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多重PCR快速檢測(cè)化妝品中三種致病菌的研究

2016-09-15 08:22:53楊秀茳郭曉苑謝小保
工業(yè)微生物 2016年4期
關(guān)鍵詞:銅綠菌液金黃色

楊秀茳, 郭曉苑, 文 霞, 謝小保

廣東省微生物研究所,廣東省微生物分析檢測(cè)中心,省部共建華南應(yīng)用微生物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室 廣東 廣州 510070

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多重PCR快速檢測(cè)化妝品中三種致病菌的研究

楊秀茳,郭曉苑,文霞,謝小保*

廣東省微生物研究所,廣東省微生物分析檢測(cè)中心,省部共建華南應(yīng)用微生物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室 廣東 廣州 510070

利用多重PCR技術(shù)建立快速檢測(cè)化妝品中三種致病菌的方法。根據(jù)已報(bào)道的大腸桿菌phoA基因、銅綠假單胞菌外膜蛋白基因oprL和金黃色葡萄球菌特異性序列SmaI選擇特異性引物,對(duì)人工染菌化妝品進(jìn)行多重PCR檢測(cè)。結(jié)果顯示,三種致病菌的基因組DNA均可與各自引物特異性結(jié)合,擴(kuò)增產(chǎn)物大小分別為622 bp、504 bp和426 bp。該方法用于人工污染的化妝品中,大腸桿菌的檢出限濃度為103CFU/mL,銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的檢出限濃度為105CFU/mL。作者建立的多重PCR方法可同時(shí)快速、特異地對(duì)化妝品中三種致病菌進(jìn)行檢測(cè),在化妝品行業(yè)具有較大的應(yīng)用價(jià)值。

多重PCR; 化妝品; 致病菌; 檢測(cè)

近幾年我國(guó)化妝品消費(fèi)量不斷上升,其安全問題一直備受關(guān)注,其中微生物指標(biāo)是化妝品衛(wèi)生質(zhì)量合格與否的重要影響因素。目前我國(guó)對(duì)進(jìn)出口化妝品規(guī)定一律按《化妝品衛(wèi)生規(guī)范》(2007版)進(jìn)行檢驗(yàn),其中明確規(guī)定了每克或每毫升化妝品產(chǎn)品中不得檢出糞大腸菌群、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌,對(duì)此也列出了詳細(xì)的檢驗(yàn)方法,但是該方法需要配制各種培養(yǎng)基和試劑,操作繁瑣,耗時(shí)4 d~7 d,且存在對(duì)一些致病性金黃色葡萄球菌、糞大腸菌群檢出率很低的問題[1]。

為了適應(yīng)我國(guó)化妝品行業(yè)的發(fā)展,急需建立化妝品微生物快速檢測(cè)方法。多重PCR(multiplex-PCR)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上建立起來的一種新型檢測(cè)技術(shù),是在同一反應(yīng)體系中同時(shí)加入多對(duì)特異性引物擴(kuò)增出多條目的DNA片段的PCR反應(yīng),可用于多種病原微生物的同時(shí)快速檢測(cè)或鑒定[2-4]。該技術(shù)以快速、經(jīng)濟(jì)、高效的優(yōu)勢(shì)已被用于食品或環(huán)境中同時(shí)檢測(cè)多種病原微生物[5-11]。近幾年,PCR技術(shù)在化妝品檢測(cè)行業(yè)也得到了應(yīng)用,但還停留在對(duì)單個(gè)菌株的檢測(cè)[12-13],而同時(shí)檢測(cè)化妝品中大腸桿菌、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的方法還未有相關(guān)報(bào)道。本文對(duì)化妝品中大腸桿菌、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的多重PCR檢測(cè)做了初步研究,以期建立一種快速、準(zhǔn)確的化妝品微生物檢測(cè)方法。

1 材料與方法

1.1材料

1.1.1儀器Centrifuge5424小型高速離心機(jī)(Eppendorf)、紫外分光光度計(jì)(METASH UV-5200PC)、 Mastercycler?nexus GSX1梯度PCR儀(Eppendorf)、凝膠成像分析系統(tǒng)(Bio-Rad)。

1.1.2主要試劑2xEasyTaq?PCR SuperMix、Trans2K?PlusDNA Maker、Agarose(北京全式金生物技術(shù)有限公司),細(xì)菌DNA提取試劑盒(HiPure Bacterial DNA Kit,Magen),營(yíng)養(yǎng)瓊脂(NA)培養(yǎng)基(廣州環(huán)凱微生物科技有限公司)。

1.1.3引物合成

根據(jù)大腸桿菌的持家基因phoA、銅綠假單胞菌的外膜蛋白基因oprL和金黃色葡萄球菌的特異性序列SmaI,利用Primer5.0分析篩選文獻(xiàn)引物,引物由北京六合華大基因科技有限公司合成,其序列及擴(kuò)增長(zhǎng)度見表1。

