沈德勝,朱良寬,宋佳音,李克新
(東北林業(yè)大學(xué) 機(jī)電工程學(xué)院,哈爾濱 150040)
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基于改進(jìn)k均值聚類(lèi)方法的林木冠層孔隙度提取
沈德勝,朱良寬*,宋佳音,李克新
(東北林業(yè)大學(xué) 機(jī)電工程學(xué)院,哈爾濱 150040)
摘要:在利用林木冠層半球圖像獲取冠層孔隙度的過(guò)程中,針對(duì)因植被反光現(xiàn)象導(dǎo)致的圖像誤分割或分割不精確,以及傳統(tǒng)k均值聚類(lèi)圖像分割方法易陷入局部最優(yōu)值的問(wèn)題,提出一種新的林木孔隙度提取策略。首先,利用數(shù)字圖像處理方法消除了冠層半球圖像中植被的反光,降低了因植被反光引起孔隙度計(jì)算出現(xiàn)較大誤差的風(fēng)險(xiǎn);然后,將初始聚類(lèi)中心優(yōu)化的k均值聚類(lèi)方法與數(shù)字圖像的數(shù)據(jù)特點(diǎn)相結(jié)合,確定了較為合理的數(shù)據(jù)密度搜索半徑,提出改進(jìn)k均值聚類(lèi)方法對(duì)冠層圖像進(jìn)行兩次聚類(lèi)分割,計(jì)算出冠層孔隙度。最后,將結(jié)果與傳統(tǒng)k均值方法、Otsu法和WinSCANOPY2006a軟件的處理結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明所提的方法是可行且有效的。
關(guān)鍵詞:圖像反光;k均值聚類(lèi);冠層半球圖像;孔隙度
0引言
林木冠層孔隙度是植被結(jié)構(gòu)參數(shù)中重要的組成部分,也是獲取其他冠層結(jié)構(gòu)參數(shù)(如葉面積指數(shù)、植被郁閉度、葉面積等)的重要依據(jù)。冠層孔隙度是冠層圖像中植被部分所占的比例,近年來(lái),由魚(yú)眼鏡頭獲得地面植被半球圖像計(jì)算植被冠層孔隙度的方法深受?chē)?guó)內(nèi)外學(xué)者的青睞,如何探尋一種計(jì)算準(zhǔn)確、精度更高、計(jì)算速度更快的孔隙度獲取方法具有重要意義[1-4]。
目前,應(yīng)用數(shù)字圖像處理技術(shù)處理冠層圖像獲得冠層孔隙度是一種高效實(shí)用的方法,并取得了一系列成果。文獻(xiàn)[2]通過(guò)對(duì)植被半球圖像的藍(lán)色分量進(jìn)行處理,可以有效抑制部分光線對(duì)冠層孔隙度提取的影響,但是當(dāng)圖像中植被部分有較強(qiáng)反光時(shí)孔隙度的計(jì)算結(jié)果并不理想。文獻(xiàn)[3-5]通過(guò)對(duì)低矮植被圖像HIS(色度,飽和度,亮度)顏色空間H分量圖像進(jìn)行圖像分割雖然效果較好,但由于樹(shù)木冠層結(jié)構(gòu)復(fù)雜,H分量的植被區(qū)域與實(shí)際的植被區(qū)域差別較大,其對(duì)H分量圖像的分割結(jié)果并不理想。
針對(duì)上述問(wèn)題,本文提出一種基于改進(jìn)k均值聚類(lèi)的冠層孔隙度提取方法。首先,通過(guò)分析圖像RGB(紅,藍(lán),綠)和HSI顏色空間的色彩結(jié)構(gòu),并結(jié)合圖像形態(tài)學(xué)對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理,旨在消除因樹(shù)木、枝葉等反光現(xiàn)象對(duì)圖像分割的影響;然后,將初始聚類(lèi)中心優(yōu)化的思想與冠層數(shù)字圖像的數(shù)據(jù)特點(diǎn)相結(jié)合,對(duì)傳統(tǒng)k均值聚類(lèi)方法進(jìn)行了改進(jìn),利用改進(jìn)后的k均值聚類(lèi)方法對(duì)去除反光影響的圖像進(jìn)行兩次聚類(lèi)分割,并將兩次聚類(lèi)分割得到的植被區(qū)域合并;最后,將兩次聚類(lèi)分割得到的圖像進(jìn)行二值化處理,利用公式計(jì)算出冠層孔隙度,并將得到的結(jié)果與常規(guī)方法處理結(jié)果進(jìn)行了對(duì)比驗(yàn)證。
