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獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的設(shè)計與構(gòu)建

2015-10-14 03:27甘海霞趙曉彤
廣西農(nóng)學(xué)報 2015年2期
關(guān)鍵詞:管理系統(tǒng)數(shù)字化信息

趙++培++甘海霞++趙曉彤++魏++澍+張雅為++楊國麗++顧貴波

摘要:文章闡述了獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)( LIMS)在實驗室實際管理中的意義和構(gòu)建原則,分析了遼寧省動物瘦病預(yù)防控制中心的實驗室管理系統(tǒng)的構(gòu)建模塊和實現(xiàn)功能,對獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)的功能和未來發(fā)展提出建議。

關(guān)鍵詞:獸醫(yī)實驗室;信息;管理系統(tǒng);數(shù)字化

中圖分類號:C931.6

文獻標識碼:A

文章編號:1003-4374( 2015 )02-0052-03

The design and building of Vet LIMS-Case study of building Vet LIMS of Liaoning Province

Zhao Pei et al

Abstract: This paper has introduced the significance and building principal of Vet LIMS in actual labmanagement, analyzed the building module and functions of LIMS iii Animal disease prevention andcontrol center of Liaoning Province, and put forward several suggestions to the Vet LIMS's functions andfuture development.

Key words: Vet lab; information; management system; digitization

在當前獸醫(yī)實驗室的業(yè)務(wù)種類逐年增多、檢測任務(wù)量日漸加大、信息量成倍增長的背景下,獸醫(yī)實驗室的業(yè)務(wù)接待、實驗室檢測以及結(jié)果的反饋、數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析等各環(huán)節(jié)的準確性、時效性和可追溯性有了更高層次的質(zhì)量要求,而傳統(tǒng)的人工管理方式和純?nèi)斯さ臄?shù)據(jù)整理方法遠遠滯后于信息量倍增的獸醫(yī)實驗室的需求,迫切需要通過計算機網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、數(shù)據(jù)處理技術(shù)建立現(xiàn)代化的實驗室信息管理系統(tǒng)。遼寧省動物疫病預(yù)防控制中心于2013年開始構(gòu)建的獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng),應(yīng)用了當前較為先進的軟件開發(fā)技術(shù),實現(xiàn)了對實驗室的全面的、專業(yè)的管理,實現(xiàn)實驗過程的全程監(jiān)控,實現(xiàn)對實驗過程中的人、機、料、法、環(huán)等環(huán)節(jié)的管理,來提高實驗室質(zhì)量控制和管理水平。獸醫(yī)實驗室管理系統(tǒng)的應(yīng)用,也成為衡量一個實驗室現(xiàn)代化水平的重要標志之一。

實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)簡介

實驗室信息管理系統(tǒng)( Laboratory Information Manage- ment System英文縮寫LIMS)于20世紀60年代末起源于美國。它是由計算機硬件和應(yīng)用軟件組成的,實現(xiàn)以實驗室為核心的、整體的全方位管理,能夠完成實驗室數(shù)據(jù)和信息的采集、收集、分析和報告,它集人員管理、樣品管理、事務(wù)管理、資源管理、數(shù)據(jù)管理、報表管理等諸多模塊為一體,使實驗室的業(yè)務(wù)流程各步驟環(huán)環(huán)相扣,是一套完整的實驗室綜合管理和質(zhì)量控制體系。

近幾十年,國際上出臺了許多與LIMS相關(guān)的標準和技術(shù)細則,比如:美國環(huán)保局(EPA)制訂的有關(guān)健康和環(huán)境產(chǎn)品的管理規(guī)范;歐共體(EEC)頒布的實驗室認證指南;國際標準化機構(gòu)ISO,制訂的IS0-9000系列規(guī)范成為國際公認的標準;ASTM于1998年公布的色譜分析數(shù)據(jù)交換協(xié)議(AIA)和分析數(shù)據(jù)交換和信息存儲標準( ADISS)等等。我國已于2001年加入了WTO,為了與國際接軌,我們的獸醫(yī)實驗室應(yīng)該實施國際標準化管理。規(guī)范化建設(shè)關(guān)系到將來區(qū)域化網(wǎng)絡(luò)建成后,各實驗室之間數(shù)據(jù)能否交流、信息能否共享。同時,這些標準和規(guī)范的實施,對LIMS的原理、技術(shù)進行了高度概括和總結(jié),將LIMS系統(tǒng)的使用納入了法制化軌道,這也是LIMS系統(tǒng)這項高新技術(shù)發(fā)展趨向成熟的標志。

獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)建立的意義

實驗室信息管理系統(tǒng)對于規(guī)范獸醫(yī)實驗室的建設(shè),提高網(wǎng)絡(luò)信息平臺數(shù)據(jù)質(zhì)量、為管理和決策提供及時而準確的數(shù)據(jù)資源,推進疫病監(jiān)測水平,推進實驗室認證認可,提高突發(fā)動物疫情等公共衛(wèi)生事件的應(yīng)急處置能力將起到重要作用。

一是規(guī)范實驗室操作程序,嚴格執(zhí)行體系文件。遵循管理體系要求,將管理要素的人、機、料、法、環(huán)、測等有機結(jié)合,實現(xiàn)從樣品登記、合同評審、任務(wù)下達到實驗檢測、數(shù)據(jù)采集處理和查詢、直至報告生成、信息傳遞等一系列工作的閉環(huán)式流程化管理,這對全面提升獸醫(yī)實驗室的分析水平和管理水平具有重要意義,為實驗室認證認可工作打下良好基礎(chǔ),促進實驗室認證認可工作的順利進行。

二是建立一個嚴格的程序化管理系統(tǒng),環(huán)環(huán)相扣,所有操作均實現(xiàn)授權(quán)管理、痕跡記憶管理,實現(xiàn)數(shù)據(jù)追溯,是有效改進和提高質(zhì)量管理的重要手段。LIMS通過應(yīng)用計算機技術(shù),對實驗室活動進行統(tǒng)籌規(guī)劃、指揮、控制和協(xié)調(diào),能夠及時準確地反映出實驗室的實況,快速的提供各種數(shù)據(jù)信息,改變了實驗室的管理方式,為管理者帶來了巨大的方便,使實驗室管理更具合理化和科學(xué)化。

三是提高工作效率、實現(xiàn)質(zhì)量數(shù)據(jù)大范圍共享的有效平臺。通過授予相應(yīng)的訪問權(quán)限,終端用戶就可以通過一定的途徑,瀏覽相應(yīng)的分析數(shù)據(jù)和結(jié)果,提高分析數(shù)據(jù)的綜合利用率和時效性。

四是實現(xiàn)過程監(jiān)控,強化質(zhì)量監(jiān)督的有效途徑。通過對管理層授予一定的權(quán)限,實施對LIMS系統(tǒng)的關(guān)鍵過程環(huán)節(jié)的監(jiān)督,以實現(xiàn)質(zhì)量管理體系的監(jiān)督過程。這無疑是為獸醫(yī)實驗室的管理注入了新的活力,使實驗室站在當今科技發(fā)展的前沿。

獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)( LIMS)構(gòu)建的原則

一要遵循依據(jù)ISO/IEC 17025標準的原則,構(gòu)建完整的質(zhì)量保證體系。LIMS系統(tǒng)是對實驗室管理過程的計算機化,其功能構(gòu)建不能偏離實驗室管理準則,即應(yīng)該緊緊圍繞標準依據(jù)、或是圍繞實驗室管理體系文件來構(gòu)建。

二是遵循檢測數(shù)據(jù)和圖像等的自動化采集原則,遵循智能化管理原則,提高實驗室的工作效率。多年來,LIMS的儀器直聯(lián)一直是實驗人的夢想,英國實驗室系統(tǒng)公司為主組成的實驗室軟件開發(fā)部門ThermoInformatics發(fā)布My Instrument儀器控制標準以來,LIMS參照這一標準,得以與儀器實現(xiàn)聯(lián)接,例如Nau-tilusLIMS中即可以實現(xiàn)不同廠家、多種型號的色譜儀和光譜儀的聯(lián)接。

三是遵循人性化管理的原則,有利于實驗室人員的友好錄入。LIMS的應(yīng)用雖然為管理人員帶來了方便,但同時也為實際操作者帶來不可避免的煩惱,即是將原來大量工作通過計算機登錄頁面操作,必然受使用人員的計算機操作水平限制,所以LIMS的設(shè)計要充分考慮方便信息錄入、提供批量操作功能、一個按鈕實現(xiàn)自動采集等為使用者著想的功能。

四是遵循可改進和可拓展的原則,有利于系統(tǒng)的持續(xù)發(fā)展,有利于資金的有效使用。國內(nèi)LIMS系統(tǒng)多采用目前先進的B/S結(jié)構(gòu),由WEB服務(wù)器和數(shù)據(jù)庫服務(wù)器組成,能實現(xiàn)局域網(wǎng)內(nèi)不同地點的訪問與接入。LIMS系統(tǒng)本身的N層架構(gòu)技術(shù)也保證了系統(tǒng)內(nèi)部各表達層和數(shù)據(jù)存取層的獨立性,可單獨對系統(tǒng)中某個模塊進行升級,保證了系統(tǒng)的可升級性和可拓展性,實現(xiàn)對投入資金的持續(xù)使用。

