劉子記 詹園鳳 朱婕 賀滉
摘 要 建立快速、準(zhǔn)確、穩(wěn)定的種子純度檢測(cè)技術(shù)是保證西瓜雜交種質(zhì)量的有效措施。利用分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)小型西瓜‘美月雜交種純度進(jìn)行鑒定。從均勻分布于不同西瓜染色體上的88對(duì)SSR引物中篩選出8對(duì)引物在‘美月親本間表現(xiàn)明顯的多態(tài)性,分別位于第1、2、3、6、8、9、10染色體上,多態(tài)性比率為9.09%,多態(tài)性標(biāo)記均為共顯性標(biāo)記。為了提高檢測(cè)效率,結(jié)合多態(tài)性片段大小,同時(shí)對(duì)標(biāo)記SSR48和SSR62進(jìn)行擴(kuò)增,可成功獲得221 bp和131 bp的兩組特異性條帶,成功建立了雙重PCR體系。為了提高鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性,選用位于西瓜不同染色體上的4對(duì)共顯性標(biāo)記對(duì)‘美月進(jìn)行純度檢測(cè),4對(duì)標(biāo)記的檢測(cè)結(jié)果高度一致,‘美月雜交種純度為99.44%。標(biāo)記鑒定結(jié)果與田間表型鑒定結(jié)果比較分析表明,2種鑒定結(jié)果高度一致。研究結(jié)果可為西瓜雜交品種純度快速檢測(cè)和品種權(quán)保護(hù)提供理論依據(jù)與技術(shù)支撐。
關(guān)鍵詞 小型西瓜;雜交種;雙重PCR技術(shù);純度鑒定
中圖分類號(hào) S651 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A
\ 西瓜[Citrullus lanatus(Thunb.)Matsum. & Nakai]為葫蘆科(Cucurbitaceae)西瓜屬(Citrullus)一年生蔓性草本植物[1],原產(chǎn)非洲南部[2],廣泛分布于熱帶、亞熱帶地區(qū)[3],包括3個(gè)亞種:C. lanatus subsp. lanatus L.,古老的栽培種群組,生長(zhǎng)于南非;C. lanatus subsp. mucosospermus L.,籽用型西瓜群組;C. lanatus subsp. vulgaris L.,果肉具有甜味的西瓜群組,現(xiàn)代栽培的優(yōu)良西瓜品種由此亞種衍生而來(lái)[4]。西瓜在中國(guó)已有上千年的栽培歷史,中國(guó)是西瓜最大的生產(chǎn)國(guó)和消費(fèi)國(guó),平均年產(chǎn)量6 800萬(wàn)t[5]。其果實(shí)脆嫩,味甜多汁,營(yíng)養(yǎng)豐富,富含多種礦物質(zhì)和維生素。隨著人民生活水平的提高,飲食習(xí)慣的變化,種植結(jié)構(gòu)的調(diào)整,西瓜栽培面積逐漸擴(kuò)大,已成為增加農(nóng)民收人和促進(jìn)農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要作物之一。選育適應(yīng)不同地區(qū)和栽培模式的西瓜新品種是當(dāng)今西瓜育種的主要任務(wù)。小型西瓜外形美觀,單瓜重為1.0~2.5 kg,含糖量可達(dá)13%~14%,肉質(zhì)多汁脆甜,生育期短。因其品質(zhì)優(yōu)良、早熟,市場(chǎng)價(jià)格較高,經(jīng)濟(jì)效益遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于普通西瓜,種植面積呈現(xiàn)穩(wěn)定增長(zhǎng)的趨勢(shì)。
