馬 亮,殷獎(jiǎng)悠,湛玉良
(中日友好醫(yī)院 檢驗(yàn)科,北京 100029)
隨著基因組學(xué)的發(fā)展,對(duì)白血病分子遺傳學(xué)及分子生物學(xué)的研究不斷深入,發(fā)現(xiàn)急性髓細(xì)胞白血?。╝cute myelocytic leukemia,AML)中存在多種不同的基因突變和基因表達(dá)的改變,目前對(duì)核仁磷酸蛋白基因1(nucleophosmin family,member 1,NPM1)研究較多,該基因突變與患者的臨床表現(xiàn)和預(yù)后有很大的相關(guān)性,現(xiàn)作一綜述。
核磷素(nucleophosmin,NPM),也稱為核仁磷酸蛋白B23或核仁間質(zhì)蛋白,包括NPM1、NPM2及NPM3 3種亞型。NPM1是位于核仁顆粒區(qū)的主要蛋白分子之一,能穿梭于核仁、核質(zhì)和胞質(zhì)之間,參與核糖體前體運(yùn)輸和合成及中心體的復(fù)制,進(jìn)而調(diào)控細(xì)胞的周期進(jìn)程和增殖發(fā)育[1]。人類NPM1基因位于染色體5q35,基因全長(zhǎng)約23kb,含有12個(gè)外顯子,編碼由294個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì)。在分子結(jié)構(gòu)上NPM可分為3個(gè)區(qū)域,分別負(fù)責(zé)不同的功能[2],由N端開始,NPM蛋白包含一個(gè)疏水區(qū),它參與寡聚化過(guò)程,并與NPM分子伴侶活性相關(guān)。隨后2個(gè)富含天冬氨酸和谷氨酸的酸性區(qū),是與組蛋白結(jié)合的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)。在兩個(gè)酸性區(qū)是核糖核酸酶活性區(qū),與C端的核酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域一起構(gòu)成核糖核酸酶活性結(jié)構(gòu)域。NPM主要定位在核仁顆粒區(qū),可通過(guò)核仁定位信號(hào)在核仁、胞核和胞質(zhì)之間往返,參與核質(zhì)間物質(zhì)的運(yùn)輸。
NPM具有多種生物學(xué)功能。一方面,NPM在rRNA前體加工過(guò)程中發(fā)揮核糖核酸內(nèi)切酶的活性,參與28S rRNA的形成,進(jìn)而促進(jìn)核糖體的形成,同時(shí)NPM可作為細(xì)胞周期依賴性蛋白激酶2(CDK2)/細(xì)胞周期蛋白E復(fù)合物的直接底物,被CDK2/cyclin E磷酸化,并從中心體中解離出來(lái),啟動(dòng)中心體復(fù)制,在調(diào)控周期進(jìn)程和促進(jìn)細(xì)胞增殖中發(fā)揮著重要作用。另一方面,NPM可以與HIV-Rev等帶有核定位信號(hào)的蛋白質(zhì)結(jié)合,促進(jìn)它們運(yùn)輸至核仁并阻止核仁內(nèi)多種蛋白質(zhì)的聚集,還可以結(jié)合組蛋白,介導(dǎo)核小體的合成和致密染色質(zhì)的舒展,發(fā)揮分子伴侶功能[3]。
Falini等[4]首先通過(guò)免疫組織化學(xué)方法對(duì)591例AML患者NPM基因表達(dá)的研究中發(fā)現(xiàn),其中208例患者 (占35.2%)白血病細(xì)胞胞漿中檢出NPM蛋白,NPM基因突變導(dǎo)致大量的NPM分子從核仁移位至胞漿,因此把基因突變致NPM胞漿移位的白血病細(xì)胞稱之為NPMc+細(xì)胞。這種 NPMc+細(xì)胞分布在除 M3、M4EO、M7以外的其它 AML FAB各亞型中,但在不同F(xiàn)AB亞型中突變率不同,如M2中約為20%,M4中為40%~50%,M5a中為40%~50%,M5b中則高達(dá)90%??梢?,其與單核細(xì)胞關(guān)系較為密切[5]。經(jīng)測(cè)序證實(shí)為NPM1基因第12外顯子突變導(dǎo)致NPM蛋白核定位改變。
