曹毅等
摘要:為篩選對煙草花葉病毒(tobacco mosaic virus,TMV)具有拮抗活性的放線菌,以烤煙Coker 176、K326為材料,采用生物活性測試和半葉枯斑法,測定47株放線菌菌株發(fā)酵上清液抗TMV的活性,對具活性的菌株進行分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果表明,6株放線菌的發(fā)酵上清液具有一定的抗TMV活性,其中菌株F187、F349、F417發(fā)酵上清液對TMV具有明顯鈍化作用,發(fā)酵上清液與TMV作用30 min后抑制率分別為57.18%、60.27%、70.19%;分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析顯示菌株F187、F417、F349均屬鏈霉菌;鏈霉菌F187、F349、F417的代謝產(chǎn)物對TMV有較高的抑制活性,值得在菌種鑒定、發(fā)酵條件優(yōu)化、活性物質(zhì)的分離與鑒定等方面進行深入研究。
關(guān)鍵詞:煙草普通花葉病毒(TMV);放線菌;抗病毒活性;分子鑒定
中圖分類號: Q435.72 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2014)04-0100-03
收稿日期:2013-11-12
基金項目:貴州省科學(xué)技術(shù)基金(編號:黔科合J字[2012]2257號、黔科合J字[2011]2336號)。
作者簡介:曹毅(1982—),男,云南會澤人,碩士,助理研究員,從事微生物和植物保護研究。E-mail:yicao1001@163.com。煙草普通花葉病毒?。╰obacco mosaic virus,TMV)嚴重威脅煙草的品質(zhì)和產(chǎn)量,給煙草生產(chǎn)和煙草種植者造成了嚴重的經(jīng)濟損失。由于植物病毒對寄主細胞的絕對寄生性、植物缺乏完整的免疫系統(tǒng)以及病毒傳播方式的多樣性,目前尚無有效的防治措施和藥劑。由煙草病毒病造成的經(jīng)濟損失已超過真菌引起的病害,成為煙草生產(chǎn)上威脅最大的一類病害[1]。長期以來,人們使用有機或無機化合物進行植株病毒病防治,不僅防效甚微[2],也容易帶來農(nóng)藥污染。安全可靠、環(huán)境友好的生物源農(nóng)藥成為病毒防治藥劑的研究熱點。與植物源、動物源農(nóng)藥相比,微生物源農(nóng)藥具有資源豐富、成本低、效果穩(wěn)定和易商品化等特點[3-4],是公認的無公害農(nóng)藥。近年來國內(nèi)外大量研究表明,許多細菌[5]、真菌[6]和大型真菌[7]的代謝產(chǎn)物具有良好的抗植物病毒活性,為防治植物病毒病開辟了新的途徑。
放線菌是一類極具經(jīng)濟價值和廣泛應(yīng)用前景的微生物資源,因其豐富的代謝產(chǎn)物,已被廣泛應(yīng)用于工業(yè)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。放線菌來源的抗病毒活性物質(zhì)如寧南霉素(ningnanmycin)、嘧肽霉素(cytosinpeptidemycin)、全霉素(holomycin)等對植物病毒病具有一定的治療效果[5]。由于病毒侵染危害植物的作用機理復(fù)雜以及植物病毒學(xué)研究方法受到一些因素制約等原因,其研究開發(fā)還處于初級階段,目前我國登記生產(chǎn)的微生物源抗植物病毒劑還很少。因此,不斷挖掘有生物活性的放線菌資源,開發(fā)有自主知識產(chǎn)權(quán)、對環(huán)境友好且高效的抗病毒劑,具有重要的社會、生態(tài)和經(jīng)濟意義[8]。
本研究對前期從云南、貴州、河南等全國主要植煙區(qū)健康煙草根際土壤分離純化的放線菌進行發(fā)酵產(chǎn)物抗病毒活性篩選,通過16S rDNA序列和系統(tǒng)發(fā)育分析對具有抗病毒活性的菌株進行分類地位的確定,以期為抗病毒放線菌資源的篩選和綠色農(nóng)業(yè)的發(fā)展提供基礎(chǔ)。
1材料與方法
1.1供試材料
1.1.1放線菌菌株供試的47株放線菌均采集、分離自田間健康煙草根際土壤。
