本生長在美國佐治亞州奧古斯塔國家高爾夫俱樂部第17號(hào)洞附近的火炬松(Pinus taeda)曾擋住了美國前總統(tǒng)德懷特·戴維·艾森豪威爾的很多桿球。1956年,他曾試圖砍掉這棵樹。如今,火炬松正在書寫一段與眾不同的歷史:火炬松的基因組有221.8億個(gè)堿基對(duì)——約為人類基因組的7倍多,是目前已完成測(cè)序的最大基因組。
火炬松原產(chǎn)于美國東南部,是美國南方松中重要的速生針葉用材樹種。在基因測(cè)序工作伊始,火炬松就被確定為研究對(duì)象。然而,火炬松基因組的龐大規(guī)模給傳統(tǒng)的全基因組“鳥槍法”測(cè)序(只能對(duì)短的基因組片段進(jìn)行測(cè)序)出了一道難題。
新研究中,研究人員改進(jìn)了原有的“鳥槍法”——利用基因克隆方法對(duì)單獨(dú)的DNA片段進(jìn)行預(yù)處理,因而能夠更容易地拼裝出一個(gè)完整的基因組。該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),82%的火炬松基因組由重復(fù)的基因片段組成——而人類基因組中重復(fù)的基因片段只占25%。