趙婀娜
這項成果不僅標(biāo)志著人類對生命過程和本質(zhì)的理解又向前邁進了關(guān)鍵一步,也標(biāo)志著困擾國際生命科學(xué)界二十幾年的分子生物學(xué)“中心法則”中的一個關(guān)鍵步驟、一直以來充滿神秘感的剪接體的三維結(jié)構(gòu)終被揭示。
這幾天,生命科學(xué)領(lǐng)域的學(xué)者都在熱議中國的一項重大成果。因為這項成果不僅標(biāo)志著人類對生命過程和本質(zhì)的理解又向前邁進了關(guān)鍵一步,也標(biāo)志著困擾國際生命科學(xué)界二十幾年的分子生物學(xué)“中心法則”中的一個關(guān)鍵步驟、一直以來充滿神秘感的剪接體的三維結(jié)構(gòu)終被揭示。
這項成果來自清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院施一公教授的團隊。
8月21日,施一公團隊在《科學(xué)》(Science)同時在線發(fā)表了兩篇研究長文,《3.6埃的酵母剪接體結(jié)構(gòu)》和《前體信使RNA剪接的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)》。第一篇文章介紹了通過單顆粒冷凍電子顯微技術(shù)(冷凍電鏡)解析的酵母剪接體近原子分辨率的三維結(jié)構(gòu),第二篇文章在此結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進行了詳細分析,闡述了剪接體對前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機理。捕獲真核細胞剪接體復(fù)合物的高分辨率空間三維結(jié)構(gòu),闡述剪接體對前體信使RNA執(zhí)行剪接的基本工作機理,這在世界范圍都是第一次。
圍繞基因表達過程的研究,已產(chǎn)生多個諾貝爾獎,施一公團隊的研究被認為是其中最受矚目的課題之一
什么是剪接體?什么是RNA?施一公團隊成果的價值何在?解答這些問題,還要從生物學(xué)的“中心法則”說起。
“中心法則”是描述基因表達這一細胞最基礎(chǔ)也是最核心的生命活動的一套規(guī)律,于1956年由英國生物學(xué)家克里克首先提出,對“中心法則”各個環(huán)節(jié)中重要生物大分子的組成、結(jié)構(gòu)和功能的研究一直以來都是研究者追逐的前沿?zé)狳c。
在所有真核細胞中,基因表達分三步進行,分別由RNA聚合酶、剪接體和核糖體執(zhí)行。第一步簡稱轉(zhuǎn)錄,即儲存在遺傳物質(zhì)DNA序列中的遺傳信息通過RNA聚合酶的作用轉(zhuǎn)變成前體信使RNA(pre-mRNA);第二步簡稱剪接,即由多個內(nèi)含子和外顯子間隔形成的前體信使RNA通過剪接體的作用去除內(nèi)含子、連接外顯子,轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓男攀筊NA;第三步簡稱翻譯,即成熟的信使RNA通過核糖體的作用轉(zhuǎn)變成蛋白質(zhì),從而行使生命活動的各種功能。
描述這一過程的規(guī)律被稱為分子生物學(xué)的“中心法則”,多個諾貝爾獎圍繞此過程產(chǎn)生。其中,第一步與第三步中的RNA聚合酶及核糖體的結(jié)構(gòu)解析已分別獲得2006年和2009年的諾貝爾化學(xué)獎。
第二步關(guān)鍵步驟,即實現(xiàn)從前體信使RNA到成熟的信使RNA轉(zhuǎn)變的剪接過程中,剪接體是如何工作的,以及剪接體到底長什么樣,是迄今為止國際生命科學(xué)領(lǐng)域最受矚目的課題之一,而由于剪接體是一個巨大而復(fù)雜的動態(tài)分子機器,其結(jié)構(gòu)解析難度被普遍認為高于RNA聚合酶和核糖體,因此也被認為是結(jié)構(gòu)生物學(xué)的難題之一。
從1977年基因剪接現(xiàn)象首次被發(fā)現(xiàn)至今,很多科學(xué)家都在對剪接體進行研究分析,但始終沒有重大進展。不久前,來自劍橋大學(xué)分子生物學(xué)實驗室的一個研究組宣布,將剪接體組裝過程中一個前體復(fù)合物的分辨率提高到了5.9埃(1埃為十億分之一米)。
施一公團隊的成果不僅將精度從5.9埃提高到了3.6埃,而且解析的對象是真正的剪接體,這是人類第一次在近原子分辨率上看到剪接體的細節(jié),并闡述剪接反應(yīng)進行的分子機制。
人類許多疾病都是由于基因的剪接差錯,施一公團隊的成果初步解答了基礎(chǔ)生命科學(xué)領(lǐng)域的核心問題
