王長春 毛偉敏 凌志強
浙江省腫瘤醫(yī)院 浙江省腫瘤研究所腫瘤分子遺傳實驗室
浙江省胸部腫瘤(肺、食管、乳腺)診治技術研究重點實驗室(310022)
腫瘤的表觀遺傳學研究已成為近年腫瘤研究的熱點問題。有研究發(fā)現(xiàn)多種腫瘤包括胃癌、食管癌中可見基因啟動子區(qū)5’CpG島異常甲基化[1,2],食管癌前病變Barrett食管中抑癌基因APC基因啟動子區(qū)亦存在高甲基化[3]。大量研究已證實抑癌基因甲基化與食管癌相關,但多種抑癌基因啟動子區(qū)5’CpG島甲基化與腫瘤家族史的研究鮮見報道。本研究通過檢測食管鱗狀細胞癌(ESCC)患者中多種抑癌基因的甲基化狀態(tài),旨在探討其與腫瘤家族史和預后的相關性,為進一步研究腫瘤易感家族提供依據(jù)。
選取2010年2~7月浙江省腫瘤醫(yī)院76例經(jīng)病理檢查確診的ESCC患者,均為首診病例,術前未接受過放、化療以及其他任何治療。其中男61例,女15例,年齡40~76歲,中位年齡60歲。食管上/中段病變46例,下段30例;高/中分化60例,低分化16例。有腫瘤家族史(定義為兩代以內(nèi)有直系親屬曾患有惡性腫瘤)者16例,其中食管癌5例,結腸癌2例,胰腺癌2例,肺癌2例,淋巴瘤2例,白血病、胃癌和腎癌各1例;無腫瘤家族史者60例。按照國際抗癌聯(lián)盟(UICC)和美國腫瘤聯(lián)合會(AJCC)2009第7版TNM分期標準,Ⅰ期5例,Ⅱ期30例,Ⅲ期40例,Ⅳ期1例。本研究方案經(jīng)浙江省腫瘤醫(yī)院倫理委員會批準同意,患者均簽署知情同意書。
1.組織DNA提?。菏中g切除標本后,由專人負責取組織標本。腫瘤組織標本取自癌巢,癌旁正常組織取自距腫瘤邊緣5 cm處,切取后立即置于液氮-76℃保存。采用苯酚/氯仿法提取基因組DNA(杭州化學試劑有限公司),置于-20℃保存待測。
2.DNA亞硫酸氫鹽修飾:以紫外分光光度計(型號NanoDrop ND-1000)測定DNA濃度和純度,A260nm/A280nm比值≥1.8的DNA判定為合格樣本?;蚪MDNA行亞硫酸氫鹽修飾和純化,具體步驟按EpiTect Bisulfite Kits(Qiagen)說明書操作。
3.MSP 檢測:參照 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a和RASSF1A基因序列,分別設計5’CpG島特異性甲基化和非甲基化引物,所有引物由Invitrogen公司合成(見表1)。PCR反應體系20μl,反應條件:95℃預變性 10 min;95℃變性 15 s,60℃退火1 min,72℃延伸1 min,共40個循環(huán);72℃延伸10 min[2]。采用2-△CT法定量分析各抑癌基因的甲基化狀態(tài)。以體外經(jīng)SssⅠ甲基轉(zhuǎn)移酶處理過的人類基因組DNA作為陽性對照。
采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件。計數(shù)資料的比較采用χ2檢驗;生存分析采用Kaplan-Meier分析,終點事件為腫瘤復發(fā)或死亡,觀察無進展生存期(progression-free survival,PFS)。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。
ESCC患者腫瘤組織APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為44.7%、72.4%、72.4%、86.8%、55.3%,均顯著高于相應癌旁正常組織,差異均有統(tǒng)計學意義(P=0.000)(見表 2)。
表2 ESCC患者腫瘤組織和癌旁正常組織中各抑癌基因甲基化率的比較 n(%)
16例有腫瘤家族史的ESCC患者中,腫瘤組織 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為75.0% (12/16)、100% (16/16)、93.8%(15/16)、93.8%(15/16)、100%(16/16);60 例無腫瘤家族史者中,甲基化率分別為36.7%(22/60)、65.0%(39/60)、66.7%(40/60)、85.0%(51/60)和 43.3%(26/60),兩組相比差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
