李冬梅,孟凡立,王志坤,臧振源,孫 晶,李文濱
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,大豆生物學(xué)教育部重點實驗室,哈爾濱 150030)
大豆食心蟲(Leguminivora glycinivorella Matsumurav)屬鱗翅目(Lepidoptera)小卷蛾科(Olethreutidae),是東北大豆產(chǎn)區(qū)最嚴(yán)重的一種害蟲,以幼蟲鉆蛀豆莢取食豆粒,將豆粒咬成溝道或殘破狀,嚴(yán)重影響大豆產(chǎn)量和品質(zhì)[1]。豆農(nóng)每年至少使用2次化學(xué)殺蟲劑對大豆食心蟲進行防治?,F(xiàn)在使用的化學(xué)殺蟲劑多為廣譜性殺蟲劑,可殺死目標(biāo)昆蟲,也會殺死有益昆蟲。同時化學(xué)殺蟲劑在自然界可長期存在,在土壤和河流中逐漸積累,破壞土壤和河流的生態(tài)環(huán)境;化學(xué)殺蟲劑還可以通過食物鏈進入人體,誘發(fā)致畸、致癌,嚴(yán)重損害健康。利用傳統(tǒng)育種方法培育抗大豆食心蟲的大豆品種雖有效,但周期長、效率低。因而,急需探索防治大豆食心蟲的新方法,以精確、高效地控制大豆食心蟲。
Fire等在研究反義RNA在線蟲Caenorhabditis elagans中的基因阻斷作用時,首先發(fā)現(xiàn)利用純化的外源dsRNA能夠高效特異性阻斷內(nèi)源基因表達,并將這一現(xiàn)象稱為 RNAi(RNA interference)[2]。由于RNAi技術(shù)沉默基因的高效性和特異性,人們提出通過轉(zhuǎn)基因手段,讓植物體內(nèi)表達昆蟲基因的dsRNA,dsRNA經(jīng)昆蟲取食后進入蟲體內(nèi),對昆蟲靶基因進行RNA干擾,從而特異性抑制靶基因表達,提高植物抗蟲性[3-6]。中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所陳曉亞院士實驗室的研究成果證明,昆蟲取食表達dsRNA的轉(zhuǎn)基因植物后,體內(nèi)相應(yīng)的靶基因受到抑制,提高植物的抗蟲性[7]。Mao等先通過轉(zhuǎn)基因手段,讓擬南芥和煙草表達棉鈴蟲參與棉毒素解毒的P450基因dsRNA。然后,利用轉(zhuǎn)基因植物喂食棉鈴蟲,dsRNA從食道進入細胞,抑制棉鈴蟲體內(nèi)P450基因的表達,致使棉鈴蟲對棉子酚的抗性降低。最后,對棉鈴蟲造成致命的影響[8]。孟山都公司報道表明,玉米根蟲V-ATPase基因被轉(zhuǎn)基因玉米表達的siRNA抑制,轉(zhuǎn)基因玉米根部遭受的破壞要比對照植株顯著降低[9]。以上研究結(jié)果表明,dsRNA可以通過取食從植物傳遞到昆蟲體內(nèi),通過植物介導(dǎo)的RNAi技術(shù)可以干擾害蟲的重要基因,達到防治害蟲的目的,為利用RNAi技術(shù)培育新一代抗蟲轉(zhuǎn)基因作物提供重要的科學(xué)依據(jù)。
核糖體是普遍存在于各種細胞內(nèi)的細胞器,由大小兩個亞基組成,是蛋白質(zhì)合成的唯一場所。核糖體含有50%~60%的核糖體RNA(rRNA),其余為蛋白質(zhì)。近年,國內(nèi)外的研究表明,核糖體RNA(rRNA)不僅是構(gòu)成核糖體的主要成分,還具有自我復(fù)制和自我剪切功能[10],在蛋白質(zhì)合成中起重要作用[11]。28SrRNA是核糖體RNA主要成員之一,是生物的關(guān)鍵生長基因。因此,本試驗根據(jù)GenBank上已經(jīng)發(fā)表的昆蟲28SrDNA基因序列,利用28SrDNA基因序列的保守區(qū)域,克隆大豆食心蟲28SrDNA序列全長,利用熒光定量PCR對大豆食心蟲不同生育時期和幼蟲的不同組織的28SrDNA表達量進行分析后,構(gòu)建表達大豆食心蟲28SrDNA dsRNA的重組載體L4440-28SrDNA,為進一步研究RNA干擾技術(shù)防治大豆食心蟲奠定基礎(chǔ)。
[1]Laufer,B.&P.,Nation.(1999).A Vocabulary Size Test of Controlled Productive Ability,Language Testing,16(1).33-51.
