李天芝,于新友,沈志強(qiáng)(.山東綠都生物科技有限公司,山東 濱州 56600;.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東 濱州 56600)
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一步法RT-PCR快速檢測(cè)豬瘟活疫苗中BVDV外源病毒方法的建立
李天芝1,于新友1,沈志強(qiáng)2
(1.山東綠都生物科技有限公司,山東 濱州 256600;2.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東 濱州 256600)
摘 要:為檢測(cè)商品化豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中牛病毒性腹瀉病毒污染,根據(jù)牛病毒性腹瀉病毒5′端非編碼區(qū)基因保守序列設(shè)計(jì)引物,建立了檢測(cè)牛病毒性腹瀉病毒一步法反轉(zhuǎn)錄—聚合酶鏈(RT-PCR)方法,并對(duì)其特異性、敏感性進(jìn)行了研究。該一步法RT-PCR對(duì)牛病毒性腹瀉病毒擴(kuò)增結(jié)果為陽(yáng)性,對(duì)照毒株擴(kuò)增結(jié)果均為陰性,對(duì)牛病毒性腹瀉病毒檢測(cè)的靈敏性為1pg總RNA量,應(yīng)用該方法,檢測(cè)了32批豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品,以上結(jié)果表明該一步法RT-PCR方法檢測(cè)速度快、特異性強(qiáng)、敏感性高,可用于豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中污染的牛病毒性腹瀉病毒外源病毒檢測(cè)。
關(guān)鍵詞:豬瘟;牛病毒性腹瀉病毒;檢測(cè)
豬瘟(CSF)由豬瘟病毒(CSFV)引起的一種豬高度傳染、致死性疾病,我國(guó)將豬瘟列為一類動(dòng)物疫病[1]。牛病毒性腹瀉病(BVD)是由牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)引起的以發(fā)熱、黏膜糜爛潰瘍、腹瀉、咳嗽、持續(xù)性感染與免疫耐受以及懷孕母牛流產(chǎn)、畸胎甚至死胎等為主要特征的牛傳染病[2],我國(guó)將牛病毒性腹瀉病列為禁止入境的二類檢疫對(duì)象。BVDV和CSFV同屬于黃病毒科瘟病毒屬中的成員,BVDV還可引起豬、駱駝、羊、鹿等多種動(dòng)物感染發(fā)病[3],給各國(guó)養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。豬感染BVDV后可產(chǎn)生類似慢性豬瘟的臨床癥狀和病理變化,懷孕母豬可致發(fā)生流產(chǎn),產(chǎn)出畸形胎兒,免疫BVDV污染的豬瘟細(xì)胞毒活疫苗是豬感染BVDV一種重要途徑。BVDV主要通過(guò)生產(chǎn)過(guò)程中使用的牛血清、胰酶、牛睪丸等材料以及容器、設(shè)備污染豬瘟細(xì)胞活疫苗。對(duì)豬感染BVDV的現(xiàn)狀必須有清醒的認(rèn)識(shí)和必要的防控措施。本研究根據(jù)GenBank公布BVDV基因序列,針對(duì)具有很高保守性的5′端非編碼區(qū)基因設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,建立了一種特異、敏感的BVDV檢測(cè)方法,以確保疫苗的安全、有效,為商品化豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中BVDV污染提供一種有效的分子生物學(xué)檢測(cè)方法。
1.1病毒株與病料
牛病毒性腹瀉病毒、豬瘟病毒、豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬偽狂犬病毒、豬細(xì)小病毒、豬圓環(huán)病毒2型等均由本實(shí)驗(yàn)室保存,32批豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品購(gòu)買自不同廠家。
1.2工具酶及試劑盒
AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量試劑盒購(gòu)自愛思進(jìn)生物技術(shù)(杭州)有限公司、DNA Marker、PCR相關(guān)試劑、限制性內(nèi)切酶、MD18-T載體、DNA凝膠回收試劑盒購(gòu)自大連寶生物公司。
1.3RT-PCR引物設(shè)計(jì)與合成
參照GenBank中登錄的BVDV 5′端非編碼區(qū)序列,設(shè)計(jì)1對(duì)引物,上游引物:5′-AGGCTAG CCATGCCCTTAGT-3′,下游引物:5′-TCTGCAGCACCCTAT CAGG-3′,擴(kuò)增BVDV 5′端非編碼區(qū)序列244 bp,引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。