1圖像數(shù)據(jù)來(lái)源
實(shí)驗(yàn)用冠層半球圖像來(lái)源于東北林業(yè)大學(xué)帽兒山實(shí)驗(yàn)林場(chǎng)闊葉林實(shí)驗(yàn)樣地,采用帶有魚(yú)眼鏡頭的WinSCANOPY2006a設(shè)備,在樣地內(nèi)由下向上采集闊葉林冠層半球圖像,試驗(yàn)用圖像以WinSCANOPY2006a軟件測(cè)定的冠層孔隙度作為真實(shí)值,用于驗(yàn)證不同方法計(jì)算得到孔隙度的準(zhǔn)確性。
2冠層半球圖像反光區(qū)預(yù)處理
2.1RGB與HSI顏色空間色彩結(jié)構(gòu)分析
RGB和HSI空間的數(shù)字圖像都是三維矩陣,通過(guò)相機(jī)獲得的圖像幾乎都是RGB顏色空間的圖像,RGB顏色空間數(shù)字化程度高,三個(gè)分量數(shù)據(jù)信息模式一致,使得數(shù)據(jù)計(jì)算方便快捷。但是,由于RGB三個(gè)顏色分量的相關(guān)度較高,任一分量的改變都會(huì)改變整個(gè)像素的顏色信息,在圖像處理中容易相互影響,而H分量與I分量相關(guān)度很低,因此若將其轉(zhuǎn)換成HSI顏色空間,則可將亮度分量與彩色圖像中的彩色信息分開(kāi),從而實(shí)現(xiàn)只改變亮度信息而不改變顏色信息。
2.2反光區(qū)處理
反光區(qū)處理的基本流程如圖1所示。
圖1 反光區(qū)處理流程圖Fig.1 Flow chart of reflective processing
RGB與HSI顏色空間轉(zhuǎn)換公式如下:
色度分量為:
(1)
其中
(2)
飽和度分量為:
(3)
亮度分量為:
(4)
應(yīng)用轉(zhuǎn)換公式(1)~公式(4),將原冠層圖像由RGB空間轉(zhuǎn)換為HSI空間,應(yīng)用形態(tài)學(xué)的方法確定天空灰度為0的區(qū)域,將該區(qū)域灰度值修正為正常值,得到新的H分量圖像H_NEW數(shù)據(jù),再用I-λ×H_NEW得到差值圖像(其中λ取值根據(jù)反光程度設(shè)定,反光越強(qiáng)λ越大,反之λ越小)。通過(guò)差值圖像可以得到明顯的反光區(qū),再進(jìn)一步確定反光區(qū)域的位置集合P,對(duì)I中相應(yīng)區(qū)域進(jìn)行減弱,I_NEW=m×I(P)(其中m為亮度調(diào)節(jié)參數(shù))得到新的I分量數(shù)據(jù)I_NEW,將I_NEW與原來(lái)的H分量數(shù)據(jù)和S分量數(shù)據(jù)合成新的圖像HSI_NEW,再將HSI_NEW圖像轉(zhuǎn)化為新的圖像RGB_NEW。
圖2 原圖HSI空間H分量 Fig.2 The H component inHSI space for the original image
圖3 形態(tài)學(xué)處理后H分量Fig.3 The H component aftermorphological processing
圖2、圖4為原圖HSI空間中的H分量圖和I分量圖,圖3為形態(tài)學(xué)處理修正后的H_NEW圖,圖5為I-λ×H_NEW得到的差值圖,圖中的亮區(qū)即樹(shù)葉和樹(shù)干的反光區(qū),圖6、圖7為原RGB圖及去除反光后的RGB_NEW圖像。圖8為去反光處理的對(duì)比結(jié)果,其中(a1),(b1),(c1)為原圖,(a2),(b2),(c2)為去反光后結(jié)果??梢园l(fā)現(xiàn),應(yīng)用本文方法可有效去除反光,并未改變?cè)紙D像非反光區(qū)的顏色信息和反光區(qū)色度信息,保留了圖像的原始數(shù)據(jù)。
圖4 原圖HSI空間I分量Fig.4 The I component in HSI space for the original image
圖5 差值圖像Fig.5 Differencial image
圖6 原RGB圖像Fig.6 The original RGB image
圖7 RGB_NEW圖像Fig.7 RGB_NEW image