表1 目的基因名稱及引物序列

1.1.4菌株

標(biāo)準(zhǔn)菌株:大腸桿菌(Escherichiacoli)ATCC8739、金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus) ATCC6538、銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)ATCC9027,均購(gòu)自廣東省菌種保藏中心,由本實(shí)驗(yàn)室保存。

污染菌株:枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis),腐生葡萄球菌(Staphylococcussaprophyticus),肺炎克雷伯氏菌(Klebsiellapneumonia),嗜麥芽窄食單胞菌(Stenotrophomonasmaltophilia),洋蔥伯克霍爾德菌(Burkholderiacepacia),惡臭假單胞菌(Pseudomonasputida),由本實(shí)驗(yàn)室從污染化妝品中分離。

1.1.5樣品

某化妝品公司送檢的化妝水和保濕乳,分別編號(hào)為H和B,采用傳統(tǒng)方法檢測(cè)無微生物污染。

1.2方法

1.2.1菌液制備

分別挑取3支標(biāo)準(zhǔn)菌株和6支污染菌株培養(yǎng)基上的單菌落接種于NA平板上,37 ℃培養(yǎng)18 h。分別制備9株菌的菌懸液和3株標(biāo)準(zhǔn)菌的混合菌懸液,濃度為108CFU/mL,然后將混合菌液稀釋至102CFU/mL,即制備成了濃度分別為108CFU/mL、107CFU/mL、106CFU/mL、105CFU/mL、104CFU/mL、103CFU/mL和102CFU/mL的菌懸液。

1.2.2模板DNA制備

首先分別吸取9種菌懸液和3種標(biāo)準(zhǔn)菌的混合菌懸液各1 mL于1.5 mL離心管中,離心去上清,收集菌體,采用試劑盒提取基因組DNA,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.3PCR特異性分析

分別以3個(gè)標(biāo)準(zhǔn)菌株、3個(gè)混合標(biāo)準(zhǔn)菌株和6個(gè)污染菌株的DNA為模板,用3對(duì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系(28 μL):2xEasyTaq?PCR SuperMix 14 μL,上下游引物各1 μL(10 μmol/L),模板1 μL,ddH2O補(bǔ)足至28 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。

1.2.4人工污染樣品

取3組15mL離心管,每組7支,第一組加生理鹽水,9 mL/支,編號(hào)7、6、5、4、3、2、1;第二組化妝水9g/支,編號(hào)B7、B6、B5、B4、B3、B2、B1;第三組保濕乳9g/支,編號(hào)H7、H6、H5、H4、H3、H2、H1。

每組離心管依次加入1 mL 108CFU/mL、107CFU/mL、106CFU/mL、105CFU/mL、104CFU/mL、103CFU/mL和102CFU/mL的混合菌液,充分混勻,即制備成107CFU/mL、106CFU/mL 、105CFU/mL、104CFU/mL、103CFU/mL、102CFU/mL和101CFU/mL的生理鹽水對(duì)照樣品組和B、H實(shí)驗(yàn)樣品組。離心去上清,對(duì)照組菌體沉淀直接提取DNA,實(shí)驗(yàn)組用生理鹽水將菌體沉淀重復(fù)洗滌3次后提取細(xì)菌DNA,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.5多重PCR測(cè)定靈敏度

以人工污染樣品中的混合DNA為模板,同時(shí)用3對(duì)引物進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增。通過對(duì)多重PCR反應(yīng)體系參數(shù)進(jìn)行優(yōu)化,確定了最佳反應(yīng)體系(28μL):2xEasyTaq?PCR SuperMix 14 μL,3對(duì)上下游引物各0.5 μL(10 μmol/L),模板1 μL/2 μL,ddH2O補(bǔ)足至28 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。

1.2.6PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)

以Trans2K?PlusDNA Maker作相對(duì)分子質(zhì)量指示,取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物5 μL用1%瓊脂糖凝膠(含染色劑Gold view)在120 V電壓下電泳30 min,然后置于凝膠成像分析系統(tǒng)中觀察結(jié)果并拍照。

2 結(jié)果與討論

2.1結(jié)果

2.1.1多重PCR擴(kuò)增結(jié)果及特異性分析

根據(jù)所篩選的3對(duì)特異性引物對(duì)3個(gè)標(biāo)準(zhǔn)菌株、3個(gè)混合標(biāo)準(zhǔn)菌株和6個(gè)污染菌株的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,檢測(cè)3對(duì)引物的特異性,結(jié)果顯示3對(duì)引物均能與對(duì)應(yīng)的菌株發(fā)生特異性結(jié)合,出現(xiàn)了與預(yù)期擴(kuò)增長(zhǎng)度相一致的清晰條帶,6株其他菌株均未擴(kuò)增出條帶,結(jié)果見圖1和表2。

