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DPP-4抑制劑的構(gòu)效關(guān)系

2012-12-08 19:38陳忻翟所迪
藥品評(píng)價(jià) 2012年34期
關(guān)鍵詞:氫鍵列汀氨基

陳忻 翟所迪

據(jù)國(guó)際糖尿病聯(lián)盟(International Diabetes Federation,簡(jiǎn)稱IDF)統(tǒng)計(jì),在2000年全球有糖尿病患者1.51億,到2010年11月全球糖尿病患者已超過(guò)3億,還有3億人屬于糖尿病的高危人群,而且正以每年新發(fā)700萬(wàn)患者的速度迅速蔓延[1]。我國(guó)屬于糖尿病易感人群國(guó)家,目前我國(guó)糖尿病患者數(shù)量占據(jù)全球的1/3,2008年的調(diào)查結(jié)果顯示,在20歲以上的成人中,年齡標(biāo)化的糖尿病的患病率為9.7%[2],隨著糖尿病治療藥物的研究進(jìn)展,目前臨床使用的糖尿病治療藥物不僅有胰島素、二甲雙胍等傳統(tǒng)藥物,還有作用于胰高血糖素樣肽-1(GLP-1)或二肽基肽酶-4(DPP-4)的兩類新型藥物,其中二肽基肽酶-4(DPP-4)抑制劑由于其作用靶點(diǎn)獨(dú)特、有效性及安全性俱佳,成為糖尿病藥物市場(chǎng)最受關(guān)注的一類藥物。

DPP-4結(jié)構(gòu)功能

DPP-4由Hopsu-Havu和Glenner在鼠肝臟組織勻漿過(guò)程中發(fā)現(xiàn),2003年首次確定了DPP-4蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu),是體內(nèi)降解GLP-1,并使其失活的關(guān)鍵酶之一。

DPP-4是一種位于細(xì)胞表面的絲氨酸肽酶,廣泛存在于血漿、胃腸道、腎臟、淋巴結(jié)和結(jié)締組織等體內(nèi)組織中,其中腎臟最多。其家族成員包括DPP-1、DPP-2、DPP-3、DPP-4、DPP-8、DPP-9和成纖維細(xì)胞活化蛋白-α(FAP)。DPP-4的分子量為220ku,活性體為二聚體形式,每個(gè)亞單位包含兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,控制底物的出入口位于兩個(gè)結(jié)構(gòu)域之間的一個(gè)大小為30~45A的大型洞穴,其內(nèi)的袋狀結(jié)構(gòu)便是DPP-4的活性部位,凡是結(jié)構(gòu)的N端第二位上是脯氨酸(Pro)或丙氨酸(Ala)的多肽都是DPP-4發(fā)揮活性的主要底物[3]。

DPP-4抑制劑作用機(jī)理

由于體內(nèi)DPP-4的迅速降解作用,GLP-1在體內(nèi)半衰期很短(<2min),研究發(fā)現(xiàn)當(dāng)DPP-4活性被抑制后GLP-1的作用時(shí)間便有效延長(zhǎng),從而發(fā)揮降低血糖水平作用。DPP-4抑制劑作用機(jī)理便是基于其結(jié)構(gòu)與天然底物相似,含有Xaa-Pro類似結(jié)構(gòu),能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合DPP-4活性部位,而且親和力遠(yuǎn)大于天然底物,因而改變了DPP-4的構(gòu)象,降低催化活性。實(shí)驗(yàn)證明DPP-4抑制劑可在24h內(nèi)可逆性地抑制大約90%的DPP-4酶活性。因而DPP-4抑制劑能夠通過(guò)提高體內(nèi)GLP-1濃度,延長(zhǎng)其降糖作用時(shí)間,并且抑制胰高血糖素分泌,延長(zhǎng)GLP-1對(duì)胰島素分泌的刺激持續(xù)時(shí)間。因?yàn)镚LP-1對(duì)胰島素分泌的調(diào)節(jié)作用呈現(xiàn)嚴(yán)格的血糖濃度依賴性,只有在血糖升高時(shí),GLP-1才會(huì)增加胰島素分泌,所以DPP-4抑制劑不會(huì)引起低血糖發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。DPP-4抑制劑獨(dú)特作用機(jī)理和良好的安全性特點(diǎn),成為了糖尿病新藥研究的熱點(diǎn)領(lǐng)域,目前,已有4個(gè)DPP-4抑制劑獲得上市批準(zhǔn),并且仍有許多正在開(kāi)發(fā)過(guò)程中的化合物。

