和占龍 禹文海 楊鳳梅 趙 遠(yuǎn) 魯帥堯 王俊斌 陳麗雄 乞素冬 李艷艷 劉龍丁
恒河猴(Rhesus monkey,Macaca mulatta),屬靈長(zhǎng)目(Primates)、類(lèi)人猿亞目(Anthropoidea)、猴科(Cercopithecidae)、獼猴屬(Macaca),屬于國(guó)家二級(jí)保護(hù)動(dòng)物。其適應(yīng)性強(qiáng),容易馴養(yǎng)繁殖,生理上與人類(lèi)較接近,因此是人類(lèi)醫(yī)學(xué)科研究工作中比較理想的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,主要應(yīng)用于傳染病學(xué)、藥理學(xué)、毒理學(xué)、行為學(xué)、老年病、器官移植、內(nèi)分泌病、腫瘤學(xué)等方面研究。恒河猴MHC又稱為RhLA(rhesus macque leukocyteantigen),其MHC基因命名時(shí)加前綴Mamu(Macaca mulatta),習(xí)慣上直接使用為Mamu。根據(jù)Mamu基因產(chǎn)物功能和結(jié)構(gòu)的不同,又將其分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ類(lèi)基因。恒河猴的Mamu-Ⅱ類(lèi)分子與人類(lèi)一樣,也有3個(gè)典型的亞區(qū) DR、DQ、DP[1,2]。與 DQ、DP 相比,DR在細(xì)胞表面有較高的濃度,在免疫反應(yīng)中具有重要作用。恒河猴DRB位點(diǎn)的多態(tài)性之高,是人類(lèi)和其他靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物中所沒(méi)有的,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的恒河猴DRB位點(diǎn)的等位基因有126個(gè)[3~6]。本研究以來(lái)源清晰的云南地區(qū)恒河猴為研究對(duì)象,應(yīng)用PCR技術(shù)對(duì)部分MHC-DRB等位基因進(jìn)行分析,為今后開(kāi)展恒河猴群遺傳資源保護(hù)及相關(guān)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)提供基礎(chǔ)。
1.樣品采集和DNA提取:實(shí)驗(yàn)采集云南地區(qū)普通級(jí)恒河猴全血共195份,其中昆明自繁猴123份、寧蒗縣26份、景東縣27份和鎮(zhèn)沅縣19份。均來(lái)源于中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所全國(guó)醫(yī)學(xué)靈長(zhǎng)類(lèi)研究中心[實(shí)驗(yàn)動(dòng)物許可證號(hào):SCXK(滇)2010-0006]。靜脈抽取全血2ml,EDTA抗凝。采用AXYGEN DNA提取試劑盒提取基因組DNA,詳細(xì)操作步驟見(jiàn)說(shuō)明書(shū)。
2.PCR擴(kuò)增及測(cè)序:參考相關(guān)文獻(xiàn)[7]選取引物對(duì),引物序列見(jiàn)表1。由生工生物工程(上海)有限公司合成。在PCR儀(Bio-Rad C1000)中進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體積為10μl,上游引物和下游引物各(20μmol/L)0.5μl,模板 DNA 0.5μl,2 ×PCR Master Mix 5μl,ddH2O 3.5μl。反應(yīng)條件為 94℃ 4min,然后 94℃ 1min,64 ~66℃ 45s,72℃ 1min,35 個(gè)循環(huán),最后 72℃延伸7min。用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,參照DNA marker DL2000確定陽(yáng)性樣品。陽(yáng)性樣品PCR產(chǎn)物送上海杰李生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。
表1 MHC-DRB各等位基因引物序列
3.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:數(shù)據(jù)利用Excel和SPSS 13.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用卡方檢驗(yàn)進(jìn)行顯著性分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
