雷新勝 張偉
[摘 要]隨著有機氟化學(xué)的不斷發(fā)展,化學(xué)家已開發(fā)了許多將氟原子或含氟基團引入到小分子中的有效方法。為適應(yīng)當(dāng)前藥學(xué)專業(yè)人才的培養(yǎng),在藥學(xué)專業(yè)本科生課程中,適當(dāng)增加有關(guān)氟化學(xué)方面的知識是非常有必要的。授課教師可以從新概念、新方法和新應(yīng)用等方面加強這部分教學(xué)工作,為培養(yǎng)適應(yīng)現(xiàn)代新藥研發(fā)的藥學(xué)人才做出應(yīng)有的貢獻。各藥學(xué)相關(guān)院系可據(jù)自身情況在《藥物化學(xué)》、《有機化學(xué)》或《有機合成》等傳統(tǒng)課程中增加部分章節(jié),有條件的也可獨立開設(shè)專門的課程。
[關(guān)鍵詞]氟化學(xué) 教學(xué) 本科生教育
[中圖分類號] G642 [文獻標(biāo)識碼] A [文章編號] 2095-3437(2014)15-0153-03
到目前為止,臨床使用的含氟藥物已經(jīng)超過了180個,氟原子或含氟基團在生物有機和藥物化學(xué)中的重要性由此可見一斑。[1,2]隨著有機氟化學(xué)的不斷發(fā)展,化學(xué)家已開發(fā)了許多將氟原子或含氟基團引入到小分子中的有效方法。為適應(yīng)當(dāng)前藥學(xué)專業(yè)人才的培養(yǎng),在藥學(xué)專業(yè)本科生課程中,適當(dāng)增加有關(guān)氟化學(xué)方面的知識是非常有必要的。近年來,筆者嘗試在藥學(xué)及相關(guān)專業(yè)的《有機合成》課程中增加“藥物化學(xué)中的氟化學(xué)”一章,該部分內(nèi)容在教學(xué)中獲得了較好的反響。在此,本文簡要闡述氟原子或含氟基團在藥物化學(xué)中的作用并輔以應(yīng)用實例,期望能引起藥學(xué)專業(yè)教學(xué)和科研工作者的關(guān)注。
一、氟原子的氫模擬效應(yīng)
氟是原子半徑第二小的化學(xué)元素。氟原子的范德華半徑為1.47■,僅比氫原子的半徑大20%左右;碳-氫鍵鍵長約為1.087 ■,而碳-氟鍵鍵長約為1.382■,只增加了0.295 ■。從原子體積方面看,與其他元素相比,氟與氫具有更好的相似性。由于這種相似性,通常生物體內(nèi)的酶無法區(qū)分天然底物及其碳-氫被碳-氟取代的類似物,此為氟原子的氫模擬效應(yīng)(Mimic effect)。一個著名的例子是乙酰輔酶A和氟代乙酰輔酶A均可以被檸檬酸合成酶轉(zhuǎn)化為檸檬酸和相應(yīng)的氟代檸檬酸,即檸檬酸合成酶對二者無法區(qū)分[3],這是氟原子氫模擬效應(yīng)的重要體現(xiàn)。
二、氟原子的阻斷效應(yīng)
小分子藥物進入體內(nèi)后,其分子結(jié)構(gòu)中某些位置上的碳-氫鍵,由于受到體內(nèi)細胞色素P450酶的氧化代謝(羥基化)作用而導(dǎo)致藥物代謝過快失活,不能獲得滿意的療效。由于碳-氟鍵要比碳-氫鍵更為牢固(解離能:C-F 108.1 kcal/mol;C-H 103.1 kcal/mol),這時如果策略性地用碳-氟鍵代替相應(yīng)的碳-氫鍵,則可以防止活性分子在體內(nèi)過快代謝而失活,從而提高代謝穩(wěn)定性,這體現(xiàn)了氟原子的阻斷效應(yīng)(Block effect)。例如,維生素D3分子中24位的亞甲基(CH2)在體內(nèi)易羥基化而失活,將其用CF2取代后,代謝穩(wěn)定性大為提高。[4]
三、氟原子的氫鍵作用
氟原子核外周有3對孤對電子,顯強電負性,可作為氫鍵的受體。它與酸性較強的羥基氫或酰?;械牡蠚淙菀仔纬煞肿觾?nèi)或分子間氫鍵(Hydrogen bond)。這可以從許多酶-小分子晶體復(fù)合物結(jié)構(gòu)中得到證實,如彈性酶(elastase)與含氟多肽抑制劑(acetyl-Ala-Pro-Val-Val-difluoro-phenylethylacetamide)的晶體復(fù)合物結(jié)構(gòu)顯示:小分子中的1個氟原子與彈性酶57位組氨酸中咪唑氮原子距離(N-H-F)為2.8 ■,說明抑制劑中的氟原子與此處氮上的氫形成了氫鍵。[5]
四、氟原子的構(gòu)象鄰位交叉效應(yīng)