DPP-4抑制劑結(jié)構(gòu)分類

DPP-4抑制劑首先要求對(duì)DPP-4具有較強(qiáng)抑制作用,但是最早發(fā)現(xiàn)的一批化合物對(duì)相關(guān)其他酶如DPP-7、DPP-8和DPP-9也有抑制作用。另外,還要求研發(fā)出對(duì)DPP-4選擇性高的化合物,即兼?zhèn)鋵?duì)DPP-4的高抑制活性和高選擇性,并且作用時(shí)間持續(xù),如能保持24h作用,以方便每日1次給藥。

通過(guò)X線衍射研究發(fā)現(xiàn)DPP-4酶分子的結(jié)合位點(diǎn)具有高度類藥性[4]:催化位點(diǎn)位于較大的空間中,存在由數(shù)個(gè)芳環(huán)側(cè)鏈形成的親脂性口袋,從而具有有效的分子錨定位點(diǎn),有利于設(shè)計(jì)小分子藥物,以實(shí)現(xiàn)對(duì)酶的緊密特異性結(jié)合;另一方面,DPP-4酶的催化位點(diǎn)有兩個(gè)開(kāi)口,能夠使溶劑進(jìn)入,調(diào)解抑制劑的理化性質(zhì),改善藥動(dòng)學(xué)特性。正是這些結(jié)構(gòu)特征提供了DPP-4酶結(jié)合位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)優(yōu)勢(shì),使發(fā)現(xiàn)多種不同化學(xué)類型的DPP-4抑制劑成為可能。

現(xiàn)有的DPP-4抑制劑根據(jù)其化學(xué)結(jié)構(gòu)特點(diǎn),分為兩大類別:擬肽類DPP-4抑制劑(α-氨基酸類和β-氨基酸類)和非擬肽類DPP-4抑制劑(嘧啶類、黃嘌呤類等)。

擬肽類抑制劑基于DPP-4的天然底物GLP-1的N端結(jié)構(gòu)片段為化學(xué)模擬對(duì)象來(lái)進(jìn)行藥物設(shè)計(jì),得到一類具有類似于脯氨酸結(jié)構(gòu)的化合物,是目前研究最為廣泛的一類DPP-4抑制劑,其結(jié)構(gòu)主要由含有雜環(huán)的P1位和含有取代氨基側(cè)鏈的P2位組成。P1與DPP-4的S1疏水口袋結(jié)合;P2占據(jù)S2口袋。當(dāng)P2的吡咯烷(或類似結(jié)構(gòu))所連的羰基的α-位氨基取代,得到含有甘氨酸結(jié)構(gòu)片段的化合物為α-氨基酸類擬肽類DPP-4抑制劑;如果為β-位氨基取代,對(duì)應(yīng)得到含有β-丙氨酸結(jié)構(gòu)片段的化合物則為β-氨基酸類擬肽類DPP-4抑制劑。

與擬肽類DPP-4抑制劑不同,非擬肽類抑制劑結(jié)構(gòu)不存在明顯一致性,可分為黃嘌呤類、氨甲基嘧啶類、氨基環(huán)己烷、嘧啶酮和煙酰胺類等。

DPP-4抑制劑的構(gòu)效關(guān)系

近些年來(lái),相繼有沙格列?。⊿axagliptin),維格列?。╒ildagliptin)和Linagliptin獲得上市批準(zhǔn)。另外,還有多種處于臨床研究階段的抑制劑分子。下面將對(duì)其構(gòu)效關(guān)系進(jìn)行綜述。

