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響應(yīng)面法優(yōu)化南極菌Psychrobacter sp.B-3的發(fā)酵產(chǎn)糖條件

2013-11-12 04:53:00宋益民
海洋科學(xué)進(jìn)展 2013年2期
關(guān)鍵詞:產(chǎn)糖量酵母粉回歸方程

張 曲,宋益民,李 江

(1.青島科技大學(xué) 化工學(xué)院,青島 山東 266042;2.國家海洋局 第一海洋研究所,青島 山東 266061)

微生物在當(dāng)今被普遍認(rèn)為是一些生物活性物質(zhì)和新化合物的高效生產(chǎn)者[1]。而生存于極地的微生物由于氣候極其苛刻、惡劣,這也意味著來自于極地微生物的生物活性物質(zhì)對于人類可能具有特殊的意義[2]。極地微生物(海冰微藻和細(xì)菌)分泌產(chǎn)生大量的胞外多糖(EPSs),這些物質(zhì)聚集在冰藻和細(xì)菌生存的海冰通道中,提供了海冰和冰水界面的有機(jī)碳,是能源傳輸?shù)闹饕镔|(zhì)[3]。除了其生態(tài)學(xué)上的作用,國內(nèi)外學(xué)者開始關(guān)注胞外多糖的生物學(xué)活性,在前期的研究工作中,從南極嗜冷桿菌Psychrobactersp. B-3的發(fā)酵液中分離獲得的胞外糖能夠顯著地誘導(dǎo)植物體內(nèi)多種抗氧化酶的活性,以清除植物在受到傷病侵害時大量積累的活性氧,從而有效地防治設(shè)施蔬菜的病害。單獨(dú)施用EPS-B3對黃瓜白粉病和枯萎病的防治率分別達(dá)到42.99%和83.09%,因而具有廣闊的開發(fā)潛力[4]。但微生物EPSs產(chǎn)量低而不穩(wěn)定限制了其開發(fā)應(yīng)用,因此如何提高EPSs的產(chǎn)量顯得尤為重要。

響應(yīng)面法是先利用合理的試驗(yàn)設(shè)計并通過實(shí)驗(yàn)得到的一定數(shù)據(jù),采用多元二次回歸方程來擬合因素與響應(yīng)值之間的函數(shù)關(guān)系,通過對回歸方程的分析來尋求最優(yōu)工藝參數(shù),解決多變量問題的一種統(tǒng)計方法[5]。本研究以南極菌Psychrobactersp.B-3菌株為研究對象,通過單因子實(shí)驗(yàn),Plackett-Burman設(shè)計,Box-Behnken實(shí)驗(yàn)設(shè)計及響應(yīng)面分析法等統(tǒng)計學(xué)方法,高效地實(shí)現(xiàn)了南極菌Psychrobactersp.B-3產(chǎn)胞外多糖的優(yōu)化,為該胞外多糖以后的應(yīng)用研究奠定了基礎(chǔ)。

1 材料和方法

1.1 材 料

1.1.1 菌 種

南極菌B-3源自中國第24次南極科學(xué)考察烏拉圭站(62°11′50.52″S,58°55′50.4″W)采集的海冰樣品,采用佐貝爾2216培養(yǎng)基篩選、分離獲得,經(jīng)16S rDNA鑒定為Psychrobacter屬。

1.1.2 培養(yǎng)基

液體種子培養(yǎng)基:蛋白胨5 g/L,酵母粉1 g/L,陳海水:自來水為2:1,即2216E培養(yǎng)基。

初始液體發(fā)酵培養(yǎng)基:蛋白胨5 g/L,酵母粉1 g/L,陳海水:自來水為2:1,MgCl20.02 g/L。

發(fā)酵培養(yǎng)的初始溫度為10 ℃, pH為7,搖床轉(zhuǎn)速為150 r/min,發(fā)酵時間為72 h。

1.2 方 法

1.2.1 苯酚-硫酸法總糖標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備

葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液的制備:準(zhǔn)確稱取無水葡萄糖10 mg,加入100 mL容量瓶中,定容至刻度,濃度為100 μg/mL。利用苯酚-硫酸法測出葡萄糖的標(biāo)準(zhǔn)曲線[6]。