表1 各抑癌基因甲基化特異性PCR反應引物和片段長度
66例ESCC患者有隨訪結果,其中18例復發(fā)或死亡,另有10例失訪。經(jīng)Kaplan-Meier分析,CDH1和RASSF1A非甲基化患者的平均生存期均明顯高于甲基化患者(P=0.015、P=0.016),其余 3種抑癌基因甲基化與否對預后的影響無明顯差異(見表 3、圖 1)。
腫瘤的病因和發(fā)病機制復雜,其中抑癌基因起重要調(diào)控作用。APC基因涉及調(diào)節(jié)細胞黏附、細胞遷移乃至細胞凋亡,其調(diào)控方式是與微管結合,調(diào)節(jié)胞液中β-catenin蛋白水平;RARβ2是一種抑癌基因,定位于染色體3p24,通過在靶細胞中轉(zhuǎn)化成視黃酸而發(fā)揮作用,其啟動子區(qū)甲基化可引起癌癥的發(fā)生[4];p16基因主要通過調(diào)節(jié)細胞周期來參與腫瘤的發(fā)生,其調(diào)節(jié)機制可能通過Rb基因依賴途徑實現(xiàn)[5];CDH1基因參與同型細胞間黏附;RASSF1A除具有調(diào)節(jié)細胞周期的作用之外,還可促進凋亡和調(diào)節(jié)微管穩(wěn)定性[6]。
業(yè)已證實抑癌基因在食管癌的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用[7],其表遺傳沉默與腫瘤侵襲、生長、新生血管生成、轉(zhuǎn)移行為密切相關,可能是食管癌發(fā)生、發(fā)展以及治療后復發(fā)的重要因素之一,并影響患者的總體生存率。多項研究證實ESCC組織中存在多種抑癌基因的高甲基化。且在癌變過程中,不同組織類型的基因甲基化狀態(tài)亦不相同[8]。Zare等[9]發(fā)現(xiàn)44.4%的ESCC患者發(fā)生APC啟動子區(qū)高甲基化,其兩年生存率更低,而正常組織中未發(fā)生甲基化;Kim等[10]的研究結果顯示50例ESCC患者中,APC、RARβ2、p16、RASSF1A 的 甲 基 化 率 分 別 為46%、34%、10%和 14%;Kuroki等[11]的研究發(fā)現(xiàn)ESCC細胞株和 ESCC組織中均可見 RARβ2、RASSF1A高甲基化,且腫瘤組織的甲基化率高于癌旁組織;Lee等[12]發(fā)現(xiàn)251例ESCC患者中p16、RARβ2、CDH1 的甲基化率分別為 52%、25%和43%,且CDH1高甲基化可作為TNM分期Ⅰ期患者的復發(fā)指標;Taghavi等[13]發(fā)現(xiàn)ESCC患者腫瘤組織p16INK4a甲基化率顯著高于相鄰癌旁組織。本研究中,ESCC 患者腫瘤組織中 APC、RARβ2、CDH1、p16INK4a、RASSF1A的甲基化率分別為44.7%、72.4%、72.4%、86.8%、55.3%,均顯著高于相應癌旁正常組織。由此可見,各種抑癌基因甲基化可能在ESCC的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。
表3 ESCC患者各抑癌基因甲基化Kaplan-Meier分析
圖1 CDH1和RASSF1A甲基化和非甲基化患者的生存曲線
Abbaszadegan等[14]在ESCC患者家族成員中發(fā)現(xiàn),p16啟動子區(qū)異常甲基化率為64.3%,而健康志愿者為0,說明p16異常甲基化可作為高危ESCC家族成員腫瘤的早期鑒別標記。本研究發(fā)現(xiàn)ESCC患者 APC、RARβ2、CDH1、RASSF1A 基因甲基化與腫瘤家族史顯著相關,而p16INK4a基因甲基化與腫瘤家族史無關。
目前抑癌基因甲基化與ESCC患者預后關系的報道少見。本研究中,CDH1和RASSF1A甲基化患者的生存期明顯低于非甲基化患者,但因隨訪時間過短,故不能肯定其臨床意義,尚需進一步隨訪并重新分析才能得出可信的結果。
由此可見,對具有腫瘤家族史的健康家庭成員行多種抑癌基因甲基化檢測,并密切隨訪甲基化陽性者,可在一定程度上早期診斷和治療ESCC等疾病。但該結論尚需擴大樣本量進一步驗證。
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