中國(guó)西瓜生產(chǎn)用種已100%實(shí)現(xiàn)雜種化。種子是重要的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料,種子質(zhì)量?jī)?yōu)劣直接影響農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量和優(yōu)良品種的增產(chǎn)潛力,開展種子純度檢測(cè)對(duì)保證種子質(zhì)量和提高生產(chǎn)效益具有重要意義。雜交種純度檢驗(yàn)的常用方法包括形態(tài)鑒定、田間鑒定和同工酶電泳技術(shù)鑒定等[6]。種子形態(tài)鑒定準(zhǔn)確性較差;田間鑒定周期較長(zhǎng),表型易受栽培措施和環(huán)境條件影響;同工酶鑒定多態(tài)性不夠豐富,且有組織和器官特異性[7]。西瓜遺傳基礎(chǔ)狹窄,傳統(tǒng)的鑒定方法難以滿足雜交種純度鑒定在精確度方面的要求。近年來(lái),隨著測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展,使得從基因組水平上檢測(cè)雜交種純度成為可能。分子標(biāo)記技術(shù)能夠從DNA水平上檢測(cè)子代與親本間的微小差異,不受時(shí)空限制,可以大大縮短檢驗(yàn)時(shí)間[8]。歐陽(yáng)新星等[9]利用RAPD標(biāo)記對(duì)‘無(wú)籽京欣一號(hào)西瓜種子純度進(jìn)行鑒定,多態(tài)性引物可有效區(qū)分母本與雜交種。劉澤發(fā)等[10]采用SRAP標(biāo)記開展了西瓜品種紅小玉雜交種純度鑒定,分子鑒定結(jié)果與大田鑒定結(jié)果高度吻合。周賢達(dá)等[11]以西瓜雜交一代品種黑寶、紅與黑、黑優(yōu)美及其親本為試驗(yàn)材料,利用EST-SSR標(biāo)記對(duì)西瓜雜交種純度進(jìn)行了快速鑒定,鑒定結(jié)果與田間鑒定結(jié)果一致。由于RAPD標(biāo)記重復(fù)性和穩(wěn)定性較差,SRAP標(biāo)記多為顯性標(biāo)記,EST-SSR標(biāo)記多態(tài)性較低,利用RAPD、SRAP、EST-SSR標(biāo)記進(jìn)行純度鑒定具有一定的局限性。在真核生物基因組中SSR標(biāo)記具有數(shù)量豐富、分布均勻、共顯性遺傳、操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),是進(jìn)行遺傳多樣性分析、雜交種純度鑒定及分子輔助育種的理想標(biāo)記類型[12]。SSR標(biāo)記在小型西瓜雜交種純度鑒定方面的研究鮮有報(bào)道。本研究以小型西瓜品種‘美月為研究對(duì)象,旨在利用SSR標(biāo)記建立小型西瓜雜交種純度鑒定技術(shù),以期為小型西瓜育種、制種、良種的及時(shí)銷售及品種保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
供試材料為小型西瓜[Citrullus lanatus(Thunb.) Matsum. & Nakai]雜交種一代‘美月、母本材料MH-35-1和父本材料MH-9-1。‘美月為中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所選育的早熟小型西瓜雜交品種,全生育期冬播75~80 d,夏播63~65 d,果實(shí)平均發(fā)育期為28 d,植株生長(zhǎng)勢(shì)較強(qiáng),第一雌花節(jié)位6~8節(jié),雌花間隔4~5節(jié)。果實(shí)短橢圓形,果型指數(shù)為1.29,外觀清秀,深綠果皮覆墨綠細(xì)齒條帶14~15條,果肉鮮紅色,色澤均勻,中心含糖量為12.5%~13%,最高可達(dá)14%,邊緣含糖量為9%~10%,肉質(zhì)細(xì)膩無(wú)纖維,口感極佳,果皮薄,皮厚0.4~0.5 cm,抗病性強(qiáng),適于保護(hù)地栽培。將供試材料播種于營(yíng)養(yǎng)缽中,待植株長(zhǎng)至2片真葉時(shí)取材備用。
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA提取 待植株長(zhǎng)至2片真葉時(shí),摘取1片真葉,利用Sharp等[13]的CTAB法提取MH-35-1、MH-9-1和‘美月單株的基因組DNA。
