劉 奔,鐘民濤,王曉麗,孫文長(zhǎng),寧安紅,李星云,劉 磊,黃 敏
(大連醫(yī)科大學(xué) 微生物學(xué)教研室,遼寧 大連 116044)
香菇菌C91-3具有氣味甘平、無(wú)毒、健脾益氣、扶正祛邪,調(diào)和陰陽(yáng)的藥食兼用特點(diǎn)[1]。以往的研究表明其發(fā)酵液具有良好的抗腫瘤、抗細(xì)菌作用。其發(fā)酵液中除含有大量多糖和氨基酸成分外,還含有多種蛋白成分。經(jīng)體內(nèi)及體外實(shí)驗(yàn)證實(shí),其中的一些蛋白組分具有很高的誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的能力[2-3]。為明確香菇菌中蛋白的抗腫瘤作用,本課題組對(duì)其轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了高通量測(cè)序,獲得了香菇菌C91-3的轉(zhuǎn)錄組序列。通過(guò)GenBANK、SWISS-MODEL等數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析,初步篩選確定了其凋亡相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組序列,并根據(jù)此轉(zhuǎn)錄組序列設(shè)計(jì)引物,用3′-Full RACE、5′-Full RACE(Rapid Amplificatioon of cDNA Ends)方法獲得了基因全長(zhǎng)。通過(guò)畢赤酵母表達(dá)體系誘導(dǎo)表達(dá)出此目的蛋白,并將鑒定后的蛋白作用于小鼠肝癌細(xì)胞Hca,經(jīng)流式細(xì)胞術(shù)等方法檢測(cè)其對(duì)腫瘤細(xì)胞Hca生物學(xué)功能的影響,進(jìn)而分析其是否具有誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡的功能,為進(jìn)一步深入研究香菇菌C91-3的抗腫瘤機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器:低溫離心機(jī):Eppendorf ,德國(guó)。 PCR擴(kuò)增儀:Takara Thermal Cycler TP600,Takara BIO INC。超凈工作臺(tái):SW-CJ-1FD型,蚌埠凈化設(shè)備廠。核酸電泳儀:Mupid,ADVANCE-BIO Co.,Ltd。蛋白電泳儀:EPS300,上海天能。凝膠成像分析系統(tǒng):北京六一實(shí)驗(yàn)儀器廠?;驕y(cè)序儀:ABI PRISMTM3730XL DNA Sequencer,Applied Biosystem。
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑:總RNA提取Trizol試劑盒、Penta.His Antibody、HRP-Rabbit Anti-Mouse IgG (H+L)購(gòu)自invitrogen公司,3′-Full RACE Core Set Ver 2.0 、5′-Full RACE Kit、BigDye Terminater V3.1 Cycle Sequencing Kit、Lysis Buffer for Microorganism to Direct PCR、質(zhì)粒提取試劑盒、凝膠回收試劑盒及實(shí)驗(yàn)所需各種引物、酶類均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司,各種培養(yǎng)基為本實(shí)驗(yàn)室配置。
1.1.3 質(zhì)粒、菌株與細(xì)胞株:質(zhì)粒pPIC9K、菌株DH5α、畢赤酵母GS115購(gòu)自invitrogen公司(中國(guó));小鼠肝癌細(xì)胞Hca購(gòu)自中科院上海生化與細(xì)胞所;雞胚成纖維細(xì)胞,本實(shí)驗(yàn)室制備。
1.2.1 香菇菌C91-3總RNA提取與24414基因CDS區(qū)序列的獲得:取綜合馬鈴薯培養(yǎng)基培養(yǎng)18 d的香菇菌C91-3的菌絲體,于研缽中加入液氮充分研磨,用Trizol試劑盒按說(shuō)明一步法提取總RNA,將所得總RNA溶于50 μL DEPC水中。引物設(shè)計(jì)采用oligo 6.0設(shè)計(jì)軟件,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,設(shè)計(jì)合成3′-RACE、5′-RACE實(shí)驗(yàn)所需特異性引物,通過(guò)3′-Full RACE、5′-Full RACE反應(yīng)得到香菇菌C91-3 24414基因CDS區(qū)序列。實(shí)驗(yàn)所需引物序列如下:
