国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

某院鮑曼不動(dòng)桿菌流行克隆株的分子特征

2014-02-14 01:49:36劉超梅胡曉冬邢紅英郭素芳李雪梅楊曉波
解放軍醫(yī)藥雜志 2014年2期
關(guān)鍵詞:譜系鮑曼分型

劉超梅,胡曉冬,邢紅英,郭素芳,李雪梅,楊曉波,肖 麗

近年來,鮑曼不動(dòng)桿菌(acinetobacter baumannii)引起的醫(yī)院感染日益突出[1-4],其主要流行克隆株的監(jiān)測(cè)及定義已成為分子流行病學(xué)學(xué)者關(guān)注的熱點(diǎn)[5-6]。有研究依據(jù)AFLP分型方法將鮑曼不動(dòng)桿菌的流行菌株分別定義為歐洲克隆譜系Ⅰ、Ⅱ和

Ⅲ[7];而英國(guó)學(xué)者 Turton等[8]依據(jù)脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)分型方法發(fā)現(xiàn)了SE克隆系、OXA-23克隆系1和2。Turton等[9]基于序列分型的多重聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)方法,實(shí)現(xiàn)了準(zhǔn)確而快速地對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌的同源性進(jìn)行分析,該研究將上述不同的克隆譜系分為3組(Group 1、Group 2和 Group 3),Group 1包括SE克隆系、歐洲克隆譜系Ⅱ及OXA-23克隆系1,Group 2包括歐洲克隆譜系Ⅰ、OXA-23克隆系2等,而Group 3主要包括歐洲克隆譜系Ⅲ。本文對(duì)不重復(fù)鮑曼不動(dòng)桿菌進(jìn)行同源性分析,了解其主要流行克隆株的分子特征,為控制醫(yī)院感染提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 菌株來源 將解放軍253醫(yī)院2010年6月—2012年12月臨床分離的74株不重復(fù)鮑曼不動(dòng)桿菌作為實(shí)驗(yàn)菌株,標(biāo)本來源:痰32例,尿16例,創(chuàng)面或傷口分泌物13例,血液10例,腦脊液3例。

1.2 引物合成及PCR擴(kuò)增 多種耐藥基因、Group 1和Group 2多重PCR引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增方法參照文獻(xiàn)[10-12],引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。PCR產(chǎn)物在含0.5μg/ml溴化乙啶(EB)的1.5%瓊脂糖凝膠上電泳,用凝膠成像系統(tǒng)記錄電泳結(jié)果,每次PCR檢測(cè)均設(shè)陰性對(duì)照。同時(shí)于陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物中隨機(jī)抽取3株,送上海英駿生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果通過GenBank(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)比對(duì)分析。

1.3 PFGE實(shí)驗(yàn)方法 按國(guó)家疾病控制中心傳染病所PulseNet China網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室提供的鮑曼不動(dòng)桿菌PFGE標(biāo)準(zhǔn)程序進(jìn)行操作,具體實(shí)驗(yàn)方法及結(jié)果分析參照文獻(xiàn)[13]。

1.4 克隆菌株聚類分析 基于序列分型的多重PCR方法鑒定鮑曼不動(dòng)桿菌的主要流行克隆譜系,結(jié)果判定參照文獻(xiàn)[12]。PFGE實(shí)驗(yàn)得到74株鮑曼不動(dòng)桿菌的DNA指紋圖譜,用BioNumerics軟件對(duì)各菌株間進(jìn)行聚類分析,將相似性系數(shù)87%作為不同型別的區(qū)分標(biāo)準(zhǔn),相似度>87%為同一亞型,代表同一克隆株;<87%為不同的基因型,代表不同的克隆株。

1.5 多重耐藥相關(guān)基因譜分析 應(yīng)用PCR及測(cè)序方法[10-12]檢測(cè)10種多重耐藥相關(guān)基因(blaOXA-51-like、blaOXA-23-like、blaOXA-24-like、blaOXA-58-like、blaTEM、blaampC、armA、ISA ba1、intI 1 和 intI 2)的攜帶情況。

2 結(jié)果

2.1 Group PCR序列分型結(jié)果 74株鮑曼不動(dòng)桿菌分為 6種 Group序列型(SG),其中 57株(77.0%)為 Group SG1,4 株(5.4%)為 Group SG4,8株(10.8%)為 Group SG5,2株(2.7%)為 Group SG9,1 株(1.4%)為 Group SG11,2 株(2.7%)為Group SG13。

2.2 克隆菌株聚類分析結(jié)果 74株鮑曼不動(dòng)桿菌的PFGE帶型表現(xiàn)出多樣性,可大致分為13種圖譜,其中 A型35株、B型17株、C型7株、D型5株,其余型別10株。74株鮑曼不動(dòng)桿菌克隆菌株聚類分析樹狀圖見圖1。