2010年7月末8月初大豆田間出現(xiàn)大豆食心蟲成蟲開始,收集卵、幼蟲、蛹、成蟲四個時期的大豆食心蟲樣品,將收集的蟲樣分別放入無Rnase的EP管中,立即放入液氮中冷凍,然后存于-80℃低溫冰箱,每個處理重復(fù)3次。選取大豆食心蟲3~4齡幼蟲進行解剖,剖取神經(jīng)節(jié)、表皮、唾腺、中腸、卵巢、睪丸和脂肪體組織后,分別放入無Rnase的EP管中,立即放入-80℃低溫冰箱中保存。
DNA提取、PCR、電泳所用試劑均購自上海生工公司,測序由華大基因有限公司完成、OMEGA膠回收試劑盒、Trizol reagen試劑盒、MEGA4.0軟件、DNAman 5.2.2軟件、載體L4440和菌種HT115均由美國線蟲遺傳學(xué)中心提供。
嵌入式計算機在接到指定任務(wù)后,必須在規(guī)定時間內(nèi)給出實時應(yīng)答,這是區(qū)別嵌入式計算機與通用計算機的一個重要特征,實時性涉及到硬件的性能、軟件的中斷管理和調(diào)度算法等。
Design of Intelligent Balancing Vehicle Control System based on Arduino
2.3 術(shù)后硬膜下并發(fā)癥影響因素分析 單因素分析結(jié)果(表3)表明:男性、高齡、動脈瘤部位、Fisher分級、腦萎縮程度及術(shù)后腰大池引流是破裂動脈瘤夾閉術(shù)后硬膜下并發(fā)癥發(fā)生的潛在危險因素(P<0.05)。
1.2.1 大豆食心蟲基因組DNA的提取
種植雙胞山藥最好選擇土質(zhì)疏松、地勢高燥、土層深厚、排灌方便、通氣透水、保水保肥性能好的砂壤土。鹽堿地、低洼積水地、賣窯泥地、地下異物多的地不能種山藥。
縣級設(shè)專職人影管理人員1名,作業(yè)人員4~5名(高炮作業(yè)人員除外)。防雹作業(yè)點均交由當(dāng)?shù)卣芾?,施行鄉(xiāng)鎮(zhèn)武裝部長主管、村干部管理、炮長負責(zé)的制度,每個作業(yè)點配備4名作業(yè)人員,一人為炮長,具體負責(zé)作業(yè)點管理、高炮維護、彈藥交接、作業(yè)實施及空域請示,氣象部門僅負責(zé)安全檢查、作業(yè)指導(dǎo)和空域請示等。
根據(jù)GenBank上已經(jīng)發(fā)表鱗翅目昆蟲的銀月豹鳳蝶(Papilio troilus,登錄號AF423920);家蠶(Bombyx mori,登錄號M31320);雄鹿天蠶蛾(Hemileuca sp,登錄號AF423922);洋槐木蠹蛾(Prionoxystus robiniae,登錄號AY521785)的28SrDNA序列,根據(jù)鱗翅目昆蟲28SrDNA序列的保守區(qū)域設(shè)計兩對簡并引物用于擴增大豆食心蟲28SrDNA序列全長,引物具體如下:
利用DNAMAN5.2.2和MEGA4.0軟件進行序列分析。
P2:ATGGTGAACTATGCCTGGT;
P3:AACTTCGGAGGGAACCG;
P4:CCCTCCCTGRATTTCAAGGTCCG。
按昆蟲DNA提取方法,利用試劑盒提取大豆食心蟲幼蟲DNA。
P1和P2預(yù)期的PCR擴增條帶大小約為1100 bp,P3和P4約為1200 bp。
1.2.3 PCR擴增與檢測
PCR反應(yīng)體系為PCR Buffer 2.5 μL,TaqDNA聚合酶 0.3 μL,dNTPs 0.5 μL,10 mmol·L-1引物 1.0 μL,模板DNA 2.5 U 1.0 μL,ddH2O 19.7 μL。PCR循環(huán)條件為:95℃5 min;57.1℃1 min,72℃2 min,30個循環(huán);最后72℃延伸10 min。取4 μL PCR產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.4 PCR產(chǎn)物的純化
將PCR產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳后,切下擴增的目的條帶,利用OMEGA膠回收試劑盒回收PCR目的片段。
1.2.2 引物設(shè)計
1.2.5 熒光定量PCR
actin-a:5'ATCCTCCGTCTGGACTTGGC 3'
本文針對RBC的特點,考慮風(fēng)險因素之間的影響,提出基于ANP和證據(jù)融合理論的風(fēng)險評估模型,對RBC的風(fēng)險等級進行評估。
