劉國(guó)才 胡澤田 朱蘇雨 袁媛 劉科 吳崢 張九堂 莫逸
摘要:針對(duì)腫瘤放療生物靶區(qū)高精度勾畫難題,根據(jù)頭頸部腫瘤PET(positron emission computed tomography)影像特點(diǎn),提出了腫瘤PET圖像分割隨機(jī)游走方法.首先,根據(jù)PET SUV(standardized uptake value)影像,采用三維自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)和數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)膨脹方法確定隨機(jī)游走方法的種子點(diǎn),將包含腫瘤的感興趣區(qū)域分為核心腫瘤區(qū)域(標(biāo)記為前景種子點(diǎn))、正常組織區(qū)域(標(biāo)記為背景種子點(diǎn))和待定區(qū)域.然后,利用頭頸部腫瘤和周圍正常組織PET圖像具有不同的對(duì)比度紋理特征,將PET SUV及其對(duì)比度紋理值作為隨機(jī)游走方法中邊的權(quán)值計(jì)算依據(jù).實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該法不僅比傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法平均提速9.34倍,而且,以臨床醫(yī)生手工勾畫的大體腫瘤區(qū)作為參考標(biāo)準(zhǔn),相似度平均提高32.5%(P<0.05).本文方法能夠有效地自動(dòng)勾畫頭頸部腫瘤放療生物靶區(qū).
關(guān)鍵詞:醫(yī)學(xué)圖像分割;隨機(jī)游走;區(qū)域生長(zhǎng);生物靶區(qū);頭頸癌
中圖分類號(hào):TP391.4 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1674-2974(2016)02-0141-09
18F-脫氧葡萄糖(18FDG)正電子發(fā)射斷層掃描(positron emission computed tomography, PET)是一種在分子水平上非侵入性的生物學(xué)特性成像方法,是核醫(yī)學(xué)影像最先進(jìn)的分子影像技術(shù)之一,目前已被廣泛應(yīng)用于惡性腫瘤的檢測(cè)和分期,并已成為當(dāng)前腫瘤生物調(diào)強(qiáng)放療計(jì)劃和療效評(píng)估研究的重要影像技術(shù)[1-3].基于PET影像的高精度腫瘤生物靶區(qū)勾畫是腫瘤放療計(jì)劃和療效評(píng)估的基礎(chǔ),但腫瘤PET影像不僅信噪比低,而且空間分辨率低、部分容積效應(yīng)嚴(yán)重,頭頸部腫瘤周圍正常組織的18FDG標(biāo)準(zhǔn)攝取值(standardized uptake value, SUV)通常還和腫瘤的SUV非常接近,因此,PET影像中的腫瘤邊界通常模糊,且與毗鄰正常組織的分界不清晰.腫瘤內(nèi)部還具有各向異性的生物學(xué)特性,因此,高精度的腫瘤生物靶區(qū)勾畫非常困難.
腫瘤生物靶區(qū)勾畫本質(zhì)上是腫瘤PET圖像分割問題.隨機(jī)游走(random walk, RW)是一種基于圖論的交互式圖像分割方法[4-6],它將圖像的分割問題轉(zhuǎn)化為圖的Dirichlet最優(yōu)化問題[5].隨機(jī)游走圖像分割算法在圖像像素?cái)?shù)量比較少的情況下,分割速度快,分割效果好,特別是在處理含有強(qiáng)噪聲、弱邊界或缺失邊界、有模棱兩可的圖像區(qū)域時(shí)顯示出了突出優(yōu)勢(shì).這些特性使得隨機(jī)游走算法非常適合處理PET圖像.Bagci等[7]和Onoma等[8]最先將隨機(jī)游走方法應(yīng)用在肺部腫瘤PET圖像分割中,并取得不錯(cuò)的效果.但由于頭頸部解剖結(jié)構(gòu)復(fù)雜,目前尚未見有關(guān)將隨機(jī)游走方法應(yīng)用于三維頭頸癌PET圖像分割的文獻(xiàn).
