国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

水稻中兩個同源異型結(jié)構(gòu)域轉(zhuǎn)錄因子的亞細胞定位

2014-02-18 08:38李政龍欒維江
關(guān)鍵詞:同源擬南芥結(jié)構(gòu)域

李政龍,申 奧,欒維江

(天津師范大學(xué)a.生命科學(xué)學(xué)院,b.天津市動植物抗性重點實驗室,天津300387)

同源異型盒(homeobox,HB)是同源異型基因中都具有的保守基序,廣泛存在于動物、植物和微生物中.該序列出現(xiàn)在真核生物進化的早期,在生物發(fā)育中具有重要功能[1].由同源異型盒編碼的蛋白序列稱為同源異型結(jié)構(gòu)域(homeodomain,HD).植物HB轉(zhuǎn)錄因子家族可分為6類:HD-Zip(homeodomain-leucinezipper)、KNOX (knotted-like homeobox)、PHD-Finger(plant homeodomain-finger)、BELL(bell homeodomain)、WOX(Wuschel-related homeobox)和 ZF-HD(zinc fingerhomeodomain)[2].其中,HD-Zip由DNA同源異型結(jié)構(gòu)域和附加的leucine-zipper(亮氨酸拉鏈)元件組成[3],主要參與調(diào)控植物正常生長以及環(huán)境脅迫后植物的生長發(fā)育[4].根據(jù)結(jié)構(gòu)域的保守性、序列結(jié)構(gòu)以及生理學(xué)功能,HD-Zip家族又可以分為HD-ZipⅠ、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ等4個亞家族[4].HD-ZipⅢ基因是近年來研究較多的一類,在植物胚胎及胚后形態(tài)發(fā)生(頂端分生組織及側(cè)生分生組織的形成)、側(cè)生器官的極性建立和維管組織細胞分化為葉片的功能等方面具有重要作用[5-6].如擬南芥中HD-ZipⅢ基因家族包括 AtHB8、AVB1(REV)/IFL1//REVOL UTA、AtHB15/CORONA(CAN)、AtHB9(PHV)/PHAVO-LUTA和AtHB14(PHB)等5個成員,它們在調(diào)控頂端分生組織的分化、側(cè)部器官的極性和次生維管的發(fā)育中發(fā)揮重要作用[2].水稻中HD-ZipⅢ也有5個成員,HDZ1和HDZ2是其中的2個基因.

植物蛋白質(zhì)的亞細胞定位是系統(tǒng)理解植物形態(tài)建成、生長發(fā)育和逆境耐性等必不可少的環(huán)節(jié),也是功能基因組學(xué)的重要內(nèi)容[7].綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是細胞生物學(xué)研究領(lǐng)域廣泛使用的一種報告因子,該因子能在藍光或紫光的激發(fā)下產(chǎn)生綠色熒光[8],具有檢測方便、高效、無需輔助因子和底物、對宿主細胞無傷害等優(yōu)點[9],常用于活細胞中蛋白的鑒定、跟蹤和分析.1994年Chalfie等[10]首次用GFP作為報告蛋白,之后,GFP作為報告蛋白在多種植物、動物和微生物中均能夠成功表達,并逐漸發(fā)展為一項成熟的技術(shù)[11].

本課題組構(gòu)建了HDZ1和HDZ2轉(zhuǎn)錄因子的GFP融合表達載體,并分析其亞細胞定位,初步研究這2個轉(zhuǎn)錄因子在水稻中的功能和作用.

1 實驗材料與方法

1.1 實驗材料

水稻品種花11及煙草種植于天津師范大學(xué)人工氣候箱.農(nóng)桿菌菌株EHA105、pCAMBIA35S-GFP質(zhì)粒由本實驗室保存.

1.2 表達載體的構(gòu)建

從生長約15d的水稻幼苗中提取RNA.利用RTPCR擴增HDZ1和HDZ2基因編碼區(qū)(去除終止密碼子序列). 所用 HDZ1的引物為 F:5′-TCAgagctc-ATTTGGCTTTGGCGAGGTAG-3′;R:5′-TACgtcgac-CACAAAGGACCAGTTGACGA-3′.HDZ2的引物為 F:5′-ATAgagctcGAGAAGAAGGAGAAGGGTCG-3′;R :5′-CTGtctagaGACGAATGACCAGTTGACGA-3′.反應(yīng)條件為:95℃,3 min;94℃,30s;55℃,30s;72℃,2.5min,運行32個循環(huán);72℃,5min.回收目的片段.用相應(yīng)的酶切位點(HDZ1為samI和sacI,HDZ2為sacI和salI)與空載體pCAMBIA35S-GFP連接獲得融合表達載體.

