王 利,茍小蘭
(西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 動物遺傳育種學(xué)國家民委-教育部重點實驗室,四川 成都 610041)
小腸結(jié)腸炎耶爾森菌(Yersiniaenterocolitica)屬于耶爾森菌屬,腸桿菌科。小腸結(jié)腸炎耶爾森菌廣泛存在于自然界中,是人、畜、魚等共患的致病菌,可引發(fā)人和動物患胃腸炎和腹瀉,還可引起關(guān)節(jié)炎、結(jié)節(jié)性紅斑,嚴(yán)重時可引起敗血癥,造成死亡。從20世紀(jì)80年代開始,研究者用體外法測定小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的毒力以代替昂貴的動物試驗。體外法主要包括:小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的自凝性、血清抵抗性和毒力質(zhì)粒的測定等[1-2]。至今為止,對小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的毒力的研究已經(jīng)取得了一些進(jìn)展[3-4]。對其致病機制有了初步的認(rèn)識,但仍有許多的問題有待深入研究。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)已經(jīng)用于檢測小腸結(jié)腸炎耶爾森菌毒力基因,迅速對該菌進(jìn)行毒力鑒定,甚至在毒力質(zhì)粒丟失后仍然可以預(yù)測該菌的致病力[5]。本試驗采用PCR方法檢測和分析了魚源小腸結(jié)腸炎耶爾森菌5種重要的毒力基因:毒力活化因子基因(vir F)、粘附素基因(yad A)、粘附侵襲位點基因(ail)、毒力島基因(HPI-int)和耐熱腸毒素基因(ystB)。這有利于為深入探討魚源小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的毒力和致病性積累科學(xué)資料。
1.1 菌種來源 小腸結(jié)腸炎耶爾森菌分離自四川某胭脂魚養(yǎng)殖場,以甘油菌的形式保存于本實驗室-80℃冰箱,備用。
1.2 主要試劑 改良Y培養(yǎng)基和CIN-1培養(yǎng)基,購自杭州天和微生物試劑有限公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,購自TIANGEN BIOTECH(BEIJING);TaqDNA聚合酶、dNTP、DNA Marker(2000)等,購自寶生物工程(大連)有限公司。
1.3 方法
1.3.1 引物設(shè)計 參考文獻(xiàn)[6],設(shè)計小腸結(jié)腸炎耶爾森菌5對毒力基因(ail、yad A、virF、ystB和 HPI-int)的引物,詳細(xì)見表1。引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
表1 5對毒力基因引物序列
1.3.2 DNA模板制備 采用兩種方法制備小腸結(jié)腸炎耶爾森菌DNA模板。第一方法是煮沸法,主要步驟是:取營養(yǎng)平板上生長的單個菌落加入含50μL dd H2O的1.5 m L離心管中,混勻后放入-80℃冰箱中過夜,取出后立即放入沸水中煮10 min,12 000 r/min離心5 min,取上清液作為模板,-20℃凍存?zhèn)溆谩5诙N方法是用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,具體步驟參照試劑盒說明書進(jìn)行。
1.3.3 PCR反應(yīng) PCR反應(yīng)的體系:dd H2O 8.5 μL,2×TaqPCR Master Mix 12.5μL,上游引物和下游引物(濃度均為10μmol/L)各1μL,模板DNA 2 μL,共25μL。ail和HPI-int毒力基因PCR擴增反應(yīng)條件為:94℃5 min;94℃60 s,50℃60 s,72℃60 s,35個循環(huán),72℃10 min。virF毒力基因PCR擴增反應(yīng)條件為:94℃5 min;94℃60 s,48℃60 s,72℃60 s,35個循環(huán),72℃10 min。另外,兩種毒力基因(ystB和yad A)則采用梯度PCR反應(yīng)進(jìn)行優(yōu)化:94℃5 min;94℃60 s,退火溫度分別為45℃、50℃、55℃和60℃,35個循環(huán),72℃10 min。PCR結(jié)束后,取PCR產(chǎn)物5μL,進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳,80V電壓,電泳30 min,凝膠成像儀下拍照。
1.3.4 HPI-int基因測序和序列分析 HPI-int基因PCR反應(yīng)采用50μL體系:dd H2O 17μL,2×TaqPCR Master Mix 25μL,上游引物和下游引物(濃度均為10μmol/L)各2μL,模板DNA 4μL。PCR擴增反應(yīng)條件為:94℃ 5 min;94℃ 60 s,50℃ 60 s,72℃60 s,35個循環(huán),72℃10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳,檢測出單一條帶后,送交上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司,采用ABI3730測序儀進(jìn)行正反向測序。所得序列提交到NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫,并采用生物信息學(xué)軟件DNAStar和Blastn等對該序列進(jìn)行分析。
