,有一預測的stat6序列片段與鱖魚stat6相似度達到90%以上,根據(jù)該序列片段,設計引物stat6-F0:TGTTTGACTGAAGCCCTGC和stat6-R0:CAATGTCTGCTTTGCTCTCA,以鱸魚肝臟cDNA為模板擴增stat6。PCR反應條件如下:94℃預變性5 min;94℃變性 30 s,54℃退火 30 s,72℃延伸 2 min 30 s,共35個循環(huán);最后72℃再延伸8 min。

5′ RACE和3′ RACE擴增使用按Clontech公司的SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit說明書進行。根據(jù)驗證過的已知片段,設計3′和5′端引物stat6-3′ F1:TGACGACAACCTCAACCCCCTGC和stat6-5′ R1:TCAGAGAGAGGTGCCAGGGATGTAGC,分別以3′ RACE cDNA和5′ RACE cDNA為模板,以及試劑盒提供通用引物UMP進行3′ RACE和5′ RACE PCR反應。第2輪PCR的引物為stat6-3′ F2:CCTGGGAAGCCTGTGGTGCTAAAG和stat6-5′ R2:CCGATGGGTGACGCTTGAGGCT,與試劑盒提供的引物Nest-UPM分別進行PCR擴增,PCR條件按照說明書進行。

將上述PCR產(chǎn)物凝膠電泳,割膠回收,與pMD-18T Vector連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α中,挑克隆PCR陽性檢測,送至上海Invitrogen公司測序。

1.2.3 鱸魚STAT6氨基酸的序列分析

通過http://web.expasy.org/compute_pi/在線預測STAT6蛋白質(zhì)的分子質(zhì)量、等電點,利用http://smart.embl-heidelberg.de/在線分析STAT6蛋白質(zhì)結(jié)構,利用Bioedit比對氨基酸序列,用MEGA6.0構建STAT6的進化樹。

1.2.4 鱸魚stat6組織表達分析

根據(jù)已得到的鱸魚stat6的cDNA序列,設計熒光定量stat6引物和內(nèi)參基因stat6-F:AAGGAGTGTGTGGACTGTTTGG,stat6-R:GAGGTTGTCGTCAAAAGGATGT,β-actin-F:TGTGCAAAGCCGGATTCG,β-actin-R:CCTCTCTTGCTCTGGGCTTCA,以心臟、肝、脾、頭腎、鰓、眼、脂肪、肌肉、大腦和腸組織的cDNA為模板,擴增目的片段長度為114 bp。反應條件為:95℃預變性20 s;95℃變性15 s,58℃退火15 s,68℃延伸20 s,40個循環(huán)。反應結(jié)束后,通過測得Ct值,再利用2-△△Ct法計算stat6在不同組織中的相對表達量。

1.2.5 哈維氏弧菌感染后stat6表達分析

取50條體重約100 g,體長約20 cm的新鮮鱸魚進行感染。水溫15℃,pH 7.2,鹽度25‰,分成4組放入養(yǎng)殖箱,2組為實驗組,另2組為對照組,實驗組腹腔注射100 μL哈維氏弧菌(3.8×106CFU/mL),對照組腹腔注射生理鹽水,分別在0、3、6、12和24 h隨機各取5條鱸魚,麻醉后取脾、頭腎、腸和鰓組織,通過Real-time PCR測定stat6的表達。數(shù)據(jù)處理方法同上,利用SSPS 13.0軟件進行顯著性分析。

2 結(jié)果

2.1 鱸魚stat6全長cDNA的克隆

通過stat6-F0和stat6-R0引物從鱸魚肝臟的cDNA中擴增得到長度為2350 bp的產(chǎn)物,經(jīng)BLAST分析是鱸魚stat6。根據(jù)該序列設計RACE引物,分別得到2290 bp的5′ 末端和2638 bp的3′ 末端,將其拼接得到stat6的全長cDNA序列(GeneBank 登錄號為KT956195)。鱸魚stat6全長cDNA序列為3938 bp,5′ UTR和3′UTR分別為295 bp和1369 bp,含有PolyA加尾信號aataaa,最后以Poly(A)結(jié)尾。整個CDS為2274 bp,編碼757個氨基酸,該蛋白質(zhì)的分子質(zhì)量為86.43 ku,等電點5.90(圖1)。

2.2 鱸魚STAT6的氨基酸序列分析

通過NCBI的BLAST將鱸魚STAT6氨基酸序列進行相似性檢索,發(fā)現(xiàn)鱸魚與同為鱸形目的鱖魚相似性最高,為93.7%;與鱸形目的大黃魚(Larimichthyscrocea)和鲀形目的東方鲀也都有較高的相似性,分別為86.7%和73.7%。與親緣關系較遠的鯉形目鯉魚和鯰形目斑點叉尾鮰相似性為64.6%和61.5%。與人(Homosapiens)、牛(Bostaurus)和大鼠(Rattusnorvegicus)相似性分別為41.7%、40.8%和40.3%。