1.3 電激轉(zhuǎn)化

將感受態(tài)細胞取出解凍,向感受態(tài)細胞中加入1~3 μL連接產(chǎn)物,輕輕混勻,加入電擊杯中,冰上冷卻2~3 min.將電擊杯置于電擊儀中1800V電擊后,取出電擊杯中的混合液轉(zhuǎn)入1.5mL離心管中,加入LB培養(yǎng)液培養(yǎng)至1個月,28℃搖床(220r/min)活化 3 min.取200μL涂布LB平板(含50mg/L的卡那霉素或50mg/L的利福平),28℃培養(yǎng)2~3 d.

1.4 GFP融合載體的瞬時表達

挑取含有重組質(zhì)粒的農(nóng)桿菌,單克隆于液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)2d.待菌液濃度達到OD值為0.5時,取2mL菌液加入離心管中,12000r/min離心1min,去上清液,重復(fù)加入2mL菌液,12000r/min離心1min,去上清液.加入2mL注射液(1mol/L的MgCl2、1mol/L的MES和0.2mol/L的AS),充分振蕩混勻.將混合液在室溫下靜置4h,之后進行煙草葉片轉(zhuǎn)化,3~4d后取煙草葉片表皮觀察GFP瞬時表達.

2 結(jié)果與分析

2.1 基因的同源比較

HDZ1和HDZ2是水稻HD-ZipⅢ家族成員,分別編碼1個由839和862個氨基酸組成的蛋白質(zhì).HDZipⅢ蛋白含有4個結(jié)構(gòu)域,從N端到C端依次是同源異型結(jié)構(gòu)域(HD)、亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域(ZIP)、START結(jié)構(gòu)域(START)和MEKHLA結(jié)構(gòu)域,如圖1(a)所示.其中,HD和ZIP結(jié)構(gòu)域在植物中有較高保守性.通過對HDZ1和HDZ2蛋白的HD和ZIP序列比較,發(fā)現(xiàn)二者在HD結(jié)構(gòu)的約60個保守氨基酸序列中,只有 7處不同,分別為第 18、19、24、26、32、39、57號殘基,如圖 1(b)所示.

圖1 HDZ1和HDZ2蛋白的結(jié)構(gòu)域及同源性比較Fig.1 Homeodomain and comparison of HDZ1and HDZ2

2.2 GFP融合載體的構(gòu)建及其酶切檢測

按照水稻數(shù)據(jù)庫中全長cDNA序列,設(shè)計帶有與載體中酶切位點對應(yīng)的特異性引物,用RT-PCR方法擴增目的基因的ORF(去除終止密碼子序列).由于該轉(zhuǎn)錄因子家族在植物頂端分生組織中有較高的表達[22],因此收集發(fā)芽后15d的水稻幼苗,提取RNA,反轉(zhuǎn)錄后獲得cDNA模板進行PCR反應(yīng).HDZ1和HDZ2的ORF長度分別為2520bp和2589bp.為了驗證獲得的目的基因在PCR過程中是否有堿基突變,對獲得的條帶進行回收純化,電泳結(jié)果如圖2a所示,再進行下一步的酶切和連接.

圖2 目的基因和重組質(zhì)粒的電泳圖Fig.2 Electropherogram of target genes and recombinant plasmids

連接轉(zhuǎn)化后挑取單克隆進行酶切鑒定,重組質(zhì)粒都切出了預(yù)期的約2.5kb的片段,如圖2b所示,進行測序.與數(shù)據(jù)庫中的序列(HDZ1的基因號為LOC_Os03g01890,HDZ2為 LOC_Os03g43930)進行比對和確認,表明目的基因成功連接到載體中,可以進行下一步的亞細胞定位.