1.1.2烤煙品種TMV枯斑寄主煙草Coker 176、系統(tǒng)侵染寄主煙草K326,由貴州省煙草科學(xué)研究院良種繁育中心提供。
1.1.3供試毒源供試病毒為純化的TMV,試驗前繁殖保存于煙草K326。
1.1.4培養(yǎng)基高氏1號培養(yǎng)基:可溶性淀粉20 g、KH2PO4 0.5 g、FeSO4·7H2O 0.01 g、KNO3 1.0 g、MgSO4·7H2O 0.5 g、KCl 0.5 g、瓊脂18 g,蒸餾水定容至1 L,121 ℃滅菌 20 min 后備用。
黃豆粉培養(yǎng)基:黃豆粉 25 g、酵母浸膏 5 g、NaCl 0.5 g、K2HPO4 0.5 g、MgSO4·7H2O 0.5 g、蛋白胨2 g、可溶性淀粉 10 g、CaCO3 0.5 g,蒸餾水定容至1 L,調(diào)節(jié)pH值至7.2,121 ℃ 滅菌 30 min。
1.1.5主要試劑16S rDNA Bacterial Identification PCR Kit、DL2000 DNA Marker、Premix Ex Taq購自寶生物工程(大連)有限公司(TaKaRa),其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.2試驗方法
1.2.1放線菌發(fā)酵產(chǎn)物的制備供試菌株接種于高氏1號培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)箱中活化培養(yǎng)4 d,用直徑5 mm的打孔器打取菌株生長良好的菌餅,接種于裝有100 mL高氏1號液體培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,每瓶6塊;28 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)4 d后按5%的接種量接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,28 ℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)7 d后,無菌條件下吸取發(fā)酵產(chǎn)物于滅菌離心管中8 000 r/min離心15 min,收集菌株發(fā)酵上清液,4 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2寄主培養(yǎng)和病毒接種供試煙草按常規(guī)育苗規(guī)程進行培育管理,7~8張葉時用于病毒接種。取新鮮感染TMV的病葉置于滅菌研缽中加適量金剛砂研磨勻漿,加入0.01 mol/L pH值7.2的磷酸緩沖液,離心后取上清液,配制40倍液的病毒汁液(40 mL/g病葉)。接種前噴灑適量金剛砂于葉片表面,用配置的病毒汁液進行常規(guī)摩擦接種,接種2 min后用清水噴霧沖洗葉面,于25 ℃無蟲溫室內(nèi)進行。
1.2.3抗TMV活性菌株的篩選初篩:取長勢一致的K326每2株分為1組,病毒汁液摩擦接種后,分別在接種后的第2、4、6 天噴灑20%的待測放線菌發(fā)酵上清液,設(shè)置陰性空白對照(病毒接種后噴灑20%的未接菌發(fā)酵培養(yǎng)液)、陽性發(fā)病對照(病毒接種后噴灑滅菌蒸餾水)。第10天開始觀察記錄發(fā)病情況,每組2株的心葉脈明、輕微花葉,或上部不超過 1/3 葉片花葉以及2株中只有1株出現(xiàn)1/3~1/2葉片花葉或少許變形或主側(cè)脈壞死,植株矮化為正常株高的2/3以上的記錄菌株號,保留備用。2株都出現(xiàn)1/2~2/3葉片花葉或變形或主側(cè)脈壞死或全株葉片花葉或嚴重變形或壞死,病株明顯矮化的則放棄。
復(fù)篩:將初篩保留的菌株發(fā)酵液與等量TMV病葉汁液混合,室溫放置30 min后,以發(fā)酵培養(yǎng)基與病毒汁液混合為陽性對照,采用半葉枯斑法[9]接種4~5葉期的TMV枯斑寄主烤煙Coker 176,左半葉接種對照,右半葉接種經(jīng)發(fā)酵液處理的TMV病葉汁液。每個處理4~5張葉,重復(fù)3次。接種5~7 d后記錄枯斑數(shù),計算病毒抑制率:
抑制率=(對照枯斑數(shù)-處理枯斑數(shù))/對照枯斑數(shù)×100%。