多序列比對結(jié)果顯示(圖2),鱸魚STAT6蛋白質(zhì)和其他物種一樣,存在著高度保守的功能結(jié)構域,包括N-末端結(jié)構域(2~125區(qū)段),卷曲螺旋結(jié)構域(143~304區(qū)段),DNA結(jié)合域(306~551區(qū)段),SH2結(jié)構域(560~647區(qū)段)和轉(zhuǎn)錄激活域(648~757區(qū)段)。根據(jù)http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html在線軟件分析,鱸魚STAT6的卷曲螺旋結(jié)構域是由4個α螺旋結(jié)構組成,分別在143~184、198~250、260~279、285~303區(qū)段。

利用MEGA6.0軟件建立STAT6系譜樹(圖3)。從系譜樹可以看出,STAT6可以分成兩大分枝。第一分枝是哺乳類、兩棲類和爬行類,第二分枝是硬骨魚類。

2.3 鱸魚stat6組織表達分析

熒光定量PCR結(jié)果顯示,stat6在鱸魚檢測的組織中都表達,在脾、頭腎、鰓、大腦和腸組織中表達較高,在心臟、眼、脂肪和肌肉中表達較少,其中肌肉表達量最低,鰓中表達最高(如圖4)。

2.4哈維氏弧菌感染后stat6表達變化

由于stat6在脾、頭腎、腸和鰓中表達較高,因此用Real-time PCR技術檢測注射哈維氏弧菌后stat6在鱸魚這4個組織中的表達變化。結(jié)果顯示,腹腔注射哈維氏弧菌3 h后,鱸魚stat6 mRNA表達在脾、頭腎、腸和鰓中顯著增加(P< 0.05),脾、腸和鰓在6 h達到峰值,12 h回落,24 h繼續(xù)下降,但仍高于對照組,而頭腎在12 h達到峰值,24 h回落,同樣仍顯著高于對照組(如圖5)。

圖2 鱸魚、鱖魚、大鼠和人STAT6的氨基酸序列比較Fig 2 STAT6 amino acid sequences from L. japonicus, S. chuatsi, R. norvegicus and H. sapiens黑色區(qū)域代表相同氨基酸;*代表酪氨酸(Tyr);黑框代表NCoA-1結(jié)合位點;下劃線代表α螺旋

3 討論

本研究用RACE-PCR方法在鱸魚肝臟中克隆得到stat6的cDNA全長,并推斷可翻譯757個氨基酸。該蛋白具有5個典型特征: N-末端結(jié)構域、卷曲螺旋結(jié)構域、DNA結(jié)合域、SH2結(jié)構域和轉(zhuǎn)錄激活域。

圖3 鱸魚與其他物種STAT6氨基酸序列進化樹Fig 3 Phylogenetic tree of STAT6 amino acid sequence of L. japonicus and other species

STAT蛋白的卷曲螺旋區(qū)域參與了受體結(jié)合、磷酸化和核轉(zhuǎn)運過程[1]。STAT1的晶體結(jié)構顯示,卷曲螺旋區(qū)是由4個α螺旋狀結(jié)構組成,為轉(zhuǎn)錄因子和調(diào)節(jié)蛋白提供作用位點[14]。鱸魚STAT6的卷曲螺旋結(jié)構域也包含4個α螺旋(圖3),推測鱸魚STAT6蛋白的卷曲螺旋結(jié)構具有和轉(zhuǎn)錄因子互相作用的功能。

STAT6的激活需要依靠IL-4和IL-13參與,當其與受體結(jié)合后,引發(fā)酪氨酸激酶系統(tǒng)JAK的激活,使受體磷酸化,磷酸化后的受體與STAT6的SH2結(jié)構域結(jié)合,使得STAT6的Tyr-641也被JAK激酶磷酸化。隨后STAT6形成二聚體并定位到核內(nèi)并調(diào)節(jié)目標基因的轉(zhuǎn)錄[11]??梢?41位的Tyr磷酸化是STAT6調(diào)控目標基因轉(zhuǎn)錄的關鍵因素,Yumiko等證實第641位的Tyr發(fā)生突變,STAT6將喪失與結(jié)合DNA的能力[15]。在東方鲀,STAT6的Tyr-637的酪氨酸的發(fā)生突變后也不能和DNA發(fā)生結(jié)合,不能轉(zhuǎn)錄激活目標基因[2]。鱸魚STAT6蛋白的第641個氨基酸殘基也是酪氨酸(Tyr),恰好在SH2區(qū)域上,推測鱸魚STAT6蛋白的SH2區(qū)域在磷酸化和二聚體形成過程中發(fā)揮重要功能。

