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核因子Y在植物中的分類及其功能概述

2012-03-29 03:51:51李文濱李勝暢王志坤
關(guān)鍵詞:亞基擬南芥調(diào)控

李文濱,李勝暢,王志坤

(1.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,哈爾濱 150030;2.大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150030)

植物生長(zhǎng)在一個(gè)千變?nèi)f化的環(huán)境中,會(huì)受到干旱、低溫以及病原侵染等逆境脅迫,植物細(xì)胞在染色體DNA水平、轉(zhuǎn)錄水平以及轉(zhuǎn)錄后水平上對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行精確調(diào)控,以適應(yīng)環(huán)境的變化[1]。受環(huán)境脅迫誘導(dǎo)表達(dá)的基因可分為兩類:一類是基因編碼的蛋白產(chǎn)物,使植物細(xì)胞直接具有抵御環(huán)境脅迫的功能,如胚胎后期發(fā)育豐富蛋白(LEA蛋白)、滲調(diào)蛋白、離子區(qū)域化和水通道蛋白、抗凍蛋白、脯氨酸、果聚糖合成酶及甜菜堿合成酶等;另一類是基因編碼的調(diào)控產(chǎn)物,在植物脅迫應(yīng)答中具有信號(hào)傳導(dǎo)和調(diào)控基因表達(dá)的功能,如感應(yīng)和傳導(dǎo)脅迫信號(hào)的CDPK、MAPK等蛋白激酶,以及參與調(diào)控基因表達(dá)的bZIP類、bHLH類、NAC類、DREB類、ERF類、RAV類、WRKY和MYB類等轉(zhuǎn)錄因子[2-3]。

轉(zhuǎn)錄因子(Transcription factor,TF)又稱反式作用因子,是能夠與基因啟動(dòng)子區(qū)域中的順式作用元件發(fā)生特異性結(jié)合,從而保證目的基因以特定的強(qiáng)度、在特定的時(shí)間與空間表達(dá)的蛋白質(zhì)分子相結(jié)合[4]。植物許多基因的表達(dá)都是由特定的轉(zhuǎn)錄因子與特定的順式作用元件相互作用調(diào)控的。

核因子Y是成員最多的植物特異轉(zhuǎn)錄因子之一。在酵母和哺乳動(dòng)物中,其中每個(gè)亞基一般只有一個(gè)基因編碼。在植物中,每個(gè)亞基類已被大大擴(kuò)展,分別由幾個(gè)或更多個(gè)基因編碼。這樣的家族擴(kuò)展,提供了更多的NF-YA/NF-YB/NF-YC三聚體組合,并大量增加了核因子Y功能復(fù)雜的潛力,成為一個(gè)廣泛調(diào)控系統(tǒng)。這表明了不同的核因子Y在植物中比在其他生物中更復(fù)雜的調(diào)節(jié)作用。

1 植物核因子Y的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及其分類

核因子Y是一種普遍存在的轉(zhuǎn)錄因子,由三個(gè)不同的亞基組成:NF-YA、NF-YB和NF-YC。在真菌和動(dòng)物中,每一個(gè)亞基由一個(gè)基因編碼;而在植物中每個(gè)亞基是由多個(gè)基因編碼的。NF-YA亞基有兩個(gè)功能上很保守的核心結(jié)構(gòu)域,N端結(jié)構(gòu)域和NF-YB/C相互作用,C端結(jié)構(gòu)域和DNA相互作用。NF-YB和NF-YC兩個(gè)亞基的保守結(jié)構(gòu)域也包括一些和DNA相互作用的殘基。NF-YB主要對(duì)NF-YA與DNA的結(jié)合起促進(jìn)作用[5]。NF-YB和NF-YC亞基包含有高度保守的蛋白折疊序(Histone-fold motif,HFM),并且結(jié)構(gòu)上和核心組蛋白亞基H2B和H2A相似[6-8]。與植物、脊椎動(dòng)物和酵母的NF-YA高度保守核心區(qū)相比,NF-YB和NF-YC亞基的核心序列不是保守的。

