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手性有機(jī)酸薄層色譜保留指數(shù)的拓?fù)淠P?/h1>
2014-12-24 03:31:48李鳴建王欲曉馮長(zhǎng)君
色譜 2014年3期
關(guān)鍵詞:旋光連接性異構(gòu)體

李鳴建, 王欲曉, 馮 惠, 馮長(zhǎng)君

(徐州工程學(xué)院化學(xué)化工學(xué)院,江蘇 徐州221111)

分子的手性即不對(duì)稱性(亦稱為旋光性)在生命系統(tǒng)中起著極為關(guān)鍵的作用,是因?yàn)樵S多重要的生物活性皆通過嚴(yán)格的手性匹配即立體結(jié)構(gòu)契合產(chǎn)生分子識(shí)別而實(shí)現(xiàn)的[1-4]。因此,許多有機(jī)物參與生物體內(nèi)代謝時(shí)都表現(xiàn)出嚴(yán)格的立體選擇性與專一性。這就促使人們對(duì)手性化合物(特別是手性藥物)的合成、分離、生物學(xué)實(shí)驗(yàn)等進(jìn)行許多有益的探討,但與之相應(yīng)的物質(zhì)定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)相關(guān)性(quantitative structure-property index relationship,QSPR)研究相對(duì)滯后[5-7]。這是因?yàn)橐呀⒌耐負(fù)渲笖?shù)(topological index)多不考慮分子的空間形狀,而不能區(qū)分分子的旋光異構(gòu)[8,9]。目前已有較多學(xué)者對(duì)拓?fù)渲笖?shù)進(jìn)行擴(kuò)展修正,以建立能夠揭示分子三維結(jié) 構(gòu) 特 征 的 手 性 拓 撲 指 數(shù)(chiral topological index)。

文獻(xiàn)[10]采用手性乘積方法構(gòu)建能夠反映分子手性的拓?fù)渲笖?shù),將其與16個(gè)手性有機(jī)酸(6種手性羥酸和10種手性氨基酸)的薄層色譜保留指數(shù)進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)回歸分析及人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)研究。文獻(xiàn)[11]運(yùn)用3種方法建立手性拓?fù)渲笖?shù),將它們與18種手性有機(jī)酸(8種手性羥酸和10種手性氨基酸)的薄層色譜保留指數(shù)進(jìn)行擬合,經(jīng)多元統(tǒng)計(jì)及人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析,建立了良好的數(shù)學(xué)模型,為開展手性表征方法及其定量結(jié)構(gòu)-保留指數(shù)相關(guān)性(quantitative structure-retention index relationship,QSRR)研究具有啟示性意義。作者前文[12-14]分別基于原子類型電性拓?fù)渲笖?shù)、電性距離矢量、連接性指數(shù)與手性指數(shù)關(guān)聯(lián)上述手性有機(jī)酸的薄層色譜保留指數(shù),構(gòu)建的最佳二元、三元及四元數(shù)學(xué)模型的判定系數(shù)(R2)依次為0.915、0.909、0.969,為手性分子表征提供了一種簡(jiǎn)便方法。

1 理論與方法

1.1 手性薄層色譜保留指數(shù)

18種手性化合物包括8種手性羥酸和10種手性氨基酸,它們的薄層色譜的保留指數(shù)(RM)數(shù)據(jù)引自文獻(xiàn)[11]:

其中Rf稱為手性有機(jī)酸的比移值,其RM值見表1。

1.2 新型連接性指數(shù)的建立方法

表1 18種手性有機(jī)酸的手性拓?fù)渲笖?shù)及其保留指數(shù)Table 1 Chiral topological indices and retention indices of the 18 chiral organic acids

綜合考察18種手性有機(jī)酸的薄層色譜保留指數(shù)RM與其母體、取代基及其組成原子結(jié)構(gòu)特征的關(guān)系,建議非氫原子i的新型原子點(diǎn)價(jià)(gi):

式(3)中,ni、xpi、ti、ki、mi及πi依次為非氫原子i的電子層數(shù)、Pauling電負(fù)性、成單價(jià)電子數(shù)、孤電子對(duì)數(shù)、價(jià)電子數(shù)、成π 鍵電子數(shù)。xpC、tC為碳原子的Pauling電負(fù)性、成單價(jià)電子數(shù)??紤]醇羥基受苯環(huán)上大π鍵電子影響較大,引入芳環(huán)校正因子si。對(duì)于分子中含有苯環(huán)的si=-0.5,否則,si=0。按式(3)可求得-OH、=O、-NH2、-S-等基團(tuán)中非氫原子的gi依次為-12.644 2、5.710 0、1.139 8、1.365 3。對(duì)于伯、仲、叔、季碳原子的gi依次為-2.838 5、-1.039 7、3.000 0、4.000 0;含有π鍵電子的叔、季碳原子的gi依次為-1.656 9、2.343 1;而含有苯環(huán)的醇羥基中氧原子的gO為0.934 9。

