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中國(guó)漢族人群前交叉韌帶損傷與β-fib基因多態(tài)性的相關(guān)性

2016-06-24 12:20陳鴻史荔張俊趙道洪史磊陸秦楠張啟段祺輝舒嵩華
關(guān)鍵詞:多態(tài)性韌帶測(cè)序

陳鴻 史荔 張俊 趙道洪 史磊陸秦楠 張啟 段祺輝 舒嵩華

1昆明市第一人民醫(yī)院運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)關(guān)節(jié)外科(昆明650000)

2中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所

3昆明醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院骨科

中國(guó)漢族人群前交叉韌帶損傷與β-fib基因多態(tài)性的相關(guān)性

陳鴻1史荔2張俊3趙道洪3史磊2陸秦楠1張啟1段祺輝1舒嵩華1

1昆明市第一人民醫(yī)院運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)關(guān)節(jié)外科(昆明650000)

2中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所

3昆明醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院骨科

目的:探索β-fib基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群前交叉韌帶(anterior cruciate ligament,ACL)損傷發(fā)生的關(guān)系。方法:收集105名ACL損傷的漢族患者,以110名無ACL損傷史的漢族個(gè)體作為對(duì)照,通過限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析、測(cè)序技術(shù)對(duì)β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)進(jìn)行檢測(cè)并分型,開展病例對(duì)照關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果:β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)共檢出6個(gè)SNPs,包括;β-148C/T(rs1800787)、β-249C/T(rs1800788)、β-455G/ A(rs1800790)、β-854G/A(rs1800791)、β-933G/A(rs2227389)、β-1420G/A(rs1800789),其中rs1800790、rs1800788和rs1800787的AG、CT和CT基因表型頻率在病例組中高于對(duì)照組 (P<0.05)。rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型C G A*、T G A*、T G G*在病例組和對(duì)照組中也顯示統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)論:在中國(guó)漢族人群,β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)rs1800790、rs1800788和rs1800787及其單倍型可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。

前交叉韌帶損傷;β-fib基因多態(tài)性;病例對(duì)照研究

前交叉韌帶(anterior cruciate ligament,ACL)是人體膝關(guān)節(jié)中重要的靜力性穩(wěn)定結(jié)構(gòu),ACL損傷在膝關(guān)節(jié)的損傷中較為常見,是引起膝關(guān)節(jié)功能障礙的常見因素之一[1]。 ACL損傷常使患者健康水平下降,將出現(xiàn)脛骨前移并導(dǎo)致膝關(guān)節(jié)不穩(wěn),繼而出現(xiàn)半月板損傷,尤其內(nèi)側(cè)半月板損傷多見[2],且ACL損傷時(shí)間越久,關(guān)節(jié)軟骨退變的范圍和程度越大[3],結(jié)果會(huì)進(jìn)一步加速膝關(guān)節(jié)的退行性改變和骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)生[4]。大量研究表明ACL損傷的患者關(guān)節(jié)炎發(fā)生的概率遠(yuǎn)高于無損傷的患者[5,6]。明確ACL損傷的原因?qū)⒂兄陬A(yù)防膝關(guān)節(jié)損傷,但目前ACL損傷發(fā)生的病因尚不清楚,Bahr等[7]認(rèn)為內(nèi)部因素和外部因素共同作用導(dǎo)致ACL損傷,而作為內(nèi)部危險(xiǎn)因素之一的遺傳因素逐漸受到人們的重視[8]。研究表明,在ACL損傷的發(fā)生過程中以及手術(shù)后,常常伴隨著纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)水平的顯著升高[9-11]。而β-fib基因決定纖維蛋白β多肽鏈的合成進(jìn)而影響血漿纖維蛋白原水平的大部分變化。由于不同人種或不同地區(qū)的人群存在基因異質(zhì)性,在中國(guó)人群中β-fib基因多態(tài)性是否與ACL損傷相關(guān)呢?本研究探討β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)的基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群ACL損傷發(fā)生的相關(guān)性。

1 對(duì)象與方法

1.1研究對(duì)象

納入標(biāo)準(zhǔn):(1)體格檢查膝關(guān)節(jié)不穩(wěn)、磁共振(MRI)與關(guān)節(jié)鏡檢查明確ACL損傷;(2)除ACL損傷,不合并有膝關(guān)節(jié)其他部位的韌帶損傷。