NPM突變的類型:NPM突變基因是雜合型的,在基因座上保留了1個(gè)野生型的等位基因。目前發(fā)現(xiàn)有多種NPM1基因突變,都是由在外顯子12的不同位置插入不同的核苷酸而產(chǎn)生,主要以6種變異體(mutation A-F)為主,其中最常見的是mutation A,它是在野生型NPM核苷酸序列第956-959位上插入1個(gè)TCTG 4個(gè)核苷酸而形成串聯(lián)重復(fù)序列;mutation B、C、D是在野生型NPM核苷酸序列上第960位之前插入4個(gè)不同堿基而產(chǎn)生;而mutation E、F是由于缺失了野生型NPM核苷酸序列第965-969位上的GGAGG堿基序列,但隨后插入了2種不同的9個(gè)堿基的序列而產(chǎn)生[6]。 Mutation A-F導(dǎo)致NPM1基因外顯子12的移碼突變,使NPM蛋白C末端的7種氨基酸色(W)-谷(Q)-W-精(R)-賴(K)-絲(S)-亮(L)被 11 個(gè)短肽鏈X-X-X-X-X-X-纈 (V)-S-L-R-K或13個(gè)短肽鏈 W-Q-天冬(D)-苯丙(F)-L-門冬(N)-R-L-F-K-K-異亮(I)-V所代替,從而導(dǎo)致NPM蛋白C端的288和290位點(diǎn)上至少有1個(gè)色氨酸發(fā)生突變而產(chǎn)生一個(gè)核輸出信號(hào)(NES),最終使NPM移位到胞漿。
Nakagawa等[7]進(jìn)一步研究提出,在野生型NPM分子結(jié)構(gòu)中C端的色氨酸只對(duì)NPM的核仁定位起主要作用,而對(duì)NPM的胞漿移位不起主要作用;他同時(shí)還提出在突變NPM的C端中存在一種核輸出信號(hào)序列(NES),由疏水性氨基酸殘基所組成。NES中的分子被輸出信號(hào)受體CRM1所識(shí)別,從而產(chǎn)生核輸出信號(hào),導(dǎo)致NPM移位到胞漿。在野生型NPM的N端92-104位點(diǎn)有一個(gè)生理性的NES序列,若將此NES序列敲除或?qū)端突變產(chǎn)生的NES序列敲除,然后將NES序列敲除的NPM基因轉(zhuǎn)染入NIH3T3細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)無(wú)論敲除N端還是C端的任意一種NES序列,NPM都只能出現(xiàn)在核質(zhì)而不能聚集在胞漿中,這說(shuō)明突變NPM只有在同時(shí)具有兩種NES序列的情況下才能實(shí)現(xiàn)其胞漿的聚集。
關(guān)于NPM1突變的檢測(cè),目前應(yīng)用的主要方法有PCR-毛細(xì)管電泳、變性高效液相色譜(DHPLC)、直接測(cè)序、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Q-PCR)以及免疫組化檢測(cè)胞漿中NPM蛋白等方法[9,12],這幾種檢測(cè)方法各自有其優(yōu)缺點(diǎn)。近年來(lái)DHPLC、毛細(xì)管電泳和RQ-PCR作為檢測(cè)基因突變方法,以其靈敏度高、自動(dòng)化、快速高效、準(zhǔn)確等優(yōu)勢(shì)漸漸成為各種基因突變檢測(cè)方法中常用的可靠方法。直接測(cè)序作為檢測(cè)基因突變的“金指標(biāo)”,隨著靈敏度不斷提高、檢測(cè)的成本進(jìn)一步降低,該方法也逐漸普及。
DHPLC:是在PCR產(chǎn)物的基礎(chǔ)上進(jìn)行的。NPM1基因突變?yōu)殡s合子,PCR擴(kuò)增的基因不僅包括突變基因,還包括未突變等位基因。如果正?;蚝屯蛔兓蛟谠嚬軆?nèi)變性雜交,DHPLC的圖譜上會(huì)出現(xiàn)有別于正?;虻臉?gòu)象,出現(xiàn)不同的峰型,由此可以辨別是否有突變。Roti等[8]認(rèn)為該方法檢測(cè)突變高度敏感、可靠,并且只需對(duì)PCR產(chǎn)物直接檢測(cè),因而快速廉價(jià)。但鄒積艷等[9]發(fā)現(xiàn),DHPLC檢測(cè)結(jié)果受較多因素影響,雖然多次更換條件,部分突變患者的峰型并不典型,最終的判斷很容易出現(xiàn)假陰性。