1.PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果:對(duì) DRB1*0303、DRB1*0309、DRB1*0305/06、DRB1*0403、DRB1*1005/07、DRB3*0403、DRB5*0301/02、DRB6*0101、DRB6*0103、DRB6*0104/05、DRB*W101 和 DRB*W201 等12個(gè)基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),根據(jù)電泳圖及結(jié)合分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)DL2000判斷結(jié)果。本研究以DRB3*0403基因電泳圖來(lái)說(shuō)明,DRB3*0403基因PCR產(chǎn)物大小為243bp,與預(yù)期結(jié)果一致(圖1)。由圖1可以看出,第1、5、9、10號(hào)樣品為陽(yáng)性。
圖1 恒河猴MHC-DRB3*0403基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.DRB基因的序列分析結(jié)果:將 DRB各基因PCR擴(kuò)增的部分陽(yáng)性樣品進(jìn)行測(cè)序,經(jīng)BLAST比對(duì)發(fā)現(xiàn)本研究中測(cè)定的序列與GenBank中對(duì)應(yīng)序列同源性在92%以上。本研究以DRB3*0403基因測(cè)定的序列為例進(jìn)行說(shuō)明。DRB3*0403基因在GenBank中BLAST比對(duì)結(jié)果見(jiàn)圖2,兩者同源性為99%。對(duì)比發(fā)現(xiàn)本實(shí)驗(yàn)測(cè)定的序列在GenBank中對(duì)應(yīng)序列(FJ544411)的227位堿基A突變成T、337位堿基C突變成G。
圖2 DRB3*0403基因的對(duì)比結(jié)果
3.云南地區(qū)4個(gè)恒河猴群各基因的分布情況:云南地區(qū)4個(gè)恒河猴群各MHC-DRB基因分布情況見(jiàn)表2。
表2 云南地區(qū)4個(gè)恒河猴群MHC-DRB部分基因檢測(cè)結(jié)果[n(%)]
由表2可知,寧蒗恒河猴群檢測(cè)出了所有的12個(gè)基因,檢出率為 3.85% ~57.69%,其中 DRB5*0301/02、DRB6*0104/05、DRB*W101 檢出率最低(3.85%),DRB6*0103 檢出率最高(57.69%)。來(lái)自昆明的自繁猴群除了未檢測(cè)出DRB*W201外,均檢測(cè)出了其余所有的11個(gè)基因,檢出率為1.63% ~42.28%,其中 DRB1*0303 檢出率最低(1.63%),DRB6*0101檢出率最高(42.28%)。景東群未檢測(cè)出DRB1*0403和DRB5*0301/02基因,其他基因的檢出率為3.70% ~33.33%,其中 DRB*W101檢出率最低(3.70%),DRB3*0403、DRB6*0101、DRB6*0103檢出率最高(42.28%)。鎮(zhèn)沅群未檢出DRB*W201、DRB1*0309和 DRB5*0301/02基因,其他基因檢出率為5.26% ~63.16%,其中 DRB1*0303和DRB1*0403檢出率最低(5.26%),DRB6*0103 檢出率最高(63.16%)。
卡方檢驗(yàn)結(jié)果表明,DRB*W201在寧蒗群和昆明自繁猴群之間存在顯著性差異(χ2=4.66,P<0.05),景東群與昆明自繁猴群之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.85,P <0.01),其余各基因在 4 個(gè)恒河猴群之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2<3.84,P >0.05)。
主要組織相容性復(fù)合體與機(jī)體免疫功能和機(jī)體對(duì)免疫相關(guān)疾病的抵抗力密切相關(guān)[8,9]。在抗原遞呈過(guò)程中,MHCⅡ類(lèi)分子參與胞外抗原向CD4+T細(xì)胞的遞呈,大量研究表明許多疾病的進(jìn)展過(guò)程與宿主的MHC基因型密切相關(guān),許多有關(guān)MHCⅡ類(lèi)分子在HIV-1病毒感染中的作用的報(bào)道說(shuō)明其在控制病毒感染中具有重要作用[10]。
本研究利用PCR-SSP方法對(duì)195只云南地區(qū)恒河猴的外周血樣品進(jìn)行了檢測(cè),12個(gè)MHC-DRB基因在云南地區(qū)恒河猴群中均有檢出,說(shuō)明云南地區(qū)恒河猴遺傳多樣性較豐富。在本研究中檢測(cè)出的12個(gè)基因PCR陽(yáng)性樣品測(cè)序比對(duì)與目標(biāo)序列完全一致,說(shuō)明PCR-SSP方法能較好的用于DRB各基因的分析,這有利于下一步開(kāi)展大規(guī)模樣品DRB基因攜帶情況分析,從而獲得具有特定基因的恒河猴群篩選和選育提供了基礎(chǔ),為生物醫(yī)學(xué)相關(guān)研究提供合適的具有特定遺傳背景的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物提供依據(jù)。
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