1.2.2 多態(tài)性標(biāo)記分析 參考已開發(fā)的西瓜SSR標(biāo)記和構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜[14],選擇了均勻分布于西瓜11條染色體上的88對(duì)SSR標(biāo)記,其中11對(duì)位于1號(hào)染色體,9對(duì)位于2號(hào)染色體,7對(duì)位于3號(hào)染色體,8對(duì)位于4號(hào)染色體,9對(duì)位于5號(hào)染色體,7對(duì)位于6號(hào)染色體,7對(duì)位于7號(hào)染色體,5對(duì)位于8號(hào)染色體,8對(duì)位于9號(hào)染色體,8對(duì)位于10號(hào)染色體,9對(duì)位于11號(hào)染色體。以母本材料MH-35-1和父本材料MH-9-1基因組DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,篩選在親本間表現(xiàn)多態(tài)性的SSR標(biāo)記。
PCR反應(yīng)體系為10 μL,其中包括9 mmol/L Tris-HCl(pH7.6),55 mmol/L KCl,1.2 mmol/L MgCl2,
0.20 mmol/L dNTPs,55 ng引物,0.80 U Taq DNA聚合酶,75 ng模板DNA。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性35 s,55 ℃退火35 s,72 ℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸8 min。PCR產(chǎn)物保存于10 ℃。4 μL擴(kuò)增產(chǎn)物與2 μL上樣緩沖液混合經(jīng)12%非變性聚丙烯酰胺凝膠(丙烯酰胺∶甲叉雙丙烯酰胺=29 ∶ 1)于200 V電泳4 h,銀染顯色進(jìn)行帶型統(tǒng)計(jì)。
1.2.3 雙重PCR技術(shù)建立 參考多態(tài)性標(biāo)記目的片段大小及引物之間的互補(bǔ)性,進(jìn)行引物組合,以母本材料MH-35-1和父本材料MH-9-1基因組DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)合單引物擴(kuò)增結(jié)果,將多態(tài)性片段進(jìn)行分組,建立雙重PCR擴(kuò)增技術(shù)。
1.2.4 分子標(biāo)記種子純度鑒定 以‘美月小型西瓜單株DNA為模板,利用在親本材料間表現(xiàn)為共顯性的SSR標(biāo)記進(jìn)行擴(kuò)增,根據(jù)特異譜帶的有無(wú)檢測(cè)雜交種的純度。品種純度=(1-a/A)×100%,其中A為待測(cè)‘美月種子數(shù)目,a為單獨(dú)具有母本譜帶特征或單獨(dú)具有父本譜帶特征或既不同于‘美月譜帶特征也不同于父母本譜帶特征的植株數(shù)目。
1.2.5 田間純度鑒定 將取材后的西瓜幼苗按照原順序移栽到地勢(shì)平坦、土質(zhì)肥沃的試驗(yàn)基地,試驗(yàn)地的管理參照小型西瓜栽培措施,在果實(shí)成熟期依據(jù)品種的特征特性逐株進(jìn)行鑒定,將標(biāo)記鑒定結(jié)果與田間鑒定結(jié)果進(jìn)行比較分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 多態(tài)性標(biāo)記篩選
以‘美月母本材料MH-35-1和父本材料MH-9-1為模板篩選88對(duì)均衡分布于西瓜11條染色上的SSR引物,其中8對(duì)引物在親本間能擴(kuò)增出明顯的多態(tài)性,多態(tài)性比率為9.09%,多態(tài)性標(biāo)記均為共顯性標(biāo)記,擴(kuò)增出互補(bǔ)的特異譜帶能將雜交種與親本材料區(qū)分開來(lái),多態(tài)性片段大小127~228 bp,分別位于西瓜第1、2、3、6、8、9、10染色體上(表1、圖1)。
2.2 雙重PCR技術(shù)建立