(a1)
(a2)
(b1)
(b2)
(c1)
(c2)
表1給出了圖6中樹(shù)干和樹(shù)葉各3處反光區(qū)域、同類(lèi)無(wú)反光區(qū)和去反光后的平均灰度對(duì)比結(jié)果,可以看出,本文去除反光的方法計(jì)算量較小,易于實(shí)現(xiàn)且效果較好,是一種林木冠層圖像反光區(qū)預(yù)處理較實(shí)用的方法。
表1 反光區(qū)處理結(jié)果對(duì)比
本文中的圖像數(shù)據(jù)是以魚(yú)眼鏡頭在樣地內(nèi)由下向上采集闊葉林冠層半球圖像,圖像只有植被和天空兩部分,文中圖像分割的目的是獲取植被和天空區(qū)域的面積即像素?cái)?shù)量,用以計(jì)算孔隙度,但由于部分樹(shù)葉和樹(shù)干有較強(qiáng)的反光現(xiàn)象,直接導(dǎo)致實(shí)際的枝干、樹(shù)葉占空比降低,因此需要對(duì)其進(jìn)行上述(如流程圖1)的預(yù)處理,以提高孔隙度的計(jì)算精度。
3改進(jìn)k均值聚類(lèi)法圖像分割
3.1k均值聚類(lèi)算法
設(shè)對(duì)有N個(gè)數(shù)據(jù)的集合A分為k類(lèi),也就是k個(gè)族,x表示Ci族中的成員,ci表示Ci族中心值[5-8]一般使用公式(5):
(5)
為目標(biāo)收斂函數(shù),dis為集合A的族內(nèi)成員對(duì)族內(nèi)中心點(diǎn)的誤差平方和。k均值聚類(lèi)迭代過(guò)程可參見(jiàn)文獻(xiàn)[5-8],在此不贅述。
3.2改進(jìn)k均值聚類(lèi)方法
k均值聚類(lèi)算法的不足之處在于:算法隨機(jī)選取聚類(lèi)中心,如果初始中心為孤立點(diǎn),會(huì)導(dǎo)致迭代過(guò)程陷入局部最優(yōu)值,得不到最優(yōu)解;迭代的次數(shù)與初始聚類(lèi)中心的選取密切相關(guān),隨機(jī)選取聚類(lèi)中心也會(huì)使每次聚類(lèi)時(shí)間不同,甚至最后的聚類(lèi)結(jié)果也不同,增加了算法的不穩(wěn)定性。針對(duì)冠層圖像的數(shù)據(jù)特點(diǎn)和k均值聚類(lèi)算法的不足,本文結(jié)合數(shù)據(jù)密度和最大化最小距離的方法,對(duì)k均值聚類(lèi)方法進(jìn)行了改進(jìn)。
首先確立統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)的區(qū)域半徑,本文的數(shù)據(jù)區(qū)域半徑 為全體數(shù)據(jù)中任意兩個(gè)數(shù)據(jù)的距離之和的均值。計(jì)算公式如下:
(6)
以r為區(qū)域半徑,統(tǒng)計(jì)任一區(qū)域內(nèi)數(shù)據(jù)的數(shù)量,如果數(shù)量大于Min則表示以該數(shù)據(jù)x為中心r為半徑的區(qū)域?yàn)楦呙芏葏^(qū),x為高密度點(diǎn),統(tǒng)計(jì)所有的高密度點(diǎn)和相應(yīng)的密度。
最大化最小值方法描述如下:[9-10]
(1)假設(shè)G={x1,x2,x3,…,xn}為已選好的高密度點(diǎn)數(shù)據(jù)集,找出其中密度最大的點(diǎn)J1。
(2)在集合G中找到距離J1最遠(yuǎn)的點(diǎn)為J2。
(3)統(tǒng)計(jì)G中其余對(duì)象與J1和J2的距離di1和di2,計(jì)算其中較小的值為min(di1,di2)。
(4)計(jì)算min(di1,di2)中的最大值,即最大的最小距離max(min(di1,di2)),以此xi為J3。
(5)以此類(lèi)推J4=max(min(di1,di2,di3))最終確定k個(gè)初始聚類(lèi)中心點(diǎn)。
需要注意的是:由高密度點(diǎn)和最大化最小距離方法選取的初始聚類(lèi)中心點(diǎn),避免了聚類(lèi)結(jié)果的不確定性,避免了聚類(lèi)局部最優(yōu)的風(fēng)險(xiǎn),可減少迭代次數(shù),由此得到的初始聚類(lèi)中心方法切實(shí)可行。