(5′→ 3′):3′RACE Outer Primer 1:GAAATGGTCCTAGTTCCCGTG; 3′RACE Outer Primer 2:TA-GATGCCAGGGACCGCTTCT; 3′RACE Inner Primer 1:CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG; 3′RACE Inner Primer 2: AGTAGGGCTTCATGTGCTT; 5′RACE Outer Primer 1:CCGGGAATGTGTCTGTTGTTA; 5′RACE Outer Primer 2:CCGTTTTACAAGTTT-TTCGTT; 5′RACE Inner Primer 1:CGCGGATCCACAGCCTACTGATGATCAGTCGATG; 5′RACE Inner Primer 2:ATGCGCGTAGGTAGACTTTGA; F Primer:ACTGGCGCGTGAGCCACTCG; R Primer:GCCCTG-AGGTCCAAACATTG; R1seq primer:ACCTCGGCAACAAACCCCAA; 5′AOX I primer:GACTGGTTCCAATTGACAAGC; 3′AOX I primer:GGCAAATGGCATTCTGACAT。
1.2.2 酵母真核表達(dá)載體構(gòu)建、陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子培養(yǎng)及誘導(dǎo)表達(dá):構(gòu)建真核重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-24414,采用畢赤酵母GS115體系進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),其目的蛋白末端加入6×His鑒定、純化標(biāo)簽,得到鑒定的香菇菌C91-3凋亡相關(guān)目的蛋白24414[4]。
1.2.3 MTT法測(cè)定目的蛋白的抑瘤率:選取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的Hca小鼠肝癌細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞數(shù)為1×105個(gè)/mL,加于96孔培養(yǎng)板,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔,終體積200 μL。實(shí)驗(yàn)分為5組:不同濃度目的蛋白3組,化療藥物順鉑(DDP)組與培養(yǎng)基空白對(duì)照組。所有成分用RPMI-1640配制,目的蛋白為鑒定后的誘導(dǎo)表達(dá)72 h的產(chǎn)物,分別稀釋至終濃度7.5 μg/mL、15 μg/mL、30 μg/mL,化療藥物DDP終濃度為5.0 μg/mL,于37 ℃作用于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的Hca細(xì)胞24 h、48 h、72 h后,用 MTT法進(jìn)行檢測(cè),測(cè)定波長(zhǎng)595 nm,參考波長(zhǎng)655 nm,按照下面公式計(jì)算抑瘤率(細(xì)胞生長(zhǎng)抑制率):IR(inhibited rate)=(對(duì)照組平均A值-實(shí)驗(yàn)組平均A值)/對(duì)照組平均A值×100%。
1.2.4 目的蛋白對(duì)腫瘤細(xì)胞Hca凋亡作用檢測(cè):細(xì)胞分組同上,選取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的小鼠肝癌Hca細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞數(shù)為1×105個(gè)/mL,加入25 mL培養(yǎng)瓶,每瓶3 mL。用藥及藥物作用濃度同上,混勻后,37 ℃,5%CO2孵育24 h,細(xì)胞懸液800 r/min,離心3 min,再以PBS洗滌1次,800 r/min離心3 min;按試劑盒說(shuō)明加入Annexin/PI染液,避光孵育15 min后以流式細(xì)胞儀檢測(cè),使用Cell Quest軟件進(jìn)行分析。
1.2.5 目的蛋白對(duì)正常雞胚成纖維細(xì)胞毒性檢測(cè):制備雞胚成纖維細(xì)胞懸液[5],分組同上,調(diào)整細(xì)胞濃度至1×105個(gè)/mL,分裝于96孔板,二氧化碳培養(yǎng)箱中37℃培養(yǎng)24 h,觀察雞胚成纖維細(xì)胞貼壁良好時(shí)用藥同上,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔,37 ℃繼續(xù)培養(yǎng),于24 h、48 h、72 h采用 MTT法進(jìn)行檢測(cè),測(cè)定波長(zhǎng)595 nm,參考波長(zhǎng)655 nm。