2.3 HDZ1和HDZ2亞細胞定位

重組質(zhì)粒(pCAMBIA35S-HDZ1-GFP、pCAMBIA35SHDZ2-GFP)和空載體質(zhì)粒(pCAMBIA35S)轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,注射煙草葉片進行瞬時表達,用熒光顯微鏡(Leica DM5000B)觀察,確定HDZ1和HDZ2在細胞中的作用部位.結(jié)果表明:在空載體對照中,GFP熒光信號在整個細胞中都有表達,無表達特異性,如圖3(a)和圖3(e)所示;在pCAMBIA35S-HDZ1-GFP融合瞬時表達中,GFP熒光信號與明場中的氣孔完全重合,如圖3b~3d所示,這說明HDZ1定位在氣孔細胞中,可能在植物的氣孔中發(fā)揮著重要作用;pCAMBIA35S-HDZ2-GFP融合瞬時表達細胞中,GFP熒光信號主要定位于煙草表皮細胞的細胞膜上,如圖 3(f)~圖 3(h)所示.

圖3 目的基因在煙草葉片下表皮細胞中的瞬時表達Fig.3 Transient expression of target genes in epidermal cells of leaf of tobacco

3 討論

轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors,TFs)也稱反式作用因子(trans-acting factor),是一類能夠與DNA或RNA中順式作用元件發(fā)生特異性相互作用的DNA結(jié)合蛋白,通過它們之間以及與其他相關(guān)蛋白之間的相互作用激活或抑制某些基因的轉(zhuǎn)錄與表達[12].從蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析,典型的植物轉(zhuǎn)錄因子由核定位信號區(qū)(nuclear localization signal,NLS)、DNA 結(jié)合區(qū)(DNA binding domain,BD)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)(transcription regulation domain)和寡聚化位點區(qū)(oligomerization site)等4個功能區(qū)域組成[13].核定位信號區(qū)將轉(zhuǎn)錄因子定位到細胞核[14],所以大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子定位在細胞核中,如擬南芥中的Roc5[15]、大豆中的GmERF5[16]、小麥中的W17[17]等.但也有例外,如擬南芥熱激轉(zhuǎn)錄因子AtHsfA6a在細胞質(zhì)中的表達[18].目前,關(guān)于擬南芥HDZipⅢ轉(zhuǎn)錄因子家族亞細胞定位方面的研究很少,僅Zhong等[19]發(fā)現(xiàn)IFL基因定位在細胞核.在擬南芥的維管組織生長發(fā)育過程中,ATHB8具有促進維管組織分化的作用,過量表達會導(dǎo)致木質(zhì)素積累過多[13].REV、CAN、PHB和PHV可以調(diào)控頂端分生組織的分化和側(cè)部器官的極性,但REV與CAN、PHB、PHV在調(diào)控維管發(fā)育過程中作用相反[20].在葉片極性建立方面,REV和PHB的顯性突變體都出現(xiàn)了不同程度的近軸面化,產(chǎn)生了喇叭狀葉、棒狀葉和針狀葉[21].水稻HD-ZipⅢ家族基因與擬南芥HD-ZipⅢ家族基因具有同源性,在功能上可能也是調(diào)控頂端分生組織的分化和側(cè)部器官的極性.本課題組研究發(fā)現(xiàn),水稻HDZ1轉(zhuǎn)錄因子定位在氣孔細胞中,猜測該基因可能在水稻葉片的生長發(fā)育中起到一定作用;HDZ2定位在細胞膜上,其功能尚不清楚.雖然HDZ1和HDZ2具有較高的同源性,但在水稻的生長發(fā)育中所起作用是否相同有待于進一步研究.

[1] 劉國振,朱立煌.植物同源盒基因的克隆與功能研究[J].遺傳,1998,20(3):42-47.

[2] 秦永芳,李登弟,李學(xué)寶.植物HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子研究進展[J].細胞生物學(xué)雜志,2009,31(4):514-520.

[3]NAKASHIMA K,ITO Y,YAMAGUCHI-SHINOZAKI K.Transcriptional regulatory networks in response to abiotic stresses in Arabidopsis and grasses[J].Plant Physiol,2009,149(1):88-95.

[4] HARRIS J C,HRMOVA M,LOPATO S,et al.Modulation of plant growth by HD-Zip classⅠandⅡtranscription factors in response to en-vironmental stimuli[J].New Phytol,2011,190(4):823-837.

[5]朱瑩瑩,于亮亮,汪杏芬,等.HD-ZipⅢ轉(zhuǎn)錄因子家族與植物細胞分化[J].植物學(xué)報,2013,48(2):199-209.