利用Trizol reagent提取大豆食心蟲卵、幼蟲、蛹、成蟲四個時期和神經(jīng)節(jié)、表皮、唾腺、中腸、卵巢、睪丸和脂肪體7個組織的總RNA,采用Fermentas公司M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA。以cDNA為模板,利用熒光定量PCR對28SrDNA表達量進行檢測。熒光定量PCR按照TOYOBO公司SYBR?Green Realtime PCR Master Mix-Plus-程序進行。熒光定量PCR反應(yīng)中所使用的基因及其引物如下:
actin-s:5'GGCGACATAGCACAGCTTCTC 3'
那時實行大集體制,生產(chǎn)隊按照家庭人口和掙得工分的多少,定期分給社員一些稻草、棉稈、松枝之類的東西用于做飯之用,但分配的那點柴草遠遠不能滿足炊用的需要,家家都感覺到柴不夠燒。棉稈、松枝還好燒一點,稻草一燒煙大灰多,做完一餐飯,是滿面火灰,兩眼通紅。所以,弄柴就成了我們這些孩子上學(xué)之余的主要任務(wù),逢放學(xué)或放假,村子中10多個中小學(xué)生就都扛著鋤頭、背上箢子、帶上鐮刀浩浩蕩蕩地到山上找柴,遠山近坡能砍的都被我們砍光,能挖的都被我們挖完,山都變成了光禿禿的。
28S-a:5'ACGTTTGGTTCATCCCACAGC 3'
28S-s:5'CGGTAAAGCGAATGATTAGAGGC 3'
1.2.6 生物軟件
P1:AGGATTYCCYBAGTAGCKGCGAGCGAA;
1.2.7 載體構(gòu)建
利用內(nèi)切酶XbaⅠ和HindⅢ分別雙酶切具有雙向T7啟動子的載體L4440和28S rDNA目的片段,回收目標(biāo)DNA片段,將純化產(chǎn)物連接,對重組子經(jīng)菌液PCR鑒定,得到陽性克隆,命名為L4440-2828SrDNA。
從大豆食心蟲基因組模板獲得PCR擴增產(chǎn)物,引物1和引物2的擴增產(chǎn)物為1100 bp(見圖1a),引物3和引物4的擴增產(chǎn)物為1200 bp(見圖1b),并將PCR產(chǎn)物均進行測序,將兩段序列拼接成全長的大豆食心蟲28SrDNA序列,該序列長度為2127 bp。
在推進地下水超采治理試點工作中,始終牢牢把握五條基本原則:一是政府引導(dǎo)、全民行動,發(fā)揮好政府和群眾兩個積極性;二是規(guī)劃統(tǒng)領(lǐng)、科學(xué)治理,年度實施方案與中長期規(guī)劃有機銜接,集中連片規(guī)模實施,務(wù)求治理一片、見效一片、鞏固一片;三是創(chuàng)新機制、示范帶動,探索建立地下水超采治理的有效途徑,力求取得可示范、可復(fù)制、可推廣的經(jīng)驗;四是因地制宜、積極穩(wěn)妥,根據(jù)實際情況,科學(xué)確定治理模式和工程規(guī)模;五是競爭立項、績效考核,依據(jù)項目前期工作和壓采效果擇優(yōu)實施,嚴(yán)格把關(guān)、嚴(yán)格獎懲。
圖1 28SrDNA的PCR擴增結(jié)果Fig.1 PCR amplification results of 28SrDNA
將大豆食心蟲28SrDNA序列和其他昆蟲28SrDNA序列進行同源序列比較(見圖2),發(fā)現(xiàn)大豆食心蟲28SrDNA序列與蝎蛉(Anthocharis sara)、大蠟螟(Galleria mellonella)、粉蝶(Panorpa claripennis)、姬蜂(Poecilocryptus nigromaculatu)、家蠶(Bombyx mori)的28SrDNA同源性都在80%以上。采用MEGA4.0軟件利用相鄰連接法NJ(Neighborjoining method)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,結(jié)果表明,大豆食心蟲的28SrDNA和鱗翅目家蠶的親緣關(guān)系較近,分布在同一分支,與膜翅目姬蜂親緣關(guān)系較遠,處于不同分支。
圖2 根據(jù)昆蟲28SrDNA序列利用相鄰連接(NJ)法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹Fig.2 Phylogenetic analysis of the sequences of 28SrDNA from insect by neighbor joining method
為了確定大豆食心蟲28SrDNA基因在大豆食心蟲不同發(fā)育時期和大豆食心蟲幼蟲不同組織的表達情況,利用熒光定量PCR對28SrDNA mRNA的表達情況進行檢測,結(jié)果表明,28SrDNA的rRNA在卵、幼蟲、蛹、成蟲各發(fā)育階段均表達(見圖3),其中成蟲期(AD)28SrDNA的表達量最高,4齡幼蟲(N4)、蛹(PU)和1齡幼蟲(N1)的表達量較高,2齡幼蟲(N2)和3齡幼蟲(N3)表達量較低,卵中表達量最低。28SrDNA在神經(jīng)節(jié)、表皮、唾腺、中腸、卵巢、睪丸和脂肪體7個組織中均有表達,其中脂肪體(FT)和睪丸(TE)的相對表達量最高,神經(jīng)節(jié)(SY)的表達量較高,表皮(CU)、唾腺(SA)、中腸(MD)和卵巢(OV)相對表達量較低(見圖4)。
