楊 柳,陳宇飛(吉林工商學院食品工程學院,吉林長春130507)
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環(huán)導等溫擴增(LAMP)技術(shù)在奶牛常見疾病診斷中的應用
楊柳,陳宇飛
(吉林工商學院食品工程學院,吉林長春130507)
奶牛養(yǎng)殖業(yè)作為新興產(chǎn)業(yè)和朝陽產(chǎn)業(yè),得到了快速發(fā)展,與此同時,奶牛各類疾病發(fā)病率尤其是普通病的發(fā)病率居高不下,嚴重影響著我國奶牛業(yè)的健康發(fā)展和乳品安全。徐孝宙等[1]對奶牛的疾病進行調(diào)查研究,發(fā)現(xiàn)乳房炎、子宮內(nèi)膜炎、腐蹄病發(fā)病率高,為奶牛3大常見疾病。王君偉等[2]研究發(fā)現(xiàn),在各種奶牛傳染病中,布?。ú剪斁。┡c結(jié)核病危害最為嚴重。
目前,奶牛疾病診斷常用的方法有細菌分離及生化鑒定法、免疫膠體金法等傳統(tǒng)檢測方法和PCR分子生物學檢測法[3-5]。傳統(tǒng)的細菌分離及生化鑒定法培養(yǎng)要求高,診斷難度大,所需時間長;RCR檢測方法雖然敏感度較高,但是需要依賴昂貴復雜的精密儀器,難以在條件較差的基層推廣普及應用[6]。因此,建立一種快速、簡便、準確的奶牛疾病診斷技術(shù)十分重要。
本文針對環(huán)介導等溫擴增技術(shù)在奶牛5種常見疾病診斷中的應用情況進行綜述,分析環(huán)介導等溫擴增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術(shù)在奶牛常見疾病診斷中應用的優(yōu)勢,旨在為LAMP技術(shù)在奶牛疾病診斷中更深入的應用提供一定的參考。
環(huán)介導等溫擴增(loop-mediated isothermal am?plification,LAMP)是Notomi等在2000年建立的一種新的體外擴增特異DNA片段的分子生物學技術(shù)[7]。
LAMP技術(shù)是在65℃恒溫條件下進行核酸快速擴增,利用兩條特異性內(nèi)引物和兩條特異性外引物識別靶基因上的六個區(qū)域,其DNA聚合酶具有鏈置換活性,幾十分鐘即可完成核酸擴增[8]。
2.1乳房炎診斷奶牛乳房炎是世界奶牛養(yǎng)殖業(yè)中發(fā)病率最高、流行最快,造成損失最大的疾病之一,在奶牛泌乳期發(fā)病率高達78%以上[9]。該病是由奶牛乳腺組織受到物理、化學、微生物刺激所發(fā)生的一種炎性反應。主要影響奶牛泌乳機能,可導致產(chǎn)奶量減少,乳品質(zhì)下降。乳房炎的預防與治療難度很大,原因主要在于其致病菌的多樣性和易感牛、病原、環(huán)境之間的相互作用。
賀婷等[10]應用環(huán)介導等溫擴增技術(shù),建立了鏈球菌性乳房炎LAMP可視化檢測方法,對鏈球菌檢測的敏感性最高達到52 fg/μf,是普通PCR方法的10倍。
彭清潔等[11]以FIP、BIP為內(nèi)引物,以F3、B3為外引物對牛支原體DNA進行恒溫擴增,建立了牛支原體引起奶牛乳房炎的環(huán)介導等溫擴增方法,給牛支原體病的臨床診斷帶來了極大的方便。
2.2子宮內(nèi)膜炎診斷奶牛子宮內(nèi)膜炎是最常見的一種奶牛生殖器官疾病,是造成奶牛不孕不育的主要因素之一,是降低奶牛飼養(yǎng)戶利益的重要原因,是制約奶牛事業(yè)發(fā)展的大敵。
奶牛子宮內(nèi)膜炎現(xiàn)檢出的主要病原菌包括化膿性鏈球菌、大腸桿菌、葡萄球菌、變形桿菌、乳鏈球菌、綠膿桿菌、化膿性棒狀桿菌等。
唐婕等[12]建立了能引起多種動物,如豬、牛、羊、禽和人類感染,出現(xiàn)乳房炎、子宮內(nèi)膜炎的化膿隱秘桿菌,曾被稱為化膿棒狀桿菌、化膿放線菌的LAMP檢測方法。
2.3腐蹄病診斷奶牛腐蹄病是一種急性高度接觸性傳染病,發(fā)生在反芻動物趾間,患有腐蹄病的奶牛通常表現(xiàn)為精神萎靡、食欲減退、產(chǎn)奶量下降,嚴重者將會面臨淘汰。奶牛腐蹄病占奶牛疾病的40%以上,患腐蹄病奶牛的淘汰率占總淘汰率的19%,因此加強該病的預防尤為重要[13]。
多數(shù)學者認為,奶牛腐蹄病的主要病原體是壞死桿菌和節(jié)瘤擬桿菌,該病的發(fā)生主要是由壞死桿菌和節(jié)瘤擬桿菌共同感染而引起的[14]。