氟原子的強電負性使得碳-氟鍵的成鍵軌道處于相對較低能級,成鍵電子對較難填充到其他鄰位的反鍵軌道上,但是其反鍵軌道卻較易接受鄰位成鍵軌道的電子對,這種特性常常對分子構(gòu)象產(chǎn)生影響,導(dǎo)致氟原子與鄰位的氧、氮等原子在優(yōu)勢構(gòu)象中往往處于鄰位交叉式,這就是氟原子的鄰位交叉效應(yīng)(Gauche effect)。
例如,在關(guān)于含有脯氨酸的天然活性肽的構(gòu)象研究中,若將天然的脯氨酸改用4R-氟代脯氨酸, 1H NMR光譜分析結(jié)果提示,4R-氟代脯氨酸采取了C4-H-exo型優(yōu)勢構(gòu)象,即供電子的C5-H鍵與拉電子的C4-F鍵處于反式共平面而導(dǎo)致C4-F鍵與C5-N鍵處于鄰位交叉式構(gòu)象;而4S-氟代脯氨酸采取了C4-H-endo型優(yōu)勢構(gòu)象,這同樣是由于■-H軌道上的成鍵電子對與空軌道■-F相互作用的結(jié)果,從而表現(xiàn)為C4-F鍵與C5-N鍵處于鄰位交叉式。[6]
五、氟原子或含氟基團的誘導(dǎo)效應(yīng)
由于氟元素是電負性最強的元素,因此將氟原子引入到化合物中,可通過電子誘導(dǎo)效應(yīng)(Induced effect)對化合物的酸、堿性產(chǎn)生很大影響。對酸性基團,如羧酸基鄰位引入氟原子,能夠增強化合物的酸性;對堿性基團,如氨基鄰位引入氟原子,則可降低化合物的堿性。即使氟原子距離極性官能團(羧酸基或氨基)較遠,仍可通過σ鍵傳遞氟的電子效應(yīng)。
例如,在研究II型碳酸酐酶 (Carbonic anhydrase II,一種鋅離子金屬酶)抑制劑時發(fā)現(xiàn),甲磺酰胺的pKa為10.5,與酶的結(jié)合常數(shù)Ki為105 nM;而三氟甲磺酰胺的pKa為5.8,與酶的結(jié)合常數(shù)Ki為2.0 nM。活性提高的原因是甲磺酰胺的甲基氫被3個氟取代后,顯著增強了磺胺氮上氫的酸性,使其易脫質(zhì)子而產(chǎn)生磺胺負離子,從而有利于與鋅離子的配位結(jié)合。[7]
六.氟原子或含氟基團的立體效應(yīng)
氟原子雖然具有很好的氫模擬效應(yīng),但當(dāng)同碳上的氫被多個氟取代后,體積發(fā)生明顯改變。如當(dāng)甲基上的氫被氟取代后,CH2F的Taft立體參數(shù)Es增加20%;CHF2的Es增加50%;CF3的Es增加90%。有學(xué)者估算CF3的體積與異丙基大致相當(dāng),這反映了氟原子或含氟基團的立體效應(yīng) (Steric effect)。這種效應(yīng)在1,1-二取代聯(lián)苯類化合物的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)能壘差別中有鮮明的體現(xiàn)。1,1-二甲基聯(lián)苯的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)能壘為338.2 kcal/mol,1-甲基-1-異丙基聯(lián)苯的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)能壘為388.7 kcal/mol,而1-甲基-1-三氟甲基聯(lián)苯的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)能壘為384.6 kcal/mol。在藥物設(shè)計中,可以利用氟原子或含氟基團的這種立體效應(yīng)來調(diào)控分子的藥效構(gòu)象,以提高小分子對受體的親和力。[8]
七、氟原子或含氟基團的親脂效應(yīng)
藥物分子在體內(nèi)的吸收與分布主要取決于藥物的親水性/親脂性平衡及在體內(nèi)的離子化程度。大多數(shù)藥物只有具有合適的脂溶性,能透過生物膜,才能發(fā)揮藥效。衡量藥物候選物的脂溶性通常用log P(衡量藥物的脂水分配系數(shù))與log D(衡量藥物在不同pH條件下的脂水分配系數(shù))等參數(shù)來表示。研究表明,對于氟取代的脂肪鏈狀分子,尤其是附近有羥基或氨基等極性官能團時,脂溶性增加相當(dāng)明顯。如將羥基鄰位的氫原子替換為氟原子時,其脂溶性log D平均可增加0.2;而將羥基鄰位的甲基替換為三氟甲基時,相應(yīng)的脂溶性log D增加0.6。這些都反映了氟原子或含氟基團的親脂效應(yīng)(Lipophilic effect)。這種效應(yīng)可用于藥物分子的結(jié)構(gòu)改造工作。研究表明,白三烯受體拮抗劑分子末端的脂肪氨基部分親脂性越強,細胞滲透性越好,雖然理論上可以通過延長碳鏈以提高親脂性,但是隨著碳鏈增長也會導(dǎo)致其與受體間的結(jié)合降低;而對碳鏈上的氫進行多氟取代后,既增加了親脂性又不顯著增大碳鏈體積,與母體化合物相比,其氟代類似物體內(nèi)活性平均增加了10倍。[9]
