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一株在低溫條件下產(chǎn)纖維素酶的草生帚霉

2014-12-02 04:27:44王玉榮陳萬浩韓燕峰梁宗琦
關(guān)鍵詞:產(chǎn)孢分生孢子纖維素

王 垚,王玉榮,羅 韻,陳萬浩,韓燕峰,梁宗琦

(貴州大學(xué)真菌資源研究所,貴州 貴陽 550025)

纖維素酶作為一種重要的酶產(chǎn)品,在造紙行業(yè)、紡織工業(yè)、飼料行業(yè)、食品工業(yè)以及秸稈降解等領(lǐng)域都具有廣闊的應(yīng)用前景。自然界中產(chǎn)纖維素酶的生物有很多,細(xì)菌、放線菌、真菌和昆蟲等都能產(chǎn)生;而目前研究最多是絲狀真菌,因為它們具有產(chǎn)酶效率高、便于提取、產(chǎn)酶比例適當(dāng)?shù)葍?yōu)點[1]。這些產(chǎn)酶真菌又以木霉屬 Trichoderma Pers.、曲霉屬Aspergillus Link和青霉屬 Penicillium Link報道最多;但它們大多存在酶系組分不全、活性不穩(wěn)定、作用pH范圍窄、特別是產(chǎn)酶溫度要求高等問題[2],大大限制了它們的應(yīng)用。低溫纖維素酶在自然條件(特別是低溫的自然條件)下仍可以高效發(fā)揮作用,與中高溫酶相比在應(yīng)用上更具優(yōu)勢和潛力[3]。從自然界擴(kuò)大產(chǎn)纖維素酶真菌篩選,獲得應(yīng)用范圍廣的菌株,現(xiàn)已受到人們更多的關(guān)注[4-5]。

隨著城市化水平和人民生活水平的不斷提高,城市生活垃圾產(chǎn)出量與日俱增,由此引發(fā)的環(huán)境問題也日益突出。我國是農(nóng)業(yè)大國,城市生活垃圾采用堆肥技術(shù),既符合國情,又能達(dá)到垃圾無害化、減量化、資源化的目的,前景相當(dāng)廣闊[6]。研究中的大量資料表明[7],纖維素分解作用是堆肥腐熟的關(guān)鍵問題,但天然纖維素分解菌的活性低,降解速度慢;再加上我國北方地區(qū)平均氣溫較低,纖維素降解更受限制。這就需要對產(chǎn)纖維素酶的微生物進(jìn)行大量篩選,從而獲得在自然條件(特別是低溫的自然條件)下仍能產(chǎn)生高活性纖維素酶的菌株,以提高堆肥腐熟的效率。

帚霉屬 Scopulariopsis是 Bainier于 1907年建立的,其模式種為 S.brevicaulis(Sacc.)Bainier。后來,Manual(1949)指出其產(chǎn)孢細(xì)胞為具有環(huán)痕的瓶梗,而Hughes(1953)對該產(chǎn)孢細(xì)胞進(jìn)行了更詳細(xì)的描述:“產(chǎn)孢細(xì)胞隨著孢子的產(chǎn)生而延長,每次都留下一個疤痕,這種產(chǎn)孢細(xì)胞稱為環(huán)痕梗?!敝链?,該屬的概念才明確?,F(xiàn)已知該屬的有性階段為小囊菌屬 Microascu Zukal[8]。帚霉屬分布廣泛,植物種籽、纖維物質(zhì)、糞、土壤、空氣等都可帶菌,還能參與纖維素、糞素的分解和腐殖質(zhì)的形成[9]。所以帚霉也是產(chǎn)纖維素酶的潛在菌種資源。