圖4 鱸魚stat6在不同組織中的表達Fig 4 Expression of stat6 in various tissues of L. japonicus

1:心臟;2:肝;3:脾;4:頭腎;5:腸;6:鰓;7:眼;8:大腦;9:脂肪;10:肌肉

所有STAT蛋白質(zhì)均可和有回文結(jié)構[TTC(N)2-4GAA]的DNA結(jié)合,而STAT6 所結(jié)合的DNA元件特征是中間間隔3或4個核苷酸[16]。研究發(fā)現(xiàn)在哺乳動物中β-酪蛋白、免疫球蛋白和IRF4(Interferon regulatory factor 4)的啟動子區(qū)都存在該序列[17-18],因而這3個都是STAT蛋白的靶基因。在斑馬魚(Danio rerio)中,IRF4的啟動子區(qū)也存在與STAT6的DNA結(jié)合域結(jié)合的回文序列[18],因此在魚類中IRF4同樣可作為STAT6的靶基因。

圖 5 哈維氏弧菌感染后stat6在脾、頭腎、腸、鰓中的表達變化Fig 5 Expression of stat6 in spleen, kidney, intestine and gill of L. japonicus after intraperitoneal injectin of Vibrio harveyi

*表示顯著差異(P<0.05)

STAT6轉(zhuǎn)錄激活域的特點是其轉(zhuǎn)錄激活效應依賴于細胞的類型,可能是不同細胞所具有的轉(zhuǎn)錄共激活子不同。人STAT6通過其轉(zhuǎn)錄激活域的羧基端招募結(jié)合共激活子NCoA-1,這種結(jié)合依賴于STAT6羧基端的LXXLL基序[19-20],我們在鱸魚STAT6蛋白的羧基端并沒有發(fā)現(xiàn)存在LXXLL基序,所以無法推斷其轉(zhuǎn)錄激活是否需要共激活子NCoA-1參與。哺乳動物中STAT6轉(zhuǎn)錄激活域富含脯氨酸(Pro),雖然東方鲀魚STAT6蛋白的轉(zhuǎn)錄激活域和哺乳動物的有著很大差異,但是這種差異性并沒有影響STAT6蛋白的功能[2]。

鱸魚stat6在所檢測的10個組織中均有表達,與東方鲀魚和黃顙魚(Pelteobagrusfluvidraco)[21]研究結(jié)果類似,其中鱸魚stat6在脾、頭腎、大腦、腸和鰓中表達較高,當腹腔注射哈維氏弧菌3 h后,stat6在脾、頭腎、鰓、腸組織中均顯著上調(diào),證明了stat6在抵抗細菌感染過程中扮演著重要作用,為stat6在研究魚類病原菌感染免疫分子機制提供了一定的基礎。

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Gene cDNA cloning and expression analysis of stat6 from Lateolabrax japonicas

YU Xiao-na, LIU Yan-jie, QIAN Yun-xia

(School of Marine Science, Ningbo University, Ningbo 315211, China)

Signal transduction and transcriptional activation factor 6 plays an important role in the inflammation induced by IL-4 and IL-13. A full-length cDNA of thestat6 in sea perch (Lateolabraxjaponicus) was amplified by RT-PCR and SMART RACE methods. The cDNA was 3938 bp with 5′-UTR of 295 bp, 3′-UTR of 1369 bp and open reading frame of 2274 bp. It encoded a protein of 757 amino acids with the molecular weight of 86.43 ku and pI 5.90. The blast analysis indicated that the deduced amino acids sequence of sea perch STAT6 shared the highest identity of 93.7% withSinipercachuatsiand the lowest identity of 41.7% withhomosapien. Real-time PCR results showed thatstat6 was expressed in all tissues tested with higher levels in spleen, kidney, brain,intestine and gill. The expression ofstat6 increased obviously in spleen, kidney, intestine and gill after intraperitoneal injectin ofVibrioharveyi. This obtained information will provide a theoretical basis for studying the molecular mechanism of fishstat6 in regulating fish immune response to pathogens.

stat6;Lateolabraxjaponicus; cloning; tissue expression

2015-12-21;

2016-01-19

寧波大學“水產(chǎn)”浙江省重中之重開放基金資助(xkzsc1513)

于小娜,碩士研究生,研究方向為水產(chǎn)動物免疫基因,E-mial: 1034051030@163.com

錢云霞,教授,碩士生導師,主要從事水產(chǎn)動物分子生物學,E-mial: qianyunxia@nbu.edu.cn

Q786

A

2095-1736(2016)05-0053-05

doi∶10.3969/j.issn.2095-1736.2016.05.053

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