使用SPSS11.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析,采用組間t檢驗(yàn),P<0.05為差異有顯著性意義。
取5 μL總RNA進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳,marker上樣量為5 μL,結(jié)果見(jiàn)圖1,示RNA完整無(wú)降解。
RT-PCR反應(yīng)結(jié)束后,取5 μL的RT-PCR反應(yīng)液進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳,marker上樣量為5 μL,確認(rèn)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,見(jiàn)圖2。在大約3000 bp處可見(jiàn)清晰條帶,條帶大小與拼接結(jié)果吻合,同時(shí)M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶陰性對(duì)照[M-MLV(-)]無(wú)條帶出現(xiàn),示無(wú)假陽(yáng)性結(jié)果。
圖1 香菇菌C91-3總RNAFig 1 Total RNA of Lentinus edodes C91-31:香菇菌C91-3總RNA; M:DNA Marker DL2000
圖2 香菇菌C91-324414基因CDS序列全長(zhǎng)Fig 2 Full CDS sequence of Lentinus edodes C91-3 24414 gene
M:DNA Markerλ-Hind Ⅲ digest ;1:M-MLV(-)PCR 產(chǎn)物;2:PCR 產(chǎn)物
通過(guò)Western-blot方法確認(rèn)目的蛋白的表達(dá)情況,一抗稀釋倍數(shù)為1∶1000,二抗稀釋倍數(shù)為1∶1000,顯色底物為True Blue Peroxidase Substrate,反應(yīng)條件均為室溫1 h,結(jié)果見(jiàn)圖3。在蛋白電泳大于110 kD位置處有抗His-Tag 陽(yáng)性的蛋白條帶,空載體對(duì)照組無(wú)條帶。
圖3 誘導(dǎo)表達(dá)不同時(shí)間目的蛋白的鑒定
Fig 3 Characterization of target protein on different time span of induction
M:Precision Plus Protein Standards Dual color ; 1:24414-1胞外 (72 h);2:24414-1胞外 (48 h); 3:24414-1胞外 (24 h);4:空載體pPIC9K 胞外 (48 h)
不同作用時(shí)間、不同濃度的目的蛋白對(duì)Hca細(xì)胞的MTT檢測(cè)結(jié)果,見(jiàn)表1,抑瘤率見(jiàn)表2。24 h后,蛋白作用組與DDP作用組的A值與對(duì)照組比較差異即有顯著性意義(P<0.05),且蛋白作用組的A值與DDP作用組比較差異也有顯著性意義(P<0.05)。表2所示,Hca細(xì)胞在各濃度目的蛋白作用下,生長(zhǎng)明顯受到抑制,其抑制水平超過(guò)5 μg /mL DDP的作用。
表1 不同時(shí)間、不同濃度的目的蛋白對(duì)Hca細(xì)胞的MTT檢測(cè)結(jié)果Tab 1 The MTT result of the expressed protein to Hca cell on different time span (±s)
1) 與對(duì)照組比較,P<0.05;2) 與5 μg/mL DDP組比較,P<0.05
表2不同時(shí)間、不同濃度目的蛋白對(duì)Hca細(xì)胞的抑瘤率
Tab 1 Cell inhibited rate of the expressed protein to Hca cell on different time span(%)
目的蛋白作用于Hca細(xì)胞24 h后,經(jīng)Annexin/PI雙染色法染色,以流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡率,測(cè)量3次,以Cell Quest軟件分析檢測(cè)腫瘤細(xì)胞凋亡結(jié)果,見(jiàn)表3和圖4。圖4中,右上象限為晚期凋亡細(xì)胞,右下象限為早期凋亡細(xì)胞,左上象限為死亡細(xì)胞,左下象限為正常狀態(tài)細(xì)胞。結(jié)果表明,目的蛋白作用濃度為7.5 μg/mL時(shí),其晚期凋亡率已高于對(duì)照組細(xì)胞,即對(duì)Hca細(xì)胞已具有誘導(dǎo)凋亡的作用,濃度為30 μg/mL時(shí)誘導(dǎo)凋亡的作用最強(qiáng),早晚兩期凋亡率最高。腫瘤細(xì)胞在蛋白的作用下對(duì)理化作用的耐受性降低,細(xì)胞碎片增多,死亡細(xì)胞數(shù)目亦明顯增多。
