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200例非綜合征型聾患者GJB3和GJB6基因突變分析*

2012-12-23 05:11陳塏鈿宗凌周蔚劉敏姜鴻彥
關(guān)鍵詞:雜合耳聾基因突變

陳塏鈿 宗凌 周蔚 劉敏 姜鴻彥

遺傳因素在先天性聾病因中占重要位置。目前發(fā)現(xiàn)的致聾基因超過(guò)60 個(gè),常見的有:GJB2、SLC26A4、線粒體DNA、GJB3、GJB6 等,以GJB2基因最常見[1~3],GJB3和GJB6基因突變?cè)谶z傳性聾患者中已見報(bào)道[4~6]。GJB3可表現(xiàn)為雙等位基因座突變,或與GJB2基因表現(xiàn)為雙基因復(fù)合雜合突變[6]。GJB3和GJB6的總體突變率較低[7~9]。

目前我國(guó)廣東、湖南和廣西三省的非綜合征型聾患者的GJB3和GJB6基因突變資料尚缺,因此,本研究對(duì)來(lái)自這三省的200例非綜合征型聾患者進(jìn)行GJB3和GJB6基因突變篩查,分析這兩個(gè)基因的人群突變率,為今后這些地區(qū)的耳聾人群基因篩查提供參考。

1 資料與方法

1.1 研究對(duì)象 收集來(lái)自廣東、廣西和湖南非綜合征型聾散發(fā)病例200例,男118例,女82例,其中廣東144例,湖南28例,廣西28例,均為先天性聾或后天遲發(fā)性雙耳聾。病例就診時(shí)年齡11 月~47歲,平均7.75±6.56歲。耳聾分級(jí)參照WHO 1997年日內(nèi)瓦推薦的標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)聽力較好耳0.5、1、2、4 kHz的純音平均聽閾[10]分為:正常:<25dB HL;輕度聽力損失:26~40dB HL;中度:41~60dB HL;重度:61~80dB HL;極重度:≥81dB HL;本組患者中輕度6例,中度12例,重度33例,極重度149例。每位患者均進(jìn)行詳細(xì)的病史采集和系統(tǒng)的體格檢查,排除可能的致聾病因(高膽紅素血癥、腦膜炎、腮腺炎后遺癥等)及綜合征型聾。聽力學(xué)檢查包括純音聽閾、聲導(dǎo)抗和耳聲發(fā)射,嬰幼兒或配合欠佳患者行聽性腦干反應(yīng)(ABR)及聽性穩(wěn)態(tài)反應(yīng)(auditory steady state responses,ASSR)檢查?;颊呋蚱浼覍俸炇鹬橥鈺?,采集患者外周血4 ml,采用常規(guī)氯仿抽提法提取DNA,-80 ℃保存。應(yīng)用1%瓊脂糖進(jìn)行電泳和分光光度計(jì)進(jìn)行DNA 純度和濃度鑒定。中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審核并同意此項(xiàng)研究。

1.2 引物設(shè)計(jì) GJB3引物序列為F:TACGATGGTTTTTCCTCTAATTCT,R:TTGCATAACTTAGTGAACTCAGAG,PCR 產(chǎn)物長(zhǎng)度985 bp。GJB6引物序列為F:TATCACCGTGTCACTTTCC,R:CAGGTTGGTATTGCCTTC,PCR 產(chǎn)物長(zhǎng)度937bp。參照文獻(xiàn)[11],合成檢測(cè)del(GJB6-D13S1830)及del(GJB6-D13S1854)突變的引物,引物由上海生工公司合成。

1.3 PCR 擴(kuò)增 PCR 反應(yīng)采用25μl反應(yīng)體系,2×PCR Buffer mixture 12.5μl,DNA 50ng,引物各5pmol,加ddH2O 至25μl。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5分鐘,94 ℃變性30秒,56 ℃退火30秒,72 ℃延伸30秒,35 個(gè)循環(huán),反應(yīng)結(jié)束后再72 ℃延伸7分鐘,4 ℃保存。取2μl進(jìn)行1%瓊脂糖電泳檢測(cè)PCR 產(chǎn)物。del(GJB6-D13S1830)及del(GJB6-D13S1854)采用Touch-Down PCR,反應(yīng)條件詳見文獻(xiàn)[11]。取6μl PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳,直接判斷野生型或大片段缺失突變。

1.4 PCR 產(chǎn)物測(cè)序 PCR 產(chǎn)物純化后,以PCR 引物作為測(cè)序引物進(jìn)行測(cè)序反應(yīng),利用ABI公司3730測(cè)序儀進(jìn)行Sanger測(cè)序反應(yīng)。

1.5 序列比對(duì) 應(yīng)用chromas軟件分析測(cè)序結(jié)果,測(cè)序結(jié)果與GJB3 (NM_001005752.1)和GJB6(NM_001110219.2)基因組序列進(jìn)行對(duì)比分析。