核因子Y是一種典型的通過(guò)和調(diào)控因子相互作用來(lái)調(diào)控下游基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。NF-Y轉(zhuǎn)錄因子含有保守專一性的序列,該序列和真核生物啟動(dòng)子區(qū)域的CCAAT框相結(jié)合。CCAAT盒是在真核啟動(dòng)子中最常見(jiàn)的啟動(dòng)子元件之一,它通常是位于60~100 bp的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游,并在正反兩個(gè)方向直接起作用[9-12]。在多物種中,無(wú)論是存在的位置、方向上,還是結(jié)合的核苷酸的數(shù)目上,CCAAT盒都是高度保守的同源基因序列[8]。在所有真核生物中,CCAAT盒轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)組件是一個(gè)順式調(diào)控元件,并且存在于約30%的基因的啟動(dòng)子區(qū)域[13]?;虮磉_(dá)模式可以是組織或階段特異性的,也可以由其他順式和反式作用因子決定,而由包含CCAAT盒的啟動(dòng)子來(lái)控制基因的表達(dá)可能是無(wú)處不在的。多個(gè)反式作用因子與CCAAT盒相聯(lián)系,但只有核因子NF-Y是和CCAAT這5個(gè)核苷酸相結(jié)合[10]。

在真菌中,酵母(面包酵母)HAP由HAP2/3/5三個(gè)亞基組成,即HAP2(也稱為NF-YA或CBF-B)、HAP3(NF-YB/CBF-A)和 HAP5(NF-YC/CBF-C),結(jié)合CCAAT盒并控制靶基因的表達(dá)。每個(gè)亞基含有一個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,主要和DNA、蛋白質(zhì)相結(jié)合。在雙子葉植物擬南芥中,HAP亞基的幾個(gè)成員是由愛(ài)德華茲等在1998年第一次鑒定得到的?;蚪M中編碼10個(gè)NF-YA/HAP2亞基基因,13個(gè)NF-YB/HAP3亞基基因,13個(gè)NF-YC/HAP5亞基基因[14]。在單子葉植物水稻中,克隆了10個(gè)HAP2亞基基因,11個(gè)HAP3亞基基因,7個(gè)HAP5亞基基因[15],HAP2和HAP5亞基基因未被報(bào)道過(guò),只對(duì)6個(gè)HAP3亞基基因做了詳細(xì)研究[16-17]。在小麥中有37個(gè)NF-Y亞基基因,包括10個(gè)NF-YA亞基基因,13個(gè)NF-YB亞基基因,14個(gè)NF-YC亞基基因,還有兩個(gè)Dr1蛋白,包括 Dr1(NC2b)和 Drap1(NC2a)[18],分別和NF-YB、NF-YC相聯(lián)系[19]。在小麥中建立了整個(gè)基因組DNA分析研究的數(shù)據(jù)庫(kù),根據(jù)保守的核心區(qū)域,每個(gè)NF-Y的亞基家族可進(jìn)一步劃分為4~5個(gè)分支。通過(guò)比較小麥、水稻和擬南芥的核因子Y的成員結(jié)構(gòu),幾個(gè)保守結(jié)構(gòu)域以外的NF-Y的核心區(qū)域也被確定出來(lái)[19]。

2 植物NF-Y轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能

2.1 核因子Y在植物抗旱中的作用

陸生植物在克服干旱時(shí)會(huì)引起復(fù)雜的反應(yīng)特性,但個(gè)別信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路調(diào)控表達(dá)已經(jīng)成為一種調(diào)節(jié)植物抗旱性增強(qiáng)的良好策略。這種方法將適用于干旱地區(qū)種植的多種作物。這些作物已經(jīng)證實(shí)通過(guò)功能基因組學(xué)的方法在擬南芥模式植物中確定新的克服干旱的途徑,并與作物生產(chǎn)實(shí)際應(yīng)用相聯(lián)系。

擬南芥的nf-yb5基因在抗旱方面具有重要作用。擬南芥nf-yb5的轉(zhuǎn)錄受到抗旱的強(qiáng)烈誘導(dǎo),主要在微觀組織和保衛(wèi)細(xì)胞中高度表達(dá),超表達(dá)擬南芥nf-yb5的植株在干旱脅迫時(shí),表現(xiàn)為葉片失水減少,花青素含量增加,因而植株抗旱性大為提高[14]。在擬南芥中,LEC1、LEC1-like蛋白和NF-YB亞基蛋白,都被認(rèn)為是對(duì)干旱反應(yīng)起到至關(guān)重要的物質(zhì)。在系統(tǒng)發(fā)育和功能上,擬南芥LEC1和LEC1-like蛋白又不同于NF-YB亞基蛋白。如擬南芥NF-YB1亞基很可能是一個(gè)非LEC1-like的NF-YB亞基,它和擬南芥LEC1和LEC1-like蛋白相關(guān)或者相重疊。在干旱條件下,擬南芥nf-yb1兩個(gè)獨(dú)立的T-DNA插入株系無(wú)法檢測(cè)和顯示對(duì)于干旱反應(yīng)的變化。說(shuō)明此基因是一種耐旱性的NF-Y轉(zhuǎn)錄因子。擬南芥nf-yb1基因的抗旱途徑是一種與報(bào)道公認(rèn)的ABA抗旱途徑和CBF4途徑不同的新抗旱途徑[20]。

