許存賓, 劉 艷, 王錫鋒
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研究所,植物病蟲害生物學(xué)國家重點實驗室,北京 100193)
Wolbachia是一類細胞內(nèi)共生菌,是屬于α-變形菌門的立克次氏體。最早于1924年在尖音庫蚊(Culex pipiens Linnaeus)的生殖器官內(nèi)發(fā)現(xiàn),命名為 Wolbachia pipienti[1]。Wolbachia 普遍寄生于昆蟲、甲殼動物、螨蟲和絲狀線蟲類動物體內(nèi),據(jù)估計66%的昆蟲都感染有Wolbachia[2]。Wolbachia隨母系遺傳,參與調(diào)控寄主的誘導(dǎo)細胞質(zhì)不親和(cyto-plasmic incompatibility,CI)、雄性致死(male-killing)、雌性化(feminization)、孤雌生殖(parthenogenesis inducing)等多種生殖活動[3-7],從而有利于自身的生存與傳播,并影響寄主的生殖行為。此外也有研究表明Wolbachia能保護寄主抵御病原菌和寄生蟲等的侵害[8]。Wolbachia還能依靠寄主的捕食、寄生等行為在昆蟲的個體、群體間進行橫向傳播[9-10]。
早期的研究多用DAPI染色法和電鏡觀察昆蟲體內(nèi)的 Wolbachia[11-12]。隨著分子生物學(xué)方法的快速發(fā)展,主要利用其16S/23SrDNA、groEL、ftsZ和wsp等基因進行PCR檢測與序列分析[13]。編碼表面蛋白的Wolbachia outer surface protein(wsp)基因是已知的Wolbachia基因中進化最快的基因,因而被廣泛地用于Wolbachia的PCR檢測與分子鑒別[14]。根據(jù)分子系統(tǒng)發(fā)生,Wolbachia的不同種屬被劃分為11個超群(supergroups A~K),節(jié)肢動物中的Wolbachia主要劃分在A和B超群,并在兩超群下又細分為12個組[14]。
水稻是我國最重要的糧食作物之一,水稻生產(chǎn)的豐歉直接影響我國的糧食安全。自20世紀(jì)60年代中期起,稻田3種飛虱(褐飛虱、白背飛虱和灰飛虱)陸續(xù)成為影響我國水稻生產(chǎn)的重要生物災(zāi)害。同時灰飛虱還可以在水稻、小麥、玉米上傳播水稻條紋病毒和水稻黑條矮縮病毒,引起的病毒病造成更為嚴(yán)重的損失[15]。長期以來國內(nèi)外把研究重點放在與應(yīng)急防治密切相關(guān)的技術(shù)研發(fā)上,而對與稻飛虱災(zāi)變和持續(xù)治理相關(guān)的生物學(xué)和生態(tài)學(xué)基礎(chǔ)研究較少。特別是灰飛虱與內(nèi)共生菌、病毒三者之間的相互關(guān)系的相關(guān)研究還未見報道。本研究的主要目的是檢測我國主要水稻產(chǎn)區(qū)灰飛虱攜帶的共生細菌Wolbachia比例,對其wsp基因進行序列測定與比較,為深入研究稻飛虱與其體內(nèi)共生物的關(guān)系,揭示W(wǎng)olbachia對共生昆蟲的作用機制奠定基礎(chǔ)。
本試驗所采用的灰飛虱(Laodelphax striatellus Fallen)采集于我國12個省(自治區(qū))21個水稻生產(chǎn)地區(qū)(見表1),采集時間為2010-2011年。田間活體采集并進行種類鑒定后,取部分樣品按采集地區(qū)隔離飼養(yǎng),剩余樣品經(jīng)液氮冷凍后-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
灰飛虱總DNA的提取采用Promega公司的Wizard Genomic DNA提取試劑盒,提取方法參考說明書略作改動。取冷凍保存單頭灰飛虱經(jīng)乙醇消毒清洗后,切取腹部組織于1.5mL離心管,加入液氮后用玻璃研棒充分研磨并加入50μL核酸裂解液(nuclei lysis solution)勻漿,直至組織完全破裂,再用100μL核酸裂解液沖洗研棒,混勻后65℃溫浴20min。室溫冷卻,加入1μL RNase,37℃溫浴20min,加入80μL蛋白質(zhì)沉淀劑(protein precipi-tation solution),振蕩混勻后冰浴5min,13 000~16 000r/min常溫離心6min。取上清于1.5mL離心管中,加入300mL常溫異丙醇,輕柔顛倒混勻,13 000~16 000r/min常溫離心3min,棄上清,加入75%乙醇,13 000~16 000r/min常溫離心2min,再加75%乙醇重復(fù)1次,超凈臺干燥后加入25μL ddH2O,65℃溫浴溶解1h,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
