汪沐 謝鵬 唐夢君
摘要:為建立一種新的熒光原位雜交與流式細胞術相結合(FISH-FCM)的方法,以快速鑒定肉食品中的腸桿菌科細菌,采用與腸桿菌科細菌16S rRNA保守序列互補的探針Enter1432并驗證其特異性。結果表明:6種腸桿科細菌與探針Enter1432雜交率均在90%以上,而5種非腸桿菌科細菌與探針雜交率均低于1%;與SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》傳統(tǒng)培養(yǎng)法相比,F(xiàn)ISH-FCM定量檢測法全程約需4~5 h,檢測8份豬肉樣品中腸桿菌科細菌數(shù)為1.4萬~640萬個/g,4份雞肉樣品中腸桿菌科細菌數(shù)為5.0萬~21萬個/g,檢出率為100%。綜上所述,研究建立的FISH-FCM法可快速檢測肉品中的腸桿菌科細菌,適于食品衛(wèi)生、臨床實驗室推廣使用。
關鍵詞:熒光原位雜交;流式細胞術;腸桿菌科;快速定量檢測
中圖分類號: TS207.4 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2016)07-0336-03
腸桿菌科(Enterobacteriaceae)細菌是一類分布極為廣泛的革蘭氏陰性菌,包括對人致病性較強的埃希菌屬、志賀菌屬、沙門菌屬、耶爾森菌屬細菌[1]。腸桿菌作為歐盟各國食品衛(wèi)生檢查中重要的指標細菌,是國際間食品微生物學實驗室質量控制、水平測試的必測項目之一。目前,我國仍以大腸菌群、糞大腸菌群作為食品衛(wèi)生指標菌。以腸桿科菌替代大腸菌群、糞大腸菌群作為檢測指標可消除因后者產氣特性隨檢驗方法、試驗條件不同而造成結果的不準確性[2]。由于我國農產品生產管理不當,出口畜禽產品中腸桿菌科細菌檢測超標現(xiàn)象時有發(fā)生,易被歐盟發(fā)達國家市場拒絕,進而形成所謂的貿易壁壘。我國進出口商檢局經過多次修訂,制定了針對畜禽等農產品中腸桿菌檢測的行業(yè)標準SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》。該標準以傳統(tǒng)的細菌培養(yǎng)方法為基礎,包括分離培養(yǎng)、生化判定,其步驟繁瑣,時間冗長,工作量大,得到報告結果通常需要3 d左右。過長的檢驗時間使得生產部門延誤時間,增加成本,造成一定的經濟損失,而且無法應對緊急情況。因此,各級食品衛(wèi)生防疫部門迫切需要一種快速準確定量檢測腸桿菌的方法。本研究通過利用熒光原位雜交與流式細胞術相結合(FISH-FCM)對畜禽肉產品中腸桿菌科細菌進行定量檢測,并與傳統(tǒng)行標方法進行比較,探討FISH-FCM在食品安全衛(wèi)生領域中應用的可行性。
1 材料與方法
1.1 待檢樣品
本試驗檢測的8份豬肉樣品、4份雞肉鮮樣品分別隨機取自江蘇省揚州市A、B、C、D等4個不同的農貿市場。
1.2 菌種
本試驗中所采用的部分細菌(大腸桿菌、福氏志賀氏菌、宋氏志賀氏菌、鼠傷寒沙門氏菌、豬霍亂沙門氏菌、普通變形桿菌、枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌)由中國農業(yè)科學院家禽研究所唐夢君老師、龔建森老師提供。
1.3 寡核苷酸探針
根據(jù)Sghir等報道[3],試驗采用腸桿科細菌特異性探針Enter1432,序列為5′-CTTTTGCAACCCACT-3′。其中5′端由異硫氰酸酯熒光素FITC(Abs/Em=494/520)標記,由寶生物工程(大連)有限公司合成并標記探針。
1.4 FISH-FCM法驗證探針的特異性