玉米nf-yb2被用來(lái)構(gòu)建一種新型的轉(zhuǎn)基因玉米品種。它結(jié)合一段DNA區(qū)域,該區(qū)域是由水稻的actin1蛋白的組成型啟動(dòng)子和內(nèi)含子連接到玉米的基因上。轉(zhuǎn)基因玉米在抗旱方面表現(xiàn)突出[20]。在干旱條件下,轉(zhuǎn)nf-yb2基因玉米植株較野生型植株表現(xiàn):葉片葉面積減小,葉片不萎蔫,葉片溫度低。葉綠素指數(shù)增高、光合速率增強(qiáng)、較高的氣孔電導(dǎo)率。過(guò)量表達(dá)擬南芥nf-yb1基因的轉(zhuǎn)基因玉米改善了玉米產(chǎn)量并且增強(qiáng)了植株的抗旱性[20]。

在全球,主要有四個(gè)小麥出口國(guó)(阿根廷、澳大利亞、加拿大和美國(guó))在作物生長(zhǎng)的中度至重度干旱的條件下?lián)碛凶畲蟮男←溕a(chǎn)總量。這也是對(duì)小麥產(chǎn)量的主要非生物約束[21]。從模式植物擬南芥和水稻基因序列信息出發(fā),從核苷酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)出所有小麥核因子Y的亞基成員,確定了NF-Y模式亞基基因家族,并確定了其基因的表達(dá)譜。小麥nf-y基因的表達(dá)普遍存在,NF-Y家族每一個(gè)亞基的基因成員主要在胚乳中表達(dá)。而其他一些基因在一特定器官中表達(dá)。通過(guò)定量RT-PCR分析顯示:在小麥葉片中,9個(gè)nf-y和2個(gè)dr1基因表達(dá)似乎對(duì)干旱脅迫反應(yīng)起作用。這些基因中的三個(gè)基因在干旱條件下表達(dá)是上調(diào)的,說(shuō)明了這些基因都可能與植物適應(yīng)干旱有關(guān)。通過(guò)基因組合式表達(dá)及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)分析表明,在同一進(jìn)化分支中各個(gè)成員普遍認(rèn)同為一個(gè)類似的表達(dá)譜。器官特異性表達(dá)和對(duì)干旱的差異分析,轉(zhuǎn)錄因子家族各成員有特定的生物學(xué)作用。

干旱影響超過(guò)10%的耕地,減少了50%主要農(nóng)作物的平均產(chǎn)量[22]。非生物脅迫嚴(yán)重影響產(chǎn)量,如植物細(xì)胞周期進(jìn)程,代謝率和生理平衡許多生物過(guò)程。轉(zhuǎn)錄因子像個(gè)復(fù)雜的開(kāi)關(guān)調(diào)控這些生理生化過(guò)程[23-24]。

2.2 核因子Y在植物胚胎發(fā)育和葉綠體功能形成中的作用

遺傳分析第一個(gè)植物核因子Y的基因LEAFY COTYLEDON 1(lec1)和LEAFY COTYLEDON 1 LIKE(l1l),它們?cè)谂咛グl(fā)育、種子成熟和編碼核因子-B類的旁系蛋白中起到關(guān)鍵作用[25-26]。擬南芥LEAFY COTYLEDON1(lec1)通過(guò)功能缺失突變分析和獲得性功能分析,被證明是一個(gè)胚胎發(fā)育調(diào)控的關(guān)鍵基因[27]。LEC1-like(lec1-like)是和lec1序列最相似的基因,也在擬南芥中控制胚胎發(fā)育[30]。在胡蘿卜中,C-lec1被證明是一個(gè)lec1同源基因,并在胚胎發(fā)育發(fā)揮類似的作用[29]。其他的NF-YB亞基蛋白,不屬于LEC1類,已被證明是一種新的基因調(diào)控子,參與葉綠體發(fā)育和干旱反應(yīng)的重要調(diào)節(jié)[28-29]。

水稻(OsHAP3A-C)的三個(gè)亞基在植物體內(nèi)普遍表達(dá)。抑制水稻hap3基因的表達(dá)導(dǎo)致葉綠體退化和光合作用途徑的基因下調(diào)表達(dá),說(shuō)明水稻hap3基因參與葉綠體的發(fā)育。目前,從反義RNA和RNAi試驗(yàn)數(shù)據(jù)表明:在水稻中NF-YB一些亞基被推斷為參與葉綠體的功能形成。水稻hap3a基因和同源基因水稻hap3b、水稻hap3c顯示出了控制葉綠體的生物合成[17]。提出每個(gè)hap3基因具有專一的作用。相比之下,在植物中,hap2和hap5基因都沒(méi)有被深入地研究。有研究分析表明,三聚體HAP復(fù)合體在植物中組合成了CCAAT的結(jié)合識(shí)別序列[30-32]。