2.3 鮑曼不動(dòng)桿菌多重耐藥相關(guān)基因譜的分布情況 blaOXA-51-like在所有菌株中均為陽(yáng)性,除blaOXA-24-like、blaOXA-58-like和 intI 2基因?yàn)殛幮酝猓溆喽嘀啬退幭嚓P(guān)基因均有陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物,通過陽(yáng)性菌株數(shù)所占實(shí)驗(yàn)菌株數(shù)的比例獲得耐藥相關(guān)基因的陽(yáng)性率,耐藥相關(guān)基因 blaOXA-23-like、blaTEM、blaampC、armA、ISA ba1和intI 1的陽(yáng)性率分別為54.1%(40/74)、86.5%(64/74)、66.2%(49/74)、89.2%(66/74)、90.5%(67/74)和85.1%(63/74),并且測(cè)序結(jié)果與GenBank庫(kù)中的已知序列具有高度的一致性。多種耐藥基因在不同PFGE型中的分布情況見表1。結(jié)果顯示,多種耐藥基因在A型和B型菌種中的分布比較集中,同一耐藥基因在不同PFGE型中呈現(xiàn)出交叉分布現(xiàn)象。

表1 74株鮑曼不動(dòng)桿菌多重耐藥相關(guān)基因在不同PFGE型別中的分布情況(株)

圖1 74株鮑曼不動(dòng)桿菌克隆菌株聚類分析樹狀圖

3 討論

在鮑曼不動(dòng)桿菌的流行病學(xué)調(diào)查和預(yù)防控制研究方面,尤其是在醫(yī)院感染暴發(fā)期間,為了證實(shí)是否存在其克隆株的傳播流行,實(shí)現(xiàn)感染源的溯源,迫切需要選用一種行之有效的基因分型方法?;赟G的多重PCR方法操作簡(jiǎn)便,結(jié)果容易判讀,無需進(jìn)一步測(cè)序或應(yīng)用其他分型技術(shù),非常適合于臨床實(shí)驗(yàn)室快速準(zhǔn)確地鑒定鮑曼不動(dòng)桿菌流行菌株的SG或克隆系,從而有助于實(shí)時(shí)掌控鮑曼不動(dòng)桿菌院內(nèi)感染發(fā)生的流行趨勢(shì)。

本研究結(jié)果顯示,本組鮑曼不動(dòng)桿菌克隆譜系以Group GS1為主,占77.0%。根據(jù)Group GS1對(duì)應(yīng)于歐洲克隆譜系Ⅱ的結(jié)果判斷依據(jù),解放軍253醫(yī)院臨床分離的74株鮑曼不動(dòng)桿菌的流行克隆譜系主要為歐洲克隆譜系Ⅱ,該譜系是鮑曼不動(dòng)桿菌最大的流行克隆系,在全世界不同國(guó)家均有分布。

目前,多種基因分型技術(shù)在鮑曼不動(dòng)桿菌菌株分型中得到了廣泛應(yīng)用[14-18],其中PFGE被譽(yù)為細(xì)菌分子流行病學(xué)分型技術(shù)的“金標(biāo)準(zhǔn)”[19]。本研究對(duì)74株鮑曼不動(dòng)桿菌進(jìn)行了PFGE分型,在87%的相似性水平上,共得到13種PFGE圖譜,顯示出高度多樣性,其中A型和B型為主要型別,分別占總菌株數(shù)的 47.3%(35/74)和 23.0%(17/74),說明在解放軍253醫(yī)院住院患者中存在鮑曼不動(dòng)桿菌主要克隆株的流行。因此,需要臨床醫(yī)生能快速、實(shí)時(shí)地監(jiān)測(cè)、追蹤鮑曼不動(dòng)桿菌主要流行克隆株的變化趨勢(shì),并采取合理措施預(yù)防和控制其傳播,尤其要防控醫(yī)院感染的流行或暴發(fā)。