1.2.4活性菌株的分子鑒定對具有抗TMV活性的菌株進行分子生物學(xué)鑒定,菌株基因組DNA的小量提取參照Li等的方法[10]進行。PCR引物為細菌16S rRNA序列通用引物(27f:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′;1492r:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′),參照16S rDNA Bacterial Identification PCR Kit試劑盒說明書進行。擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后送交北京諾賽基因組中心有限公司進行測序。
1.2.5菌株系統(tǒng)發(fā)育分析通過NCBI網(wǎng)站上的BLAST程序?qū)y定的序列與GenBank中的序列比較,從GenBank中獲取和試驗菌株相近種的16S rDNA序列,利用MEGA 5.1軟件構(gòu)建進化樹[11]。
2結(jié)果與分析
2.1抗TMV放線菌的篩選
將前期分離保存的47株放線菌活化后進行搖瓶發(fā)酵,收集47份發(fā)酵正常、無雜菌污染發(fā)酵上清液分別進行初篩試驗,結(jié)果表明:大部分放線菌發(fā)酵上清液無抗TMV作用,噴灑后的植株第10天逐漸表現(xiàn)葉脈間褪綠、葉片畸變、嚴重系統(tǒng)花葉至葉片壞死或矮化、或死亡,而其中6株放線菌發(fā)酵上清液處理植株未出現(xiàn)發(fā)病癥狀或僅表現(xiàn)較輕微的斑駁或系統(tǒng)花葉,具有一定的抗病毒TMV作用。將初篩的6株放線菌發(fā)酵上清液在Coker 176上進行半葉枯斑法復(fù)篩驗證,枯斑抑制率的結(jié)果見表1。從表1可以看出,菌株F187、F349、F417發(fā)酵上清液對TMV具有明顯鈍化作用,發(fā)酵上清液與TMV作用30 min后,抑制率分別為57.18%、60.27%、70.19%,菌株F370、F350-2、F251的抑制作用相對較差。
3結(jié)論與討論
由TMV導(dǎo)致的煙草花葉病毒是煙草生產(chǎn)中的一類主要病害[12],其在病葉殘體和土壤中可以存活數(shù)年,有很強的抗逆性。據(jù)調(diào)查,貴州移栽期煙苗的TMV平均帶毒率可達202%[13],可見其對貴州省煙草生產(chǎn)具有較大的潛在危害。從微生物資源中篩選抗植物病毒病物質(zhì)已成為病毒病防治研究的熱點,利用放線菌的抗病毒活性物制備新農(nóng)藥是未來無
公害農(nóng)藥的主要發(fā)展方向[13]。目前人們已發(fā)現(xiàn)鏈霉菌中多個種如諾爾斯鏈霉菌西昌變種(Strepcomces noursei var. xichangensis)、不吸水鏈霉菌遼寧變種(Streptomyces ahygroscopicus var. Liaoningensis)等放線菌產(chǎn)生的抗生素及非抗生素類物質(zhì)對植物病毒病具有一定的治療效果[14-15]。本研究中的放線菌均采集、分離自煙草根際土壤,煙草根際特有的環(huán)境可能使得菌株具有獨特的代謝方式而產(chǎn)生具有特殊活性的代謝產(chǎn)物。本研究篩選的3株放線菌發(fā)酵上清液表現(xiàn)了明顯的體外抗TMV活性,具有進一步研究和開發(fā)的價值。
本研究的主要目的在于篩選具有抗TMV活性的放線菌,筆者只對菌株發(fā)酵上清液的抗TMV活性進行了初步研究,其菌體是否具有活性還未研究;研究中采用了適合大多數(shù)放線菌的發(fā)酵培養(yǎng)基及發(fā)酵條件進行發(fā)酵,而培養(yǎng)基種類及成分、放線菌菌齡、接種量、搖培時間及轉(zhuǎn)速等對發(fā)酵液活性都有一定影響,今后可對活性放線菌的發(fā)酵條件進行優(yōu)化,對活性物質(zhì)的種類開展深入研究,同時結(jié)合基因工程菌的手段和方法,進一步挖掘、探索其在抗植物病毒上的開發(fā)應(yīng)用潛力。
致謝:云南農(nóng)業(yè)大學(xué)李應(yīng)萍同學(xué)參加了病毒接種和枯斑數(shù)統(tǒng)計工作,在此一并致謝。
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