廖芳麗 林梅 張宇飛 趙虹 熊先鋒 張凱 涂書新
摘要:在兩系雜交稻兩優(yōu)培九的大群體田間純度鑒定中,定向摻入形態(tài)學(xué)差異較大的兩系雜交稻新兩優(yōu)6380,逐株抽取田間植株葉片樣品,運(yùn)用SSR法進(jìn)行鑒定。結(jié)果表明,運(yùn)用SSR法能夠準(zhǔn)確地檢測出摻入的新兩優(yōu)6380。在室內(nèi)檢測的譜帶中發(fā)現(xiàn),新兩優(yōu)6380的帶型與兩優(yōu)培九不育系帶型的位置相同。
關(guān)鍵詞:兩系雜交稻;大群體;摻雜回收;帶型比對
中圖分類號:S511;Q789文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A文章編號:0439-8114(2012)18-3941-02
Study on Detection of Seed Purity of Two-Line Hybrid Rice by Simple Sequence Repeat (SSR) Ⅲ.Adulteration and Recovery Experiments between Two Different Varieties
LIAO Fang-li1,LIN Mei1,ZHANG Yu-fei1,ZHAO Hong1,XIONG Xian-feng1,ZHANG Kai2,TU Shu-xin3
(1. Seed Management Bureau of Jingzhou City in Hubei Province, Jingzhou 434020, Hubei, China; 2.Agricultural College, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China; 3. Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China)
Abstract: The groups seeds purity of two-line hybrid rice variety Liangyoupei 9 adulterated another different variety Xinliangyou 6380 was detected through exterminating leaves with the method of SSR. The results showed that Xinliangyou 6380 adulterated could be recognized exactly. The same lane between Xinliangyou 6380 and Liangyoupei 9 sterile line was observed during detection in the laboratory.
Key words: two-line hybrid rice; a large group; adulteration and recovery; lane alignment
由于DNA提取方法的簡化、瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)的運(yùn)用,以及SSR分子標(biāo)記鑒定兩系雜交水稻種子純度具有快速、重復(fù)性好、多態(tài)性高等優(yōu)點(diǎn),使得SSR法成為目前室內(nèi)鑒定兩系雜交水稻種子純度時(shí)應(yīng)用最為廣泛的分子標(biāo)記方法[1-6]。但是瓊脂糖凝膠電泳成像的譜帶分辨率低,信息量不充分,譜帶的主帶一般表現(xiàn)為不育系、恢復(fù)系和雜交種3種類型,不能區(qū)分不同的雜株類型。
為驗(yàn)證該方法的可靠性和準(zhǔn)確性,前人的研究一般是在鑒定時(shí),采取人為在鑒定樣品中摻入該組合的恢復(fù)系、保持系、不育系的方法來檢驗(yàn)[7-9]。但在田間正季種植鑒定條件下,用兩系雜交水稻種子大群體定位摻雜回收,且對摻入的雜交種子雜株譜帶特征的研究目前鮮有報(bào)道[10-13]。
此次研究的目的在于了解單對引物對親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的品種的識別率,驗(yàn)證單對引物SSR法測定親緣較遠(yuǎn)的兩系雜交水稻種子純度的準(zhǔn)確性和可靠性,同時(shí)探討樣品中混入其他雜交種的譜帶特征。
1材料與方法
1.1材料
試驗(yàn)材料是在通過系譜比較后,選用遺傳背景不同、親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的兩優(yōu)培九(培矮64S×9311)和新兩優(yōu)6380(03S×D208)兩個(gè)品種。這兩個(gè)品種由荊州市種子管理局從市場上抽取商品種子,并經(jīng)生產(chǎn)企業(yè)確認(rèn)。所用引物及試劑均由北京鼎國生物有限公司提供。
1.2PCR反應(yīng)體系
PCR擴(kuò)增反應(yīng)總體積10μL:10×buffer 1μL,10mmol/L dNTP 0.2μL,50ng/μL primer 0.2μL +0.2μL,2U/μL Taq酶0.6μL,25ng/μL DNA 1μL,ddH2O 6.8μL。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性4min;然后進(jìn)行35個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增,循環(huán)參數(shù)為94℃、15s,55℃、15s,72℃、30s;最后在72℃下延伸7min。擴(kuò)增產(chǎn)物在含EB的3%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳后,應(yīng)用凝膠成像系統(tǒng)觀察記錄。
1.3摻雜和抽樣方法
試驗(yàn)于2011年4月15日播種,5月15日移栽。小區(qū)單本栽植500株苗,50行,每行10株,行距26.7cm,株距16.7cm。每個(gè)植株用4位數(shù)編號,前兩位數(shù)表示所在的行數(shù),后兩位數(shù)表示所在行的位置,例如0508表示第5行的第8株。在兩優(yōu)培九田間鑒定移栽時(shí),每隔9株混栽1株新兩優(yōu)6380。兩個(gè)品種之間的植株特征特性差別較大,易于田間識別(表1);同時(shí)兩個(gè)品種之間的遺傳背景差異較大,易于室內(nèi)檢出。