許多人類疾病都緣于基因的錯誤剪接或是針對剪接體的調(diào)控錯誤。人類35%的遺傳紊亂是由于基因突變導(dǎo)致單個基因的可變剪接引起的:比如,單個剪接位點的增加或缺失可能引起α-或β-地中海貧血癥;可變剪接平衡紊亂導(dǎo)致的某些外顯子不正常表達可能導(dǎo)致額顳骨癡呆癥。一些癌癥也與剪接因子的錯誤調(diào)控有關(guān)。因此,長久以來,剪接體的結(jié)構(gòu)解析一直被認為是最值得期待的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究之一。
施一公團隊的研究成果得到了世界同行的高度評價,不少專家認為,這一成果的完成不僅初步解答了基礎(chǔ)生命科學(xué)領(lǐng)域長期以來備受關(guān)注的核心問題,也為進一步揭示與剪接體相關(guān)疾病的發(fā)病機理提供了堅實基礎(chǔ)。
美國加州大學(xué)圣地亞哥分校的細胞與分子醫(yī)學(xué)系教授付向東認為,對剪接體近原子分辨率結(jié)構(gòu)的解析,是RNA剪接領(lǐng)域里程碑式的重大突破,也是近30年中國在基礎(chǔ)生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)κ澜缈茖W(xué)做出的最大貢獻。
2009年諾貝爾生理與醫(yī)學(xué)獎得主、哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授杰克·肖斯德克評價說,兩篇論文為理解剪接體的結(jié)構(gòu)和工作機制帶來了巨大突破。剪接體是細胞內(nèi)最后一個被等待解析結(jié)構(gòu)的超大復(fù)合體,而這一等待實在已經(jīng)太久了,這一領(lǐng)域?qū)砣匀挥泻芏喙ぷ饕?,在未來會有更多的剪接通路中不同階段的結(jié)構(gòu)被解析,甚至更高分辨率的結(jié)構(gòu)、來自其他物種的結(jié)構(gòu),乃至最終獲得人類剪接體結(jié)構(gòu)。
敢于直面最富挑戰(zhàn)的課題,有眼界、有自信,施一公團隊由他和3個“85后”博士生組成
全世界的科學(xué)家都在為之努力,為什么幸運女神眷顧了施一公團隊?
施一公認為,成果源于每一個精心雕琢的實驗步驟,尤其是極為成熟的樣品處理方法。首先,實驗團隊通過反復(fù)試驗、篩選并結(jié)合大量文獻資料的查閱,最終選擇了裂殖酵母作為實驗對象,并通過簡化純化步驟,實現(xiàn)了樣品的完整性與穩(wěn)定性。這是最關(guān)鍵的一步。
值得一提的還有冷凍鏡技術(shù)。早在幾年前,施一公就已經(jīng)意識到,冷凍電鏡可能更有突破前景,于是,在極其困難的情況下,經(jīng)努力爭取,清華大學(xué)擁有了世界最大的冷凍電鏡系統(tǒng)?!皼]有冷凍電鏡技術(shù),就完全不可能得到剪接體近原子水平的分辨率。”施一公介紹。
在團隊成員杭婧看來,施一公選擇這樣一個極具挑戰(zhàn)性的課題,就是因為他“膽大心細”。膽大是建立在眼界開闊、目光精準(zhǔn)的基礎(chǔ)上,心細則體現(xiàn)在對課題方向和時機的把握與掌控上。
剛加入施一公的研究團隊時,得知要做這樣一個課題,杭婧曾有過擔(dān)心和懷疑:“國內(nèi)外有很多強有力的競爭對手,都在這一領(lǐng)域里探索多年,我們進入的時間不長,沒有太多經(jīng)驗,真的能夠做好這個課題嗎?”
一開始,他們選擇了從小處著手,試圖從解析剪接體復(fù)合物中的一些重要組成蛋白的結(jié)構(gòu)開始,逐步接近目標(biāo)。這些工作取得了一些成果,但卻遠遠不夠。
真的要一直徘徊在從小的蛋白入手的道路上嗎?經(jīng)過慎重的考慮后,團隊決定直面最富挑戰(zhàn)的攻堅課題:完整剪接體的結(jié)構(gòu)。正是這一次研究方向的調(diào)整,才使團隊后來有機會見到了勝利的曙光。
你可能想不到,在這個4人團隊中,除了施一公,其他3個人都是“85后”博士生。這3位學(xué)生就是這兩篇文章的共同第一作者——清華大學(xué)生命學(xué)院閆創(chuàng)業(yè)博士,醫(yī)學(xué)院博士研究生杭婧、萬蕊雪。其中,年齡最大的閆創(chuàng)業(yè)今年還不滿30歲,而杭婧和萬蕊雪則分別是26歲和25歲。在施一公看來,團隊成員每人都有自己的特點,他們最需要做的,就是充分發(fā)揮自己的能力特長,通過長期嚴格的科研訓(xùn)練,在擅長的領(lǐng)域里做到極致。
正是這3位年輕人,在施一公的帶領(lǐng)下,實現(xiàn)了生命科學(xué)基礎(chǔ)原理研究領(lǐng)域的一個重大突破。