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利用Mlo蛋白質(zhì)保守域MJ4—MrcD2區(qū)擴(kuò)增小麥抗白粉病基因

2012-04-29 09:07:53賈倩李東方等
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年24期
關(guān)鍵詞:白粉病蛋白質(zhì)

賈倩 李東方等

摘要:利用Mlo蛋白質(zhì)保守域設(shè)計(jì)兼并引物,以24個(gè)抗性不同的小麥品種為試驗(yàn)材料,采用抗病基因類似物(RGA)法探索小麥白粉病抗病基因快速有效篩選及利用的新方法。結(jié)果表明,所用的小麥抗病材料基因組DNA與兼并引物同源區(qū)的序列變化較感病材料大,導(dǎo)致擴(kuò)增效率較低;兼并引物在抗病及感病材料中擴(kuò)增結(jié)果類似,僅從這一結(jié)果無法判斷擴(kuò)增出的RGA與小麥白粉病基因間的關(guān)系,需要通過下游轉(zhuǎn)化、克隆、測序來進(jìn)一步篩選抗病相關(guān)RGA。

關(guān)鍵詞:白粉??;Mlo蛋白質(zhì);保守域;抗病基因類似物(RGA)

中圖分類號(hào):Q943.2 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2012)24-5798-03

小麥白粉病是小麥生產(chǎn)上的重要病害。利用抗病品種是防治小麥白粉病最經(jīng)濟(jì)有效的措施。培育、推廣不同來源的抗性基因聚合體品種或?qū)⒖剐曰虿煌钠贩N進(jìn)行合理布局,避免抗源單一化,可以有效地減緩小麥白粉病菌優(yōu)勢菌株的繁殖速度和延緩品種抗性喪失的速度[1]。因此,如何獲取新抗源是小麥白粉病抗病育種的關(guān)鍵。大麥中隱性突變基因Mlo介導(dǎo)了一類單基因控制的、非小種?;?、持久的白粉病抗性[2],是獲取新抗源的又一重要途徑。

試驗(yàn)通過對Mlo蛋白質(zhì)保守域MJ4-MrcD2區(qū)的擴(kuò)增來獲得小麥抗白粉病基因,為尋找快速有效的抗白粉病基因新篩選方法及其在作物育種上的有效利用提供技術(shù)支持。

1 材料與方法

1.1 材料

試驗(yàn)選用的小麥材料見表1。

1.2 方法

1.2.1 兼并引物的設(shè)計(jì) 根據(jù)來自普通小麥、大麥、玉米、粳稻、秈稻等物種的8個(gè)Mlo基因所編碼蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)保守域設(shè)計(jì)兼并引物(所依據(jù)的保守域見表2,序列比對所用基因編碼的蛋白質(zhì)見表3),采用的數(shù)據(jù)庫及序列分析比對軟件有CDD、ClustalX1.8、Primer5.0等。

1.2.2 小麥基因組DNA的提取 采用CTAB法。

1.2.3 PCR擴(kuò)增及電泳 PCR體系采用20μL:DNA模板1μL,10×Buffer2μL,dNTPs2μL,ddH2O12.6μL,TaqDNA聚合酶0.4μL,上下游引物各1μL。PCR循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性4min;94℃變性1min,50℃退火1.5min,72℃延伸2min,40個(gè)循環(huán);72℃延伸10min;4℃,保存。采用1.2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,緩沖液為1×TAE;電泳結(jié)果用凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行拍照,保存。

2 結(jié)果與分析

由圖1和圖2可知,抗病材料中除1、2、3、5、6沒有擴(kuò)增出結(jié)果外,7、8、12、13、14、15、18、20、23、24都擴(kuò)增出了目標(biāo)條帶,抗病材料中能擴(kuò)增出目標(biāo)條帶的頻率是66.7%(10/15);感病材料4沒有擴(kuò)增出結(jié)果,9、10、11、16、17、19、21、22中都擴(kuò)增出了目標(biāo)條帶,感病材料中能擴(kuò)增出目標(biāo)條帶的頻率是88.9%(8/9)。所有目標(biāo)擴(kuò)增帶大小都在500bp左右,基本符合兼并引物設(shè)計(jì)時(shí)的預(yù)期結(jié)果。研究中兼并引物在抗病材料中擴(kuò)增效率較低而在感病材料中擴(kuò)增效率較高的事實(shí),暗示試驗(yàn)所用小麥感病材料的基因組DNA與兼并引物序列的同源區(qū)序列相似性要高于抗病材料,或者說抗病材料基因組DNA與兼并引物同源區(qū)序列變化較大導(dǎo)致擴(kuò)增效率較低。