價(jià)連接性指數(shù)定義為若干個(gè)相鄰非氫原子的原子點(diǎn)價(jià)乘積平方根的倒數(shù)之和:

式中:m 為連接性指數(shù)的階數(shù),m=0,1,2,…;t代表分子中子圖的類型,即將分子結(jié)構(gòu)剖析成若干種局部拓?fù)鋱D:路徑、簇、簇-徑、環(huán)狀子圖,依次對(duì)應(yīng)t為p、c、pc及ch;其“Σt”是對(duì)分子子圖求和。由于本文的gi中含有負(fù)數(shù),將式(4)中的“-0.5”修正為“1”,并 以“gi”代“δiv”構(gòu) 建 新 型 價(jià) 連 接 性 指 數(shù)(mGtv):

本文利用MATLAB 軟件計(jì)算了9 種mGtv:0Gpv、1Gpv、2Gpv、3Gpv、3Gcv、4Gpv、5Gpv、4Gpcv、Gchv。例如乳酸的上述9 種mGtv值依次為-17.074 0、-55.666 0、-219.070 0、754.670 0、-372.730 0、0.0000、0.0000、6 108.100 0、0.0000。

1.3 手性連接性指數(shù)的建立方法

前文[13]依據(jù)手性碳原子上所連取代基的次序規(guī)程[17],定義了分子j的手性指數(shù)(wj)。如R-乳酸分 子 的wj,R=0.844 19;S-乳 酸 分 子 的wj,S=1.134 61。手性連接性指數(shù)(mCtv)定義為:

所建手性連接性指數(shù)可對(duì)具有手性的分子予以表征,其wj≠1,可以wj>1或wj<1,實(shí)現(xiàn)旋光異構(gòu)體的數(shù)值化。亦能區(qū)別內(nèi)消旋體及非手性分子的結(jié)構(gòu)差異,此時(shí)wj=1(即手性連接性指數(shù)退化為連接性指數(shù))。根據(jù)式(6)計(jì)算了每個(gè)有機(jī)酸分子的9種mCtv(描 述 子):0Cpv、1Cpv、2Cpv、3Cpv、3Ccv、4Cpv、5Cpv、4Cpcv、Cchv。對(duì) 于R-乳 酸、S-乳 酸 的0Cpv分 別 為-14.41、-19.37,2Cpv分 別 為-184.94、-248.56,其內(nèi)消旋體的0Cpv、2Cpv分別為-17.074 0、-219.070 0。

1.4 RM 的多元回歸分析

將每種化合物的9種描述子作為自變量,相應(yīng)的RM為因變量構(gòu)建數(shù)據(jù)集,應(yīng)用最佳子集回歸(leaps-and-bounds regression)選擇最佳變量組合,建立相應(yīng)QSRR 模型。采用逐一剔除法(leave-oneout,LOO)對(duì)模型的預(yù)測(cè)能力及穩(wěn)健度進(jìn)行檢驗(yàn),以交叉驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)(Q2)予以評(píng)價(jià)。為了確立最終的QSRR 模型,引入Akaike信息判據(jù)(Akaike’s information criterion,AIC)、Kubinyi函數(shù)(Kubinyi function,F(xiàn)IT)[18,19],其計(jì)算公式:

式中:RSS 為方差和,f 為化合物數(shù),b 為變量數(shù)。AIC 值越小,F(xiàn)IT 值越大,所建的模型越穩(wěn)定,預(yù)測(cè)能力越高。

2 結(jié)果與討論

2.1 新建手性連接性指數(shù)的RM 模型

將18種手性有機(jī)酸的色譜保留指數(shù)RM[11]與手性連接性指數(shù)mCtv輸入MINTAB14統(tǒng)計(jì)分析軟件,經(jīng)最佳變量子集回歸及留一法交叉驗(yàn)證構(gòu)建的QSRR模型見表2。其中R2、Radj2、Q2、S、F 分別為判定系數(shù)、校正判定系數(shù)(以消除自變量個(gè)數(shù)及樣本容量對(duì)判定系數(shù)的影響)、留一法交叉驗(yàn)證系數(shù)、估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差、Fischer檢驗(yàn)值。