圖3 28SrDNA在大豆食心蟲不同發(fā)育階段的表達量Fig.3 Transcript level of 28SrDNA in different development stage
圖4 28SrDNA在大豆食心蟲不同組織的表達量Fig.4 Transcript level of 28SrDNA in different tissues of soybean pod borer
利用DNAman軟件將大豆食心蟲28SrDNA和人28SrDNA進行序列比較,選擇同源性最低的大豆食心蟲28SrDNA序列區(qū)域作為目標(biāo)片段。根據(jù)分析結(jié)果設(shè)計引物,通過PCR擴增得到418 bp的擴增產(chǎn)物(見圖5),純化后克隆到pMD18-T上。將質(zhì)粒pMD18T-28S與載體L4440用XbaⅠ和HindⅢ雙酶切,回收目的片段,將純化產(chǎn)物連接,對重組子經(jīng)菌液PCR鑒定,得到陽性克隆,命名為L4440-28SrDNA。重組質(zhì)粒L4440-28SrDNA經(jīng)XbaⅠ單酶切和XbaⅠ、HindⅢ雙酶切(見圖6),目的條帶均與預(yù)期結(jié)果相符,表明構(gòu)建的重組載體L4440-28SrDNA正確。
圖5 28SrDNA目的片段的PCR擴增產(chǎn)物Fig.5 PCR amplification result of 28SrDNA
圖6 重組質(zhì)粒L4440-28SrDNA的雙酶切鑒定Fig.6 Confirmation of recombinant plasmid L4440-28SrDNA by Xba I and Hind III
RNA干擾是利用外源導(dǎo)入或轉(zhuǎn)錄載體在體內(nèi)轉(zhuǎn)錄的雙鏈RNA介導(dǎo)受體細胞中的序列特異的同源性mRNA發(fā)生降解或翻譯受阻,引發(fā)受體細胞產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄后基因沉默,使與此相應(yīng)的內(nèi)源靶基因的表達被阻抑,從而得到類似于“基因敲除”的基因阻抑效果[12]。Fire等在線蟲發(fā)現(xiàn)RNA干擾現(xiàn)象后,在真菌、植物、線蟲、昆蟲、斑馬魚、小鼠等大多數(shù)真核生物也發(fā)現(xiàn)RNAi現(xiàn)象,研究表明RNAi是生物進化過程中保留下來的一種抵抗微生物侵入、轉(zhuǎn)座子擴展和對基因表達進行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的強大機制。由于RNAi沉默基因的高效性和特異性,將昆蟲關(guān)鍵生長基因dsRNA導(dǎo)入昆蟲體內(nèi)細胞,dsRNA介導(dǎo)受體細胞內(nèi)同源性mRNA發(fā)生降解,使昆蟲體內(nèi)與dsRNA相對應(yīng)的靶基因表達被抑制,可以直接分析基因的功能。目前的主要問題是尋找一個向目標(biāo)昆蟲體內(nèi)導(dǎo)入dsRNA簡單而且穩(wěn)定的方法。Timmons等發(fā)現(xiàn)給線蟲喂食表達dsRNA的大腸桿菌或?qū)⒕€蟲浸泡在dsRNA溶液中均能誘導(dǎo)線蟲體內(nèi)靶基因的沉默,表明dsRNA可以直接從環(huán)境(體內(nèi)腸道和體表)進入到昆蟲體內(nèi)[13]。
目前,國內(nèi)外尚無大豆食心蟲RNA干擾的研究報道。本研究以大豆食心蟲幼蟲作為研究對象,利用同源克隆法克隆大豆食心蟲28SrDNA全長序列。對大豆食心蟲28SrDNA不同發(fā)育階段和不同組織的表達量進行分析,結(jié)果表明,大豆食心蟲28SrDNA在大豆食心蟲的不同發(fā)育階段的不同組織均有表達,在大豆食心蟲生長發(fā)育階段起關(guān)鍵作用。
本研究將28SrDNA的目的片段克隆到L4440載體上,該載體具有雙T7強啟動子,對目標(biāo)基因片段的克隆不要求方向性,目的片段以何種方向連入,利用該載體的雙T7強啟動子均可以得到對應(yīng)于目標(biāo)基因的dsRNA。構(gòu)建完的載體可轉(zhuǎn)入E.coli HT115(DE3)中,該菌株含有T7RNA聚合酶基因,在T7強啟動子的控制下進行該基因的轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生T7RNA聚合酶。而且該菌株還是一個Rnc基因突變菌株,不能編碼降解dsRNA的內(nèi)切酶RnaseⅢ的基因,這樣在IPTG的誘導(dǎo)下,在E.coli HT115菌株中很容易產(chǎn)生大量的目的片段的dsRNA。因此該載體的成功構(gòu)建,為利用喂食方法研究大豆食心蟲28SrDNA基因的功能奠定基礎(chǔ),有利于進一步探索利用植物介導(dǎo)的RNA技術(shù)防治大豆食心蟲。