1.4病毒基因組RNA的提取
按AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量試劑盒使用說(shuō)明書提取BVDV的RNA,并提取其他幾種病毒的RNA。
1.5一步法 RT-PCR擴(kuò)增及條件優(yōu)化
以RNA為模板進(jìn)行一步法RTPCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系為20 μL。各參數(shù)為50℃逆轉(zhuǎn)錄30 min,95℃預(yù)變性3 min,然后進(jìn)入95 ℃ 20 S、56 ℃20 S、72 ℃ 20 S,共35個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸8 min。取5 μL產(chǎn)物,1.5%瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果。同時(shí)對(duì)各擴(kuò)增條件進(jìn)行優(yōu)化,包括退火溫度(50~60 ℃梯度溫度,每2 ℃為1個(gè)梯度)、引物濃度(0.1~1.1μmol/L,每0.2μmol/L為1個(gè)梯度)等,反應(yīng)體系均為20μL。
1.6擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
首先取擴(kuò)增產(chǎn)物5μL在1.5%的瓊脂糖凝膠上電泳,用DNA凝膠回收試劑盒回收目的片段。將目的片段與pMD18-T克隆載體在16 ℃恒溫金屬浴中過(guò)夜連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)菌株DH5α。挑取單個(gè)的轉(zhuǎn)化菌落,加LB溶液培養(yǎng)18 h后用質(zhì)粒提取試劑盒抽提質(zhì)粒,用PCR方法進(jìn)行鑒定,將陽(yáng)性克隆送上海生工生物工程股份有限公司進(jìn)行測(cè)序鑒定,將測(cè)序結(jié)果與參照的BVDV序列同源性比較。
1.7特異性試驗(yàn)
分別提取牛病毒性腹瀉病毒、豬瘟病毒、豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬偽狂犬病毒、豬細(xì)小病毒、豬圓環(huán)病毒2型的RNA,用已建立的方法進(jìn)行擴(kuò)增。
1.8敏感性試驗(yàn)
BVDV 病毒提取RNA后定量,然后10倍梯度稀釋提取的病毒基因組RNA,使其分別相當(dāng)于含有10 ng RNA、1 ng RNA、100 pg RNA、10 pg RNA、1 pg RNA、0.1 pg RNA的含量,分別進(jìn)行一步法RT-PCR檢測(cè),確定其敏感性。
1.9重復(fù)性試驗(yàn)
用建立的一步法RT-PCR檢測(cè)方法,檢測(cè)3份牛病毒性腹瀉病毒、豬瘟病毒、豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬偽狂犬病毒、豬細(xì)小病毒、豬圓環(huán)病毒2型,重復(fù)檢測(cè)3次,以驗(yàn)證本方法的重復(fù)性和穩(wěn)定性。
1.10豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中BVDV外源病毒的檢測(cè)
將購(gòu)買的32批豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品稀釋為含有1頭份/200μL作為檢測(cè)樣品進(jìn)行一步法RT-PCR擴(kuò)增BVDV,同時(shí)設(shè)立陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。并同時(shí)參照相關(guān)規(guī)程用細(xì)胞培養(yǎng)法檢驗(yàn)并比較二者的符合性。
2.1擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過(guò)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,在244 bp處可見特異性擴(kuò)增帶,與預(yù)期大小相符(圖1)。挑取PCR鑒定陽(yáng)性的菌液送上海生工生物工程股份有限公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果顯示,插入到T載體的基因片段的核苷酸序列與BVDV(登錄號(hào):KJ620017)的序列相似性為100%。
圖1 牛病毒性腹瀉病毒擴(kuò)增結(jié)果
2.2特異性試驗(yàn)