作者于2013年在進(jìn)行中國部分地區(qū)戴氏霉屬Taifanglania Liang et al.真菌資源調(diào)查及其對木質(zhì)纖維素的降解研究時,從陜西合陽縣蔥的根際土壤中分離到一株真菌E71702M,經(jīng)形態(tài)學(xué)結(jié)合分子系統(tǒng)學(xué)手段鑒定為草生帚霉Scopulariopsis hibernica Mangan。在國內(nèi),此菌僅見有名錄,而無詳細(xì)描述記載[10]。經(jīng)初步試驗表明,草生帚霉 S.hibernica E71702M菌株,在較低溫度(10℃)條件下亦具有明顯的纖維素酶活性。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 樣品 采集自我國陜西合陽縣蔥的根際土壤。菌株保存于貴州大學(xué)真菌資源研究所。

1.1.2 培養(yǎng)基 馬丁氏培養(yǎng)基:磷酸氫二鉀1 g,硫酸鎂0.5 g,蛋白胨5 g,葡萄糖10 g,瓊脂18 g,孟加拉紅1/300 mL。用前待溫度冷卻在40℃ 左右,加入青霉素 20 pg/mg,鏈霉素 40 pg/mg,水1 000 mL,pH自然。滅菌條件:121℃ 滅菌30 min。(以下滅菌條件與此相同)。

PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g切塊,用水煮沸30 min,加葡萄糖 20 g,瓊脂 20 g,水補(bǔ)足 1 000 mL,pH自然。

CMC剛果紅培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉2 g,硫酸銨2 g,硫酸鎂0.5 g,磷酸氫二鉀1 g,氯化鈉0.5 g,剛果紅0.4 g瓊脂20 g,蒸餾水1 000 mL,明膠2 g,pH值自然。

1.2 方法

1.2.1 菌株的分離純化 分離菌株參照文獻(xiàn)[11]的方法,稱取2 g樣品加入盛有20 mL無菌水和玻璃珠的三角瓶中,振蕩10 min左右,使土樣均勻地分散在無菌水中成為懸液,靜置片刻,然后吸取1 mL懸液到含9 mL無菌水的試管中并充分混勻,依次按10倍法稀釋,稀釋到10-1~10-3倍。吸取1 mL稀釋后的懸液于干凈無菌的平板上,倒入20 mL左右添加了雙抗(鏈霉素和青霉素)的馬丁氏培養(yǎng)基,待冷卻后置于25℃ 培養(yǎng)。培養(yǎng)5 d后,在顯微鏡下進(jìn)行觀察并分離純化,純化后轉(zhuǎn)移至PDA斜面保存。

1.2.2 形態(tài)鑒定 參照 Bainier[12]和 Morton等人[13]的方法,將菌株 E71702M 接種于 PDA培養(yǎng)基上25℃ 培養(yǎng),觀察記錄菌落的大小、質(zhì)地、顏色、邊緣情況等。采用膠帶粘片法制片,在 Motic數(shù)碼顯微鏡下觀察產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)特征,記錄其菌絲、分生孢子梗、產(chǎn)孢細(xì)胞形狀大小和分生孢子的形態(tài)大小等特征,并選取具典型性狀特征的視野拍照。

1.2.3 DNA序列提取和PCR擴(kuò)增 刮取平板上生長旺盛的菌絲和孢子,經(jīng)DNA提取后,采用通用引物ITS4 5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'和ITS5 5'-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3'進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

擴(kuò)增體系選用25 μL反應(yīng)體系,包括引物ITS4 1 μL,ITS5 1 L,2 × Master Mix 12.5 μL,模板 2 μL,用無菌ddH2O補(bǔ)足25 μL。PCR條件為:94℃ 預(yù)變性3 min;94℃ 變性30 s,55℃ 退火30 s,72℃延伸1 min,30個循環(huán);最后72℃延伸5 min。將擴(kuò)增產(chǎn)物送北京諾賽基因組研究中心有限公司進(jìn)行測序,得到的序列經(jīng)校正后提交 GenBank(KJ704846)。

1.2.4 數(shù)據(jù)處理和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建 在 Gen-Bank上經(jīng)Blast后,下載與E71702M菌株序列相似性 >80% 的菌株序列共19條,以菌株Scedosporium apiospermum 532F08的ITS1-5.8S-ITS2 rDNA序列為外群,在CLUSTAL X1.83上進(jìn)行序列比對,手工校正后,用 Mega5.0中的鄰接法 (NJ),經(jīng)1 000次 bootstrap驗證,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[14]。