毛細(xì)管電泳:是在基因序列分析儀上做毛細(xì)管電泳檢測(cè)來(lái)分析PCR基因產(chǎn)物[10]。毛細(xì)管電泳法是用熒光標(biāo)記PCR產(chǎn)物,觀測(cè)PCR獲得的基因片段在毛細(xì)管電泳圖上顯示的長(zhǎng)度,還可根據(jù)峰面積定量檢測(cè)突變型與野生型的比率。并且需要的樣本量很小,可對(duì)多重PCR產(chǎn)物同時(shí)檢測(cè)而不影響結(jié)果的準(zhǔn)確性,但是,毛細(xì)管電泳要求擴(kuò)增產(chǎn)物不能太長(zhǎng)(一般<500bp),否則會(huì)影響其準(zhǔn)確性,另外該方法需要價(jià)格昂貴的基因序列測(cè)定儀。作為一種快速的定性檢測(cè)方法,毛細(xì)管電泳具有很大的優(yōu)勢(shì)。
Q-PCR:可以精確地做基因定量,從而估計(jì)突變細(xì)胞在患者體內(nèi)的數(shù)量。Q-PCR基因定量往往用于檢測(cè)治療后的白血病微小殘留?。∕RD)。臨床治療要求檢測(cè)MRD的靈敏度達(dá)到惡性細(xì)胞占1/105~1/106個(gè)細(xì)胞的水平,并且要求快速、價(jià)廉、易于標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)量控制,在不同實(shí)驗(yàn)室可以重復(fù)。Q-PCR完全可以達(dá)到要求,使臨床工作中對(duì)患者不同病期、不同實(shí)驗(yàn)室的檢測(cè)結(jié)果有了可比性[12]。Q-PCR有多種模式:Taqman探針?lè)?、熒光染料法、分子信?biāo)法等,但Q-PCR只能針對(duì)NPM1已知基因突變類型檢測(cè)。
PCR產(chǎn)物的直接測(cè)序:是檢測(cè)基因突變的“金指標(biāo)”。其往往受到基因組DNA同時(shí)存在正常(野生型)等位基因和突變等位基因片段混雜在一起的影響,需要對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行凝膠純化,步驟較繁瑣,而且突變基因含量較低時(shí),直接測(cè)序往往很難檢測(cè)到突變,靈敏度相對(duì)較低。
免疫組化:該方法簡(jiǎn)便易行,可同時(shí)觀察細(xì)胞形態(tài)及分布,適用于標(biāo)本取材較少或髓外組織活檢等情況。有3種抗體可用于NPM的免疫組化檢測(cè)[13]。一種為標(biāo)記NPM的單克隆抗體,但其不能區(qū)分NPM突變型與野生型,只能通過(guò)其細(xì)胞定位(野生型位于細(xì)胞核,突變型位于胞漿)區(qū)分。此種抗體目前應(yīng)用最廣泛。另一種為多克隆抗體,可識(shí)別NPM突變型,但其診斷敏感性僅為50%~60%,因其高度特異性而主要應(yīng)用于NPMc+AML細(xì)胞系研究。第3種單克隆抗體只識(shí)別野生型NPM,此種單克隆抗體診斷意義不大。Falini等[13]分析200例NPM1基因突變患者,通過(guò)免疫組化方法檢測(cè)NPMc+,其中195例呈強(qiáng)陽(yáng)性,5例呈弱陽(yáng)性。對(duì)照250例野生型NPM1均為陰性。其缺點(diǎn)是不能準(zhǔn)確定量,對(duì)NPM1陰性檢測(cè)缺乏準(zhǔn)確性。
另外,變性聚丙烯酰胺凝膠電泳也是檢測(cè)NPM1突變的一個(gè)比較好的方法,在普通聚丙烯酰胺凝膠中加入變性劑如尿素等,可去除單鏈DNA的構(gòu)象變化,使電泳的單鏈遷移率只由DNA的長(zhǎng)度決定,從而可以分辨不同DNA標(biāo)本間的細(xì)微堿基數(shù)量差別。