2.1 毒力基因檢測 分別用兩種方法制備的DNA作為模板,用PCR方法檢測小腸結(jié)腸炎耶爾森菌5種毒力基因(ail、yad A、virF、ystB和 HPI-int),得到的結(jié)果相似,無明顯差異。ail基因目的條帶大小約為351 bp,HPI-int基因條帶大小約為714 bp,而virF基因目的條帶大小約為561 bp,這3種基因所得的PCR擴增產(chǎn)物大小與試驗預(yù)期結(jié)果一致,結(jié)果詳見圖1。另外兩種基因(ystB和yad A)在反復(fù)優(yōu)化PCR條件后都未擴增出目的條帶,表明該菌株未攜帶ystB和yad A這兩種毒力基因。
圖1 毒力基因的擴增1:ail;2:HPI-int;3:yad A;4:vir F;5:ystB;M:DNA Marker分子量
2.2 HPI-int基因序列分析 HPI-int基因分別使用正反向引物測序,采用DNAStar軟件中的Seqman對正反向序列進(jìn)行組裝、拼接,最終所得序列長度為722 bp,將該序列提交到 NCBI,GenBank序列號為JX041513。采用NCBI的Blastn工具對該序列進(jìn)行比對,結(jié)果顯示,該序列與小腸結(jié)腸炎耶爾森菌強毒力島基因(Yersiniaenterocoliticaleft arm of the highpathogenicity island Score,GenBank 序 列 號 為AJ132668.1)序列的相似性為99% (705/710),因此表明HPI-int基因的測序結(jié)果和預(yù)期相符合。
耶爾森菌的致病因素主要包括:毒力質(zhì)粒編碼的分泌系統(tǒng)、外膜蛋白、侵襲性與毒素、鐵攝取系統(tǒng)和超抗原等方面[7]。致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的致病因素主要是該菌所具有的特殊染色體基因、毒力質(zhì)粒和菌毛。ail、HPI-int、yst A、ystB和 HPI毒力基因位于染色體上,而yad A和virF毒力基因位于質(zhì)粒上。致病性的耶爾森菌可分為低致病性和高致病性兩類。這種分類與染色體上是否攜帶有 HPI毒力島有關(guān),因為HPI是高毒力細(xì)菌表型表達(dá)的必需條件。這個染色體上的片段涉及生物合成、調(diào)節(jié)和耶爾森菌含鐵鐵載體的轉(zhuǎn)運作用。在小腸結(jié)腸炎耶爾森菌中,毒力島只出現(xiàn)于高致病性的小腸結(jié)腸炎耶爾森菌生物1B型 ,而低致病性的則無[4]。
至今為止,對小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的毒力基因已經(jīng)進(jìn)行了一些研究[8-9]。典型的致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌攜帶ail、yst A、yad A基因和virF毒力基因。致病性菌株不攜帶ystB,而非致病性菌株不攜帶ail、yst A、yad A、vir F。ystB主要為生物1A型小腸結(jié)腸炎耶爾森菌攜帶的編碼一種性質(zhì)類似于yst A的耐熱性腸毒素。ystB僅存在于生物1A型的菌株,而且在這個生物型中,目前資料表明這類菌株通常都是非致病性菌株。81株生物1A型小腸結(jié)腸炎耶爾森菌均未檢測出ail、virF、yst A基因和ystC基因[10]。王鑫等(2005)運用PCR和DNA探針雜交方法檢測了致病性和非致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌攜帶的ystB基因[11]。48株致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌均不攜帶該基因。98株非致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌中有52株攜帶ystB基因,占53.06%。這表明ystB基因僅存在于部分生物1A型非致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌,而不存在于致病性菌株中。以上多個研究結(jié)果基本一致。本試驗通過多次優(yōu)化PCR條件也未檢測出ystB基因,這提示該菌株很可能為致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌。
裴耀文等(2011)發(fā)現(xiàn)3株致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌株的毒力基因檢測中均表現(xiàn)為ail和yst A陽性,而yad A、virF毒力基因缺失[12]。吉林省致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌血清型毒力基因的分布情況表明,血清型O:3和O:9小腸結(jié)腸炎耶爾森菌毒力基因的分布主要為ail+、yst A+、ystB-、yad A+、virF+型,其次是ail+、yst A+、ystB-、yad A-、vir F-型[13]。南京地區(qū)不同來源的123株小腸結(jié)腸炎耶爾森菌致病生物型菌株,均包含染色體上的毒力基因ail[14]。因此,ail與致病生物型之間存在明顯關(guān)聯(lián)。Zheng等(2008)用PCR方法檢測了從腹瀉病人糞便中分離出160株致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的毒力基因。檢出率分別 為:ail(94%)、inv(100%)、yst A (93%)、ystB(7.5%)、ystC(5%)、yad A(89%)和virF(82%)[5]。該結(jié)果表明,并非所有的致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌都攜帶了能引起疾病的染色體和質(zhì)粒上的全部毒力基因。由此推測,其中一些缺乏某種毒力基因的菌株可能具有其他的、未知的毒力標(biāo)記,從而在致病性小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的多種發(fā)病機理中發(fā)揮著重要的作用。以上報道的結(jié)果存在一些較小的差異,可能是由于不同地區(qū)、不同菌株的差異或毒力基因的檢測片段的差異等原因。