利用設(shè)計(jì)的引物和確定的最佳擴(kuò)增條件分別對(duì)牛病毒性腹瀉病毒、豬瘟病毒、豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬偽狂犬病毒、豬細(xì)小病毒、豬圓環(huán)病毒2型的核酸進(jìn)行一步法RT-PCR。結(jié)果6個(gè)樣品中只有BVDV能擴(kuò)增出大小為244 bp目的片段,而其他均未擴(kuò)增出相應(yīng)的片段(圖2),表明本試驗(yàn)建立的方法有很好的特異性。
圖2 特異性試驗(yàn)
2.3敏感性試驗(yàn)
取5μ L PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析,分別在約244 bp附近出現(xiàn)特異性條帶,與預(yù)期產(chǎn)物大小相符。從結(jié)果可以看出,引物的一步法RT-PCR檢測(cè)靈敏度可以達(dá)到1 pg RNA(圖3)。
圖3 敏感性試驗(yàn)
2.4重復(fù)性試驗(yàn)經(jīng)過(guò)3次重復(fù)操作,結(jié)果一致,說(shuō)明建立的方法是穩(wěn)定、可靠的。
2.5豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中BVDV外源病毒的檢測(cè)
用建立的BVDV 一步法 RT-PCR檢測(cè)方法,共檢測(cè)了32批商品化豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品,其中有2批有BVDV污染。細(xì)胞培養(yǎng)法的檢測(cè)結(jié)果與一步法 RT-PCR檢測(cè)方法的結(jié)果相同。
范學(xué)政等[4]用RT-PCR方法對(duì)23批次的豬瘟疫苗進(jìn)行BVDV檢測(cè),結(jié)果顯示,5批次豬瘟疫苗被BVDV污染,污染率達(dá)21.74%。范仲鑫等[5]用RTPCR方法對(duì)湖南省內(nèi)銷售的10個(gè)廠家48個(gè)批次的豬瘟細(xì)胞苗進(jìn)行BVDV病毒核酸檢測(cè),結(jié)果:10個(gè)廠家的豬瘟細(xì)胞苗中有5個(gè)廠家檢出BVDV核酸陽(yáng)性,48個(gè)批次中有9批次檢出BVDV核酸陽(yáng)性,陽(yáng)性率為18.75%。因此,必須對(duì)豬瘟活疫苗中的BVDV進(jìn)行嚴(yán)格檢驗(yàn),禁止接種BVDV污染的豬瘟活疫苗,按照《中華人民共和國(guó)獸藥典》(2010年版3部)外源病毒檢驗(yàn)方法,對(duì)豬瘟細(xì)胞毒活疫苗中BVDV外源病毒的檢驗(yàn)主要采取細(xì)胞培養(yǎng)法,該法操作復(fù)雜,耗時(shí)間長(zhǎng),傳統(tǒng)的兩部法RT-PCR檢測(cè)方法時(shí)間長(zhǎng),操作繁瑣,需要先反轉(zhuǎn)錄成cDNA再進(jìn)行PCR擴(kuò)增,本試驗(yàn)建立的BVDV一步法RTPCR檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)單,不需要單獨(dú)做反轉(zhuǎn)錄,反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增一步完成,能在3 h內(nèi)檢出BVDV,不僅節(jié)省了時(shí)間,而且減少了操作步驟,可方便快捷地?cái)U(kuò)增出目的片段,適合于大規(guī)模推廣應(yīng)用。本試驗(yàn)建立的BVDV一步法RT-PCR檢測(cè)方法,共檢測(cè)了32批商品化豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品,其中有2批有BVDV污染,與細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果一致。本試驗(yàn)所建立的方法為豬場(chǎng)基層獸醫(yī)工作者開展豬瘟細(xì)胞毒活疫苗樣品BVDV污染的檢測(cè)提供了一種簡(jiǎn)單、有效的分子生物學(xué)檢測(cè)方法。
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(收稿日期:2015-11-09)
作者簡(jiǎn)介:李天芝(1985-),女,助理研究員,碩士,主要從事動(dòng)物傳染病診斷技術(shù)研究.
基金項(xiàng)目:山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系生豬產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(SDAIT-06-011-14);濱州市科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(2013GG0304)