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LIG4和HSPB1基因多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率的相關(guān)性

2014-03-27 01:58:10郭根燕趙玉霞中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院腫瘤放射治療科沈陽003
關(guān)鍵詞:核苷酸多態(tài)性基因型

劉 丹 郭根燕 趙玉霞 白 露(中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院腫瘤放射治療科 沈陽 003)

2(中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院腫瘤放射治療科 沈陽 110001)

肺癌的發(fā)病率呈逐年上升趨勢,已經(jīng)成為全球發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤[1]。臨床工作中發(fā)現(xiàn)肺癌患者放療后腫瘤退縮程度明顯不同,主要原因在于肺癌的放射敏感性存在很大的個體差異。DNA是電離輻射的主要靶點,DNA損傷修復(fù)能力的強弱是影響放射敏感性的重要因素,與DNA修復(fù)功能相關(guān)的基因突變、多態(tài)性及表觀修飾均可使放射敏感性出現(xiàn)差異[2]。電離輻射引起的DNA損傷的修復(fù)主要由DNA雙鏈斷裂修復(fù)通路參與[3]。研究發(fā)現(xiàn) LIG4(DNA連接酶4)是DNA雙鏈斷裂修復(fù)通路中一個重要的修復(fù)因子[4-5]。熱休克蛋白B1(Heat shock protein B1, HSPB1)是熱休克蛋白(Heat shock proteins, HSPs)家族中27×103的小分子熱休克蛋白,在DNA修復(fù)方面起著重要的作用[6]。本研究擬探討HSPB1及LIG4基因單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率的相關(guān)性。

1 材料與方法

1.1 病例與材料

本研究所有對象為北方地區(qū)漢族人群,患者之間彼此均無血緣關(guān)系。在簽署知情同意書后,提供外周血標本,同時完成流行病學(xué)調(diào)查。病例來自2009年12月至2011年12月期間,中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院的137名原發(fā)性非小細胞肺癌(Non-small-cell lung cancer, NSCLC)患者,有明確的病理診斷(鱗癌87例,腺癌50例),所有患者行胸部病灶三維適形放射治療(Three-dimensional conformal radiotherapy, 3D-CRT)且具有肺內(nèi)可評估病灶者,放療前及放療20次后測量腫瘤大小。

紅細胞裂解液(3.85 g NH4Cl+0.42 g NaHCO3加雙蒸水至500 mL);核懸浮液(75 mmol·L?1NaCl、24 mmol·L?1pH=8.0, EDTA);TE 緩 沖 液(10 mmol·L?1pH=7.5 Tris-HCI、1 mmol·L?1pH=8.0 EDTA );PCR Taqman 探針及引物(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司);Taqman Master Mix(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司);Eppendorf BioPhotometer核酸蛋白測定儀(德國Eppendoff公司);低溫離心機(德國Sigma公司);移液器(法國Gilson公司);96孔板及蓋膜(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司);ABI 7500熒光定量PCR儀(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)。

1.2 調(diào)查方法

采用統(tǒng)一制定打印的調(diào)查表,由2名培訓(xùn)的調(diào)查員對病例進行流行病學(xué)調(diào)查,調(diào)查內(nèi)容包括每個研究對象詳細的人口學(xué)資料、吸煙史、組織類型、臨床表現(xiàn)和伴發(fā)疾病等。非吸煙者指終生吸煙少于100支的個體。所有參與研究的個體外周血標本采集使用枸櫞酸鈉抗凝試管,每人采血2 mL,在?20 ℃到?80 ℃的冰箱中凍存。腫瘤放射治療方案采用三維適形治療,放療單次劑量2 Gy,5次/周,總劑量(Total dose,DT)達到40 Gy/20次/4周后重新CT定位,觀察腫瘤消退情況,重新制定放療計劃,單次劑量改為2.5 Gy,5次/周,共8次,使腫瘤DT達到60 Gy。腫瘤體積用放射治療計劃系統(tǒng)計算,放療前腫瘤體積(Vpre),放療40 Gy后的腫瘤體積(Vmid)。用下面的公式計算腫瘤體積退縮率(R)。

所有調(diào)查資料、臨床資料經(jīng)反復(fù)檢查、核對和編碼后,用Excel軟件進行數(shù)據(jù)錄入。

1.3 實驗方法

采用酚-氯仿法集中進行基因組DNA提取,提取后測OD值確定DNA的原始濃度,再倍比稀釋到30?100 ng·μL?1的終濃度備用。采用Taqman real-time PCR方法進行單核苷酸多態(tài)性的基因分型?;蚍中驮贏BI 7500熒光定量PCR儀上進行,擴增條件為:95 ℃預(yù)變性10 min;92 ℃變性30 s,60 ℃退火以及延伸1 min;共47個循環(huán)。以SDS(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)軟件 Allelic Discrimination程序進行終點分析,通過檢測不同等位基因所標記的FAM和VIC熒光強度,判斷待測樣本的基因型。

1.4 統(tǒng)計學(xué)分析

采用SPSS 13.0統(tǒng)計軟件進行分析,數(shù)據(jù)比較用t檢驗和方差分析,p<0.05時認為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 非小細胞肺癌病例的一般特征

137例患者,平均年齡60.1±5.33歲,腫瘤平均退縮率為0.3474±0.1910,鱗癌87例,腺癌50例,男102例,女35例,Ⅰ期9例,Ⅱ期26例,Ⅲ期70例,Ⅳ期32例。吸煙95例,吸煙者放療腫瘤退縮率明顯高于非吸煙者,分別為0.3755±0.1775和0.2840±0.2068,t=2.643,p=0.009。性別、病理類型及臨床分期與放療腫瘤退縮率無關(guān),具體見表1。