Sun[15-17]等利用白細胞毒素基因作為擴增靶基因,建立了檢測奶牛腐蹄病壞死桿菌的環(huán)介導等溫擴增方法(Fn-LAMP)和節(jié)瘤擬桿菌環(huán)介導等溫擴增方法(Dn-LAMP)。
兩種方法不需特殊的儀器和昂貴的檢測試劑,在電子恒溫水浴鍋內(nèi)1 h即可完成奶牛腐蹄病壞死桿菌和節(jié)瘤擬桿菌的檢測,結(jié)果肉眼可見。Fn-LAMP和Dn-LAMP檢測能力為1 CFU/ mL,與PCR法相比,符合率為92.0%。研究結(jié)果顯示,F(xiàn)n-LAMP和Dn-LAMP給合可用于奶牛腐蹄病的流行病學調(diào)查。
2.4布魯菌病診斷布魯菌病是重要人獸共患慢性傳染病[17],被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)列為必須通報的傳染病之一,我國將其列為二類動物疫病[2]。
許鄒亮等[18]建立了布魯菌環(huán)介導等溫擴增可視化檢測方法,該方法最低檢出限為17 fg,與B4/ B5PCR方法進行比較,這兩種方法的結(jié)果符合率為85.0%,且LAMP方法的敏感性高于B4/B5PCR。
藺國珍[19]建立了布魯菌快速檢測LAMP方法,從奶樣和血樣中檢出6個種的布魯菌病原,所能檢測出的最低限度為9 fg/μL,較PCR方法高出10倍。
2.5結(jié)核病診斷奶牛結(jié)核病是由分支桿菌屬牛分枝桿菌引起的一種慢性消耗性傳染病,由于該病也感染人,所以是人獸共患病。
陳偉[20]針對結(jié)核分枝桿菌和牛分枝桿菌共有的基因序列RV3877設計特異性引物,能檢測出結(jié)核分枝桿菌與牛分枝桿菌,并且有很高的特異性,靈敏度達到16個菌/模板。
3.1診斷特異性強在奶牛常見疾病診斷方面,與傳統(tǒng)診斷方法以及PCR檢測方法相比,LAMP技術(shù)具有了更強的特異性。主要原因是:LAMP技術(shù)是利用2對引物(內(nèi)引物與外引物),與靶序列上的6個特異性部位進行準確結(jié)合發(fā)生擴增反應,如果6個區(qū)域中的任何區(qū)域與引物不匹配,則都不能進行核酸擴增。
3.2診斷靈敏度高賀婷[6]對奶牛鏈球菌性乳房炎可視化LAMP檢測方法進行研究,得出LAMP對無乳鏈球菌、停乳鏈球菌和乳房鏈球菌DNA檢出限依次為52.6 fg/μf,48.9 fg/μf,3.55 fg/μf,敏感性為100%。唐婕等[12]對化膿性棒狀桿菌LAMP檢測方法的研究,靈敏度在DNA水平上可達112 fg。綜合各文獻數(shù)據(jù),可得出結(jié)論:與PCR診斷方法相比,LAMP檢測靈敏度通常是常規(guī)PCR的10~100倍。
3.3診斷速度快許鄒亮等[18]對布魯菌環(huán)介導等溫擴增方法的研究,LAMP反應在60 min完成。
綜合各文獻數(shù)據(jù),可得出結(jié)論:LAMP技術(shù)用于奶牛疾病診斷的基本反應可以在60~90 min內(nèi)完成,如果加入環(huán)引物,則能使反應時間縮短為30~45 min。
3.4診斷更便捷在LAMP檢測體系中可加入鈣黃綠素熒光染料,這樣試驗的結(jié)果即可產(chǎn)生綠色熒光,使得目視檢測效果好。利用LAMP技術(shù)開發(fā)配套診斷試劑盒,只需對檢測原料進行簡單的DNA提取,就可以完成直接的擴增和診斷。與PCR方法相比,LAMP診斷方法不需要購買昂貴的儀器設備,只需配一臺普通的水浴鍋,就可以完成現(xiàn)場檢測,特別適用于基層、農(nóng)村、偏遠山區(qū)進行奶牛常見疾病的診斷。
LAMP檢測技術(shù)非常適用于進行奶牛常見疾病的實時定性檢測。相信隨著LAMP檢測技術(shù)的不斷完善,在不久的將來,它將逐漸取代傳統(tǒng)的診斷方法以及PCR檢測方法,推動奶牛常見疾病診斷技術(shù)朝著更準確、更廉價、更便捷的方向發(fā)展。
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中圖分類號:S823.8
文獻標志碼:A
文章編號:0529-6005(2016)05-0064-02
收稿日期:2015-09-10
作者簡介:楊柳(1975-),女,副教授,本科,主要從事畜產(chǎn)品加工及安全檢測研究,E-mail:yl0313@163.com
通訊作者:陳宇飛,E-mail:254447088@163.com