鮑曼不動(dòng)桿菌的耐藥呈逐年上升趨勢(shì)[20-23],OXA類碳青霉烯酶、插入序列、整合子、ampC酶、超廣譜β內(nèi)酰胺酶(ESBLs)等在鮑曼不動(dòng)桿菌的多重耐藥機(jī)制方面發(fā)揮著重要的作用[24-25]。本研究結(jié)果顯示,40株(54.1%)鮑曼不動(dòng)桿菌攜帶有blaOXA-23-like基因,進(jìn)一步證實(shí)耐碳青霉烯類的鮑曼不動(dòng)桿菌以產(chǎn) OXA-23型碳青霉烯酶為主[10];在66.2%的菌株中檢出blaampC基因,86.5%的菌株中檢出blaTEM基因,可見對(duì)于本組分離的鮑曼不動(dòng)桿菌,blaTEM的檢出率高于國(guó)內(nèi)其他地區(qū)水平[12]。通過檢測(cè)整合酶基因可以篩查和鑒定鮑曼不動(dòng)桿菌的多重耐藥性[26]。在本研究74株鮑曼不動(dòng)桿菌中僅檢測(cè)出intI 1,未發(fā)現(xiàn)intI 2,說明本組鮑曼不動(dòng)桿菌主要攜帶Ⅰ類整合子,檢出率高達(dá)85.1%。在鮑曼不動(dòng)桿菌中,ISA ba1通過提供啟動(dòng)子序列來增強(qiáng)β內(nèi)酰胺酶的表達(dá)[27],ADC型ampCβ內(nèi)酰胺酶和OXA類碳青霉烯酶基因的上游經(jīng)常發(fā)現(xiàn)存在有ISA ba1,本研究中插入序列ISA ba1的檢出率高達(dá)90.5%。16SrRNA甲基化酶基因armA絕大多數(shù)位于整合子、質(zhì)粒等可移性遺傳元件上,易于在細(xì)菌間傳播,與阿米卡星的耐藥性密切相關(guān),本研究74株實(shí)驗(yàn)菌株中89.2%的菌株攜帶此基因。

本研究對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌多重耐藥相關(guān)基因在不同PFGE型別中的分布特征進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)在不同的PFGE型別中同一耐藥基因呈現(xiàn)出交叉分布現(xiàn)象,進(jìn)一步說明了在具有不同遺傳背景的鮑曼不動(dòng)桿菌中發(fā)生著耐藥基因的水平轉(zhuǎn)移。

[1] 侯萬樂,田萍.98株鮑曼不動(dòng)桿菌醫(yī)院感染分布及耐藥性分析[J].中國(guó)當(dāng)代醫(yī)藥,2010,17(36):83-84.

[2] 喻茂文,肖嚴(yán),周呂蒙,等.臨床鮑曼不動(dòng)桿菌分布和耐藥性分析[J].中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生,2012,50(28):62-64.

[3] 燕成嶺,曹銀芳,李鳳娥.鮑曼不動(dòng)桿菌感染分布及耐藥性分析[J].中國(guó)醫(yī)藥,2011,6(7):863-864.

[4] 安寶清,王金俠,唱麗敏.320株鮑曼不動(dòng)桿菌的臨床分布及耐藥性分析[J].臨床薈萃,2011,26(17):1534-1536.

[5] Higgins P G,Janssen K,F(xiàn)resen M M,et al.Molecular epidemiology of Acinetobacter baumannii bloodstream isolates obtained in the United States from 1995 to 2004 using rep-PCR and multilocus sequence typing[J].JClin Microbiol,2012,50(11):3493-3500.

[6] Hamouda A,Evans B A,Towner K J,et al.Characterization of epidemiologically unrelated Acinetobacter baumannii isolates from four continents by use of multilocus sequence typing,pulsed-field gel electrophoresis,and sequence-based typing of bla(OXA-51-like)genes[J].J Clin Microbiol,2010,48(7):2476-2483.

[7] van Dessel H,Dijkshoorn L,van der Reijden T,et al.Identification of a new geographically widespread multiresistant Acinetobacter baumanniiclone from European hospitals[J].Res Microbiol,2004,155(2):105-112.

[8] Turton J F,Kaufmann M E,Gill M J,et al.Comparison of Acinetobacter baumannii isolates from the United Kingdom and the United States that were associated with repatriated casualties of the Iraq conflict[J].JClin Microbiol,2006,44(7):2630-2634.

[9] Turton J F,Gabriel SN,Valderrey C,et al.Use of sequence-based typing and multiplex PCR to identify clonal lineages of outbreakstrains of Acinetobacter baumannii[J].Clin Microbiol Infect,2007,13(8):807-815.

[10]閆中強(qiáng),沈定霞,羅燕萍,等.多重PCR方法檢測(cè)多耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌基因型[J].臨床檢驗(yàn)雜志,2008,26(6):422-424.

[11]董喆,徐雅萍,龔美亮.高齡住院患者鮑曼不動(dòng)桿菌多重耐藥相關(guān)基因的監(jiān)測(cè)[J].解放軍醫(yī)學(xué)雜志,2012,37(3):234-237.

[12]董喆,丁志平,徐雅萍.部隊(duì)醫(yī)院多藥耐藥鮑氏不動(dòng)桿菌主要流行克隆譜系的分析[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2011,21(24):5118-5121.