排除標(biāo)準(zhǔn):(1)除ACL損傷,合并有膝關(guān)節(jié)其他部位的韌帶損傷;(2)既往風(fēng)濕或類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、化膿性關(guān)節(jié)炎、膝關(guān)節(jié)結(jié)核等膝關(guān)節(jié)疾病患者;(3)既往膝關(guān)節(jié)手術(shù)或外傷患者。

2011年10 月至2015年10月,研究包括105名ACL損傷患者和110名正常對(duì)照者:ACL損傷患者男73例、女32例,平均年齡33.62±11.18歲,左ACL損傷41例,右ACL損傷64例;正常對(duì)照者男69例、女41例,平均年齡35.57±12.78歲。均為漢族。臨床診斷前交叉韌帶損傷的方法主要包括:臨床膝關(guān)節(jié)穩(wěn)定性體格檢查提示膝關(guān)節(jié)不穩(wěn),膝關(guān)節(jié)MRI檢查提示ACL異常信號(hào),關(guān)節(jié)鏡檢查明確ACL損傷。本次試驗(yàn)的ACL損傷病例同時(shí)滿足以上三方面的檢查標(biāo)準(zhǔn),上述三個(gè)標(biāo)準(zhǔn)均不滿足者進(jìn)入對(duì)照組。本研究獲得昆明醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院及昆明醫(yī)科大學(xué)臨床研究倫理委員會(huì)批準(zhǔn)通過,經(jīng)患者和正常對(duì)照本人及其家屬同意并簽署同意書。

1.2DNA提取、定量

采集ACL損傷病例及對(duì)照組外周靜脈血5 ml, EDTA抗凝。使用AxyPrep血基因組DNA小量試劑盒提取樣本的基因組DNA,采用瓊脂糖凝膠電泳對(duì)樣品DNA進(jìn)行測(cè)定。電泳條件:4V/cm,2%瓊脂糖電泳45分鐘,凝膠成像。使用分光光度計(jì)ND-1000測(cè)定DNA濃度,調(diào)節(jié)DNA濃度至15 ng/μL~20 ng/μL。

1.3fib啟動(dòng)子SNP檢測(cè)

1.3.1PCR引物設(shè)計(jì)

用DNASTAR primerselect設(shè)計(jì)引物序列。引物設(shè)計(jì)完成后在UCSC上進(jìn)行PCR確認(rèn)擴(kuò)增序列準(zhǔn)確性和長(zhǎng)度。再將序列輸入NCBI進(jìn)行BLAST序列比對(duì),再次確認(rèn)序列準(zhǔn)確性和長(zhǎng)度;同時(shí)確認(rèn)擴(kuò)增序列中的限制性核酸內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)是否是待檢測(cè)的SNP位點(diǎn)和酶切片段的長(zhǎng)度。最后抽取一些樣本進(jìn)行測(cè)序確認(rèn)。引物序列 (擴(kuò)增片段 1560bp)為:上游引物 (F):5’-ACGTCACTAAAATAAAATCCTGTCTA-3’;下游引物(R):5’-GAAGCTCCAAGAAACCATCC-3’

1.3.2PCR擴(kuò)增:PCR反應(yīng)體系

10×PCR擴(kuò)增緩沖液2.0 μL、dNTP1.6 μL、正向引物0.2 μL、反向引物0.2 μL HostStart rTaq聚合酶0.1 μL、模板DNA 1.3 μL,再加入雙蒸水至20 μL。PCR反應(yīng)程序 94℃,3 min(94℃,30 s;58.9℃,30 s;72℃,2 min)×30;72℃,10 min,4℃保存。

1.3.3雙向測(cè)序

擴(kuò)增PCR產(chǎn)物經(jīng)生工生物工程(上海)有限公司測(cè)序,檢測(cè)β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)位點(diǎn)。

1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

所有數(shù)據(jù)采用 SPSS17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用Hardy-weinberg遺傳平衡定律檢驗(yàn)病例組和對(duì)照組的基因頻率以及等位基因頻率。運(yùn)用SHEsis程序[12](http://analysis2.bio-x.cn/myAnalysis.php)分析統(tǒng)計(jì)β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)的基因型、等位基因及其單倍型頻率。位點(diǎn)的多態(tài)性與ACL損傷風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性用比值比(oddsratio,OR 值 ) 及 其 95% 可 信 區(qū) 間(confidenceintervals,CI)表示。P<0.05表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)SNP檢測(cè)