2.3 核因子Y在植物光合作用中的調(diào)節(jié)作用

最近,有證據(jù)顯示植物的所有三種NF-Y家族亞基成員活動(dòng)的變化會(huì)影響開(kāi)花時(shí)間。擬南芥NF-Y家族的NF-YB2(HAP3b)和密切相關(guān)的擬南芥蛋白NF-YB3(HAP3c)有著相似的功能,二者在開(kāi)花誘導(dǎo)上都是必需的[33]。在光周期誘導(dǎo)的條件下,NF-Y復(fù)合體提供了DNA結(jié)構(gòu),能和CONSTANS蛋白結(jié)合,激活光周期途徑促進(jìn)開(kāi)花的重要下游組件轉(zhuǎn)錄促進(jìn)開(kāi)花,例如FT基因。進(jìn)一步通過(guò)使用一個(gè)ELISA法為基礎(chǔ)的體外試驗(yàn)表明,植物的NF-YB亞基能夠結(jié)合CCAAT盒啟動(dòng)子元件并作為NF-YA(HAP2)和NF-YC(HAP5)三聚體亞基的一個(gè)特殊結(jié)構(gòu)。越來(lái)越多的證據(jù)表明CCAAT框結(jié)合的核因子Y家族在調(diào)控開(kāi)花時(shí)間中起作用。特別是NF-YB2亞基(HAP3b)已被證明通過(guò)促進(jìn)開(kāi)花的CO2(SOC1)表達(dá)(FT)[34-35]。雖然沒(méi)有試驗(yàn)證據(jù)表明,CO有DNA結(jié)合活性,但CO及相關(guān)蛋白最近能夠在體外和體內(nèi)研究,已顯示出能結(jié)合NF-YB和NF-YC亞基蛋白的特性,包括核因子-YB2系列[36-37]。因此,有可能NF-YB調(diào)節(jié)植物開(kāi)花的影響,可以作為NF-Y復(fù)合體的一部分來(lái)直接與CONSTANS蛋白質(zhì)相互作用。長(zhǎng)日照條件下表型變化很明顯,并暗示了NF-YB2與CONSTANS的蛋白質(zhì)在同一途徑相互作用,通過(guò)“光周期途徑”調(diào)節(jié)開(kāi)花,并反對(duì)“自主”開(kāi)花途徑[38]。

核因子Y家族的CCAAT盒結(jié)合蛋白在植物中實(shí)現(xiàn)了很多種NF-Y三聚體的組合,以一種正調(diào)控或者負(fù)調(diào)控的方式,任意數(shù)量的三聚體都可能影響開(kāi)花時(shí)間。特別值得注意的是,另一種擬南芥的NF-YB亞家族的HAP3a(NF-YB1)成員,最近被證明抑制開(kāi)花[37]。因此,NF-YB1可能在NF-YB2和NF-YB3促進(jìn)開(kāi)花上起到相反的作用。

鑒定NF-YA(HAP2)、NF-YC(HAP5)與NF-YB(HAP3)蛋白質(zhì),以及對(duì)于目標(biāo)基因的結(jié)合位點(diǎn),現(xiàn)在是一個(gè)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù),需要廣泛的遺傳與生物學(xué)的研究,所以提出DNA結(jié)合生化方法檢測(cè)。這很可能是具體的核因子Y的亞基和目標(biāo)基因的結(jié)合來(lái)監(jiān)管調(diào)控開(kāi)花時(shí)間。如CO在特定的環(huán)境或生理?xiàng)l件下,將提供優(yōu)良的光周期條件調(diào)控開(kāi)花。除了植物核因子Y蛋白質(zhì)在開(kāi)花時(shí)間調(diào)控中的作用,這個(gè)家族已演變?yōu)橐环N調(diào)節(jié)植物生物學(xué)的重要方面,包括胚胎發(fā)育,光合作用和生理反應(yīng)調(diào)節(jié)[29-30]。通過(guò)他們與其他調(diào)節(jié)蛋白互作,如CCTs,以及可能的大量亞基組合,核因子-Y家庭的DNA結(jié)合蛋白提供了許多關(guān)鍵的共同協(xié)調(diào)途徑。