結(jié)合多態(tài)性引物擴(kuò)增模式及多態(tài)性片段大小,將多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行組合。SSR48多態(tài)性片段大小為221 bp,SSR62多態(tài)性片段大小為131 bp,比較兩對(duì)標(biāo)記多態(tài)性片段對(duì)應(yīng)區(qū)域發(fā)現(xiàn),多態(tài)性片段區(qū)域雜帶較少。分別以母本材料MH-35-1、父本材料MH-9-1和‘美月單株基因組DNA為模板,同時(shí)對(duì)引物SSR48和SSR62進(jìn)行擴(kuò)增,多態(tài)性片段分布在兩個(gè)區(qū)域,第1個(gè)區(qū)段為引物SSR48多態(tài)性片段分布區(qū)域,第2個(gè)區(qū)段為引物SSR62多態(tài)性片段分布區(qū)域。從擴(kuò)增結(jié)果發(fā)現(xiàn),19號(hào)單株僅具有母本特異譜帶,不具有父本特異譜帶,為母本自交株(圖2)。其余單株均同時(shí)具有母本特異譜帶和父本特異譜帶,為真實(shí)雜交種。兩對(duì)標(biāo)記的檢測(cè)結(jié)果一致。
2.3 結(jié)合多對(duì)標(biāo)記鑒定雜交種純度
為了確保檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,采用另外2對(duì)位于西瓜不同染色體上的共顯性標(biāo)記SSR21和SSR71對(duì)180株‘美月小型西瓜進(jìn)行純度鑒定,從標(biāo)記擴(kuò)增結(jié)果發(fā)現(xiàn),179個(gè)單株既具有母本特異譜帶也具有父本特異譜帶,屬于真實(shí)的雜交種,19號(hào)單株缺少父本特異帶,與母本擴(kuò)增譜帶一致,說(shuō)明19號(hào)單株為母本自交株,與標(biāo)記SSR48和SSR62檢測(cè)結(jié)果一致(圖3),‘美月小型西瓜品種的純度為99.44%。
2.4 田間種子純度鑒定
果實(shí)成熟期田間調(diào)查結(jié)果發(fā)現(xiàn),母本MH-35-1植株生長(zhǎng)勢(shì)中等,主蔓第6~7節(jié)出現(xiàn)第1雌花,果實(shí)外形美觀,果實(shí)圓球形,瓤肉鮮紅色,皮厚0.45 cm左右,較韌。父本MH-9-1果實(shí)長(zhǎng)橢圓形,花皮覆墨綠寬鋸齒條帶,瓤肉紅色,皮厚0.5 cm左右,較脆,植株長(zhǎng)勢(shì)強(qiáng)?!涝轮仓晟L(zhǎng)勢(shì)強(qiáng),果實(shí)整齊、外觀漂亮,短橢圓形,深綠果皮覆墨綠細(xì)齒條帶,瓤肉紅色,果肉組織細(xì)膩,無(wú)纖維,口感極佳,抗病能力強(qiáng),皮厚0.4~0.5 cm,較脆。19號(hào)植株與母本性狀一樣,易座果,果實(shí)圓形,皮較韌,植株長(zhǎng)勢(shì)較強(qiáng)。其余植株均具有‘美月小型西瓜品種的典型特征,生長(zhǎng)一致,果實(shí)外觀漂亮,短橢圓形,深綠果皮覆墨綠細(xì)齒條帶,果皮較脆。田間形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果與分子標(biāo)記鑒定結(jié)果高度一致,試驗(yàn)結(jié)果說(shuō)明利用SSR標(biāo)記進(jìn)行小型西瓜雜交種純度鑒定是可行的。
3 討論與結(jié)論
3.1 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展為高效、準(zhǔn)確檢測(cè)西瓜品種純度提供技術(shù)支撐
