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秀麗線蟲(chóng)mfn-1 RNAi通過(guò)依賴于ATFS-1途徑激活線粒體未折疊蛋白反應(yīng)

2014-06-13 10:53:26姚秀萍陳思希任亞光周懷彬呂建新
關(guān)鍵詞:菌膜瓊脂糖內(nèi)質(zhì)網(wǎng)

姚秀萍,陳思希,任亞光,周懷彬,呂建新

(溫州醫(yī)科大學(xué) 浙江省醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 溫州 325035)

細(xì)胞在內(nèi)部或外界環(huán)境的不利刺激下引起蛋白穩(wěn)態(tài)失衡時(shí)會(huì)激活一系列的保護(hù)性反應(yīng),具體到細(xì)胞內(nèi)的不同部位有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)未折疊蛋白反應(yīng)、細(xì)胞質(zhì)未折疊蛋白反應(yīng)、線粒體未折疊蛋白反應(yīng)(mtochondrial unfolded protein response,UPRmt)[1-6]。當(dāng)線粒體蛋白穩(wěn)態(tài)受到影響時(shí),細(xì)胞核基因編碼的定位于線粒體的分子伴侶HSP-6、HSP-60等的表達(dá)會(huì)上調(diào),以使發(fā)生錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)形成正確構(gòu)象并促進(jìn)新生蛋白質(zhì)的正確折疊,這一過(guò)程叫作UPRmt[7-9]。轉(zhuǎn)錄因子ATFS-1介導(dǎo)UPRmt信號(hào)通路,ATFS-1含有線粒體及細(xì)胞核定位序列,在正常條件下,ATFS-1進(jìn)入線粒體并被蛋白酶CLPP-1、LON-1等降解;在線粒體受到應(yīng)激時(shí),如線粒體亞基被RNAi敲低等,ATFS-1進(jìn)入線粒體減少而進(jìn)入細(xì)胞核增多,從而激活下游基因如分子伴侶HSP-6、HSP-60等表達(dá),即激活UPRmt[10-11]。線粒體膜蛋白HAF-1被認(rèn)為介導(dǎo)線粒體與細(xì)胞核之間的信號(hào)傳遞并參與UPRmt,然而最近發(fā)現(xiàn)clk-1的敲低通過(guò)HAF-1激活UPRmt,而nuo-6、cco-1等基因RNAi對(duì)UPRmt的激活則不依賴HAF-1[10,12-14]。

線粒體功能紊亂與人類許多疾病的發(fā)生有關(guān),然而在線蟲(chóng)及果蠅等低等生物中卻延緩衰老[15-17]。我們此前發(fā)現(xiàn),敲低線蟲(chóng)線粒體轉(zhuǎn)鐵蛋白MFN-1后顯著延長(zhǎng)壽命[18]?,F(xiàn)就mfn-1RNAi是否激活UPRmt及其激活的信號(hào)通路進(jìn)行研究,今后將進(jìn)一步驗(yàn)證UPRmt的激活是否介導(dǎo)了mfn-1RNAi壽命延長(zhǎng)。

1 材料和方法

1.1 材料 線蟲(chóng)N2、SJ4058、SJ4100、TJ375、SJ4005、RB867、VC3201,大腸桿菌HT115(DE3)由Caenorhabditis genetics center(CGC)提供;質(zhì)粒L4440由本實(shí)驗(yàn)室保存;LA Taq酶、DNA marker購(gòu)自寶生物有限公司;異丙基硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、氨芐青霉素、鹽酸四環(huán)素鈉、瓊脂、蛋白胨、酵母提取液、硫酸鎂、氯化鈣、磷酸氫二鉀、磷酸二氫鉀等試劑購(gòu)自Sigma;其他材料為本實(shí)驗(yàn)室保存。

1.2 SJ4058雄蟲(chóng)的制備 將L4期SJ4058線蟲(chóng)挑至鋪有HT115菌膜的板上,每板6條,共5個(gè)板,置于31 ℃熱激6 h,然后置于20 ℃培養(yǎng)。3~4 d后尋找F1代雄性線蟲(chóng)(尾巴有突起狀),將其挑至新的HT115菌膜上,然后再挑入3條雌雄同體線蟲(chóng)雜交,F(xiàn)2代可獲得大量SJ4058雄蟲(chóng)。