3 植物核因子Y的研究方法

隨著植物功能基因不斷地深入研究,用來(lái)研究植物基因功能的方法也隨之增多,目前研究植物核因子Y功能的方法主要包括以下幾種。

3.1 瞬間表達(dá)分析方法

該方法是指植物轉(zhuǎn)錄因子瞬間表達(dá)分析,主要是針對(duì)轉(zhuǎn)錄因子與特定順式作用元件的結(jié)合及對(duì)其轉(zhuǎn)錄的激活或轉(zhuǎn)錄抑制效應(yīng)的作用[39]。辣椒WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的瞬間表達(dá)分析,就是通過(guò)基因槍瞬間轉(zhuǎn)化技術(shù)將兩種載體共轉(zhuǎn)化洋蔥表皮細(xì)胞。檢測(cè)共轉(zhuǎn)化洋蔥表皮細(xì)胞中g(shù)us基因的表達(dá)情況,以此來(lái)分析轉(zhuǎn)錄因子與其特定的順式元件結(jié)合的作用及對(duì)其轉(zhuǎn)錄的激活效應(yīng)。目前用得比較多的基因瞬間表達(dá)分析方法有酵母單雜交和酵母雙雜交。

3.2 植物基因功能突變分析方法

該方法包括基因功能的缺失突變和基因功能獲得性突變兩個(gè)方面,目前,基因功能的缺失突變研究方法主要包括T-DNA插入突變[40]、反義抑制、轉(zhuǎn)座子插入突變[41]。植物轉(zhuǎn)錄因子基因功能獲得性突變主要有基因超量表達(dá)和基因誘導(dǎo)表達(dá)兩種。

3.2.1 植物轉(zhuǎn)錄因子基因超量表達(dá)

該方法是指將轉(zhuǎn)錄因子基因全長(zhǎng)序列與組成型強(qiáng)啟動(dòng)子(花椰菜花葉病毒(CaMV)35S啟動(dòng)子)融合,轉(zhuǎn)化受體材料,獲得目標(biāo)基因產(chǎn)物過(guò)量表達(dá)的植株。超量表達(dá)擬南芥nf-yb1的轉(zhuǎn)基因植株在抗旱脅迫反應(yīng)中較野生型植株表現(xiàn)明顯,而T-DNA插入突變的擬南芥nf-yb1的轉(zhuǎn)基因植株在抗旱脅迫中的反應(yīng)表現(xiàn)不明顯。葉片明顯萎蔫,發(fā)黃[20]。擬南芥nf-ya5基因在干旱條件下,是個(gè)上調(diào)表達(dá)基因。對(duì)miR169前體物miR169a和miR169c的表達(dá)分析顯示:在干旱情況下,miR169a和miR169c下調(diào)表達(dá)。擬南芥nf-ya5包含有miR169結(jié)合位點(diǎn),與目標(biāo)mRNA結(jié)合抑制基因的轉(zhuǎn)錄。在依賴于ABA的干旱脅迫途經(jīng)下,miR16下調(diào)表達(dá)。擬南芥nf-ya5基因敲除植株和miR16a基因敲除植株顯示了葉片嚴(yán)重失水,轉(zhuǎn)基因植株比野生型植株更敏感。相比之下,過(guò)量表達(dá)擬南芥nf-ya5基因植株比野生型植株對(duì)干旱反應(yīng)不是很敏感,表現(xiàn)葉片失水減少,野生型植株葉片失水嚴(yán)重,出現(xiàn)萎蔫和發(fā)黃狀態(tài)?;蛐酒治霰砻?,擬南芥nf-ya5是干旱反應(yīng)的至關(guān)重要表達(dá)的數(shù)量基因。因此,擬南芥nf-ya5抗旱能力是很重要的,其誘導(dǎo)干旱脅迫都發(fā)生在轉(zhuǎn)錄和逆境的水平[14]。但該方法得到的目標(biāo)基因產(chǎn)物的超量表達(dá)往往是致死效應(yīng),從而很難從表型上正確判斷和評(píng)價(jià)目標(biāo)基因?qū)χ仓甑恼鎸?shí)影響,因而這種方法具有很大的局限性[42]。

3.2.2 植物轉(zhuǎn)錄因子基因誘導(dǎo)表達(dá)