返青后按對應(yīng)編號采取田間各植株的倒二葉葉片,用RM11對兩優(yōu)培九進(jìn)行室內(nèi)分子檢測,為了防止人為因素干擾,試驗(yàn)過程中將摻雜、田間鑒定和室內(nèi)SSR檢測的操作分別由3批不同的專業(yè)人員獨(dú)立完成。
1.4結(jié)果比對
在抽穗前及齊穗后分兩次按GB/T 3543.5-1995進(jìn)行田間純度鑒定,并將田間結(jié)果與室內(nèi)SSR法的純度檢出結(jié)果進(jìn)行比對,驗(yàn)證室內(nèi)與田間結(jié)果的一致性。
2結(jié)果與分析
2.1混入的雜株田間和室內(nèi)鑒定結(jié)果
室內(nèi)SSR法將小區(qū)的所有植株都抽樣檢測,共檢出雜株68株,其中摻入的新兩優(yōu)6380共50株,樣品自有雜株18株,摻入株的檢出率為100%。摻入的新兩優(yōu)6380譜帶特征如圖1所示。
從表2中可見,兩優(yōu)培九田間鑒定中,共發(fā)現(xiàn)雜株62株,其中摻入的新兩優(yōu)6380共50株,樣品自有雜株12株,摻入株的檢出率為100%。
2.2雜株譜帶與兩優(yōu)培九及其親本的譜帶比較
引物篩選時(shí),兩優(yōu)培九的不育系帶型在雜交種互補(bǔ)帶型的下方,恢復(fù)系帶型在雜交種互補(bǔ)帶型的上方。摻入的新兩優(yōu)6380的帶型均在互補(bǔ)帶型的下方,與兩優(yōu)培九不育系的譜帶位置相同。
3小結(jié)與討論
研究表明,應(yīng)用SSR法對兩系種子純度進(jìn)行鑒定時(shí),雖能準(zhǔn)確地把摻入的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的其他兩系雜交稻品種識別出來,但不能僅根據(jù)室內(nèi)SSR法電泳得到的雜株譜帶類型簡單地推斷其田間形態(tài)為不育系或恢復(fù)系類型雜株,必須進(jìn)行田間比對才能作出準(zhǔn)確判斷。
結(jié)合文獻(xiàn)[14]的結(jié)論可以看出,對特定品種及適宜的引物而言,如果田間雜株為真實(shí)的不育系或恢復(fù)系,SSR法的譜帶一定為不育系或恢復(fù)系的特征譜帶,反之,如果譜帶表現(xiàn)為不育系或恢復(fù)系的特征譜帶,植株田間表現(xiàn)型并不一定是不育系或恢復(fù)系。
對與親緣關(guān)系較近的品種,因?yàn)橛H本間遺傳差異較小,而SSR法標(biāo)記的是一些無意義的DNA重復(fù)序列,這些DNA片段很可能都會(huì)在親緣關(guān)系較近的品種中普遍存在,從而使親緣關(guān)系較近但田間表現(xiàn)型差異明顯的品種顯示出相同的帶譜,從而產(chǎn)生種子純度誤判風(fēng)險(xiǎn),這方面還需進(jìn)一步研究。
參考文獻(xiàn):
[1]辛業(yè)蕓,張展,熊易平,等.應(yīng)用SSR分子標(biāo)記鑒定超級雜交水稻組合及其純度[J].中國水稻科學(xué),2005,19(2):95-100.
[2]馬秀芳,華澤田,隋國民,等.利用微衛(wèi)星標(biāo)記鑒定北方雜交粳稻種子純度的研究[J].雜交水稻,2006,21(5):56-58.
[3]黃成志,黃文章,嚴(yán)明建,等.利用SSR分子標(biāo)記鑒定雜交水稻真?zhèn)闻c純度[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,37(8):3437-3438.
[4] 譚智丹,余顯權(quán),高健強(qiáng),等.利用SSR鑒定雜交水稻種子純度的研究[J].種子,2006,25(4):27-33
[5] 劉之熙,陳祖武,朱克永,等.利用SSR分子標(biāo)記快速鑒定雜交水稻種子純度技術(shù)體系的優(yōu)化[J].雜交水稻,2008,23(1):60-63.
[6] 樊葉楊,莊杰云.應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記鑒別水稻秈粳亞種[J].遺傳,2000,22(6):392-394.
[7] 李穩(wěn)香,詹慶才.雜交水稻種子純度SSR指紋圖譜標(biāo)記鑒定技術(shù)研究[J].中國種業(yè),2006(3):21-22.
[8] 詹慶才.利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記進(jìn)行雜交水稻種子純度鑒定的研究[J].雜交水稻,2002,17(5):46-50.
[9] 薛燦輝,朱克永,陳祖武,等.利用微衛(wèi)星標(biāo)記鑒定金優(yōu)207雜種純度技術(shù)研究〔J〕.湖南農(nóng)業(yè)科學(xué),2005(5):6-8.
[10] 金偉棟,洪德林.雜交水稻品種純度鑒定研究進(jìn)展[J].種子,2005,24(8):49-54.
[11] 陳兆貴,梁展鵬.雜交水稻種子純度分子鑒定技術(shù)研究[J].中國種業(yè),2009(1):50-52.
[12] 張輝,姜勇.雜交水稻品種鑒定和純度分析技術(shù)研究進(jìn)展[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,37(20):9416-9419.
[13] 殷兆晴,王玉平,周黎軍,等.雜交稻種子純度的SSR分子檢測及應(yīng)用研究[J].西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2006,19(6):1000-1004.
[14] 張凱,趙虹,張宇飛,等. SSR法鑒定水稻兩系雜交種純度的運(yùn)用與探討Ⅰ.親本和雜交種分別篩選引物的適應(yīng)性[J].湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2012,51(10):1965-1966,1970.
(責(zé)任編輯鄭威)
收稿日期:2012-04-11
基金項(xiàng)目:國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201103007)
作者簡介:廖芳麗(1978-),女,湖北天門人,助理農(nóng)藝師,主要從事農(nóng)作物種子質(zhì)量檢驗(yàn)及管理工作,(電話)0716-8443252(電子信箱)
jyjyk502@163.com;通訊作者,張凱(1983-),男,在讀碩士研究生,研究方向?yàn)檗r(nóng)作物育種,(電話)0716-8400643(電子信箱)
fongyun00@tom.com。