1.擬肽類DPP-4抑制劑

1.1 α-氨基酸類DPP-4抑制劑 早期的擬肽類抑制劑模擬DPP-4的天然底物,結(jié)構(gòu)中都含有類似脯氨酸片段。與DPP-4相結(jié)合時(shí),P1、P2區(qū)分別占據(jù)S1和S2口袋,同時(shí)氨基與DPP-4中的205位(或206位)谷氨酸形成鹽橋,羰基上的氧原子與125位精氨酸形成氫鍵。由于發(fā)現(xiàn)若在P1區(qū)吡咯烷C2位引入親電子基團(tuán),如CN,則可與DPP-4的活性部位的630位絲氨酸進(jìn)一步形成鍵合,能夠增加對(duì)DPP-4的抑制活性,但是這樣的2-氰基吡咯烷類衍生物在中性和堿性條件下易成環(huán)水解而失活,穩(wěn)定性差。通過(guò)研究得到兩種方法能夠提高穩(wěn)定性,降低其成環(huán)速率,從而得到了今天的上市藥物維格列汀和沙格列汀。

一方面,可以通過(guò)N端修飾提高穩(wěn)定性。維格列汀[5]是在P2區(qū)的α-氨基氮原子上引入大體積基團(tuán),即3-羥基金剛烷基,通過(guò)空間位阻效應(yīng)降低氮原子的反應(yīng)性,分子內(nèi)環(huán)合的概率降低至原先的1/30,顯著提高化學(xué)穩(wěn)定性,對(duì)DPP-4的IC50為3.5nmol/L。維格列汀的血漿半衰期為3h,口服生物利用度達(dá)到85%。

另一方面,可以在C端進(jìn)行修飾。百時(shí)美施貴寶研發(fā)的沙格列汀在P1區(qū)氰基吡咯環(huán)的C4和C5上引入具有手性環(huán)丙基,同時(shí)引入3-羥基金剛烷基,阻礙環(huán)合反應(yīng)進(jìn)行[6]。體外活性研究顯示沙格列汀對(duì)DPP-4的IC50為3.37nmol/L,穩(wěn)定性高于維格列汀。沙格列汀的半衰期為2.1h,生物利用度為75%。

1.2 β-氨基酸類DPP-4抑制劑 β-氨基酸類擬肽類DPP-4抑制劑的代表西格列汀是首個(gè)獲得美國(guó)FDA批準(zhǔn)上市的DPP-4抑制劑。該類化合物的氨基能與DPP-4分子的第205位谷氨酸(或206位谷氨酸)結(jié)合形成鹽橋。構(gòu)效關(guān)系表明:當(dāng)β-氨基與其手性碳原子的構(gòu)象為R型時(shí)活性優(yōu)于S型;而R基必須是苯環(huán),若用芳雜環(huán)或環(huán)烷基取代則活性會(huì)下降,苯環(huán)上引入較小的取代基團(tuán)(如氟)活性增強(qiáng),而且多氟取代物的活性高于單氟取代物;分子結(jié)構(gòu)中的雜環(huán)多為吡咯烷、噻唑烷、哌嗪或三唑并哌嗪環(huán)。在雜環(huán)或芳雜環(huán)上引入適當(dāng)?shù)娜〈鶗?huì)增強(qiáng)藥效活性。

西格列汀的結(jié)構(gòu)中2,4,5-三氟苯基能夠較好地占據(jù)S1疏水口袋,產(chǎn)生疏水作用,4位的氟原子與Asn710和Arg125相互作用形成氫鍵;羰基的氧原子與Tyr547通過(guò)水分子形成橋連;(R)-氨基與2個(gè)谷氨酸殘基Glu205、Glu206發(fā)生氫鍵相互作用;該保守性氫鍵與底物的N端和DPP-4結(jié)合作用類似;三唑哌嗪環(huán)與Phe357的側(cè)鏈還能產(chǎn)生π-π相互作用;三氟甲基與Arg358和Ser209分別形成氫鍵,與所處的口袋結(jié)合十分緊密,當(dāng)除去該基團(tuán)或被更大的取代基取代時(shí),活性都有所下降,故表明此位點(diǎn)的最佳大小基團(tuán)便是三氟甲基[7]。對(duì)西格列汀的體外抑酶活性試驗(yàn)研究結(jié)果為西格列汀對(duì)DPP-4的IC50為18nmol/L。藥動(dòng)學(xué)研究顯示,口服100mg劑量后迅速吸收,1~4h后血漿藥物濃度達(dá)峰值,血藥AUC與劑量成比例,半衰期為12.4h,有16%被代謝。一項(xiàng)為期18周的研究表明,西格列汀單藥治療能夠改善HOMA-β指數(shù)和胰島素原/胰島素比值(與安慰劑相比12.1% vs 1%;-0.05 vs 0.07)。