植物轉(zhuǎn)錄因子基因誘導(dǎo)表達(dá)可以實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)的時(shí)間控制,可以避免如基因超量表達(dá)引起的致死效應(yīng)和多重效應(yīng)的局限,因而可以成為基因功能獲得性研究中一種非常有效的方法。利用熱擊蛋白的表達(dá)特性是最先出現(xiàn)的基因誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)。在熱擊的情況下,熱擊蛋白的啟動(dòng)子會(huì)啟動(dòng)其下游基因序列的表達(dá),將目標(biāo)基因與該啟動(dòng)子相結(jié)合,在熱擊的情況下即可以實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)基因的時(shí)空表達(dá)的控制,即所謂的HS(Heat-shocking)系統(tǒng)[43]。之后又建立起其他的誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng),又如依賴于四環(huán)素的tTA表達(dá)系統(tǒng),四環(huán)素反式激活蛋白(tTA)是一個(gè)包含大腸桿菌TN10(編碼四環(huán)素的抑制子)和單純皰疹病毒P16蛋白(VP16)C端部分的融合蛋白,它能夠促進(jìn)由7個(gè)tet操縱子和一個(gè)TATA-box組成的人工啟動(dòng)子控制的報(bào)告基因(如gus基因)的轉(zhuǎn)錄,在四環(huán)素及其衍生物的條件下,四環(huán)素能夠干擾tTA與操縱子DNA的結(jié)合。tTA無(wú)法與其靶位點(diǎn)相互作用,從而極大地減少報(bào)告基因的表達(dá),轉(zhuǎn)錄也就無(wú)法進(jìn)行。四環(huán)素這種嚴(yán)謹(jǐn)?shù)谋磉_(dá)調(diào)控誘導(dǎo)系統(tǒng)在細(xì)胞水平和轉(zhuǎn)基因中被廣泛用來(lái)研究基因的功能。這一系統(tǒng)可用于對(duì)那些可能產(chǎn)生致死產(chǎn)物的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)基因研究[44]。如依賴于銅離子的表達(dá)系統(tǒng),這是一種根據(jù)酵母MT(Metallothionein,金屬硫)基因的調(diào)控原理構(gòu)建的應(yīng)用于植物的基因表達(dá)系統(tǒng)。該系統(tǒng)中銅離子的濃度直接作用于組合式啟動(dòng)子的活性,因此可以用于基因的適時(shí)精確表達(dá)實(shí)驗(yàn)中。目前,已經(jīng)有大量的實(shí)驗(yàn)表明:這些誘導(dǎo)系統(tǒng)中,用得最多的是GR系統(tǒng),可以成功地應(yīng)用于研究植物(雙子葉植物和單子葉植)轉(zhuǎn)錄因子的功能。

3.3 基于糖皮質(zhì)激素受體系統(tǒng)的基因誘導(dǎo)表達(dá)

糖皮質(zhì)激素受體系統(tǒng)(GR)的基因誘導(dǎo)表達(dá),已經(jīng)被證實(shí)是研究基因功能和植物轉(zhuǎn)錄因子非常有效的誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)。它利用了GR的調(diào)控機(jī)制,即在沒(méi)有配基(如DEX,地塞米松)的情況下,GR的配基結(jié)合功能區(qū)與其相連的蛋白分子相結(jié)合,從而封閉該GR的配基蛋白分子的結(jié)合,其功能就會(huì)失去;但在有GR的配基存在的條件下,其功能又可以恢復(fù)[45]。

3.4 RNA干涉(RNAi)

近幾年發(fā)展起來(lái)的RNAi技術(shù),作為一種高效、特異的代替基因敲除的遺傳工具,此技術(shù)正在加速改變著功能基因組學(xué)領(lǐng)域的研究[46]。

4 結(jié)語(yǔ)

核因子Y功能多樣,它們參與調(diào)節(jié)植物生物學(xué)的重要方面,包括胚胎發(fā)育、光合作用、葉綠體發(fā)育和干旱反應(yīng)等重要生理過(guò)程。目前,在數(shù)量眾多的NF-Y轉(zhuǎn)錄因子中,功能明確的只占很少一部分,大部分NF-Y轉(zhuǎn)錄因子的研究尚處于基因克隆、結(jié)構(gòu)鑒定和表達(dá)分析等層面上。對(duì)于植物核因子Y復(fù)合物的生物學(xué)功能,人們了解的還不是很清晰。NF-Y轉(zhuǎn)錄因子的下游目標(biāo)基因和上游調(diào)控因子更是知之甚少。但是,相信隨著RNAi、反義RNA等技術(shù)和miRNA的不斷發(fā)展和應(yīng)用以及NF-Y蛋白同DNA與其他蛋白相互作用的深入研究,將會(huì)進(jìn)一步明確NF-Y轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能,其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)也會(huì)逐漸清晰。

*感謝農(nóng)業(yè)部大豆產(chǎn)業(yè)科技研發(fā)中心和黑龍江省教育廳創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)對(duì)本試驗(yàn)的支持。

[1] Zhang Y Y,Yang C W,Li Y,et al.SDIR1 is a RING finger E3 ligase that positively regulates stress-responsive abscisic acid signaling in Arabidopsis[J].Plant Cell,2007,19:1912-1929.