[6]LUAN W J,SHEN A,JIN Z P,et al.Knockdown of OsHox33,a member of the classⅢ homeodomain-leucine zipper gene family,accelerates leaf senescence in rice[J].Science China:Life Sciences,2013,56(12):1113-1123.

[7] 邢浩然,劉麗娟,劉國振.植物蛋白質(zhì)的亞細胞定位研究進展[J].華北農(nóng)學(xué)報,2006,21(增刊):1-6.

[8]YANG F,MOSS L G,PHILLIPS G N J R.The molecular structure of green fluorescent protein[J].Nature Biotech,1996,14(10):1246-1251.

[9] HEIM R,CUBITT A B,TSIEN R Y.Improved green fluorescence[J].Nature,1995,373(6516):663-664.

[10]CHALFIE M,TU Y,EUSKIRCHEN G,et al.Green fluorescent protein as a marker for gene expression[J].Science,1994,263(5148):802-805.

[11]張俊蓮,王蒂,張金文,等.用綠色熒光蛋白和洋蔥表皮細胞檢測擬南芥rd29A基因啟動子活性的方法[J].植物生理學(xué)通訊,2005,41(6):815-819.

[12]BASTOLA D R,PETHE V V,WINICOV I.Alfin1,a novel zinc-finger protein in alfalfa roots that binds to promoter elements in the saltinducible MsPRP2gene[J].Plant Molecular Biology,1998,38(6):1123-1135.

[13]OHASHI-ITO K,KUBO M,DEMURA T,et al.ClassⅢhomeodomain leucine-zipper proteins regulate xylem cell differentiation[J].Plant and Cell Physiology,2005,46(10):1646-1656.

[14]羅紅麗,宋鳳鳴,鄭重.水稻homeodomain型轉(zhuǎn)錄因子基因OsBIHD1在抗病和抗逆反應(yīng)中起不同作用[C]//中國植物病理學(xué)會2006年學(xué)術(shù)年會論文集.北京:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)出版社,2006:304.

[15]ZOU L,SUN X,ZHANG Z,et al.Leaf rolling controlled by the homeodomain leucine zipper class IV gene Roc5in rice[J].Plant Physiology,2011,156(3):1589-1602.

[16]翟瑩,楊曉杰,孫天國,等.大豆轉(zhuǎn)錄因子GmERF5的克隆、表達及功能分析[J].植物學(xué)報,2013,48(5):498-506.

[17]趙云祥,徐兆師,陳明,等.小麥ERF類轉(zhuǎn)錄因子W17的結(jié)合特異性及亞細胞定位分析[J].中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2008,41(6):1575-1582.

[18]鞏振輝,逯明輝,馬超,等.擬南芥熱激轉(zhuǎn)錄因子AtHsfA 6a的克隆[J].西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2008,36(4):94-98.

[19]ZHONG R,YE Z H.IFL1,a gene regulating interfascicular fiber differentiation in Arabidopsis,encodes a homeodomain-leucine zipper protein[J].The Plant Cell Online,1999,11(11):2139-2152.

[20]PRIGGE M J,OTSUGA D,ALONSO J M,et al.ClassⅢhomeodomain leucine-zipper gene family members have overlapping,antagonistic,and distinct roles in Arabidopsis development[J].Plant Cell,2005,17(1):61-76.

[21]EMERYJF,F(xiàn)LOYDSK,ALVAREZJ,etal.Radialpatterningof Arabidopsis shoots by ClassⅢHD-ZIP and KANADI genes[J].Current Biology,2003,13(20):1768-1774.

猜你喜歡
同源擬南芥結(jié)構(gòu)域
細菌四類胞外感覺結(jié)構(gòu)域的概述
以同源詞看《詩經(jīng)》的訓(xùn)釋三則
UBR5突變與淋巴瘤B細胞成熟
“鋌”有“直”義的詞源學(xué)解釋——兼說/直/義的同源詞族
同源賓語的三大類型與七項注意
兩種LED光源作為擬南芥生長光源的應(yīng)用探究
虔誠書畫乃同源
口水暴露了身份
PTPMeg2的PTP結(jié)構(gòu)域?qū)α姿峄疭TAT3入核的抑制作用
木醋液與6-芐基腺嘌呤對擬南芥生長的影響研究