將大腸桿菌、福氏志賀氏菌、宋氏志賀氏菌、鼠傷寒沙門氏菌、豬霍亂沙門氏菌、普通變形桿菌、枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、嗜水氣單胞菌、屎腸球菌11種菌株按照常規(guī)劃線培養(yǎng)法獲得單菌落,在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),將細菌濃度調整為0.1億個/mL,雜交方法參照Vaahtovuo等的報道[4-5]并有所改進:(1)取200 μL菌液,用等體積8%多聚甲醛溶液于4 ℃固定1 h;(2)固定完畢后,將樣品于12 000 g高速離心10 min,用PBS緩沖液洗滌3次;(3)取 10 μL 固定的菌液,加入85 μL預熱的雜交緩沖液(0.9 mol/L NaCl,pH值7.2的20 mmol/L Tris-HCl,0.1% SDS)中,加入5 μL 100 ng/μL 探針,50 ℃雜交2 h;(4)在1 mL PBS緩沖液中加入50 μL雜交溶液,渦旋振蕩;(5)將溶液上流式細胞儀(BD FACSCaliburTM,Becton Dickinson,美國),對每個樣品分析2 000 個物體。
1.5 FISH-FCM法檢測樣品
鮮肉樣品前處理步驟同SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》,制備成稀釋10倍的肉樣液。取1 mL肉樣液,80 g低速離心1 min,去除雜質。其余雜交方法同上,制備“1.4”節(jié)步驟(5)中的液體,加入10 μL 0.5 mg/mL 碘化丙啶,37 ℃避光孵育20 min。加入50 μL 1 000個/μL熒光微球(CountBringhtTM,Invitrogeon,美國)。混合溶液上樣于流式細胞儀分析,每個樣品分析10 000個物體。
1.6 培養(yǎng)法檢測樣品
按照SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》中相應方法檢測樣品。
1.7 試驗方法
用CellQuest Pro軟件(版本5.2.1,Becton Dickinson,美國)分析。在dot plot 圖上,x軸表示雜交結合熒光探針的目的細菌的熒光強度,y軸表示DNA染料的熒光強度。按照以下公式計算肉樣品中的細菌數(shù)量:
AB×CD×104=測定樣本的細菌濃度。
式中:A為目的細菌所占比例,%;B為熒光微球所占比例,%;C為測定樣本中的熒光的數(shù)量,個;D為測定樣本的體積或質量,g/μL。
2 結果與分析
2.1 FISH-FCM法驗證探針Enter1432的有效性
由圖1-A可知,目標菌株幾乎未與探針Enter1432結合,在dot plot散點圖上處于Q4區(qū)域,呈陰性結果;由圖1-B可知,目標菌株大部分與探針Enter1432結合,在dot plot散點圖上處于Q3區(qū)域,呈陽性結果。由表1可知,6種腸桿科細菌與探針Enter1432的雜交率為91.9%~95.7%,而5種非腸桿科細菌與探針的雜交率均低于1%。
2.2 FISH-FCM法與傳統(tǒng)培養(yǎng)法比較檢測肉樣品中的腸桿科細菌
由圖2、表2可知,按照SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》傳統(tǒng)培養(yǎng)方法檢測8份豬肉樣品中腸桿科細菌數(shù)量為0.63萬~53萬CFU/g,4份雞肉樣品中腸桿科細菌數(shù)量為0.10萬~1.5萬CFU/g。用FISH-FCM法檢測8份豬肉樣品中腸桿科細菌數(shù)量為1.4萬~640萬個/g,4份雞肉樣品中腸桿科細菌數(shù)量為5.0萬~21萬個/g。
3 結論與討論