1.3 SJ4058線蟲(chóng)與VC3201線蟲(chóng)的雜交 將SJ4058線蟲(chóng)雄蟲(chóng)20條與VC3201線蟲(chóng)雌雄同體2條挑至同一個(gè)鋪有HT115菌膜的NGM板上(3.5 cm直徑小平皿)讓其交配產(chǎn)生F1代,將F1代雌雄同體線蟲(chóng)2條轉(zhuǎn)到新的含菌膜NGM板上讓其產(chǎn)生F2代,挑取50條F2代分別于50個(gè)NGM平板上,每板1條并編號(hào),待其產(chǎn)卵后,PCR鑒定F2代基因型,篩選出含atfs-1純合子及hsp-60::gfp線蟲(chóng)(雜合或者純合),保留陽(yáng)性的F2代平板,將每個(gè)陽(yáng)性板上的F3線蟲(chóng)取20條通過(guò)PCR鑒定hsp-60::gfp,若某個(gè)板上20條F3全能擴(kuò)增出目的基因,則該板很可能為純合子hsp-60::gfp,最后將篩選到的陽(yáng)性線蟲(chóng)品系傳一兩代后進(jìn)一步PCR驗(yàn)證以確認(rèn)。所有PCR鑒定過(guò)程均以野生型N2線蟲(chóng)為陰性對(duì)照,不加模板的為空白對(duì)照。鑒定hsp-60::gfp所用引物為:hsp-60::gfp上游(5’-CATTTTACCGCCTGA AATTC-3’),hsp-60::gfp下游(5’-CTTCCATCTTCAATGT TGTG-3’),鑒定atfs-1所用引物為:atfs-1上游(5’-TTTCAGTCGTTTCAGGACCC-3’),atfs-1下游(5’-TCATCGA GTTGATCTCACGC-3’)。PCR反應(yīng)條件為:dNTP Mixture(各2.5 mmol/L)1.6 L,10×PCR buffer 1 L,上游引物0.2 L,下游引物0.2 L,LA Taq酶(5 U/ L)0.1 L,ddH2O 6.9 L,模板DNA 5 L,總體積為15 L。反應(yīng)條件:①94 ℃ 4 min;②94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 5 min,共39個(gè)循環(huán);③72 ℃20 min;④保持在4 ℃。取5 L PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢查擴(kuò)增結(jié)果。

1.4 SJ4058線蟲(chóng)與RB867線蟲(chóng)雜交 方法類似,鑒定hsp-60::gfp用引物同上。鑒定haf-1引物為:haf-1上游(5’-CACCCCTGTCACAGACCTTT-3’),haf-1下游(5’-CGCCAGAGAACAACAGATGA-3’)。PCR反應(yīng)條件為:dNTP Mixture(各2.5 mmol/L)1.6 L,10×PCR buffer 1 L,上游引物0.2 L,下游引物0.2 L,LA Taq酶(5 U/ L)0.1 L,ddH2O 6.9 L,模板DNA 5 L,總體積為15 L。反應(yīng)條件:①94 ℃ 4 min;②94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 5 min,共39個(gè)循環(huán);③72 ℃ 20 min;④保持在4 ℃。取5 L PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢查擴(kuò)增結(jié)果。

1.5 秀麗線蟲(chóng)mfn-1的RNA干擾 分別挑取含mfn-1干擾質(zhì)粒及空載l4440質(zhì)粒的HT115菌在3 mL液體LB培養(yǎng)基(含氨芐青霉素終濃度100 g/mL,四環(huán)素12.5 g/mL)中培養(yǎng)約10 h,再加入3 L 1 mol/L IPTG培養(yǎng)1 h,然后各取70 L菌液均勻涂于NGM平板(含氨芐青霉素終濃度100 g/mL,四環(huán)素12.5 g/mL,IPTG 238.3 g/mL),放于25 ℃誘導(dǎo)12~16 h。然后將L4期線蟲(chóng)轉(zhuǎn)至菌膜上,3~4 d后,取F1代進(jìn)行各種指標(biāo)觀測(cè)。

1.6 倒置熒光顯微鏡觀測(cè) 配3%的瓊脂糖,加熱融化后滴1滴于載玻片,立即加上蓋玻片,使瓊脂糖形成硬幣大小的膜,然后移走蓋玻片。在瓊脂糖膜上滴1滴0.5%的左旋霉素麻醉劑,將同步化的mfn-1RNAi及空載l4440 RNAi處理F1代成蟲(chóng)分別放到麻醉劑里,1 min后即可觀測(cè)熒光。在同樣的曝光條件及放大倍數(shù)下觀測(cè)熒光并拍照。

2 結(jié)果

2.1 將SJ4058線蟲(chóng)分別與VC3201及RB867線蟲(chóng)雜交后獲得基因型分別為hsp-60::gfp/atfs-1(gk3094)V及hsp-60::gfp/haf-1(ok705)IV的線蟲(chóng) 首先通過(guò)熱激獲得了SJ4058雄性線蟲(chóng),將雄性SJ4058線蟲(chóng)分別與雌雄同體VC3201及RB867線蟲(chóng)雜交,通過(guò)前述方法雜交并PCR鑒定篩選到基因型為hsp-60::gfp/atfs-1(gk3094)V和hsp-60::gfp/haf-1(ok705)IV的線蟲(chóng),將該兩品系線蟲(chóng)傳幾代后進(jìn)一步PCR確認(rèn)其基因型,成功獲得雜交的線蟲(chóng),如圖1-2所示。