本試驗中檢測出了ail、vir F和HPI-int,而未檢測到y(tǒng)ad A,這與以上報道基本相一致。這也提示該菌具有致病性。HPI-int基因的測序結(jié)果分析表明,該序列與小腸結(jié)腸炎耶爾森菌強毒力島基因的相似性達(dá)到99%,從而驗證了本試驗HPI-int基因檢測的正確性,也進(jìn)一步說明該菌株具有較強的致病性。yad A基因未被檢出到可能是由于該基因位于質(zhì)粒上,在實驗室分離培養(yǎng)過程中菌株多次傳代及長時間平板上保存后都很容易丟失質(zhì)粒。質(zhì)粒上的毒力基因與致病生物型之間的關(guān)聯(lián)性要略低一些,因此依賴于質(zhì)粒毒力基因檢測通常是存在較大誤差。致病性耶爾森菌遺傳背景復(fù)雜,染色體DNA指紋分析具有多態(tài)性。在檢測細(xì)菌毒力基因時必須檢測染色體上的毒力因子,不能僅用毒力質(zhì)粒的檢測。選擇染色體上的毒力基因時可優(yōu)先選擇ail基因,同時實驗室應(yīng)避免質(zhì)粒丟失而使有毒株被誤判為無毒株。綜上所述,本試驗運用PCR方法檢測了小腸結(jié)腸炎耶爾森菌株的5種毒力基因。本菌株檢測并分析了染色體上的毒力島(HPI-int)基因,因此推測它是強毒力株,具有較強的致病性。下一步,將進(jìn)行本菌株對多種魚類的致病性試驗,深入研究該菌株的毒性及其危害。
[1]Stern N J,Kotula A W,Pierson MD.Virulence prediction ofYersiniaenterocoliticaby pyrolysis gas-liquid chromatography[J].Appl Environ Microbiol,1980,40(3):646-651.
[2]Lee W H,Smith R E,DamaréJ M,etal.Evaluation of virulence test procedures forYersiniaenterocoliticarecovered from foods[J].J Appl Bacteriol,1981,50(3):529-539.
[3]Fabrega A,Vila J.Yersiniaenterocolitica:pathogenesis,virulence and antimicrobial resistance[J].Enferm Infecc Microbiol Clin,2012,30(1):24-32.
[4]Kot B,Piechota M,Jakubczak A.Analysis of occurrence of virulence genes amongYersiniaenterocoliticaisolates belonging to different biotypes and serotypes[J].Pol J Vet Sci,2010,13(1):13-19.
[5]Zheng H,Sun Y,Mao Z,Jiang B.Investigation of virulence genes in clinical isolates ofYersiniaenterocolitica[J].FEMS Immunol Med Microbiol,2008,53(3):368-374.
[6]王增國.我國部分地區(qū)攜帶ystB基因小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的分子流行病學(xué)研究[D].鎮(zhèn)江:江蘇大學(xué),2008.
[7]古文鵬,景懷琦.耶爾森菌致病機理研究[J].中國人獸共患病學(xué)報,2010,26(9):862-866.
[8]Drummond N,Murphy B P,Ringwood T,etal.Yersiniaenterocolitica:a brief review of the issues relating to the zoonotic pathogen,public health challenges,and the pork production chain[J].Foodborne Pathog Dis,2012,9(3):179-189.
[9]Schutz M,Weiss E M,Schindler M,etal.Trimer stability of Yad A is critical for virulence ofYersiniaenterocolitica[J].Infect Immun,2010,78(6):2677-2690.
[10]Bhagat N,Virdi J S.Distribution of virulence-associated genes inYersiniaenterocoliticabiovar 1A correlates with clonal groups and not the source of isolation[J].FEMS Microbiol Lett,2007,266(2):177-183.
[11]王鑫,邱海燕,肖玉春,等.小腸結(jié)腸炎耶爾森菌耐熱性腸毒B基因(ystB)初步研究[J].中國人獸共患病雜 志,2005,21(6):449-454.
[12]裴耀文,馮開軍,房玉英,等.山東省宿主動物中小腸結(jié)腸炎耶爾森菌分布狀況及毒力研究[J].醫(yī)學(xué)動物防制,2011,27(2):104-106.
[13]顧峰,張貴軍,劉亞東,等.吉林省耶爾森菌O:3和O:9血清型主要毒力基因分布調(diào)查[J].中國地方病防治雜志,2006,21(6):340-342.
[14]許文炯,丁潔,陳曉蔚,等.小腸結(jié)腸炎耶爾森菌主要毒力基因分析[J].中國人獸共患病學(xué)報,2007,23(7):675-677.