還有后續(xù)多項(xiàng)研究對(duì)西格列汀結(jié)構(gòu)進(jìn)行了相應(yīng)改造,尋找新型藥物分子。Shan等改變?nèi)颦h(huán)中氮原子的位置[8],得到1,2,3-三唑并哌嗪化合物,對(duì)DPP-4的IC50為50nmol/L。大鼠實(shí)驗(yàn)藥動(dòng)學(xué)性質(zhì)良好,半衰期為2.53h,Cmax965μg/L。在ICR小鼠OGTT試驗(yàn)中,該化合物能降低最高血糖水平約31%。若將三唑并哌嗪環(huán)替換為吡咯烷,并在吡咯烷的C2位引入大基團(tuán),那么得到的化合物體外抑酶活性為IC506.3nmol/L[9]。ob/ob小鼠的OGTT試驗(yàn)中血糖峰值降低15%。Kim對(duì)三唑并哌嗪環(huán)進(jìn)行替代,以哌嗪-2-酮替代后得到DA-1229[10],IC50為0.9nmol/L,大鼠體內(nèi)半衰期6.1h,生物利用度為74.8%,并且已進(jìn)入Ⅱ期臨床試驗(yàn)階段。

2.非擬肽類DPP-4抑制劑

2.1 黃嘌呤類 黃嘌呤衍生物DPP-4抑制劑活性較強(qiáng),該類化合物中已有Linagliptin獲批上市。該藥物是首先在高通量篩選得到的先導(dǎo)化合物BDPX后進(jìn)行有效關(guān)系研究并改造后得到的。BDPX分子的母環(huán)的結(jié)構(gòu)不固定,與Tyr547形成疏水作用,是非活性必須的,可用其他稠雜環(huán)替代,如尿嘧啶、咪唑和三唑環(huán)等;7位N上的取代基是活性必須的,多為芐基、2-丁烯基或2-丁炔基,而且在芐基2位引入氰基使活性提高;另外,還需要8位哌嗪或3-氨基哌啶取代基與S2口袋的Glu205形成保守性氫鍵。在黃嘌呤的N-1位引入疏水性基團(tuán)后還可與Trp629作用,提高與DPP-4的結(jié)合力[11]。實(shí)驗(yàn)證明Linagliptin對(duì)DPP-4的IC50為1nmol/L,而且屬于長(zhǎng)效DPP-4抑制劑,作用長(zhǎng)達(dá)24h。

2.2嘧啶類 嘧啶類抑制劑是由黃嘌呤類衍生物經(jīng)結(jié)構(gòu)改造而得到的非擬肽類抑制劑,將黃嘌呤骨架躍遷為嘧啶后再進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾,其與DPP-4的結(jié)合模式與黃嘌呤類相似。由日本武田制藥研制的阿格列汀[12]結(jié)構(gòu)內(nèi)的嘧啶酮部分與Tyr547形成π-π相互作用,嘧啶酮的羰基與Tyr631形成氫鍵;并在雜環(huán)上連接N取代氨基芐基,與Arg125產(chǎn)生氫鍵,苯環(huán)與Tyr622產(chǎn)生疏水作用,還有氨基哌啶與Glu205形成氫鍵。阿格列汀的體外活性研究顯示,其對(duì)DPP-4的IC50為7nmol/L,口服半衰期為12.3~21h。

結(jié) 語(yǔ)

隨著藥物研發(fā)和臨床研究的發(fā)展,越來(lái)越多的DPP-4抑制劑進(jìn)入臨床使用或臨床研究階段,為2型糖尿病患者的治療提供了一個(gè)較已有治療藥物具有特定方面優(yōu)勢(shì)的選擇,如在降低血糖的同時(shí)保護(hù)B細(xì)胞功能,低血糖風(fēng)險(xiǎn)低而且不會(huì)引起體重增加。但是,在研發(fā)中仍存在維持化合物活性和提高選擇性的矛盾,在臨床用藥中仍面臨著有效性與長(zhǎng)期安全性評(píng)估的重大挑戰(zhàn),需要進(jìn)行更深入的研究,來(lái)為2型糖尿病患者提供更有效安全的DPP-4抑制劑藥物治療。

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