Thiede等[14]進(jìn)行的大規(guī)模臨床研究結(jié)果顯示,在1485例AML患者中有408例(27.5%)存在4個(gè)核苷酸插入的NPM1突變,并且發(fā)現(xiàn)了13種新突變。核型正常者NPM1突變發(fā)生率(45.7%)明顯比核型異常者(8.5%)高,且表現(xiàn)為骨髓中原始細(xì)胞比例高、高白細(xì)胞和血小板,髓外浸潤(rùn)易見。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),在成人女性AML患者,NPM1突變發(fā)生率比男性患者要高1.5倍,提示存在性別差異。在兒童AML患者中,NPM1的發(fā)生率為2.1%~6.5%,在兒童AML-NK 患者發(fā)生率為 9%~26.9%[15,16],而在成人 AML 患者中為25%~35%,在成人AML-NK患者中則高達(dá)45.7%~63.8%[17],表明在兒童AML中NPM發(fā)生突變的可能性比成年病例要低得多。值得注意的是,兒童AML患者往往出現(xiàn)NPM-mtA以外的突變型,他們?cè)谛詣e和白細(xì)胞計(jì)數(shù)方面與NPM-wt患者沒有顯著的差異。
NPM1突變?cè)诼粤<?xì)胞白血病患者中并不常見。Caudil等[18]研究發(fā)現(xiàn),在CML患者中一旦出現(xiàn)了NPM1突變,提示CML極有可能短期內(nèi)迅速發(fā)展為AML,患者預(yù)后較差。Zhang等[19]在38例原發(fā)性骨髓增生異常綜合征患者中,發(fā)現(xiàn)2例NPM1突變,分別是難治性貧血(RA)和難治性貧血伴原始細(xì)胞增多。這2例患者雖表現(xiàn)異常核型,但均未涉及NPM1所在的5號(hào)染色體的改變。
關(guān)于在中國(guó)AML人群中NPM1的發(fā)病率,2個(gè)研究發(fā)現(xiàn)[20,21],中國(guó) AML患者 NPM1突變率分別為 16.4%與28.2%,前者應(yīng)用Q-PCR的方法,主要檢測(cè)的是NPM1A、B、D型突變,而后者采用的是毛細(xì)管電泳的方法,篩查NPM1所有類型突變。相對(duì)于國(guó)外研究,NPM1在中國(guó)AML患者發(fā)生率明顯低于國(guó)外。
Schnittger等[22]提出,可以把 NPMc+作為 AML預(yù)后良好的因素之一。然而,NPM1突變近40%的AML患者同時(shí)存在NPM1和FLT3-ITD基因突變,而在藥物誘導(dǎo)AML緩解的試驗(yàn)中,發(fā)現(xiàn)FLT3-ITD突變能降低完全緩解率,因此單純NPMc+的AML患者預(yù)后較好,若同時(shí)伴隨FLT3-ITD突變,將會(huì)影響AML患者對(duì)化療藥物誘導(dǎo)的緩解效果[23]。Koh等[24]認(rèn)為,F(xiàn)LT3-ITD陰性、預(yù)后良好的NPM1突變是在956-959位點(diǎn)具有經(jīng)典TCTG插入的A型,其他非A型突變患者的中位生存期和總生存期較A型突變患者短。
另外,研究發(fā)現(xiàn)NPM1突變可以作為監(jiān)測(cè)MRD的新指標(biāo)。利用Q-PCR檢測(cè)突變NPM基因cDNA拷貝數(shù),從而監(jiān)測(cè)MRD。在13例NPM1突變的AML患者中,突變NPM1基因cDNA拷貝數(shù)均>30000。藥物治療后,其中10例獲得明顯緩解,其突變NPM1基因cDNA的拷貝數(shù)明顯下降,而藥物治療無(wú)效的3例患者其突變NPM基因cDNA拷貝數(shù)下降程度很小或不下降。這表明突變NPM基因cDNA拷貝數(shù)與患者的臨床狀況明顯相關(guān)[7]。NPM1基因突變穩(wěn)定,對(duì)2組AML復(fù)發(fā)者的研究發(fā)現(xiàn),17例患者中的15例和15例患者中的10例NPM1基因突變持續(xù)存在[25]。通過(guò)定量PCR檢測(cè)NPM1基因突變,顯示其穩(wěn)定性與疾病臨床進(jìn)程密切相關(guān)[26]。因此,NPM1基因檢測(cè)可用于治療后監(jiān)測(cè)疾病復(fù)發(fā)及微小殘留病變檢測(cè)。
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