1.2.5 產(chǎn)纖維素酶測定 參照文獻(xiàn)[15]的方法,取平板上生長旺盛的菌絲和孢子,點接種于 CMC剛果紅平板中,分別置于10℃、17℃、25℃、32℃、40℃ 下恒溫培養(yǎng)。每個溫度3個重復(fù)。

1.2.6 數(shù)據(jù)分析 采用統(tǒng)計軟件SPSS 20.0。

2 結(jié)果

2.1 形態(tài)鑒定

PDA培養(yǎng)基上,25℃,7 d菌落直徑12~14 mm,6周長滿整個平板。菌落平展,中部稍有隆起,近粉狀,橄欖黑色,易發(fā)生角變現(xiàn)象;背面邊緣一輪白色,其余黑色。菌絲透明或半透明,無色或淡褐色,光滑,1.5~3 μm。瓶梗3.5 ~20 μm ×1.5 ~3 μm,常單生于氣生菌絲上,或在?;锨嗝?fàn)钆帕校h(huán)痕區(qū)長1~2 μm。梗基顯著膨大,6 ~8.5 μm ×2 ~5 μm。分生孢子幼時光滑,隨著培養(yǎng)時間的延長會產(chǎn)生疣突,倒卵形、橢圓形至短棒狀,4.5~6 μm×2.5 ~4 μm,聚集成長鏈(圖1)。

圖1 草生帚霉S.hibernica E71702M的產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)和菌落特征Fig.1 Conidiogenous structures and colony characteristics of S.hibernica E71702M

草生帚霉Scopulariopsis hibernica Mangan的主要鑒別特征是[16]:?;@著膨大,瓶梗3.5~22.5 μm,分生孢子倒卵形至短棒狀。該種與球孢帚霉S.sphaerospora Zach,雪白帚霉 S.nivea Demelius和黑帚霉S.carbonaria Morton&Smith相似。球孢帚霉和雪白帚霉的分生孢子均為球形,與草生帚霉分生孢子倒卵形至短棒狀易于區(qū)分。黑帚霉分生孢子卵形,瓶梗 4~8μm,與該種也可明顯區(qū)分。E71702M菌株除作者在后期可觀察到分生孢子具疣突外,同該種形態(tài)描述基本一致。

2.2 系統(tǒng)發(fā)育分析

NJ法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示(圖2),這些序列分為2個進(jìn)化分支。進(jìn)化分支Ⅰ包含兩個屬:帚霉屬Scopulariopsis Bainier和它的有性階段——小囊菌屬M(fèi)icroascus Zukal,它們以100% 的支持率聚在一起。作者觀察研究的菌株 E71702M與S.hibernica的兩個菌株以100% 的支持率聚在一個獨(dú)立的亞分支中,說明它們的關(guān)系非常近。進(jìn)化分支Ⅱ包含毛束霉屬Trichurus Clem,矛束霉屬Doratomyces Corda和沃德霉屬 Wardomyces Brooks&Hansford三個屬中的一些種。

結(jié)合E71702M的形態(tài)學(xué)特征和分子系統(tǒng)學(xué)分析提供的信息,菌株 E71702M被鑒定為草生帚霉Scopulariopsis hibernica Mangan。

圖2 E71702M菌株和相關(guān)種基于ITS-5.8Sr DNA序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree based on the ITS-5.8SrDNA sequences of E71702M and its relatives

2.3 產(chǎn)纖維素酶測定

CMC剛果紅平板顯示(圖3),菌株E71702M在10℃、17℃、25℃ 和32℃ 的溫度下均見有纖維素酶活性,而在40℃ 下未見有纖維素酶活性,這很可能是菌株E71702M無法適應(yīng)高溫環(huán)境的緣故。

圖3 E71702M菌株在不同溫度下產(chǎn)纖維素酶情況Fig.3 Cellulase hydrolysis of strain E71702M at different temperatures