參照Zhou等方法[14]進行Wolbachia的wsp基因的PCR擴增,采取通用引物 wsp-81F:5′-TGG TCC AAT AAG TGA TGA AGA AAC-3′;wsp-691R:5′-AAA AAT TAA ACG CTA CTC A-3′,引物由華大基因公司合成。擴增反應(yīng)液(25μL體系):模板DNA 1μL,10μmol/L正反向引物各0.5μL,2.5mmol/L dNTP 2μL,5Ur Taq 酶0.25μL,10×buffer 2.5μL,加ddH2O至25μL。在Eppendorf PCR儀中按下列擴增程序進行:95℃預(yù)變性5min;95℃變性0.5min,55℃復(fù)性0.5min,72℃延伸1min,36次循環(huán);最后在72℃延伸10min;4℃下保存?zhèn)溆谩?/p>
根據(jù)灰飛虱線粒體基因序列(GenBank登錄號:FJ360695),設(shè)計引物COI-F:5′-ATT TAC CCA CCA CTA TCT-3′;COI-R:5′-TGG AAA TGA GCC ACT ACA-3′用于PCR擴增灰飛虱的COI基因,片段長度為752bp。擴增反應(yīng)液(25μL體系):模板DNA 1μL,10μmol/L正反向引物各0.5μL,2.5mmol/L dNTP 2μL,5Ur Taq 酶0.25μL,10×buffer 2.5μL,加ddH2O至25μL。在Eppendorf PCR儀中按下列擴增程序進行:94℃預(yù)變性3min;94℃變性1min,51℃復(fù)性0.5min;72℃延伸1min,36次循環(huán);最后在72℃延伸10min,4℃下保存?zhèn)溆谩?/p>
取PCR特異性擴增產(chǎn)物5μL,在1%的瓊脂糖膠上進行電泳檢測(電壓100V,30min),紫外燈下觀察結(jié)果并保存,明確Wolbachia的wsp基因與灰飛虱的COI基因是否存在以及擴增片段的大小。
PCR產(chǎn)物純化后,連接至pMD-18T載體上,轉(zhuǎn)化到DH 5α大腸桿菌感受態(tài)中。每個樣品選取3個陽性克隆由華大基因公司進行序列測定。
對采集自全國12個省份(自治區(qū))21個地區(qū)共167頭灰飛虱樣品進行Wolbachia測定,以灰飛虱COI為對照。其中16個地區(qū)的灰飛虱都100%感染有Wolbachia,5個地區(qū)出現(xiàn)非陽性個體,四川遂寧地區(qū)感染率最低,平均陽性率為96.41%(見表1)。
表1 不同地區(qū)灰飛虱感染W(wǎng)olbachia情況統(tǒng)計表
對167頭灰飛虱中的102頭的Wolbachia wsp進行了序列測定,獲得的wsp基因的序列長度均為599bp,各地理種群間序列僅存在極小的差異。21個地區(qū)群體中都具有相同的wsp序列個體,其中只有3個地區(qū)的個體中存在變異。云南大理(YNDL-1)樣品的46位存在突變T→C;四川郫縣(SCPX-2)樣品的231位存在突變A→G,云南保山(YNBS-6)樣品的584位存在一個gap。將全國大部分地區(qū)Wolbachia一樣的wsp序列命名為National-wsp,參照Zhou等[11]Wolbachia的分類,結(jié)合NCBI的blast工具,用MEGA v.5對上述序列進行聚類構(gòu)建系統(tǒng)進化樹(圖1)。
圖1 灰飛虱體內(nèi)Wolbachia的wsp基因的PCR產(chǎn)物電泳圖
從系統(tǒng)發(fā)育樹可以得出,灰飛虱體內(nèi)Wolbachia在系統(tǒng)進化上屬于B超群(supergroup B)內(nèi)Con組(Group Con)[14]。在地理區(qū)域上,國內(nèi)各地區(qū)以及日本、泰國等地的灰飛虱Wolbachia處于同一分支,不存在地理種群的分化。