結(jié)合最大化最小距離方法的改進(jìn)k均值聚類(lèi)過(guò)程描述如下:
Step1:由公式(6)確定數(shù)據(jù)集A的區(qū)域半徑r,對(duì)A中每個(gè)樣本計(jì)算距離在r內(nèi)的數(shù)據(jù)量,若大于Min則為高密度點(diǎn),統(tǒng)計(jì)得到高密度點(diǎn)集G={x1,x2,x3,…,xn}。
Step2:在G中由最大化最小距離的方法確定出k個(gè)初始聚類(lèi)中心。
Step3:由Step2中得到的k個(gè)初始聚類(lèi)中心進(jìn)行k均值聚類(lèi)。
3.3冠層圖像分割實(shí)驗(yàn)
本文采用兩次聚類(lèi)分割的方式:第一次從整個(gè)半球圖像整體差異上區(qū)分天空與植被,第二次以第一次分割出來(lái)的含有細(xì)小枝葉的天空為整體,此時(shí)的待分割對(duì)象雖然很相近,但類(lèi)別很少,易于聚類(lèi)分割。將分割出來(lái)的細(xì)小枝葉與第一次分割出來(lái)的植被區(qū)域合并,剩下的則為天空區(qū)域。由于在可見(jiàn)光波段中,綠色植物對(duì)藍(lán)光的吸收較強(qiáng),在藍(lán)色分量下對(duì)植物的綠色葉片與天空的區(qū)分非常明顯,得到的分割結(jié)果更為準(zhǔn)確,因此選取RGB_NEW中的藍(lán)色分量(如圖9所示)進(jìn)行圖像分割。
冠層半球圖像像素大小為2211×2211,圓形區(qū)域的像素?cái)?shù)量為3 821 941個(gè)。首先,結(jié)合冠層圖像的特點(diǎn),分別取第一次聚類(lèi)分割的類(lèi)別數(shù)k1=3、4、5、6、7,對(duì)去反光圖像進(jìn)行本文方法聚類(lèi)。綜合考慮分析處理結(jié)果和耗時(shí)長(zhǎng)短,選擇k1=6對(duì)圖像進(jìn)行聚類(lèi),結(jié)果如圖10所示,按灰度值大小分為6類(lèi),同一類(lèi)具有相同的灰度值,對(duì)分類(lèi)后的圖像化分為兩類(lèi),黑色為植被區(qū)域,白色為天空區(qū)域,結(jié)果如圖11所示。然后,考慮到還有細(xì)小枝干未被分割出來(lái),對(duì)未分割完全的天空部分再進(jìn)行第二次聚類(lèi)分割,取第二次聚類(lèi)分割的類(lèi)別數(shù)為k2=2,結(jié)果如圖12所示??梢?jiàn)利用本文的方法幾乎可以將植被部分完全分割出來(lái),取得了較好的冠層圖像分割效果。
圖9 RGB_NEW藍(lán)色分量圖Fig.9 Blue componentdiagram of RGB_NEW
圖10 第一次k1=6聚類(lèi)Fig.10 The first time k1=6clustering result
圖11 第一次k1=6聚類(lèi)效果圖及細(xì)節(jié)Fig.11 The first time k1=6clustering result
圖12 第二次k2=2聚類(lèi)效果圖及細(xì)節(jié)Fig.12 The second time k2=2clustering result
4孔隙度計(jì)算
孔隙度為天空區(qū)域所占的面積與植被區(qū)域和天空區(qū)域面積和的比值,計(jì)算公式如下[11-12]:
(7)
式中:T為孔隙度;Ns為天空像素總數(shù);Nl為植被部分像素總數(shù),由RGB_NEW的藍(lán)色分量分割結(jié)果得出天空像素總數(shù)Ns=409 600,植被部分像素總數(shù)Nl=3 412 341,經(jīng)計(jì)算得T=10.71%。
表2為針對(duì)冠層圖像數(shù)據(jù)利用傳統(tǒng)k均值聚類(lèi)與本文算法選取不同k值時(shí)所花費(fèi)的時(shí)間和聚類(lèi)次數(shù)的對(duì)比,可以看出,本文方法可在一定程度上減少聚類(lèi)次數(shù),降低了聚類(lèi)時(shí)間。
表2 傳統(tǒng)k均值與本文方法聚類(lèi)時(shí)間對(duì)比