M:Trans2K?PlusDNA Maker;1:EscherichiacoliATCC8739;2:PseudomonasaeruginosaATCC9027;3:StaphylococcusaureusATCC6538;4:三株標(biāo)準(zhǔn)菌混合;5:Bacillussubtilis;6:Staphylococcussaprophyticus;7:Klebsiellapneumonia;8:Stenotrophomonasmaltophilia;9:Burkholderiacepacia;10:Pseudomonasputida

圖1 多重PCR擴(kuò)增特異性

“+”:表示PCR擴(kuò)增陽(yáng)性;“-”:表示PCR擴(kuò)增陰性

2.1.2人工污染樣品的多重PCR擴(kuò)增靈敏度

用不同濃度的混合標(biāo)準(zhǔn)菌液污染化妝水和保濕乳兩個(gè)樣品,比較兩者可檢出的菌液濃度,同時(shí)以相應(yīng)濃度的生理鹽水菌液為對(duì)照,檢測(cè)多重PCR靈敏度。

不同濃度的生理鹽水混合菌液提取DNA后進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,污染菌液濃度為105~107CFU/mL時(shí),3種菌株均擴(kuò)增出目的條帶,污染菌液濃度為104CFU/mL時(shí),只有大腸桿菌擴(kuò)增出了清晰條帶,銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌擴(kuò)增出了較淡的條帶,可辨度低,菌液濃度在101~103CFU/mL時(shí),銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌已無目的條帶出現(xiàn),只有大腸桿菌在103CFU/mL濃度處擴(kuò)增出較淡條帶??梢姡谏睇}水對(duì)照樣中,大腸桿菌的可檢出菌液濃度最低限度為103CFU/mL,銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的可檢出菌液濃度最低限度為104CFU/mL,結(jié)果見圖2。

兩個(gè)人工污染的化妝品樣品之間,以及兩者與生理鹽水菌液之間比較,檢出效果差異不大,可檢出的條帶在長(zhǎng)度上相一致,表明經(jīng)過3次洗滌后,化妝品成分并未對(duì)基因組DNA提取產(chǎn)生影響。在污染濃度為105~107CFU/mL時(shí),兩者都能清晰檢出3株菌的條帶,在污染濃度為101~104CFU/mL時(shí),兩者均未檢出銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的條帶,只有大腸桿菌在104CFU/mL和103CFU/mL濃度處出現(xiàn)了較淡的條帶??梢?,兩個(gè)污染化妝品樣品中,采用多重PCR技術(shù)可檢出103CFU/mL以上濃度的大腸桿菌以及105CFU/mL以上濃度的銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌,結(jié)果見圖2。

2.2討論

作者多年的檢測(cè)工作中,經(jīng)常在化妝品中檢出銅綠假單胞菌,檢出量大,甚至是批量污染。大腸桿菌和金黃色葡萄球菌雖檢出相對(duì)較少,但也有檢出,尤其是在天氣潮濕的季節(jié),送檢量和檢出率明顯加大。這3種菌株均為常見的致病菌,大腸桿菌在免疫力低下的人體中容易引起感染,金黃色葡萄球菌在敏感型群體內(nèi)可引起呼吸道疾病[11,14]。銅綠假單胞菌附著在人身上可引起人皮膚化膿性感染[15]。化妝品中存在其中任何一種菌都對(duì)人體健康存在威脅,因此,研究這三種致病菌株的快速檢測(cè)方法是必要的。

本研究在查閱并分析了相關(guān)文獻(xiàn)后篩選了3對(duì)目標(biāo)基因的特異性引物,其中大腸桿菌phoA基因是其持家基因[16],許一平等[17]采用一對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增3種菌的基因組DNA的方法驗(yàn)證了其特異性。金黃色葡萄球菌的SmaI基因被證實(shí)為其特異性序列,徐曉可等[18]采用10株金黃色葡萄球菌、46株非金黃色葡萄球菌以及對(duì)43份食品樣品的檢測(cè)驗(yàn)證了該基因具有很好的特異性。oprL是銅綠假單胞菌特有的外膜蛋白基因,張淑紅等[19]通過比較檢測(cè)人工污染樣品的傳統(tǒng)培養(yǎng)法和分子生物學(xué)方法以及對(duì)自然界中的8個(gè)水體樣品的檢測(cè)驗(yàn)證了該基因的特異性。