2 結(jié)果

200例非綜合征型聾患者中,發(fā)現(xiàn)GJB3 580G>A(A194T)雜合突變2 例,其中1 例為GJB2 109G>A(V37I)和GJB3 580G>A (A194T)復(fù)合雜合突變(圖1),另外1例GJB2和GJB6基因均未發(fā)現(xiàn)突變;250G>A (V84I)雜合突變1例(也未發(fā)現(xiàn)GJB2和GJB6突變),474G>A(M158I)雜合突變1例(表1)。前兩種突變位點(diǎn)均已見報(bào)道[7,8],突變位于connexin 31 蛋白高度保守區(qū),可能為病理性突變。474G>A 雜合突變導(dǎo)致第158位蛋氨酸變?yōu)楫惲涟彼?,突變的性質(zhì)暫不明確。此外,這200例患者中,發(fā)現(xiàn)357C>T 雜合突變35例,357C>T純合突變1例,由于正常人群中也存在357C>T 純合突變,該突變可能為多態(tài)性突變。據(jù)此推算,廣東、湖南和廣西三省非綜合征型聾人群中,GJB3等位基因突變頻率約為1% (4/400)。

圖1 GJB3和GJB2雙基因復(fù)合雜合突變

表1 200例非綜合征型聾患者GJB3基因篩查結(jié)果

200例患者中均未發(fā)現(xiàn)GJB6基因突變。對(duì)del(GJB6-D13S1830)及del(GJB6-D13S1854)的特異性PCR 擴(kuò)增,電泳結(jié)果均為330bp的條帶,未發(fā)現(xiàn)GJB6 大片段缺失突變。

3 討論

本研究結(jié)果顯示,本組非綜合征型聾患者GJB3等位基因突變頻率約為1%,突變位點(diǎn)以580G>A為主(2例,0.5%),均未發(fā)現(xiàn)GJB6突變,說(shuō)明GJB6在這些人群中突變率極低,在臨床篩查中可暫不列為常規(guī)檢測(cè)項(xiàng)目。

Liu等[6]報(bào)道,GJB3 基因580G>A 突變形式表現(xiàn)為GJB3 580G>A+GJB2 235delC 或GJB3 580G>A+GJB2 299-300delAT 復(fù)合雜合突變,這個(gè)突變位于connexin 31蛋白高度保守區(qū),在200例正常人群中也未發(fā)現(xiàn),但在先證者的正常聽力的親代發(fā)現(xiàn)雜合突變。因此,這個(gè)突變可能為致病性突變,突變形式為隱性遺傳。本組也有一例病例表現(xiàn)為GJB3 和GJB2 復(fù)合雜合突變,其中,GJB2 109G>A 的致病性仍存在很大的爭(zhēng)議[12,13],GJB2 109G>A 被認(rèn)為是病理性突變[12,13],或增加環(huán)境易感性的突變。本組GJB2和GJB3復(fù)合突變的病例,推測(cè)為遺傳因素引起的耳聾,其致病機(jī)制暫不明確。

GJB3 250G>A 突變由李慶忠等[7]首先報(bào)道,他們?cè)?50名正常對(duì)照組中未發(fā)現(xiàn)同樣突變,各物種多種連接蛋白氨基酸序列進(jìn)化分析證實(shí)該突變位點(diǎn)位于connexin31高度保守的第二跨膜區(qū)。關(guān)于GJB3 580G>A 和250G>A 的致病機(jī)制尚需進(jìn)一步深入研究。此外,本組病例中發(fā)現(xiàn)1例患者攜帶GJB3 474G>A 雜合突變,該突變引起第158 位蛋氨酸變?yōu)楫惲涟彼?,突變的性質(zhì)暫不明確,正常人群中尚未發(fā)現(xiàn)攜帶此突變。該突變位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的氨基酸非位于高度保守區(qū),推測(cè)該突變致病可能性低。

GJB6突變報(bào)道見于Marlin 等[5,11]報(bào)道,多見于歐美人群[11,14]。與GJB2 不同,GJB6 基因突變?cè)趪?guó)人耳聾患者中并不常見[8,9]。本研究廣東、廣西和湖南200例非綜合征型聾患者中未發(fā)現(xiàn)GJB6突變,推測(cè)GJB6在國(guó)人非綜合征型聾患者中并非主要致病基因。GJB6突變中,兩種大片段缺失突變del(GJB6-D13S1830)及del(GJB6-D13S1854)比較多見[11,14],其致病機(jī)制可能為通過(guò)反式效應(yīng)(in cis effect)作用于上游的GJB2 基因,抑制GJB2基因mRNA 的表達(dá)而致聾[15,16]。本研究參照del Castillo等[11]方法,對(duì)200 例非綜合征型聾患者進(jìn)行這兩種突變的檢測(cè),均未發(fā)現(xiàn)突變,與韓東一等[8,9]的研究結(jié)果一致,說(shuō)明在國(guó)內(nèi)耳聾人群中,GJB6基因突變可暫不列入臨床常規(guī)檢測(cè)項(xiàng)目。

本研究也存在一定的不足:首先,病例樣本數(shù)量仍較少,今后需要進(jìn)一步增加樣本數(shù),并合理分配病例的地域來(lái)源,以更好地驗(yàn)證本研究結(jié)果。其次,對(duì)GJB3可能的病理性突變位點(diǎn),如GJB3 580G>A和250G>A 的致病機(jī)制,尚需進(jìn)行深入的研究。

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