表1 非小細胞肺癌病例的一般特征與放療腫瘤退縮率關(guān)系Table 1 The relationship between general character and the ratio of tumor-decreased-size

2.2 LIG4及HSPB1基因單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率的關(guān)系

LIG4rs1805388的CC、CT和TT基因型放療腫瘤退縮率分別是0.3395±0.1802、0.342±0.2106和0.5038±0.1892,經(jīng)方差分析,F(xiàn)=2.142,p=0.121,3種基因型腫瘤退縮率無統(tǒng)計學(xué)意義。但經(jīng)LSD兩兩比較發(fā)現(xiàn),TT基因型腫瘤退縮率明顯高于CC基因型,p= 0.041。HSPB1rs2868371 GG、CG和CC基因型放療腫瘤退縮率分別是0.3454±0.1932、0.3487±0.1998和0.3487±0.1652,經(jīng)方差分析和LSD兩兩比較,未發(fā)現(xiàn)3種基因型之間有統(tǒng)計學(xué)差異(見表2)。

表2 LIG4和HSPB1基因單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率的相關(guān)性Table 2 The relationship among genetic single nucleotide polymorphisms of LIG4 and HSPB1 and the ratio of tumor-decreased-size

3 討論

吸煙是肺癌的主要危險因素,其中男性的歸因風(fēng)險為80%,女性的歸因風(fēng)險為45%[7]。非小細胞肺癌中鱗狀細胞癌與吸煙狀況密切相關(guān)[8]。放射生物學(xué)研究發(fā)現(xiàn)鱗狀細胞癌的放射敏感性高于腺癌細胞。我們的研究得出吸煙者放療腫瘤退縮率明顯高于非吸煙者,p=0.009,有統(tǒng)計學(xué)意義。目前還未見吸煙與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率相關(guān)的其他報道,我們的研究結(jié)果有待大樣本實驗進一步驗證。

非同源末端鏈接(Non-homologous end joining,NHEJ)修復(fù)是哺乳動物細胞中DNA雙鏈斷裂(DNA double-strand breaks, DSBs)修復(fù)的主要途徑。DNA 連接酶 IV及 X-射線修復(fù)交叉互補基因均為NHEJ 修復(fù)通路中的重要基因[9],影響著腫瘤細胞DNA 損傷后的修復(fù)能力及腫瘤細胞對放療的敏感性[10]。NHEJ修復(fù)主要是通過DNA依賴蛋白激酶(DNA dependent proteinkinase, DNAPK)和XRCC4-LIG4連接復(fù)合體共同完成的[11]。既往的研究[12-13]顯示,XRCC4-LIG4連接復(fù)合體功能喪失嚴重影響DNA斷裂雙鏈的再連接,增強放射敏感性。DNA連接酶4綜合癥是一種罕見的先天性疾病,因LIG4基因突變導(dǎo)致患者對放射線極度敏感[14]。我們的研究顯示LIG4rs1805388的CC、CT和TT基因型放療腫瘤退縮率分別是0.3395±0.1802、0.342±0.2106和0.5038±0.1892,兩兩比較發(fā)現(xiàn),TT基因型腫瘤退縮率明顯高于CC基因型。從我們的實驗數(shù)據(jù)可推論出攜帶LIG4rs1805388TT基因型非小細胞肺癌患者放療后腫瘤退縮率高,提示對放療敏感。但這仍需要大量的實驗研究去驗證。

熱休克蛋白B1,又稱熱休克蛋白27,是小分子熱休克蛋白(sHSP)亞家族的重要一員。Hsp27蛋白可以通過多種途徑影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,包括維持細胞骨架的正常結(jié)構(gòu)而保證細胞正常生長和存活、調(diào)節(jié)機體內(nèi)谷胱甘肽水平進而提高細胞對氧化應(yīng)激的敏感度[15-16]、抑制內(nèi)源性和外源性細胞凋亡通路、參與DNA損傷的修復(fù)等。研究顯示HSPB1通過下調(diào)炎癥反應(yīng),增強細胞對放射線抵抗力[17-18]。Zhang等[19]研究顯示鼻咽癌細胞中HSPB1表達上調(diào),增強鼻咽癌細胞對放射線抵抗力。Guo等[20]研究顯示HSPB11271C 等位基因可通過下調(diào)HSP27表達降低DNA修復(fù)能力,增加肺癌細胞對放化療的敏感性。我們研究結(jié)果顯示HSPB1rs2868371基因的單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率無關(guān)。目前針對基因的單核苷酸多態(tài)性的研究中,來自不同民族、不同地區(qū)的研究對象可能得到不同、甚至矛盾的結(jié)果,這可能與遺傳因素的地域性和種族性有關(guān),還有可能是與樣本含量較小有關(guān),HSPB1rs2868371位點純合突變率較低,小樣本結(jié)果不能達到應(yīng)有的統(tǒng)計效能。所以HSPB1rs2868371單核苷酸多態(tài)性與非小細胞肺癌放療腫瘤退縮率的關(guān)系還有待于進一步研究。

本研究發(fā)現(xiàn)吸煙者和LIG4rs180538TT基因型非小細胞肺癌患者放療腫瘤退縮率高于其他患者,為臨床提高非小細胞肺癌治療療效提供理論依據(jù)。

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