目前,關(guān)于孔隙度的計(jì)算有直接測(cè)量法和間接測(cè)量法,直接測(cè)量法中有落葉收集法、斜點(diǎn)樣方法等,測(cè)量準(zhǔn)確但費(fèi)時(shí)費(fèi)力實(shí)現(xiàn)性差;間接測(cè)量法中有基于輻射量的方法和光學(xué)儀器法,測(cè)量?jī)x器有HemiView、LAI-2000、CI-110、TRAC、DHP等,其中,WinSCANOPY2006a冠層圖像分析儀作為一種通過(guò)間接測(cè)量法獲得林木冠層參數(shù)的商業(yè)化儀器,測(cè)量精度較高,操作方便,在同類(lèi)產(chǎn)品中測(cè)量效果較好,在業(yè)內(nèi)受到廣泛的認(rèn)可,因此本文以WinSCANOPY2006a冠層圖像分析儀的測(cè)量結(jié)果作為孔隙度真實(shí)值,用以驗(yàn)證不同方法孔隙度計(jì)算結(jié)果的有效性。
表3為針對(duì)采集的10幅冠層半球圖像分別利用Otsu法、傳統(tǒng)k均值方法及本文方法進(jìn)行孔隙度提取,再將WinSCANOPY2006a軟件的計(jì)算結(jié)果與不同方法的計(jì)算結(jié)果相對(duì)比。圖13為根據(jù)10幅圖像所得三種方法的孔隙度數(shù)據(jù)和WinSCANOPY2006a軟件的處理結(jié)果,結(jié)果表明,相比傳統(tǒng)k均值方法和Otsu方法,本文方法最接近WinSCANOPY2006a軟件的處理結(jié)果,所得到的冠層孔隙度更準(zhǔn)確。
圖13 幾種方法計(jì)算結(jié)果對(duì)比圖Fig.13 The comparison charts of results with different methods
圖 號(hào)孔隙度/%Otsu算法傳統(tǒng)k均值算法本文方法WinSCANOPY2006a113.2812.4810.3210.67215.2811.8710.169.39317.3513.4511.4910.97414.1711.149.649.34511.8611.869.649.15613.9013.2610.8110.21717.4817.2414.7214.31810.8010.588.108.58912.1611.9310.149.95109.789.457.837.74
表4給出了三種方法與WinSCANOPY2006a處理結(jié)果的平均誤差對(duì)比。由表4可以看出,本文方法平均誤差小于5%,經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析得到與WinSCANOPY2006a的結(jié)果相關(guān)系數(shù)R=0.978 6,決定系數(shù)R2=0.926 1二者具有很高的相關(guān)性,說(shuō)明了本文方法精度較高,結(jié)果較Otsu法和傳統(tǒng)k均值法更為精確。
表4 三種方法與WinSCANOPY2006a
5結(jié)論與討論
本文提出了一種新的林木冠層孔隙度提取方法,該方法考慮了植被反光現(xiàn)象對(duì)圖像分割的影響,通過(guò)對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理有效地去除了半球圖像的反光,并利用改進(jìn)k均值聚類(lèi)方法對(duì)預(yù)處理后的圖像進(jìn)行兩次聚類(lèi)分割,計(jì)算出冠層孔隙度。通過(guò)實(shí)驗(yàn)可以看出,本文提出的方法去除冠層半球圖像反光效果較好,而且在聚類(lèi)分割的效率和精確度方面具有明顯的優(yōu)勢(shì),相比傳統(tǒng)k均值方法和Otsu方法,所得到的冠層孔隙度更準(zhǔn)確,為森林生長(zhǎng)狀況分析提供了有效的依據(jù),為冠層孔隙度的獲取提供了一種新的方法和途徑。
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Extraction of Vegetation Hemisphere Image Porosity Based onImproved k-means Clustering Method