[13]崔晶花,杜小莉,崔志剛,等.PulseNet China網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室能力考核結(jié)果評(píng)價(jià)與分析[J].疾病監(jiān)測(cè),2011,26(10):766-769.

[14] Saeed S,F(xiàn)akih M G,Riederer K,et al.Interinstitutional and intrainstitutional transmission of a strain of Acinetobacter baumanniidetected by molecular analysis:comparison of pulsed-field gel electrophoresis and repetitive sequence-based polymerase chain reaction[J].Infect Control Hosp Epidemiol,2006,27(9):981-983.

[15] Bartual SG,Seifert H,Hippler C,et al.Development of a multilocus sequence typing scheme for characterization of clinicalisolates of Acinetobacter baumannii[J].J Clin Microbiol,2005,43(9):4382-4390.

[16] Diancourt L,Passet V,Nemec A,et al.The population structure of Acinetobacter baumannii:expanding multiresistant clones from an ancestral susceptible genetic pool[J].PLoSOne,2010,5(4):e10034.

[17] Carretto E,Barbarini D,F(xiàn)arina C,et al.Use of the DiversiLab semiautomated repetitive-sequence-based polymerase chain reactionfor epidemiologic analysis on Acinetobacter baumannii isolates in different Italian hospitals[J].Diagn Microbiol Infect Dis,2008,60(1):1-7.

[18] Turton J F,Matos J,Kaufmann M E,et al.Variable number tandem repeat loci providing discrimination within widespread genotypesof Acinetobacter baumannii[J].Eur JClin Microbiol Infect Dis,2009,28(5):499-507.

[19]Peleg A Y,Seifert H,Paterson D L.Acinetobacter baumannii:emergence of a successful pathogen[J].Clin Microbiol Rev,2008,21(3):538-582.

[20]習(xí)慧明,徐英春,朱德妹,等.2010年中國(guó)CHINET鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥性監(jiān)測(cè)[J].中國(guó)感染與化療雜志,2012,12(2):98-104.

[21]胡智玲.鮑曼不動(dòng)桿菌感染的耐藥性分析[J].中國(guó)煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志,2011,14(7):995-996.

[22]葉春幸,馬真,卓宋明.鮑曼不動(dòng)桿菌的院內(nèi)感染及耐藥性分析[J].中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào),2013,10(14):116-117,120.

[23]董愛英,劉麗娜,鄭永強(qiáng),等.鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥情況分析[J].中國(guó)煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志,2005,8(12):1277-1278.

[24]Karthikeyan K,Thirunarayan M A,Krishnan P.Coexistence of blaOXA-23 with blaNDM-1 and armA in clinical isolates of Acinetobacter baumannii from India[J].J Antimicrob Chemother,2010,65(10):2253-2254.

[25]Wang X,Zong Z,LüX.Tn2008 is a major vehicle carrying bla(OXA-23)in Acinetobacter baumannii from China[J].Diagn Microbiol Infect Dis,2011,69(2):218-222.

[26] Gaur A,Prakash P,Anupurba S,et al.Possible role of integrase gene polymerase chain reaction as an epidemiological marker:study of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolated from nosocomial infections[J].Int J Antimicrob Agents,2007,29(4):446-450.

[27] Turton JF,Ward M E,Woodford N,et al.The role of ISAba1 in expression of OXA carbapenemase genes in Acinetobacter baumannii[J].FEMS Microbiol Lett,2006,258(1):72-77.

猜你喜歡
譜系鮑曼分型
神族譜系
百年大黨精神譜系的賡續(xù)與文化自信
王錫良陶瓷世家譜系
失眠可調(diào)養(yǎng),食補(bǔ)需分型
2014-2017年我院鮑曼不動(dòng)桿菌分布及ICU內(nèi)鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥性分析
便秘有多種 治療須分型
再論東周時(shí)期銅簠的譜系和源流
東方考古(2017年0期)2017-07-11 01:37:50
基于分型線驅(qū)動(dòng)的分型面設(shè)計(jì)研究
噬菌體治療鮑曼不動(dòng)桿菌感染的綜述
頸椎病中醫(yī)辨證分型與影像探討
鄂州市| 德安县| 胶南市| 富平县| 梧州市| 岢岚县| 鹤山市| 鱼台县| 威宁| 翁源县| 五常市| 昆明市| 大兴区| 平乐县| 琼结县| 固阳县| 紫金县| 佛学| 九台市| 霍林郭勒市| 高淳县| 长治市| 互助| 资源县| 响水县| 阿勒泰市| 海兴县| 新营市| 甘泉县| 林州市| 吉安市| 昌平区| 卫辉市| 甘德县| 东莞市| 扎囊县| 交城县| 阳高县| 托克托县| 石家庄市| 黄山市|