由表2可見,隨著模型中變量數(shù)增多,其R2逐漸增大,但Q2、FIT、Radj2先逐漸增大后逐漸下降,而AIC、S 的變化趨勢(shì)則完全反之。但其出現(xiàn)轉(zhuǎn)折點(diǎn)的位置一致,即AIC、S 值最小,相應(yīng)Q2、FIT、Radj2、F 值最大時(shí),該模型最穩(wěn)定,預(yù)測(cè)能力最高。因此,本文選用此四元數(shù)學(xué)模型:

式中n’是樣本容量。按此式給出的計(jì)算值與其實(shí)驗(yàn)值[11]頗 為 吻 合,見 表1 的“-RM(cal.1)”與“Residual 1”。Residual 1 是表1 中-RM(obs.)與-RM(cal.1)之差。

表2 RM 與手性連接性指數(shù)的最佳變量子集回歸結(jié)果Table 2 Results of mCtv and RM with leaps-and-bounds regression

2.2 模型質(zhì)量的其他驗(yàn)證

首先用方差膨脹因子(variance inflation factors,VIF)[11]評(píng)價(jià)模型中各自變量的多重相關(guān)性,如VIF=1,表明各自變量間完全不相關(guān);當(dāng)VIF<5時(shí),說明變量間沒有明顯的自相關(guān)性,所建模型是穩(wěn)定的;當(dāng)VIF>5時(shí),說明變量間存在明顯的共線性,所建模型不能用于估算與預(yù)測(cè)。VIF 的定義式為:

式中:β2為自變量中某一變量與余下變量的相關(guān)系數(shù)。模型(9)中 各 自 變 量0Cpv、2Cpv、5Cpv、Cvch的VIF 值依次為2.279、1.765、2.331、1.743,它們的VIF<5,說明該模型的多重共線性較低,具有良好的穩(wěn)定性。

其次用LOO 法(即Jackknifed法)予以檢驗(yàn)。其基本思想是從研究總體中每次只剔除一個(gè)化合物,用余下化合物的數(shù)據(jù)建立模型,以此模型對(duì)被剔除化合物予以預(yù)測(cè)。對(duì)模型(9)進(jìn)行LOO 交叉驗(yàn)證共建立18個(gè)模型,這18個(gè)模型的相關(guān)性數(shù)據(jù)列于表3。由表3 可見,18 個(gè)模型的R2在0.968~0.984之間,即在0.973附近上下波動(dòng)。說明模型(9)對(duì)18個(gè)手性有機(jī)酸的保留指數(shù)基本穩(wěn)定,具有良好的預(yù)測(cè)能力。

其三,模型(9)的Radj2與Q2相差0.015,遠(yuǎn)小于0.3,說明該模型沒有過擬合,不存在不相關(guān)的變量或數(shù)據(jù)中存在離域點(diǎn)。

表3 用Jackknifed法對(duì)模型(9)的穩(wěn)健性檢驗(yàn)Table 3 Robustness tests of model(9)with Jackknifed method

其四,評(píng)價(jià)QSRR 模型好壞的標(biāo)準(zhǔn)采用估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差S 和數(shù)值范圍的比例,當(dāng)小于10%的時(shí)候,可以認(rèn)為此模型是良好的[18]。本文的數(shù)值范圍為0.53,S=0.028 4,其比值為5.36%,小于10%。

2.3 模型(9)揭示了影響手性有機(jī)酸保留指數(shù)的本質(zhì)因素

正如文獻(xiàn)[11]所言:“手性化合物的構(gòu)效關(guān)系研究要比一般化合物難度大得多,因?yàn)橥瑫r(shí)要遵循兩種規(guī)律來構(gòu)造一個(gè)數(shù)學(xué)模型:不同化合物間的表征和同一分子的兩個(gè)對(duì)映體間的表征。如本研究中的羥酸類化合物和氨基酸類化合物,結(jié)構(gòu)看似非常簡(jiǎn)單,但要想得到一個(gè)好的預(yù)測(cè)模型是很困難的?!北疚氖紫雀鶕?jù)這些手性化合物的保留指數(shù)與其分子所含原子結(jié)構(gòu)特征的關(guān)系建立新型連接性指數(shù)(mGtv),將模型(9)中所含原來的4 種新型連接性指數(shù)即0Cpv、2Cpv、5Cpv、Cchv與18種手性有機(jī)酸的色譜保留指數(shù)(-RM)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)回歸,建立模型:

該模型的相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.836,與0.85(統(tǒng)計(jì)學(xué)認(rèn)為,R>0.85屬密切相關(guān)關(guān)系)較接近,說明這4個(gè)參數(shù)與保留指數(shù)較密切相關(guān)。按模型(11)給出的計(jì)算值(見表1 的“-RM(cal.2)”,其中Residual 2是表1中-RM(obs.)與-RM(cal.2)之差),此值與對(duì)映體保留指數(shù)的平均值均非常接近,也佐證兩者之間存在密切相關(guān)關(guān)系。根據(jù)Randic及Kier和Hall的連接性指數(shù)理論可知模型(11)揭示了原子類型、成鍵特征、環(huán)狀結(jié)構(gòu)以及分子的柔韌性和折疊程度等因素對(duì)保留指數(shù)的影響。然而,進(jìn)入模型(11)的這些拓?fù)渲笖?shù)并不能區(qū)分分子的對(duì)映異構(gòu),導(dǎo)致相關(guān)性較低。分子旋光異構(gòu)體的有些理化性質(zhì)及生物活性存在較大差異,這與其分子間力差異有關(guān)。例如本文9對(duì)旋光異構(gòu)體的R 型保留指數(shù)與S 型保留指數(shù)的比值在1.279~11.500之間,差異如此之大,體現(xiàn)了手性在其中的重要作用。薄層色譜拆分旋光異構(gòu)體基于二類方法[20]:一是采用手性固定相,二是于展開劑中加入手性添加劑。對(duì)于配體交換劑固定相常采用手性氨基酸與銅離子形成的配合物,它可與樣品中的旋光異構(gòu)分子發(fā)生配體交換,利用銅離子與旋光異構(gòu)體之間配合能力的微小差別而達(dá)到分離的目的[20]。根據(jù)本文9 對(duì)旋光異構(gòu)體的R 型保留指數(shù)比S 型保留指數(shù)大的事實(shí)可見:其一是R 型異構(gòu)體與銅離子的作用力小于S 型異構(gòu)體與銅 離 子 的 作 用 力,而 使Rf,R>Rf,S;其 二是分子間作用力越大的旋光異構(gòu)體,其與銅離子結(jié)合力的差別越小,相應(yīng)RM,R與RM,S較接近。例如R-絲氨酸、S-絲氨酸分子中同時(shí)含有-OH、-NH2,能形成更多氫鍵,分子間力較大,而與銅離子結(jié)合力的差別較小,故其Rf,R=0.780 13,與Rf,S=0.729 11較 接 近,其 分 離 因 子(α=Rf,R/Rf,S)為1.07;本文給出的手性指數(shù)的比值謂之相對(duì)手性(ε=wj,R/wj,S)為1.204 1。又 如R-異 亮 氨 酸、S-異亮氨酸分子中只含有-NH2,形成氫鍵的數(shù)目較少,且分子體積較大,因此其分子間力較小,導(dǎo)致與銅離子結(jié)合力的差別較大,相應(yīng)Rf,R=0.629 39,與Rf,S=0.511 51 有 較 大 差 別,其α=1.23;相 應(yīng)ε=1.353 2。根據(jù)文獻(xiàn)[21]的表1與圖2可得,分子間力較小的Val、Ile、Ser等氨基酸(它們先出峰)的kL/kD(對(duì)于只含1個(gè)手性碳原子的手性分子,其R/S構(gòu)型與L/D 構(gòu)型具有對(duì)應(yīng)關(guān)系)依次為1.69、1.69、1.47,而分子間力較大的Trp、Phe、His等氨基酸(它們后出峰)的kL/kD依次為1.60、1.58、1.63?;痉媳疚目偨Y(jié)的規(guī)律??梢?,ε與α 的變化方向及幅度基本一致,即ε基本反映手性薄層色譜對(duì)旋光異構(gòu)體的分離程度。模型(9)與模型(11)比較可見:其一,因模型(9)中的4個(gè)參數(shù)均來自模型(11),故模型(9)隱含了模型(11)所揭示的分子二維結(jié)構(gòu)特征對(duì)其RM的影響;其二,進(jìn)入模型(9)中的4個(gè)參數(shù)隱含了分子的三維結(jié)構(gòu)信息——手性特征,揭示了旋光異構(gòu)體的結(jié)構(gòu)差異。可以認(rèn)為模型(9)更為全面地揭示了影響本文手性有機(jī)酸保留指數(shù)的結(jié)構(gòu)因素,致使其相關(guān)性、穩(wěn)健性、預(yù)測(cè)能力等大幅度提高。

3 結(jié)論

(1)在新型連接性指數(shù)的基礎(chǔ)上引入手性指數(shù),成功建立了手性連接性指數(shù)(mCtv)。它在二維空間(隱含mGtv)基本實(shí)現(xiàn)了對(duì)不同化合物間的表征,在三維空間可對(duì)同一分子的兩個(gè)對(duì)映體間的結(jié)構(gòu)差異予以數(shù)值化表征。