我國(guó)西瓜的栽培面積及產(chǎn)量均居世界首位,自20世紀(jì)80年代以來(lái),西瓜雜交品種在我國(guó)迅速普及推廣,栽培面積逐年擴(kuò)大,在人工制種過(guò)程中,常因生物混雜、母本自交和機(jī)械混雜導(dǎo)致種子不純,給生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失[15]。雜交種純度檢驗(yàn)的常用方法主要包括形態(tài)鑒定、田間鑒定和同工酶電泳技術(shù)鑒定等。種子形態(tài)鑒定很難將母本相同父本不同的西瓜品種區(qū)別開[16]。西瓜田間純度鑒定周期長(zhǎng),占地多,費(fèi)用高[17]。黃永紅等[18]利用過(guò)氧化物同工酶對(duì)6個(gè)西瓜雜交組合進(jìn)行了純度鑒定研究,但同工酶具有組織和器官特異性,難以發(fā)掘統(tǒng)一的特征譜帶來(lái)檢測(cè)不同西瓜雜交種的純度[19]。分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展能夠從基因組水平檢測(cè)微小遺傳差異,能夠?qū)⑦z傳差異較小的品種區(qū)分開來(lái),為雜交種純度精確鑒定帶來(lái)契機(jī)。AFLP、RAPD、SRAP標(biāo)記相繼應(yīng)用于西瓜品種純度鑒定[9-10,20],但這幾種標(biāo)記在應(yīng)用的過(guò)程中存在一定的局限性,如操作復(fù)雜、顯性遺傳、穩(wěn)定性較差等。與前幾種標(biāo)記相比,采用SSR標(biāo)記進(jìn)行小型西瓜雜交種純度鑒定具有無(wú)可比擬的優(yōu)越性。本試驗(yàn)采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)鑒定小型西瓜‘美月品種純度,能夠準(zhǔn)確地將母本自交種與雜交種區(qū)分開來(lái),與田間純度鑒定結(jié)果高度一致。
3.2 雙重PCR技術(shù)構(gòu)建可以顯著提高檢測(cè)效率
雙重PCR技術(shù)與單一PCR相比,具有快速、準(zhǔn)確、靈敏和可靠的優(yōu)點(diǎn)。韓廣濤等[21]建立了雙重PCR技術(shù),能夠同時(shí)對(duì)馬鈴薯環(huán)腐病和黑脛病進(jìn)行檢測(cè),大大節(jié)省了檢測(cè)時(shí)間和費(fèi)用。截止目前,采用雙重PCR技術(shù)檢測(cè)西瓜品種純度的研究鮮有報(bào)道,本研究利用在‘美月親本間表現(xiàn)多態(tài)性的SSR引物,在充分考慮多態(tài)性片段大小和多態(tài)性區(qū)域雜帶存在與否的情況下進(jìn)行組合,成功建立雙重PCR技術(shù),單次PCR過(guò)程可同時(shí)采用2對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)小型西瓜雜交種進(jìn)行純度鑒定,不僅能夠節(jié)約檢測(cè)時(shí)間,而且能夠提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性。該技術(shù)的建立能夠?qū)τ酌缙诘奈鞴现仓赀M(jìn)行快速而準(zhǔn)確的檢測(cè),對(duì)保證小型西瓜品種‘美月雜交種純度和良種的及時(shí)銷售具有重要意義。
3.3 多引物結(jié)合可以顯著提高檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性
采用單一引物進(jìn)行雜交種純度檢測(cè)雖然可以有效區(qū)分混入雜交種中的親本自交種,但對(duì)于混雜其中的其他品種很難區(qū)分開來(lái),然而選取多對(duì)位于不同染色體上的標(biāo)記進(jìn)行檢測(cè),恰恰可以實(shí)現(xiàn)這一目的[22]。為確保鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,進(jìn)一步排除生物混雜和機(jī)械混雜,本研究選取4對(duì)位于西瓜不同染色體上的共顯性SSR標(biāo)記檢測(cè)‘美月雜交種純度,4對(duì)標(biāo)記的檢測(cè)結(jié)果完全一致,‘美月雜交種中僅混雜了母本自交種,這可能是由于同株雄花花粉被昆蟲傳到雌蕊柱頭所致。分子標(biāo)記鑒定結(jié)果與田間形態(tài)鑒定結(jié)果完全一致,該研究結(jié)果表明利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)檢測(cè)‘美月雜交種純度是切實(shí)可行的。
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