隨機(jī)游走分割結(jié)果一方面依賴于種子點(diǎn)的位置和數(shù)量,另一方面依賴于頂點(diǎn)間邊的權(quán)值計(jì)算方法.種子點(diǎn)越多,提供的前景與背景區(qū)域信息就越多,相應(yīng)的分割結(jié)果就越令人滿意 [9]. 我們也發(fā)現(xiàn)腫瘤PET圖像分割隨機(jī)游走問題的求解不僅需要提供正確標(biāo)記的腫瘤和非腫瘤種子點(diǎn),而且種子點(diǎn)的數(shù)目和位置對(duì)圖像分割結(jié)果有很大影響.不合適的種子點(diǎn)標(biāo)記,可使隨機(jī)游走問題無法有效求解;種子點(diǎn)數(shù)目不充足,可導(dǎo)致分割結(jié)果不理想.但是,在三維PET情況下,人工選擇種子點(diǎn)不僅效率十分低下,而且種子點(diǎn)不足難以得到令人滿意的分割結(jié)果,尤其對(duì)于PET SUV圖像中生物特性各向異性的腫瘤分割更是如此.因此,我們根據(jù)頭頸癌PET SUV分布特點(diǎn),提出采用三維自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)和數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)膨脹方法,將包含腫瘤的感興趣區(qū)域分為核心腫瘤區(qū)域、正常組織區(qū)域和待定區(qū)域三類,并將核心腫瘤區(qū)域全部體素點(diǎn)標(biāo)記為腫瘤分割隨機(jī)游走問題的生物靶區(qū)種子點(diǎn),同時(shí)將正常組織區(qū)域全部體素點(diǎn)標(biāo)記為非生物靶區(qū)種子點(diǎn),這樣只需要對(duì)待定區(qū)域的體素點(diǎn)進(jìn)行隨機(jī)游走分割.這不僅使隨機(jī)游走問題的求解速度顯著提高,而且大量的種子點(diǎn)使腫瘤分割結(jié)果更準(zhǔn)確.另一方面,我們發(fā)現(xiàn)頭頸部腫瘤和其周圍正常組織PET SUV圖像具有不同的對(duì)比度紋理特征,提出一種基于PET SUV及其對(duì)比度紋理特征量的腫瘤分割隨機(jī)游走頂點(diǎn)間邊的權(quán)值計(jì)算方法,以便更好地區(qū)分腫瘤和其周圍高SUV的正常組織,進(jìn)一步提高腫瘤分割結(jié)果精度.
1經(jīng)典隨機(jī)游走方法
受條件限制,我們無法獲取每個(gè)病例的病理標(biāo)本作為金標(biāo)準(zhǔn).因此,我們邀請(qǐng)3位經(jīng)驗(yàn)豐富的放療科醫(yī)生獨(dú)立地對(duì)每個(gè)病例分別進(jìn)行手工勾畫大體腫瘤靶區(qū)(gross tumor volume,GTV),然后由另外一位經(jīng)驗(yàn)豐富的放療科主任醫(yī)師綜合以上3位醫(yī)生勾畫結(jié)果給出最終的GTV,我們將這個(gè)最終的GTV作為參考標(biāo)準(zhǔn)(ground truth, GT).為了驗(yàn)證提出方法的性能,本文采用Dice相似性(similarity, SIM)、靈敏性(sensitivity, SEN)和特異性(specificity, SPE)作為定量評(píng)價(jià)指標(biāo).
3.1性能指標(biāo)
定義1相似性是指實(shí)驗(yàn)方法所得勾畫結(jié)果與金標(biāo)準(zhǔn)的重合程度.SIM值越大表明兩者幾何形狀重合得更好.定義為:
3.2與傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法性能比較
有研究[16]指出:在三維下的隨機(jī)游走分割算法中,采取三維26-鄰域來構(gòu)造圖所取得的分割效果最佳.因此,本文采用三維26-鄰域來描述三維空間內(nèi)體素與其相鄰體素的關(guān)系.為了便于比較,且根據(jù)文獻(xiàn)[5],本文對(duì)于所有隨機(jī)游走方法選取β,β1和β2值均為90.為了簡(jiǎn)便起見,我們將手工選擇種子點(diǎn)和未將紋理引入權(quán)值函數(shù)(即β2=0)的隨機(jī)游走算法記為傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法.圖4給出了不同種子點(diǎn)選擇方法所得到的隨機(jī)游走分割結(jié)果.圖4(b)和圖4(j)是手工選取的種子點(diǎn),圖4(c)和圖4(k)是本文基于三維自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)方法自動(dòng)選取的種子點(diǎn).從分割結(jié)果來看,用手工選取種子點(diǎn)的隨機(jī)游走方法分割效果并不理想,圖4(f)和圖4(n)顯示結(jié)果都出現(xiàn)了欠分割.這是因?yàn)樵谌S圖像分割中,醫(yī)學(xué)圖像情況復(fù)雜、數(shù)量較多,手工選取種子點(diǎn)費(fèi)時(shí)費(fèi)力且?guī)в泻艽蟮闹饔^性,種子點(diǎn)太少不足以表征前景和背景區(qū)域的特征,造成分割結(jié)果不理想.本文提出的自動(dòng)選擇種子點(diǎn)方法是通過大量實(shí)驗(yàn),在保證較好的分割結(jié)果和較快的分割速度前提下選擇得到的.本文方法在執(zhí)行過程中不需要人工干預(yù)選擇種子點(diǎn),從而在保證分割結(jié)果精確度的前提下大大提高了方法的執(zhí)行效率.