通過植物抗?。ǎ遥澹螅椋螅簦幔睿悖?,R)基因的保守域擴(kuò)增RGA的主要目的是分離植物的抗病基因或作為分子標(biāo)記跟蹤抗病基因。RGA與R基因的關(guān)系可分為3種:RGA是R基因或其假基因的一部分;RGA與R基因緊密連鎖;RGA與已知的R基因無關(guān)[3]。兼并引物在抗病及感病材料中擴(kuò)增結(jié)果類似,僅從這一結(jié)果無法判斷擴(kuò)增出的RGA與小麥白粉病基因間的關(guān)系。由于兼并引物序列的兼并性,其在不同小麥材料中即使擴(kuò)增產(chǎn)物大小一致但序列應(yīng)該是不一樣的??梢詫υ囼?yàn)中得到的擴(kuò)增片段進(jìn)行回收,然后進(jìn)行測序及序列比對分析驗(yàn)證。從每個(gè)回收的擴(kuò)增帶轉(zhuǎn)化的單克隆中挑選多個(gè)(10~25個(gè))進(jìn)行測序應(yīng)該能找到抗病品種中所特異出現(xiàn)的序列,該序列很有可能是抗病基因的一部分或與抗病基因緊密連鎖。這為進(jìn)一步克隆抗病基因或進(jìn)行抗病基因分子標(biāo)記篩選打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

3 討論

在不同抗源材料中全面發(fā)掘新抗源,培育積累不同類型的植物抗病(Resistance,R)基因盡可能多的小麥新品種;或者在農(nóng)作物生產(chǎn)上保證多樣性抗源使具有不同R基因的品種合理布局,以R基因的遺傳多樣性來抑制新毒性小種的產(chǎn)生和蔓延,這些措施對于加快小麥新抗病品種培育及提高抗病品種的抗性持久性有重要意義[4-6]。研究表明,R基因具有特殊的保守域,通過保守域擴(kuò)增抗病基因類似序列(RGA)是分離植物抗病基因的重要途徑,也是篩選抗病基因分子標(biāo)記的重要手段[7]。保守域擴(kuò)增中簡并引物的設(shè)計(jì)是關(guān)鍵,簡并度越低,產(chǎn)物特異性越強(qiáng),但擴(kuò)增效率會(huì)隨之降低;反之,簡并度越高,擴(kuò)增效率越高,但產(chǎn)物的特異性會(huì)降低,簡并度的大小需要根據(jù)不同抗病基因及其具體的保守域位點(diǎn)來確定。

大麥Mlo基因與以往克隆的任何R基因的結(jié)構(gòu)都沒有同源關(guān)系,是一類植物所特有的新型的抗病基因[2]。Kim等[8]克隆了水稻Mlo(OryzasativaMlo,OsMlo)基因,并闡明OsMlo編碼一個(gè)62ku的蛋白質(zhì),其功能也是負(fù)向調(diào)節(jié)廣譜抗病性與葉細(xì)胞死亡。研究采用類似RGA法,以Mlo蛋白質(zhì)保守域MJ4-MrcD2區(qū)為目標(biāo),通過PCR擴(kuò)增來獲得小麥新的抗白粉病基因,獲得了初步結(jié)果,可以為尋找快速有效的抗白粉病基因新篩選方法及其在作物育種上有效利用提供一定的參考。

參考文獻(xiàn):

[1]韓德俊,曹 莉,陳耀鋒,等.植物抗病基因與病原菌無毒基因互作的分子基礎(chǔ)[J].遺傳學(xué)報(bào),2005,32(12):1319-1326.

[2]韓德俊,李振岐,曹 莉,等.大麥抗白粉病基因Mlo的研究進(jìn)展[J].西北植物學(xué)報(bào),2003,23(3):496-502.

[3]秦跟基,李萬隆,陳佩度.植物抗病基因結(jié)構(gòu)特征及其類似序列的研究進(jìn)展[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1999,22(3):102-107.

[4]陳曉梅,郭順星.RGA植物抗病性物質(zhì)的研究進(jìn)展[J].植物學(xué)通報(bào),1999,16(6):658-664.

[5]徐冰強(qiáng),杜中軍,黃俊生.RGA法克隆候選抗病基因的研究進(jìn)展[J].分子植物育種,2004,2(3):421-428.

[6]李春來,張懷渝.植物抗病基因同源序列(RGA)研究進(jìn)展[J].分子植物育種,2004,2(6):853-860.

[7]KONGW,FANGXJ.CloningandmappingofNBS-LRRtyperesistancegeneanalogsincotton(GossypiumbarbadenseL1)[J].MolecularPlantBreeding,2003,1(3):427-429.

[8]KIMMC,LEESH,KIMJK,etal.Mlo,amodulatorofplantdefenseandcelldeath,isanovelcalmodulin-bindingprotein.[J].TheJournalofBiologicalChemistry,2002,227(22):19304-19314.

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