[2] Arabidopsis Genome Initiative.Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana[J].Nature,2000,408:796-815.

[3] Riechmann J R,Ratcliffe O J.A genomic perspective on plant transcription factors[J].Curr Opin Plant Biol,2000,3(5):423-434.

[4] 楊文杰,吳燕民,唐益雄.大豆轉(zhuǎn)錄因子基因GmMYBJ6的表達(dá)與功能分析[J].遺傳,2009,31(6):645-653.

[5] Zemzoumi K,Frontini M,Bellorini M,et al.NF-Y histone fold alpha1 helices help impart CCAAT specificity[J].J Mol Biol,1999,286:327-337.

[6] Arents G,Moudrianakis E N.The histone fold:A ubiquitous architectural motif utilized in DNA compaction and protein dimerization[J].Proc Natl Acad Sci USA,1995,92:1170-1174.

[7] Baxevanis A D,Arents G,Moudrianakis E N,et al.A variety of DNA-binding and multimeric proteins contain the histone fold motify[J].Nucleic Acids Res,1995,23:2685-2691.

[8] Mantovani R.The molecular biology of the CCAAT-binding factor NF-Y[J].Gene,1999,239:15-27.

[9] Bucher P.Weight matrix descriptions of four eukaryotic RNA polymerase II promoter elements derived from 502 unrelated promoter sequences[J].J Mol Biol,1990,212:563-578.

[10] Dorn A,Durand B,Marfing C,et al.Conserved major histocompatibility complex class II boxes-X and-Y are transcriptional control elements and specifically bind nuclear proteins[J].Proc Natl Acad Sci USA,1987b,84:6249-6253.

[11] Edwards D,Murray J A,Smith A G.Multiple genes encoding the conserved CCAAT-box transcription factor complex are expressed in Arabidopsis[J].Plant Physiol,1998,117:1015-1022.

[12] Mantovani R.A survey of 178 NF-Y binding CCAAT boxes[J].Nucleic Acids Res,1998,26:1135-1143.

[13] Bucher P,Trifonov E N.CCAAT box revisited:Bidirectionality,location and context[J].J Biomol Struct Dyn,1988(5):1231-1236.

[14] Li W X,Oono Y K,Zhu J H,et al.The Arabidopsis NFYA5 transcription factor is regulated transcriptionally and post-transcriptionally to promote drought resistance[J].The Plant Cell,2008,20:2238-2251.

[15] Thirumurugan T,Ito Y,Kubo T,et al.Identification,characterization and interaction of HAP family genes in rice[J].Mol Genet Genomics,2008,279:279-289.

[16] Masiero S,Imbriano C,Ravasio F,et al.Ternary complex formation between MADS-box transcription factors and the histone fold protein NF-YB[J].J Biol Chem,2002,277:26429-26435.

[17] Miyoshi K,Ito Y,Serizawa A,et al.OsHAP3 genes regulate chloroplast biogenesis in rice[J].Plant J,2003,36:532-540.

[18] Troy J,Stephenson C,McIntyre L,et al.Genome-wide identifcation and expression analysis of the NF-Y Family of transcription factors in Triticum aestivum[J].Plant Mol Biol,2007,65:77-92.

[19] Sinha S,Maity S N,Lu J,et al.Recombinant rat CBF-C,the third subunit of CBF/NFY,allows formation of a protein-DNA complex with CBF-A and CBF-B and with yeast HAP2 and HAP3[J].Proc Natl Acad Sci USA,1995,92:1624-1628.

[20] Nelson D E,Repetti P P,Adams T R,et al.Plant nuclear factorY(NF-Y)B subunits confer drought tolerance and lead to improved corn yield sonwater-limited acres[J].PNAS,2007,104(42):431-442.

[21] Araus J L,Slafer G A,Reynolds M P,et al.Plant breeding and drought in C3 cereals:What should we breed for?[J].Ann Bot(Lond),2002,89:925-940.

[22] Bray E A,Bailey-Serres J,Weretilnyk E.Responses to abiotic stresses in biochemistry and molecular biology of plants[C].American Society of Plant Physiologists,2000:1158.

[23] Shinozaki K,Yamaguchi-Shinozaki K,Seki M.Regulatory network of gene expression in the drought and cold stress responses[J].Curr Opin Plant Biol,2003(6):410-417.

[24] Zhu J K.Salt and drought stress signal transduction in plants[J].Annu Rev Plant Biol,2002,53:247-273.