熒光原位雜交(FISH)法鑒定微生物最初應用于醫(yī)學領域[6-8],熒光素標記的核酸探針可與目的細菌結合,使其在熒光顯微鏡下顯示出相應顏色,該方法具有特異性高、直觀的特點,但是由于通常情況下為保證統(tǒng)計結果的準確性,操作人員需要選擇多達數(shù)10個視野進行分析,這無疑增加了工作量,降低了試驗效率。流式細胞術是一種能夠對單細胞或其他生物粒子進行理化、免疫及分子生物學等多參數(shù)性狀檢測的現(xiàn)代分析技術,具有速度快、精度高、準確性好等優(yōu)點。已有研究將FISH與FCM相結合用于分析活性淤泥、海水樣品中目標菌群的數(shù)量變化[9-10]。此外,近年來研究人員通過FISH-FCM法分析人體或動物排出糞樣中有害菌、有益菌的數(shù)量變化,以監(jiān)測其健康[11-12]。環(huán)境中的物質及人或動物的腸道內容物十分復雜,不僅含有大量細菌,還含有許多非細菌物質,包括食物殘渣、有機碎屑以及脫落細胞等。雖然目前FISH-FCM尚未被應用于食品安全領域的檢測,但是該技術可應用于上述如此復雜成分物質的微生物分析檢測,筆者認為對于食品而言,該項技術應該存在較強的可行性,并具有廣闊的應用前景。
在本試驗中Enter1432探針與6種腸桿科細菌雜交率均在90%以上,而與非腸桿科細菌的雜交率均在1%以內,說明Enter1432探針在鑒定腸桿科細菌上具有較高的特異性,這與前人的研究結果[4,13]一致。在檢測豬、雞鮮肉樣品中腸桿菌科細菌數(shù)量方面,經SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》法檢測發(fā)現(xiàn),12份樣品中均檢測到腸桿菌科細菌,檢出率為100%,且腸桿菌科細菌數(shù)量在0.1萬~53萬CFU/g 之間,不同樣品檢測結果差異較大。根據(jù)瑞士聯(lián)邦獸醫(yī)局1981年的標準,生碎肉制品中腸桿科細菌含量的上限是500萬CFU/g,而近年歐盟對豬胴體的腸桿科細菌作出了更加嚴格且上限為3 lg CFU/cm2的規(guī)定,由此可見本試驗中部分樣本腸桿菌科細菌污染較為嚴重。筆者推測,由于本試驗中所采集的鮮肉樣本均來自傳統(tǒng)集市商販,肉品在經過屠宰、加工、運輸?shù)雀鱾€環(huán)節(jié)中均存在污染的可能。由于歐盟對動物屠宰過程的衛(wèi)生要求較高,對其加工過程控制進行可追溯且肉品包裝后須急凍處理,從而抑制細菌繁殖,后期肉品多經大型超市出售給消費者,而我國目前大多數(shù)以攤販為主要特征的集市貿易手段在上述各個環(huán)節(jié)中對肉品的衛(wèi)生控制程度不高,細菌的繁殖滋生現(xiàn)象可能較為明顯,因此本試驗采集的肉樣品存在較高的腸桿菌科細菌檢出率、檢出數(shù)量。
本試驗采用FISH-FCM法檢測肉樣品中的腸桿科細菌數(shù)量值是SN/T 0738—1997《出口食品中腸桿菌科檢驗方法》中相應檢測法的8.1~20.7倍。由于傳統(tǒng)培養(yǎng)方法只針對活的目標細菌,對于已死亡或者弱活力細菌在培養(yǎng)操作過程中無法檢測出,而FISH-FCM法針對目標細菌的DNA進行定量,因此無論細菌的生存狀態(tài)如何,其均能被檢測出。其次,由于單個細菌、若干同類細菌在培養(yǎng)過程中均能形成單一菌落,而FISH-FCM針對的是細菌數(shù)?;谏鲜鲈颍現(xiàn)ISH-FCM法檢測出的細菌數(shù)要比培養(yǎng)法檢測出的菌落數(shù)高。
綜上所述,鑒于傳統(tǒng)的培養(yǎng)法耗時長、工作量大的特點,本研究建立的FISH-FCM法可快速檢測肉品中的腸桿菌科細菌,適于食品衛(wèi)生和臨床實驗室推廣使用。
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