β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)共檢出6個(gè)SNPs,包括;β-148C/T(rs1800787),β-249C/T(rs1800788),β-455G/A (rs1800790),β-854G/A(rs1800791),β-933G/A(rs222-7389),β-1420G/A(rs1800789)。測(cè)序結(jié)果如圖1。

2.2β-fib基因病例對(duì)照分析

2.2.1Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)

對(duì)照組與感染組等位基因的頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P值均>0.05),說明人群具有代表性。

圖1 β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)6個(gè)SNPs測(cè)序結(jié)果

2.2.26個(gè)SNPs在病例組與對(duì)照組中等位基因頻率與基因型頻率比較

研究比較了6個(gè)SNPs在病例組和對(duì)照組中等位基因頻率,以及基因型頻率分布。結(jié)果6個(gè)SNPs等位基因頻率在病例組和對(duì)照組中未顯示差異 (P值均>0.05),但 rs1800790、rs1800788和 rs1800787的AG、CT和CT基因表型頻率在病例組中高于對(duì)照組,其差異具有顯著性意義,P值分別為0.0045、0.0022和0.010。這提示rs1800790、rs1800788和rs1800787可能與ACL的發(fā)生相關(guān)。結(jié)果見圖2和3。

圖2 β-fib基因6個(gè)SNPs等位基因頻率比較

圖3 β-fib基因6個(gè)SNPs基因型頻率比較

圖4 β-fib基因6個(gè)SNPs連鎖不平衡圖

2.2.36個(gè)SNPs連鎖不平衡分析

將β-fib基因6個(gè)SNPs進(jìn)行連鎖不平衡分析,結(jié)果如圖4顯示 :rs2227389、rs1800791和rs1800790連鎖不平衡較高。其余位點(diǎn)之間連鎖程度較低。

2.2.4單倍型構(gòu)建及病例對(duì)照分析

根據(jù)連鎖不平衡分析結(jié)果,構(gòu)建了rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型,并進(jìn)行對(duì)照病例分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)C G A*,T G A*,T G G*單倍型顯示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見表1。

表1 rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型ACL病例—對(duì)照分析結(jié)果

3 討論

目前,ACL損傷的發(fā)病機(jī)制并不十分清楚,內(nèi)外多種因素都可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。長(zhǎng)期以來,學(xué)者們關(guān)注于ACL的三維空間結(jié)構(gòu)、三維力學(xué)機(jī)制的分析研究。但近年來,多種高風(fēng)險(xiǎn)因子的發(fā)現(xiàn)表明基因與基因、基因與環(huán)境的相互作用在ACL損傷發(fā)生中也起到非常重要的作用。研究表明:性別、家族因素、特殊的遺傳序列變異等也是ACL損傷發(fā)生的高風(fēng)險(xiǎn)因素。ACL損傷在女性的發(fā)生率高于男性,Posthumus對(duì)Ⅴ型膠原基因COL5A1基因多態(tài)性進(jìn)行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):女性ACL損傷患者COL5A1 BstUI RFLP CC基因型的頻率顯著高于對(duì)照[13]。另外,女性XII型膠原基因COL12A1 AluI RFLP AA型ACL損傷的風(fēng)險(xiǎn)也增高[14]。Khoschnau等觀察到Ⅰ型膠原基因COL1A1 Sp1結(jié)合位點(diǎn)的多態(tài)性與ACL損傷減低相關(guān)[15]。而且ACL損傷患者親屬中ACL損傷的發(fā)生率高于正常,是正常的2倍,患者一級(jí)親屬的ACL損傷的發(fā)生率則達(dá)到2倍以上[16]。這些數(shù)據(jù)都提示遺傳因素在ACL損傷的發(fā)生中起到一定作用。對(duì)遺傳高風(fēng)險(xiǎn)因子的鑒別有利于確定在職業(yè)或非職業(yè)體育活動(dòng)中,重復(fù)性的機(jī)械負(fù)荷是否是導(dǎo)致個(gè)體損傷增加的因素,而且有助于在未來的治療中,針對(duì)不同個(gè)體采用最有效的治療方法。同時(shí),遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素也是決定損傷預(yù)后的重要因素。因此,ACL損傷的遺傳機(jī)制分析越來越受到重視,研究表明除了膠原蛋白(COL1A1,COL5A1,COL12A1)基因,還有基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)、血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子 (vascular endothelial growth factor,VEGF)及其受體-2(KDR)、肌原纖蛋白2(FBN2)等基因編碼或表達(dá)ACL的結(jié)構(gòu),并與ACL損傷有關(guān)[17-19]。

纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)是肝臟合成的一種血漿球蛋白,由完全相同的兩個(gè)亞基組成,每個(gè)亞基含有α、β、γ三條肽鏈,主要作為凝血因子Ⅰ 參與凝血,是凝血系統(tǒng)的核心蛋白質(zhì),它在凝血過程的最后階段被凝血酶切斷纖維蛋白原α鏈N-末端區(qū)域的纖維蛋白肽A和β鏈N-末端區(qū)域的纖維蛋白肽B而生成纖維蛋白單體,最終形成不溶性纖維蛋白凝塊而發(fā)揮血液凝固作用。纖維蛋白原3對(duì)多肽鏈分別由3條獨(dú)立的基因(α、β、γ)編碼,其中纖維蛋白原Bβ鏈的mRNA合成被認(rèn)為是控制整個(gè)分子合成的限速步驟,所以β-fib基因決定了纖維蛋白β多肽鏈的合成進(jìn)而影響血漿纖維蛋白原水平的大部分變化。本實(shí)驗(yàn)對(duì)β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)的基因多態(tài)性進(jìn)行初步研究,共檢出6個(gè)SNPs:β-148C/T(rs1800787),β-249C/T(rs1800788),β-455G/ A (rs1800790),β-854G/A (rs1800791),β-933G/A (rs2227389),β-1420G/A(rs1800789)。病例對(duì)照分析結(jié)果表明:rs1800790,rs1800788和rs1800787的AG、CT 和CT基因表型頻率在病例組中高于對(duì)照組,其差異具有顯著性意義,P值分別為0.0045、0.0022和0.010。進(jìn)一步構(gòu)建的rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型C G A*、T G A*、T G G*在病例組和對(duì)照組中也顯示統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。近年來的研究也表明,在ACL損傷的發(fā)生過程中以及手術(shù)后,常常伴隨著纖維蛋白原水平的顯著升高[9-11]。

4 結(jié)論

綜上所述,在中國(guó)漢族人群,β-fib基因啟動(dòng)子區(qū)rs1800790、rs1800788和rs1800787及其單倍型可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。

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Association of β-fib gene polymorphisms with ACL injury in Chinese Han Population

Chen Hong1,Shi Li2,Zhang Jun3,Zhao Daohong3,Shi Lei2,Lu Qinnan1,Zhang Qi1,Shu Songhua1
1 Sports Medicine and Joint Surgery,The First People’s Hospital of Kunming,Yunnan 650000,China
2 Institute of Medical Biology,Chinese Medical Sciences Academy,Yunnan 650000,China
3 Department of Orthopedics,The Second Affiliated Hospital of Kunming Medical University,Yunnan 650000,China

Lu Qinnan,Email:luqinnanyn@163.com

ObjectiveTo investigate the association of polymorphisms of β-fib gene with anterior cruciate ligament(ACL)injury in Chinese Han population.MethodOne hundred and five ACL injury patients were recruited in an experimental group,while 110 healthy counterparts were selected into a controll group.RFLP analysis and genetic sequencing technology were applied to detect and classify the single nucleotide polymorphisms(SNPs)in the β-fib gene promoter region.Then association analysis was conducted.Result In the β-fib gene promoter region,6 SNPs were detected as follow:β-148C/T (rs1800787),β-249C/T (rs1800788),β-455G/A (rs1800790),β-854G/A (rs1800791),β-933G/A (rs2227389),,β-1420G/A (rs1800789)).Moreover,the AG,CT and CT phenotypes of β-fib rs1800790,rs1800788 and rs1800787 gene were found significantly more in the experimental group than the control group (P<0.05).Significant differences were also found in the appearance of rs2227389-rs1800791-rs1800790 haplotype CGA*,TGA*,TGG* between the 2 groups.Conclusionβ-fib rs1800790,rs1800788 and rs1800787 genes and their haplotypes were related to ACL injury in Chinese Han population.

ACL injury,β-fib gene polymorphism,association analysis

2016.01.19

云南省科技計(jì)劃項(xiàng)目(昆醫(yī)聯(lián)合專項(xiàng))(40210029)

陸秦楠,Email:luqinnanyn@163.com

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