圖4(a)中黑色方框內(nèi)的腫瘤和正常組織的PET SUV很相近,腫瘤組織與其右側(cè)腮腺毗鄰,邊界沒有明顯的界限,此時(shí)(11)式中(Ii-Ij)2趨近為0,而相應(yīng)的腫瘤和正常組織對(duì)比度紋理則有明顯界限(見圖4(d)黑色框內(nèi)),此時(shí)(Ci-Cj)2非0.圖4(i)與圖4(l)也是類似情況,圖4(i)中腫瘤不僅與其左側(cè)的腮腺邊界模糊,而且與其下方的小腦組織也沒有明顯的界限.本文提出的改進(jìn)的權(quán)值函數(shù),將PET圖像的SUV信息與PET圖像對(duì)比度紋理聯(lián)合起來,兩者融合后的相應(yīng)邊權(quán)值wij將比僅考慮SUV時(shí)減小,從而有利于正確區(qū)分腫瘤和高SUV正常組織.(外圍十字點(diǎn)集:背景種子點(diǎn),中間星號(hào)點(diǎn)集:前景種子點(diǎn),封閉曲線:腫瘤輪廓,前兩行為本實(shí)驗(yàn)的一例病例,后兩行為另外一例病例的實(shí)驗(yàn)結(jié)果)
圖5,圖6和圖7給出了本文自動(dòng)選取得到種子點(diǎn)的分割結(jié)果與傳統(tǒng)手工選取種子點(diǎn)隨機(jī)游走分割結(jié)果定量比較.從圖5可以看出,本文方法性能明顯優(yōu)于傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法.本文方法分割結(jié)果比傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法分割結(jié)果與參考標(biāo)準(zhǔn)的相似度平均提高32.5%,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t檢驗(yàn): H=1, P<0.05).傳統(tǒng)手工選取種子點(diǎn)數(shù)量不足造成了傳統(tǒng)隨機(jī)游走三維圖像分割中出現(xiàn)欠分割(見圖4(f)和圖4(n)所示).因此,這種情況在特異性指標(biāo)上會(huì)高于本文方法,但是靈敏性卻很低.單一的特異性高沒有實(shí)際意義,而本文方法分割結(jié)果卻能同時(shí)具有較高的靈敏度和特異性,如圖6和圖7所示.
表1給出了本文方法與傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法運(yùn)行的CPU時(shí)間對(duì)比結(jié)果.從表1可以看出,本文方法的運(yùn)行時(shí)間要明顯少于傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法的運(yùn)行時(shí)間,本文提出的方法比傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法平均提速9.34倍左右,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t檢驗(yàn): H=1, P<0.05).
3.3與傳統(tǒng)閾值法比較
為進(jìn)一步檢驗(yàn)方法的性能,我們還將本文方法的分割結(jié)果同時(shí)與經(jīng)典的40%最大SUV值(記為40% SUVmax)閾值法和SUV 2.5閾值法(記為SUV 2.5)的分割結(jié)果進(jìn)行了比較.從圖8可以直觀地看到40% SUVmax閾值法和SUV 2.5閾值法都將與腫瘤毗鄰的正常組織包括進(jìn)來了(見圖8(c)(d)中箭頭所指區(qū)域).傳統(tǒng)手工選取種子點(diǎn)數(shù)量不足造成了傳統(tǒng)隨機(jī)游走三維圖像分割效果并不理想,圖5,圖6和圖7中顯示,對(duì)于有些病例,傳統(tǒng)隨機(jī)游走分割效果甚至不如40% SUVmax閾值法和SUV 2.5閾值法的分割效果好,這也證實(shí)了隨機(jī)游走算法依賴種子點(diǎn)的數(shù)量和位置,種子點(diǎn)數(shù)量不足導(dǎo)致傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法分割效果并不理想.而本文提出的方法卻能夠得到較好的分割結(jié)果,如圖8(b)所示.本文所提方法的分割結(jié)果光滑圓潤(rùn),沒有離散點(diǎn),充分顯示了本文方法的優(yōu)越性.
4結(jié)論
本文在三維自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)方法的基礎(chǔ)上提出一種新穎的自動(dòng)選取腫瘤PET分割隨機(jī)游走種子點(diǎn)的方法.利用PET圖像SUV的分布特點(diǎn),通過三維自適應(yīng)區(qū)域生長(zhǎng)方法結(jié)果來確定隨機(jī)游走種子點(diǎn).由此得到的種子點(diǎn),不僅數(shù)目充足,減少了圖中未標(biāo)記節(jié)點(diǎn)的數(shù)目,使計(jì)算時(shí)間大大減少,計(jì)算速度明顯提高;而且位置合理,充分地利用PET圖像的全信息,可以很好地表示腫瘤區(qū)域和正常區(qū)域的特征.本研究還將PET圖像基于NGTDM提取的對(duì)比度紋理特征引入隨機(jī)游走分割方法的權(quán)函數(shù)中,改進(jìn)后的權(quán)函數(shù)自適應(yīng)地融合了PET SUV特點(diǎn)與PET圖像對(duì)比度紋理特征,進(jìn)一步提高了PET圖像分割精度.
實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,針對(duì)不同頭頸癌PET圖像分割任務(wù),本文提出的分割方法比傳統(tǒng)隨機(jī)游走方法均表現(xiàn)出更好的分割效果和更快的分割速度,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.而且在與腫瘤毗鄰的正常組織具有與腫瘤區(qū)域相似SUV值等較難分割情況下,該方法利用PET圖像紋理信息改進(jìn)了腫瘤分割的準(zhǔn)確性.該方法還有待大規(guī)模的臨床研究,以確定其臨床應(yīng)用價(jià)值.
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