M:Trans2K?PlusDNA Maker;1~7:生理鹽水對(duì)照樣品,編號(hào)1、2、3、4、5、6、7,即混合菌濃度依次為101CFU/mL、102CFU/mL、103CFU/mL、104CFU/mL、105CFU/mL、106CFU/mL和107CFU/mL;8~14:化妝水B樣品,編號(hào)B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7,即人工加菌終濃度依次為101CFU/mL、102CFU/mL、103CFU/mL、104CFU/mL、105CFU/mL、106CFU/mL和107CFU/mL;15~21:保濕乳H樣品,編號(hào)H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7,即人工加菌終濃度依次為101CFU/mL、102CFU/mL、103CFU/mL、104CFU/mL、105CFU/mL、106CFU/mL和107CFU/mL。

圖2人工污染樣品的多重PCR擴(kuò)增靈敏度

本研究根據(jù)3對(duì)引物的Tm值確定各自的退火溫度,首先建立了單重PCR的反應(yīng)條件,擴(kuò)增出片段長(zhǎng)度分別為622 bp、426 bp和504 pb的3個(gè)保守序列,驗(yàn)證了3對(duì)目標(biāo)基因引物的特異性。同時(shí)在單重PCR的基礎(chǔ)上,調(diào)整和優(yōu)化了多重PCR的引物濃度和退火溫度,進(jìn)行了多次預(yù)實(shí)驗(yàn),最終確定了反應(yīng)體系和條件。建立的多重PCR反應(yīng)體系不存在引物錯(cuò)配、交叉擴(kuò)增,也沒有引物二聚體的產(chǎn)生,具有很好的特異性,可以有效地在化妝品中同時(shí)檢測(cè)大腸桿菌、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌,整個(gè)過程只需1 d,可檢出的菌量分別為大腸桿菌103CFU/mL、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌105CFU/mL。

但是與傳統(tǒng)方法相比,本實(shí)驗(yàn)建立的多重PCR檢測(cè)靈敏度偏低,銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌的檢測(cè)靈敏度低于大腸桿菌,原因可能是提取混合菌液基因組DNA時(shí)濃度存在差異,也可能是反應(yīng)體系中引物濃度的配比還沒達(dá)到最佳,作者將在后續(xù)的實(shí)驗(yàn)中繼續(xù)進(jìn)行研究。在實(shí)際樣品的檢測(cè)中,通過預(yù)先進(jìn)行增菌的方式提高多重PCR檢測(cè)的靈敏度。

3 結(jié)論

化妝品微生物污染不僅給企業(yè)帶來經(jīng)濟(jì)損失,更嚴(yán)重危害人體健康,因此快速有效的化妝品微生物檢測(cè)至關(guān)重要,本研究建立的多重PCR檢測(cè)方法可同時(shí)、快速、準(zhǔn)確檢測(cè)化妝中的大腸桿菌、銅綠假單胞菌和金黃色葡萄球菌,為化妝品行業(yè)的快速檢測(cè)技術(shù)提供了基礎(chǔ),在化妝品行業(yè)具有較大的應(yīng)用價(jià)值。

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Rapid detection of three types of bacterial pathogens in cosmetics by multiplex PCR

YANG Xiu-jiang, GUO Xiao-yuan, WEN Xia, XIE Xiao-bao

Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Detection Center of Microbiology, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangzhou, Guangdong 510070, China

A multiplex PCR (m-PCR) method for rapid detection of three types of bacterial pathogens in cosmetics was developed. According to the reported, three pairs of primers were chosen for the m-PCR detection of artificially contaminated cosmetics, based on thephoA gene ofEscherichiacoli, the outer membrane protein (OMP)oprL gene ofPseudomonasaeruginosaand theSmaI specific sequence ofStaphylococusaureus. The results indicated the three pairs of primers bound specifically to the genomic DNA of the three types of bacterial pathogens and amplified three fragments of 622 bp forEscherichiacoli, 504 bp forPseudomonasaeruginosaand 426 bp forStaphylococcusaureus. In the case of artificially contaminated cosmetics, the detection limits of 103CFU/mL forEscherichiacoliwere achieved, and the detection limits of 105CFU/mL forPseudomonasaeruginosawere achieved as well asStaphylococusaureus. This m-PCR method could provide a simultaneous, rapid and specific detection for three types of bacterial pathogens in cosmetics, and have greater practical application values.

multiplex PCR; cosmetics; bacterial pathogens; detection

10.3969/j.issn.1001-6678.2016.04.011

廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014A040401054),揭陽(yáng)市產(chǎn)學(xué)研結(jié)合項(xiàng)目(0201)。

楊秀茳(1987~),女,助理工程師。E-mail:xiujiangjiang99@163.com。

謝小保(1966~),男,研究員。E-mail:xiaobaoxie@126.com。

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上海蔬菜(2015年2期)2015-12-26 05:03:40
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