八、碳-氟鍵與蛋白質(zhì)中的極性官能團的偶極相互作用
除了氟原子的氫鍵作用外,大量的蛋白質(zhì)與含氟小分子配體晶體復(fù)合物結(jié)構(gòu)還提示:碳-氟鍵與蛋白質(zhì)中周圍的氨基酸殘基存在明顯的偶極相互作用(C-F Bond-Protein Dipolar Interaction),這種作用為含氟藥物與它的靶蛋白結(jié)合提供了額外的穩(wěn)定性。這是由于碳-氟鍵可以與周圍的氨基酸殘基如羰基、胍基甚至是氨基酸ɑ位的C-H等可極化的鍵發(fā)生了偶極-偶極相互作用。例如,絲裂原活化蛋白激酶(p38 Map kinase)及其含氟抑制劑的晶體復(fù)合物結(jié)構(gòu)顯示:抑制劑中的氟與激酶104位亮氨酸的酰胺羰基碳距離只有3.1■,這說明碳-氟鍵與該羰基存在偶極-偶極相互作用。
九、作為電子等排體的氟原子或含氟基團
前文已表述了氟原子的氫模擬效應(yīng),即從原子體積方面看,氟可以作為氫的電子等排體;而從鍵的極性和氫鍵供體角度看,氟也可作為羥基的電子等排體。肽類藥物由于酰胺鍵可被體內(nèi)的水解酶裂解而易失活;另外,酰胺鍵具有部分雙鍵性質(zhì),導(dǎo)致酰胺鍵兩端的基團常常處于類順式(cisoid)或類反式transoid)構(gòu)型。因此,人們也常用順式或反式的氟代烯烴作為酰胺鍵的電子等排體。這種電子等排體一方面模擬了酰胺鍵的偶極矩大小、方向和羰基氧的氫鍵受體作用,另一方面由于烯烴的雙鍵性質(zhì)而變得更加剛性和抗酶水解性。
對于核酸類藥物,由于磷酯鍵(P-O-C)、磷酐鍵(P-O-P)容易水解斷裂而失活,人們開發(fā)了用CF2作為上述二者中氧原子的電子等排體,從而防止相應(yīng)鍵的水解斷裂。為了研究水解酶如絲氨酸、天冬氨酸蛋白酶或金屬蛋白酶的抑制劑,人們常常采用過渡態(tài)模擬物的設(shè)計思想。由于三氟甲基酮容易形成相應(yīng)的比較穩(wěn)定的水合物,該水合物可以有效地模擬酯水解時的四面體過渡態(tài),因而三氟甲基酮在這些酶抑制劑研究中也得到了廣泛應(yīng)用。
十、氟在藥物化學(xué)方面的其他用途
除上述內(nèi)容外,氟元素在核磁共振技術(shù)及正電子發(fā)射型顯像技術(shù)方面也有廣闊的應(yīng)用空間。這些技術(shù)可以提供關(guān)于活性肽或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、空間取向、構(gòu)象變化等方面的信息,以及用于多種疾病的診斷與鑒別診斷、病情判斷、療效評價、臟器功能研究和新藥開發(fā)。
結(jié)論
隨著氟化學(xué)合成方法學(xué)的日益成熟以及新型氟化試劑的不斷出現(xiàn),氟原子在藥物開發(fā)中的前景將會愈加廣闊,因此,在藥學(xué)專業(yè)本科生教學(xué)中適當(dāng)增加氟化學(xué)方面的教學(xué)內(nèi)容顯得尤為必要。授課教師可以從新概念、新方法和新應(yīng)用等方面加強這部分教學(xué)工作,為培養(yǎng)適應(yīng)現(xiàn)代新藥研發(fā)的藥學(xué)人才做出應(yīng)有的貢獻。各藥學(xué)相關(guān)院系可據(jù)自身情況在《藥物化學(xué)》、《有機化學(xué)》或《有機合成》等傳統(tǒng)課程中增加部分章節(jié),有條件的也可獨立開設(shè)專門的課程。就筆者所在單位而言,近幾年在《有機合成》中增加了“藥物化學(xué)中的氟化學(xué)”一章,取得了不錯的效果,可供兄弟院校參考。
[ 參 考 文 獻 ]
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[責(zé)任編輯:羅 艷]