遼寧省獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)主要框架的構(gòu)建

遼寧省動物疫病預(yù)防控制中心獸醫(yī)實驗室管理系統(tǒng)下設(shè)九項子模塊,各模塊中再細分具體功能模塊,同時保留子模塊的拓展功能和增加功能。見圖l。

樣品管理模塊

此為LIMS系統(tǒng)的核心模塊。下設(shè)樣品信息采集、樣品信息查詢、樣品保存、樣品銷毀等功能。檢驗樣品實現(xiàn)二維條形碼管理,實現(xiàn)對樣品的快捷查詢,實現(xiàn)樣品的跟蹤、記錄和責任追溯。

任務(wù)管理模塊

系統(tǒng)根據(jù)檢驗類別自動生成唯一性任務(wù)編號,指定領(lǐng)樣人、主要檢驗人(責任人),將責任落實到人。多年來計算機軟件與儀器的聯(lián)結(jié),一直是眾多用戶關(guān)注的焦點,中心通過一系列的技術(shù)處理,實現(xiàn)了針對酶標儀等常用儀器數(shù)據(jù)的自動運算,自動生成檢驗結(jié)論。

報告管理

構(gòu)建了“報告制定”、“報告發(fā)放”和“報告存檔”三大功能模塊。自動生成檢驗報告,可對圖片格式報告的多級審核,“所見即所得”的出具檢驗報告。

設(shè)備、耗材、試劑管理

通過建立了儀器設(shè)備電子檔案,準確反應(yīng)和記錄儀器的檢測、保養(yǎng)、維修和報廢情況。儀器設(shè)備使用記錄與檢驗結(jié)果記錄一并進行,很好地實現(xiàn)了儀器設(shè)備使用記錄與檢驗記錄的吻合。實現(xiàn)試劑和耗材的庫存式管理,通過標記單元試劑信息,從而輕松統(tǒng)計出試劑在某一階段的消耗數(shù)量、可滿足的檢驗份數(shù),從而對實驗室資源的整體配置進行判斷,有效控制實驗室運行成本。

質(zhì)量管理

將實驗室管理體系文件建立電子書,可隨意查詢章節(jié)內(nèi)容,并直接調(diào)閱某章節(jié)對應(yīng)表格或文件等。實現(xiàn)了快速查詢功能。

統(tǒng)計分析管理

對檢驗結(jié)果提供多元化分析功能,是管理系統(tǒng)的重中之重,毫不夸張的說,LIMS除了實現(xiàn)全方位的質(zhì)量管制之外,就是為數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析服務(wù)。此部分簡單來說就是具有統(tǒng)計分析和報表查詢功能,查詢包括QBE(通過例子進行查詢)查詢和組合查詢方式。

系統(tǒng)維護管理

管理LIMS正常運行所需要的基本信息,包括檢驗項目、基礎(chǔ)參數(shù)、日志管理、優(yōu)先提醒等信息的建立,文件資料等數(shù)據(jù)庫的管理和備份等。是系統(tǒng)能夠正常運行的必要組成部分。

拓展與展望

未來系統(tǒng)為適應(yīng)高度專業(yè)化、智能化、自動化要求,涉及內(nèi)容可以是多方面的、甚至是跨學(xué)科的。系統(tǒng)功能可以不斷拓展與修改。

嵌入全省地理信息,通過計算機科學(xué)、地理學(xué)、測量學(xué)、地圖學(xué)等多門學(xué)科綜合應(yīng)用,按需求自動繪制各種地理圖表,使得檢測、監(jiān)測數(shù)據(jù)在全省的地理分布及階段內(nèi)區(qū)域走勢清晰可見、一目了然。

遠程訪問。系統(tǒng)將實現(xiàn)管理者或?qū)嶒炇胰藛T在家中、旅途中或異國他鄉(xiāng)還能夠隨時訪問自己的實驗室,隨時看到每一個圖譜、每一個數(shù)據(jù),實現(xiàn)在遠端審核檢測數(shù)據(jù)、簽發(fā)檢測報告。

目前系統(tǒng)僅在遼寧省動物疫病預(yù)防控制中心內(nèi)部應(yīng)用,從未來應(yīng)用發(fā)展來看,結(jié)合互聯(lián)網(wǎng)技術(shù),將來LIMS系統(tǒng)用戶端可以無限增多,在市縣級疫控機構(gòu)實驗室推廣應(yīng)用。期待全方位、智能化、跨空間的省際獸醫(yī)實驗室信息管理系統(tǒng)的構(gòu)建成功,獸醫(yī)實驗室的數(shù)字化時代早日到來。

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