[1] 劉洋,王繼安,趙奎軍.大豆抗食心蟲性遺傳研究[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2005,36(2):138-141.
[2] Fire A,Xu S Q,Montgomery M K,et al.Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans[J].Nature,1998,391:806-811.
[3] Baum J A,Bogaert T,Clinton W,et al.Control of coleopteran insect pests through RNA interference[J].Nature Biotechnology,2007,25:1322-1326.
[4] Whyard S,Singh A D,Wong S.Ingested double-stranded RNAs can act as species-specific insecticides[J]Insect Biochemistry and Molecular Biology,2009,39:824-832.
[5] Yadav B C,Veluthambi K,Subramaniam K.Host-generated double stranded RNA induces RNAi in plant-parasitic nematodes and protects the host from infection[J].Molecular&Biochemical Parasitology,2006,148:219-222.
[6] Steeves R M,Todd T C,Essig J S.Transgenic soybeans expressing siRNAs specific to a major sperm protein gene suppress Heterodera glycines reproduction[J].Functional Plant Biology,2006,33:991-999.
[7] Price D R,Gatehouse J A.RNAi-mediated crop protection against insects[J].Trends in Biotechnology,2008,26:393-400.
[8] MaoY B,Cai W J,Wang J W.Silencing a cotton bollworm P450 monooxygenase gene by plant-mediated RNAi impairs larval tolerance of gossypol[J].Nature Biotechnology,2007,25:1307-1313.
[9] Baum J A,Bogaert T,Clinton W.Control of coleopteran insect pests through RNA interference[J].Nature Biotechnology,2007,25:1322-1332.
[10] 劉望夷.核糖體的生物功能、自我剪切與自我復(fù)制[J].生物化學(xué)與生物物理進展,1991,18(1):1-5.
[11] 潘敏慧,萬永承,魯成.核糖體RNA研究進展[J].蠶學(xué)通訊,2001,21(3):10-14.
[12] Bischoff V,Vignal C,Duvic B,et al.Down regulation of the Drosophila immune response by peptidoglycan-recognition proteins SC1 and SC2[J].PLoS Pathogens,2006(2):139-147.
[13] Timmons L,Court D L,Fire A.Ingestion of bacterially expressed dsRNAs can produce specific and potent genetic interference in Caenorhabditis elegans[J].Gene,2001,263:103-112.