[25] Meinke D.A homeotic mutant of Arabidopsis thaliana with leafy cotyledons[J].Science,1992,258:1647-1650.

[26] Meinke D W,Franzmann L H,Nickle T C,et al.Leafy cotyledon mutants of Arabidopsis[J].Plant Cell,1994(6):1049-1064.

[27] Lotan T,Ohto M,Yee K M,et al.Arabidopsis LEAFY COTYLEDON1 is sufficient to induce embryo development in vegetative cells[J].1998,Cell,93:1195-1205.

[28] Kwong R W,Bui A Q,Lee H,et al.LEAFY COTYLEDON1-LIKE defines a class of regulators essential for embryogenesis[J].Plant Cell,2003,15:5-18.

[29] Yazawa K,Takahata K,Kamada H.Isolation of the gene encoding carrot leafy cotyledon1 and expression analysis during somatic and zygotic embryogenesis[J].Plant Physiol Biochem,2004,42:215-223.

[30] Kusnetsov V,Landsberger M,Meurer J,et al.The assembly of the CAAT-box binding complex at a photosynthesis gene promoter is regulated by light,cytokinin,and the stage of the plastids[J].J Biol Chem,1999,274:36009-36014.

[31] Bezhani S,Sherameti I,Pfannschmidt T,et al.A repressor with similarity to prokaryotic and eukaryotic DNA helicases controls the assembly of the CAAT box binding complex at a photosynthesis promoter[J].J Biol Chem,2001,276:23785-23789.

[32] Gusmaroli G,Tonelli C,Mantovani R.Regulation of the CCAAT-binding NF-Y subunits in Arabidopsis thaliana[J].Gene,2001,264:173-185.

[33] Roderick W,Kumimoto,Adam L,et al.The nuclear factor Y subunits NF-YB2 and NF-YB3 play additive roles in the promotion of flowering by inductive long-day photoperiods in Arabidopsis[J].Planta,2008,228:709-723.

[34] Cai X,Ballif J,Endo S,et al.A putative CCAAT-binding transcription factor is a regulator of flowering timing in Arabidopsis[J].Plant Physiol,2007,145:98-105.

[35] Chen N Z,Zhang X Q,Wei P C,et al.AtHAP3b plays a crucial role in the regulation of flowering time in Arabidopsis during osmotic stress[J].J Biochem Mol Biol,2007,40:1083-1089.

[36] Ben N O,Eshed R,Parnis A,et al.Does CONSTANS act as a transcription factor or as a co-activator?The answer may beyes[J].Plant J,2006,46:463-476.

[37] Wenkel S,Turcka F,Singer K,et al.CONSTANS and the CCAAT box binding complex share a functionally important domain and interact to regulate flowering of Arabidopsis[J].Plant Cell,2006,18:2971-2984.

[38] Martinez-Zapater J M,Coupland G,Dean C,et al.The transition to flowering in Arabidopsis[M]//Meyerowitz E M,Somerville C R.Arabidopsis,America:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1994:403-433.

[39] 王華忠,牛吉山,陳佩度,等.利用瞬間表達(dá)技術(shù)分析小麥抗病相關(guān)基因的功能[J].遺傳學(xué)報(bào),2005,32(9):930-936.

[40] 李愛(ài)宏,張亞芳,吳昌銀,等.水稻T-DNA插入突變體庫(kù)的篩選及遺傳分析[J].遺傳學(xué)報(bào),2006,33(4):319-329.

[41] 陳其軍,肖玉梅,王學(xué)臣,等.植物功能基因組研究中的基因敲除技術(shù)[J].植物生理學(xué)通訊,2004,40(1):121-126.

[42] 羅克明,趙德剛,裴炎,等.一個(gè)新的重組酶系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因植物外源基因刪除中的應(yīng)用[J].高技術(shù)通訊,2005,15(7):234-238.

[43] Viering R A,楊健.不同耐熱性小麥基因型熱擊蛋白基因的表達(dá)[J].麥類作物學(xué)報(bào),1993(2):31-33.

[44] 謝麗,覃文新,萬(wàn)大方,等.四環(huán)素調(diào)控基因表達(dá)系統(tǒng)的研究新進(jìn)展[J].腫瘤,2003,23(11):522-524.

[45] 程曉剛,粟永萍,羅成基,等.糖皮質(zhì)激素受體結(jié)構(gòu)與功能研究進(jìn)展[J].國(guó)外醫(yī)學(xué):分子生物學(xué)分冊(cè),2003,25(1):29-33.

[46] Zhang L S,Chen D Y.RNA interference and its promising future[J].Genetics,2003,25(3):341-343.

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