圖1 PCR鑒定基因型為hsp-60::gfp/atfs-1(gk3094)V的雜交線蟲(chóng)

圖2 PCR鑒定基因型為hsp-60::gfp/haf-1(ok705)IV的線蟲(chóng)

2.2Mfn-1RNAi特異性激活UPRmt分別將線蟲(chóng)SJ4058、SJ4100、TJ375、SJ4005的L4期幼蟲(chóng)放在含mfn-1RNAi質(zhì)粒及l(fā)4440空載的HT115菌膜上進(jìn)行干擾,方法如前所述。然后將F2代線蟲(chóng)在熒光倒置顯微鏡下觀測(cè)綠色熒光,根據(jù)觀測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn),mfn-1RNAi激活了線粒體的分子伴侶HSP-6及HSP-60的表達(dá),而并沒(méi)激活細(xì)胞質(zhì)分子伴侶HSP-16.2及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶HSP-4的表達(dá),如圖3所示。這表明mfn-1RNAi可能影響了線粒體蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài),激活了線粒體的反饋性反應(yīng),而細(xì)胞質(zhì)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)未受到明顯影響。

2.3Mfn-1RNAi對(duì)UPRmt的激活不依賴于線粒體膜蛋白HAF-1,而依賴于轉(zhuǎn)錄因子ATFS-1 為了驗(yàn)證mfn-1RNAi通過(guò)什么通路激活UPRmt,我們構(gòu)建了基因型分別為hsp-60::gfp/atfs-1(gk3094)V及hsp-60::gfp/haf-1(ok705)IV線蟲(chóng),對(duì)該兩種線蟲(chóng)進(jìn)行mfn-1RNAi處理后觀測(cè)熒光,并以L4440空載為對(duì)照,發(fā)現(xiàn)在atfs-1基因功能缺失線蟲(chóng)中,HSP-60表達(dá)不能被激活,而haf-1基因功能缺失的線蟲(chóng)中,HSP-60的表達(dá)仍然可以激活,如圖4所示。這說(shuō)明mfn-1RNAi 對(duì)UPRmt的激活依賴于ATFS-1,而不依賴于HAF-1。

圖3 Mfn-1 RNAi特異性激活線粒體分子伴侶,而未激活細(xì)胞質(zhì)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶的表達(dá)(×100,200 ms)

圖4 Mfn-1 RNAi對(duì)HSP-60表達(dá)的激活依賴于ATFS-1,而不依賴于HAF-1(×100,200 ms)

3 討論

線粒體是ATP合成、三羧酸循環(huán)、鐵硫簇及血紅素合成的主要場(chǎng)所[19-21]。線粒體功能紊亂與許多疾病的發(fā)生密切相關(guān),如線粒體儲(chǔ)鐵蛋白frataxin突變引起弗里德賴希共濟(jì)失調(diào),鐵硫簇組裝支架蛋白iscu突變引起肌?。╩yopathy)等[22]。在線蟲(chóng)中卻發(fā)現(xiàn)許多呼吸鏈亞基突變可以延長(zhǎng)壽命,某些保護(hù)性機(jī)制的激活被認(rèn)為促進(jìn)了長(zhǎng)壽,主要有自噬、UPRmt、蛋白質(zhì)翻譯速率降低等[17,23]。深入研究這些機(jī)制將有助于發(fā)現(xiàn)線粒體疾病的新治療方法。

MFN-1是線粒體轉(zhuǎn)鐵蛋白,我們?cè)诖饲暗难芯恐邪l(fā)現(xiàn)mfn-1RNAi后引起線蟲(chóng)體型變小,繁殖力下降,然而壽命卻顯著延長(zhǎng)[18]。本研究中,我們發(fā)現(xiàn)mfn-1RNAi激活了UPRmt,而對(duì)細(xì)胞質(zhì)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)特異性的未折疊蛋白反應(yīng)則沒(méi)有激活。這提示mfn-1RNAi影響了線粒體功能或蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài),而對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)及細(xì)胞質(zhì)蛋白穩(wěn)態(tài)影響不大。我們將hsp-60::gfp轉(zhuǎn)基因線蟲(chóng)SJ4058與atfs-1基因功能缺失線蟲(chóng)VC3201雜交,發(fā)現(xiàn)當(dāng)atfs-1缺失時(shí),UPRmt不能再被激活。這說(shuō)明mfn-1RNAi對(duì)UPRmt的激活依賴于ATFS-1。采用同樣的方法,發(fā)現(xiàn)mfn-1RNAi對(duì)UPRmt的激活不依賴于線粒體膜蛋白HAF-1。這也與文獻(xiàn)報(bào)道一致,如ISP-1、NUO-6等大部分定位于線粒體的蛋白表達(dá)降低對(duì)UPRmt的激活也不依賴于HAF-1[10,13,24]。本研究有助于繼續(xù)探索UPRmt的激活是否與mfn-1RNAi延長(zhǎng)壽命有關(guān)。

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