Shen Desheng,Zhu Liangkuan*,Song Jiayin,Li Kexin
(College of Mechanical and Electrical Engineering,Northeast Forestry University,Harbin 150040)
Abstract:Forest canopy hemisphere images can be used to capture the canopy porosity.However,the reflective phenomenon of vegetation can easily lead to image segmentation by mistake or inaccuracy,and the traditional k-means clustering image segmentation method is easy to fall into local optimal value,therefore a novel porosity extraction method was proposed in this paper.Firstly,the digital image processing technology was applied to eliminate the reflection of vegetation in the canopy hemisphere images,which reduced the risk of a larger porosity calculation error caused by vegetation reflection.Then,the method of k-means clustering algorithm was combined with the data characteristics of digital image to determine a reasonable searching radius of data density,and the image after being removed the reflective was segmented twice by the improved k-means clustering method.Finally,the canopy porosity was computed and the result was compared with the traditional k-means method,Otsu method,and WinSCANOPY2006a software processing results.The experimental results showed that the proposed method was feasible and effective.
Keywords:reflective image;k-means clustering;canopy hemisphere image;porosity
中圖分類(lèi)號(hào):S718.42
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1001-005X(2016)02-0014-05
作者簡(jiǎn)介:第一沈德勝,碩士研究生。研究方向:圖像處理技術(shù)林業(yè)應(yīng)用。*通信作者:朱良寬,博士,副教授。研究方向:林業(yè)信息智能檢測(cè)。Email:zhulk@126.com
基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31370710);高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專(zhuān)項(xiàng)科研基金資助(20110062110002)
收稿日期:2015-11-17
引文格式:沈德勝,朱良寬,宋佳音,等.基于改進(jìn)k均值聚類(lèi)方法的林木冠層孔隙度提取[J].森林工程,2016,32(2):14-18.