1.2.2 單因素篩選

分別以溫度、pH、碳源、氮源、金屬離子及海水配比作為參數(shù)進(jìn)行單因素優(yōu)化實(shí)驗(yàn),考察其對產(chǎn)糖量的影響。為確定各種環(huán)境因素對南極菌Psychrobactersp.B-3發(fā)酵產(chǎn)糖量的影響水平,通過選擇最佳的碳源,氮源及金屬離子來進(jìn)行下一步的響應(yīng)面優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。

1.3 Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)設(shè)計及分析

根據(jù)前期單因素實(shí)驗(yàn)及其它可能影響產(chǎn)糖的因素,選擇了10個因素:蛋白胨(X1),酵母粉(X2),海水配比(X3),pH(X4),溫度(X5),搖床轉(zhuǎn)速(X6),接種量(X7),裝液量(X8),培養(yǎng)時間(X9),BaCl2(X10),來進(jìn)行12次實(shí)驗(yàn)(N=12),用Plackett-Burman軟件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計,實(shí)驗(yàn)中每個因素分別設(shè)高(1),低(-1)兩個水平。以發(fā)酵液中的產(chǎn)糖量為響應(yīng)值,通過SAS軟件對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行回歸顯著性水平,選擇可信度高的顯著因素進(jìn)一步開展響應(yīng)面顯著性分析,根據(jù)結(jié)果對其進(jìn)行顯著性分析。實(shí)驗(yàn)中每個因素根據(jù)單因素實(shí)驗(yàn)結(jié)果設(shè)定2個水平。

1.4 Box-Behnken設(shè)計及響應(yīng)面分析

根據(jù)Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)確定的影響產(chǎn)糖的顯著因素,采用響應(yīng)面軟件對其進(jìn)行Box-Behnken響應(yīng)面設(shè)計,以發(fā)酵液中的產(chǎn)糖量為響應(yīng)值,通過SAS軟件對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行回歸分析,從而獲得南極菌B-3發(fā)酵產(chǎn)糖的最佳條件。

2 結(jié)果與分析

2.1 葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線

以葡萄糖為標(biāo)準(zhǔn)品,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制方法進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制,對測定數(shù)據(jù)用最小二乘法進(jìn)行線性擬合,得到回歸方程為y=0.002 3x-0.004 8(R2=0.991 3)。

2.2 單因子實(shí)驗(yàn)篩選結(jié)果

我們分別考察了溫度、pH、碳源、氮源、金屬離子及海水配比對產(chǎn)糖量的影響(圖1~6)。結(jié)果表明,最佳碳源為酵母粉,最佳氮源為蛋白胨,最佳金屬離子為BaCl2,陳海水與自來水配比為2:1,溫度10 ℃,pH為7。

圖1 不同溫度對產(chǎn)糖的影響Fig.1 Effect of various temperatures on EPS production

圖2 不同pH對產(chǎn)糖的影響Fig. 2 Effect of various pH on EPS production

圖3 不同碳源對產(chǎn)糖的影響Fig.3 Effect of various carbon sources on EPS production

圖4 不同氮源對產(chǎn)糖的影響Fig.4 Effect of various nitrogen sources on EPS production

圖5 不同海水比例對產(chǎn)糖的影響Fig. 5 Effect of various seawater proportions on EPS production

圖6 不同無機(jī)鹽對產(chǎn)糖的影響Fig. 6 Effect of various salts on EPS production

2.3 Plackett-Burman設(shè)計篩選結(jié)果

在前期單因子實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,本實(shí)驗(yàn)選取可能影響產(chǎn)糖的10個因素:蛋白胨、酵母粉、海水配比、pH、溫度、搖床轉(zhuǎn)速、接種量、裝液量、培養(yǎng)時間、BaCl2。來進(jìn)行實(shí)驗(yàn)次數(shù)N=12的Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)。10個因素分別對應(yīng)于表1中的10個列,每個因素分別取低水平“-1”和高水平“1”,并另設(shè)1個虛擬列,考察實(shí)驗(yàn)誤差,以發(fā)酵液中產(chǎn)糖質(zhì)量濃度為響應(yīng)值(Y),實(shí)驗(yàn)設(shè)計及結(jié)果見表1。運(yùn)用SAS軟件,對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,得出各因素的t值和可信度水平,各因素主效應(yīng)分析見表2。