圖2 灰飛虱COI基因的PCR產(chǎn)物電泳圖
利用NCBI數(shù)據(jù)庫,對比褐飛虱體內(nèi)Wolbachia的wsp基因(GenBank登錄號:GU289775,F(xiàn)J713754,F(xiàn)J713760,GU289751)序列和白背飛虱體內(nèi)Wolbachia的wsp基因(GenBank登錄號:GU361730,GU361731,GU361731,F(xiàn)J713766)序列。其中白背飛虱與灰飛虱的序列完全一致,但兩者與褐飛虱存在較大差異,序列相似性只有83.39%。由此我們假設(shè)白背飛虱與灰飛虱可能感染有相同的Wolbachia(圖3所示,B超群下Con組),而褐飛虱可能感染另外一個株系的Wolbachia(圖3所示,B超群下Cau組)。系統(tǒng)進化樹中與灰飛虱和白背飛虱處于同一分支的還有寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)、寄生螯蜂(Dryinid wasp),與之相近的還有一種寄生絨繭蜂[Cotesia glomerata(L.)],這些寄生昆蟲可能幫助了灰飛虱與白背飛虱體內(nèi)Wolbachia在其種群內(nèi)和種群間進行水平傳播。但是3種稻飛虱在自然界具有密切交匯,那么三者體內(nèi)應(yīng)該攜帶相似的Wolbachia,然而三者中兩者一樣而另一種存在差異。
圖3 灰飛虱體內(nèi)Wolbachia與已報道的wsp基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
通過設(shè)計Wolbachia的wsp基因的特異引物,對采集自我國12個省21個地區(qū)的灰飛虱進行鑒定,發(fā)現(xiàn)我國絕大部分地區(qū)灰飛虱都帶有Wolbachia,且感染率高。不同地區(qū)灰飛虱Wolbachia的感染率存在一定的差異,四川地區(qū)的感染率較其他地方相對低,這與甘波誼等[16]的報道相一致。從群體分化來看,灰飛虱體內(nèi)的Wolbachia為同一群體,不存在明顯的地理種群分化,這可能與不同地區(qū)的灰飛虱群體可以經(jīng)常進行基因交流有關(guān)。
三種稻飛虱體內(nèi)的Wolbachia比較發(fā)現(xiàn):灰飛虱與白背飛虱的wsp基因序列完全一致,而與褐飛虱存在較大差異。再次引起我們對Wolbachia如何在自然界進行傳播的思考。有報道推測可能與灰飛虱和白背飛虱的寄生蜂(Dryinid wasp)、寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)有關(guān)[10],這兩種寄生昆蟲可能協(xié)助了Wolbachia在兩種飛虱之間的水平傳播。
三種稻飛虱在自然界具有極其相似的生活環(huán)境,寄生螯蜂(Dryinid wasp)和寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)同為三種稻飛虱的寄生昆蟲[16-17],而從本研究得出的系統(tǒng)發(fā)育樹可以明顯看出Wolbachia在三者之間產(chǎn)生了種群分化。此外,從系統(tǒng)發(fā)育樹中還發(fā)現(xiàn)與灰飛虱、白背飛虱處于同一分支的還有雜擬谷盜(Tribolium confusumJacquelin du Val),一種鞘翅目擬步行蟲科昆蟲。與褐飛虱處于同一分支的還有鱗翅目的赤松毛蟲(Dendrolimus spectabilis Butler),寄生于赤松,與褐飛虱的生活習(xí)性及分布區(qū)域相差很大。怎樣的遺傳事件使不同的昆蟲具有相類似的Wolbachia,而相類似的昆蟲群體卻具有不同的Wolbachia?當(dāng)然,僅僅用wsp一個基因是不足以全面反映各宿主的Wolbachia種群的關(guān)系的,這只是一方面的推測。Wolbachia在自然界中真實的傳播方式還需要從多方位、多角度進一步探索。
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