對菌株E71702M在不同溫度條件下產(chǎn)生的纖維素水解圈的直徑進(jìn)行方差分析,32℃產(chǎn)生的水解圈直徑最大,它與其他溫度的差異均達(dá)到顯著水平;17℃ 次之,10℃ 再次之,但二者差異并不顯著(P=0.086>0.05);菌株 E71702M 在25℃ 時產(chǎn)生的纖維素水解圈最小。

某種程度上纖維素水解圈的大小,代表了菌株產(chǎn)纖維素酶能力的強(qiáng)弱。上述實驗結(jié)果(圖3和表1)表明,菌株E71702M在32℃ 時產(chǎn)酶能力最強(qiáng),其次是17℃ 和10℃;在25℃ 下生長情況最好。值得注意的是,菌株E71702M在較低溫度(10℃)下產(chǎn)生的纖維素水解圈直徑不僅與17℃ 時沒有明顯差異,而且同32℃ 時產(chǎn)生的最大水解圈相比也只相差15%,說明此菌株具有在低溫條件下產(chǎn)纖維素酶的潛力。

表1 不同溫度條件下纖維素水解圈直徑Tab.1 The diameters of cellulase hydrolysis zone at different temperatures

3 討論

目前,草生帚霉S.hibernica除耿月華等在《藏東三江峽谷地帶土壤暗色絲孢菌研究初報》中提及菌名外[10],該種在國內(nèi)尚未見詳細(xì)的描述報道。此外,有關(guān)該種產(chǎn)纖維素酶以及其它的應(yīng)用研究,國內(nèi)外也未見報道。本文對該種不僅進(jìn)行了詳細(xì)的特征描述和分子鑒定,還對它的產(chǎn)纖維素酶能力進(jìn)行了初步研究。

在進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析時,作者發(fā)現(xiàn)進(jìn)化分支Ⅱ的3個屬,沃德霉屬 Wardomyces是小囊菌屬的無性型[17];矛束霉屬 Doratomyces與帚霉屬具有相同的產(chǎn)孢方式,2個屬界限模糊,因而有人認(rèn)為矛束霉屬不過是帚霉屬的孢梗束時期,應(yīng)該把它們劃分在1個屬內(nèi)[18];毛束霉屬 Trichurus與頭束霉 Cephalotrichum Link聯(lián)系緊密[19]。小囊菌屬的無性型還有頭束霉 Cephalotrichum[17],所以進(jìn)化分支Ⅱ的3個屬與帚霉屬的親緣關(guān)系也較密切,這從整個系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系支持了菌株E71702M鑒定為S.hibernica的合理性。

菌株E71702M在25℃ 下生長情況最好,是典型的中溫微生物,但具有在較低溫度下(10℃)產(chǎn)纖維素酶的潛力。低溫酶并非只來自低溫微生物,有報道從腐殖質(zhì)土樣中分離得到的1株中溫纖維弧菌,在0℃ 時的殘留酶活力仍為最大酶活的60%,屬于典型的低溫酶[3]。

秸稈中含有大量的纖維素,在高溫堆腐條件下,較易腐解。而秸稈的應(yīng)用難題在于農(nóng)田秸稈大規(guī)模的降解,其腐解溫度低,需要篩選常溫或低溫條件下能夠產(chǎn)生高活性的纖維素酶菌株加快秸稈腐熟[2]。目前報道的產(chǎn)纖維素酶菌株對其產(chǎn)酶溫度的研究大多都在25℃ 以上[20-21],不利于在田間低溫條件下發(fā)揮作用,為此,低溫纖維素酶的研究已成為國內(nèi)研究的熱點[5]。此外,冬季城市垃圾的處理也急需尋找低溫產(chǎn)纖維素酶的菌種。本文報道的菌株E71702M 在10℃、17℃、25℃ 和32℃ 的溫度下均有纖維素酶活性,是1株值得關(guān)注的具有產(chǎn)生低溫纖維素酶潛力的菌株。

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