一般選擇可信度大于90%以上的因素作為顯著因素[7]。由表2的主效應(yīng)分析結(jié)果可知,在PB設(shè)計的二水平范圍內(nèi),影響南極菌B-3產(chǎn)糖的主要因素為酵母粉濃度、海水配比和裝液量,其可信度區(qū)間均在90%以上。由于發(fā)酵培養(yǎng)基的碳源、氮源均已確定,而其他因素對產(chǎn)糖的影響不顯著,故在下一步響應(yīng)面分析中需要進(jìn)一步考察酵母粉濃度、海水配比和裝液量對產(chǎn)糖量的影響,其余不顯著因素按照正負(fù)效應(yīng)確定,正效應(yīng)取高值,負(fù)效應(yīng)取低值,即蛋白胨6 g/L,接種量1.5 %,培養(yǎng)時間64 h,BaCl20.03 g/L,并且根據(jù)實(shí)驗(yàn)操作的實(shí)際情況將溫度定為10 ℃,轉(zhuǎn)速150 r/min,pH為7。

表1N=12的Plackett-Burman的實(shí)驗(yàn)設(shè)計及響應(yīng)值Table 1 Experimental design of Plackett-Burman and corresponding results(N=12)

表2Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)設(shè)計的因素水平及效應(yīng)分析Table 2 Factors, levels and effect estimates of Plackett-Burman design

2.4 響應(yīng)面分析

2.4.1 響應(yīng)面實(shí)驗(yàn)設(shè)計方案與結(jié)果

根據(jù)Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)結(jié)果,選擇酵母粉濃度、海水配比和裝液量為優(yōu)化對象,以發(fā)酵液中產(chǎn)生的總糖含量為響應(yīng)值來設(shè)計中心組合實(shí)驗(yàn),所設(shè)計的重要因素水平及編碼見表3,Box-Behnken實(shí)驗(yàn)設(shè)計方案及結(jié)果見表4。

表3響應(yīng)面因素水平編碼表Table 3 Factors and levels of response surface design

表4Box-Behnken實(shí)驗(yàn)設(shè)計與結(jié)果Table 4 Experimental design and results of Box-Behnken

2.4.2 二次回歸方程擬合及方差分析

回歸方程的方差分析和可信度分析結(jié)果分別見表5和表6。

表5回歸方程的方差分析Table 5 ANOVA for the RSM experiment

表6模型可信度分析Table 6Reliability analysis for the modle

通過回歸方程的方差分析(表5)可知,回歸模型F值檢驗(yàn)顯著(P=0.000 1<0.01),失擬項(xiàng)不顯著(P=0.090 8>0.05),即該模型在被研究的整個回歸區(qū)域擬合較好。從模型可信度分析(表6)可知,其決定系數(shù)(R2)=99.40%,這表明由這3個因素及其二次項(xiàng)能解釋響應(yīng)值(Y)變化的99.40%,說明模型的相關(guān)度較高;校正決定系數(shù)(Adj.R2)=98.64%,表明98.64%的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的變異性能用此回歸模型解釋;預(yù)測決定系數(shù)(Pred.R2)=0.924 5,預(yù)測決定系數(shù)較高,說明模型對實(shí)驗(yàn)預(yù)測的可靠性達(dá)92.45%,說明模型可靠性較好;Y的變異系數(shù)(C.V.)=1.48%,較低,說明實(shí)驗(yàn)操作性較高。由此可見,該回歸模型具有較好的擬合度,可用該回歸方程對南極菌B-3產(chǎn)糖量進(jìn)行分析和預(yù)測。

在α=0.05的顯著水平上,3個關(guān)鍵因素在所確定的濃度范圍內(nèi)對產(chǎn)糖的影響都是顯著的,在所選的各因素水平范圍內(nèi),按照其對結(jié)果的影響排序?yàn)?酵母粉濃度>海水配比>裝液量。

2.4.3 響應(yīng)面分析顯著因子水平的優(yōu)化

利用SAS軟件對二次回歸模型進(jìn)行規(guī)范分析,通過回歸方程來繪制分析圖,考察所擬合的相應(yīng)曲面形狀,酵母粉濃度、海水濃度、裝液量之間的立體分析圖和等高圖見圖7~9。

結(jié)合圖7~9,運(yùn)用響應(yīng)面軟件進(jìn)行分析,在回歸方程中存在穩(wěn)定點(diǎn)為極大值,得到極大值所對應(yīng)的各主要因素(C1,C2,C3)的編碼值分別為(0.331,0.204,0.084),其對應(yīng)的實(shí)際值為(1.07,65.05,50.84),即酵母粉濃度、海水濃度、裝液量的最佳值分別為1.07 g/L,65.05%,50.84%,而此時模型發(fā)酵液中的產(chǎn)糖量最高,其預(yù)測值為613 μg/mL。