(2)模型(9)呈現(xiàn)出良好的相關(guān)性、穩(wěn)健性及預(yù)測(cè)能力。

(3)根據(jù)模型(9)可見,所建手性連接性指數(shù)揭示了影響手性有機(jī)酸保留指數(shù)的二維結(jié)構(gòu)因素有原子類型、成鍵特征、環(huán)狀結(jié)構(gòu)和分子的手性特征以及柔韌性、折疊程度等三維結(jié)構(gòu)因素。

(4)非氫原子的次序特征值與取代基次序規(guī)則基本一致;手性指數(shù)wj還與其分子間力有關(guān)。從文中實(shí)例可見,相對(duì)手性ε與旋光異構(gòu)體的分離因子α 基本一致。

綜上所述,可以認(rèn)為本文為研究手性化合物的結(jié)構(gòu)表征及其構(gòu)效關(guān)系提供了一種簡(jiǎn)便有效的方法。

[1] Yang J,Wang L J,Guo Q L,et al.Chinese Journal of Chromatography(楊娟,王利娟,郭巧玲,等.色譜),2012,30(3):280

[2] Wu X Y,Wang R,Xie H,et al.Chinese Journal of Chromatography(武曉玉,王榮,謝華,等.色譜),2011,29(12):1205

[3] Wang L P,F(xiàn)an H J,Wu K H,et al.Chinese Journal of Chromatography(王李平,范華均,巫坤宏,等.色譜),2012,30(12):1265

[4] Li X B,Shi F G,Song Q X,et al.Progress in Pharmaceutical Sciences(李曉冰,石富國(guó),宋沁馨,等.藥學(xué)進(jìn)展),2013,37(8):360

[5] Feng C J.Journal of Huazhong University of Science and Technology:Natural Science Edition(馮長(zhǎng)君.華中科技大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版),2011,39(7):18

[6] Chen G H,Xia Z N,Lu Y,et al.Acta Chimica Sinica(陳國(guó)華,夏之寧,陸瑤,等.化學(xué)學(xué)報(bào)),2008,66(18):2052

[7] Li Z H,Cheng F S,Xia Z N.Chinese Journal of Chromatography(李正華,程凡圣,夏之寧.色譜),2011,29(1):63

[8] Feng C J,Du X H.Chinese Journal of Chromatography(馮長(zhǎng)君,堵錫華.色譜),2001,19(2):124

[9] Li M J,F(xiàn)eng C J,Cai K Y.Transactions of Beijing Institute of Technology(李鳴建,馮長(zhǎng)君,蔡可迎.北京理工大學(xué)學(xué)報(bào)),2011,31(12):1469

[10] Liu D,Zhang W J,Xu L.Chinese Journal of Analytical Chemistry(劉東,章文軍,許祿.分析化學(xué)),2009,37(4):543

[11] Liu D,Zhang W J,Xu L.Acta Chimica Sinica(劉東,章文軍,許祿.化學(xué)學(xué)報(bào)),2009,67(2):145

[12] Feng C J.Acta Physico-Chimica Sinica(馮長(zhǎng)君.物理化學(xué)學(xué)報(bào)),2010,26(1):193

[13] Feng C J.Journal Huazhong University of Science and Technology:Natural Science Edition(馮長(zhǎng)君.華中科技大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版),2011,39(7):18

[14] Tang Z Q,F(xiàn)eng C J.Journal of Nanjing University of Science and Technology(唐自強(qiáng),馮長(zhǎng)君.南京理工大學(xué)學(xué)報(bào)),2012,36(2):359

[15] Kier L B,Hall L H.Molecular Connectivity in Structure-Activity Analysis.New York:John Wiley,1986

[16] Randic M.J Amer Chem Soc,1975,97(23):6609

[17] Xu S C.Organic Chemistry.Beijing:High Education Press(徐壽昌.有機(jī)化學(xué).北京:高等教育出版社),1993

[18] Saiz Urra L,Gonzalez M P,Teijeira M.Bioorganic &Medicinal Chemistry,2007,15(10):3565

[19] Saiz Urra L,Gonzalez M P,Teijeira M.Bioorganic &Medicinal Chemistry,2006,14(21):7347

[20] Zhang Z.Natural Science Journal of the Graduates,Sun Yat-Sen University(張彰.中山大學(xué)研究生學(xué)刊自然科學(xué)版),1994,15(1):59

[21] Huang X J,Ding G S,Wang J D,et al.Chinese Journal of Chromatography(黃曉佳,丁國(guó)生,王俊德,等.色譜),2003,21(3):230

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