圖7 酵母粉濃度和海水濃度對產(chǎn)糖的交互影響Fig. 7 Reciprocal effect of yeast extract concentration and seawater concentration on EPS production

圖8酵母粉濃度和裝液量對產(chǎn)糖的交互影響Fig. 8 Reciprocal effect of yeast extract concentration and liquid volume on EPS production

圖9海水濃度和裝液量對產(chǎn)糖的交互影響Fig. 9 Reciprocal effect of seawater concentration and liquid volume on EPS production

2.4.4 模型實(shí)驗(yàn)

為了驗(yàn)證響應(yīng)面優(yōu)化設(shè)計的準(zhǔn)確性,以模型分析確定影響產(chǎn)糖主要因素的濃度來配置發(fā)酵培養(yǎng)基,并根據(jù)實(shí)驗(yàn)操作的合理性,確定酵母粉濃度為1.1 g/L,陳海水與自來水的配比為2∶1,裝液量為50%,其余發(fā)酵條件按Plackett-Burman實(shí)驗(yàn)確定,即蛋白胨6 g/L,接種量1.5%,培養(yǎng)時間64 h,BaCl20.03 g/L,溫度10 ℃,轉(zhuǎn)速150 r/min,pH為7,共進(jìn)行3組實(shí)驗(yàn),每組至少3個樣本進(jìn)行發(fā)酵。3組的平均產(chǎn)糖量分別為621 μg/mL,619 μg/mL,632 μg/mL,均值為624 μg/mL。這是原始發(fā)酵培養(yǎng)基平均444 μg/mL產(chǎn)糖量的1.4倍,產(chǎn)量提高了40%。實(shí)驗(yàn)結(jié)果與預(yù)測值較接近,說明回歸方程能夠比較真實(shí)地反映各篩選因素對產(chǎn)糖量的影響,可見,用該回歸模型優(yōu)化南極菌B-3產(chǎn)糖發(fā)酵培養(yǎng)基和條件是可行的。

3 討 論

糖類是自然界分布最廣、含量最豐富的生物高分子聚合物,也是自然界中分子結(jié)構(gòu)最復(fù)雜的一類物質(zhì)[9]。它們與蛋白質(zhì)、核酸、脂肪一起組成了生物體內(nèi)最重要的四類高分子化合物。糖的研究在經(jīng)歷了1個多世紀(jì)的緩慢發(fā)展之后,從20世紀(jì)70年代開始,隨著分離分析技術(shù)的進(jìn)步和分子生物學(xué)的發(fā)展,逐漸又得到了復(fù)興,并取得了巨大進(jìn)展,糖生物學(xué)研究正成為生命科學(xué)研究領(lǐng)域又一新的前沿和熱點(diǎn)[10]。

一些糖類物質(zhì)具有抗腫瘤,抗氧化性,和增強(qiáng)機(jī)體免疫力等非常有益的特性[11]。有些糖類物質(zhì)特別適合用于制造功能性食品,這些糖類具有巨大的工業(yè)應(yīng)用價值,并在眾多領(lǐng)域擁有著誘人的前景[12]。目前,我國雖在一些糖類的研究中取得了一定的進(jìn)展,但在糖類的工業(yè)化過程中還存在著糖產(chǎn)量較低,產(chǎn)糖菌種較少等問題。因此,關(guān)于一些產(chǎn)糖菌的發(fā)酵培養(yǎng)條件優(yōu)化就顯得尤為重要。

傳統(tǒng)的生物過程優(yōu)化大多采用單一的單因素設(shè)計,較繁雜的正交設(shè)計或單一的響應(yīng)面分析[13]。而本研究針對單一使用響應(yīng)面法的不足之處,高效整合單因子實(shí)驗(yàn)、Plackett-Burman設(shè)計、響應(yīng)面中心組合設(shè)計等統(tǒng)計學(xué)方法,準(zhǔn)確快速地實(shí)現(xiàn)了南極菌Psychrobactersp.B-3菌株產(chǎn)胞外多糖條件的優(yōu)化研究,獲得了理想的結(jié)果。本研究從眾多影響產(chǎn)胞外多糖的因素中篩選出了主要因素并實(shí)現(xiàn)了因素水平的優(yōu)化,較大地提高了南極菌B-3的產(chǎn)糖量,為以后的擴(kuò)大生產(chǎn)和工業(yè)化利用打下了堅實(shí)的研究基礎(chǔ)。

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