表3 不同濃度的目的蛋白對(duì)Hca細(xì)胞的凋亡率Tab 2 The apoptosis rate of the expressed protein on Hca cell (%)
1) 與對(duì)照組比較,P<0.05
不同濃度目的蛋白對(duì)正常雞胚成纖維細(xì)胞的毒性檢測(cè)見(jiàn)表4。雞胚成纖維細(xì)胞在不同濃度的目的蛋白作用下生長(zhǎng)沒(méi)有受到抑制,與對(duì)照組比較差異沒(méi)有顯著性意義。而在5 μg /mL 的DDP作用下,細(xì)胞生長(zhǎng)在24 h即出現(xiàn)抑制,與對(duì)照組、各蛋白作用組比較差異有顯著性意義(P<0.05)。
對(duì)照組目的蛋白組7.5μg/mL15μg/mL3μg/mL5μg/mLDDP24h1.817±0.0641.657±0.0891.789±0.1491.581±0.1400.773±0.4121)48h1.059±0.1000.990±0.0791.070±0.1541.118±0.1220.693±0.0901)72h0.939±0.0770.903±0.0810.931±0.1730.827±0.1090.522±0.0631)
1) 與其余4組比較,P<0.05
細(xì)胞凋亡是一個(gè)主動(dòng)的、信號(hào)依賴的過(guò)程,它可以由許多因素所誘導(dǎo),如放射線照射、毒素、藥物、缺血缺氧、病毒感染等。和細(xì)胞增殖一樣,細(xì)胞凋亡也是受基因調(diào)控的精確過(guò)程[6]。目前,已經(jīng)證實(shí)的凋亡相關(guān)蛋白在腫瘤細(xì)胞的增殖及凋亡過(guò)程中均起到關(guān)鍵作用[7]。研究表明,香菇菌提取物除具有抗病毒、抗細(xì)菌及免疫調(diào)節(jié)等生物功能外還具有抑制腫瘤增殖的功能[8]。Liao CH等[9]從松衫靈芝中提取的真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白能誘導(dǎo)體外培養(yǎng)的肺癌A549腫瘤細(xì)胞過(guò)早地凋亡和過(guò)早地衰老,證明了具有體外直接殺傷腫瘤作用的蛋白成分在藥用真菌中真實(shí)存在。Hsu HC等[10]從草菇中分離的真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白在體外對(duì)腫瘤細(xì)胞具有直接抑制作用,進(jìn)一步證明從真菌中可以分離得到具有直接抗腫瘤作用的蛋白。本課題組從香菇菌C91-3菌絲體發(fā)酵液中提取的蛋白LFP91-3就已在抗多種腫瘤細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)中取得了良好的結(jié)果[2-3], 并已證實(shí)該發(fā)酵液蛋白具有體外抗腫瘤和體內(nèi)直接殺傷腫瘤細(xì)胞的作用[2,11]。
本課題組通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、凋亡相關(guān)蛋白序列比對(duì)、真核表達(dá)載體構(gòu)建、酵母系統(tǒng)表達(dá)等手段得到了香菇菌C91-3凋亡相關(guān)蛋白24414,目的蛋白在1%甲醇誘導(dǎo)后24 h即有表達(dá),表達(dá)量較恒定,經(jīng)檢測(cè)在72 h達(dá)到峰值0.3 mg/mL[4]。MTT法進(jìn)行體外抗腫瘤活性的測(cè)定,發(fā)現(xiàn)該蛋白對(duì)腫瘤細(xì)胞Hca具有明顯的抑制作用,7.5 μg /mL、15 μg /mL、30 μg /mL目的蛋白的抑制率在24 h分別為50.49%、72.84%和72.96%。作用48 h后,15 μg /mL、30 μg /mL目的蛋白組出現(xiàn)組內(nèi)最大抑制率,分別為82.02%和74.66%,可以看出此蛋白對(duì)Hca細(xì)胞的抑制率不完全是時(shí)間、濃度依賴性的。作者分析這與生長(zhǎng)抑制作用通路中的某些因素有關(guān),其具體機(jī)制需要深入研究。作用24 h后,通過(guò)流式細(xì)胞儀檢測(cè),目的蛋白作用濃度為7.5 μg/mL時(shí),早期凋亡率和晚期凋亡率分別為0.47%和4.26%;目的蛋白作用濃度為30 μg /mL時(shí),早期凋亡率和晚期凋亡率分別達(dá)到9.28%和9.37%,兩期凋亡率均隨蛋白作用濃度增加而增加,晚期凋亡略占優(yōu)勢(shì)。此結(jié)果證實(shí),該蛋白具有誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡的作用,在作用24 h時(shí)腫瘤細(xì)胞出現(xiàn)的早期凋亡率和晚期凋亡率隨著單一蛋白作用濃度的增加而增加,表現(xiàn)出劑量-效應(yīng)關(guān)系。同時(shí),從毒性檢測(cè)的結(jié)果中可以看出此蛋白對(duì)正常雞胚成纖維細(xì)胞無(wú)毒性作用,雞胚成纖維細(xì)胞在不同濃度的目的蛋白作用下生長(zhǎng)沒(méi)有受到抑制,與對(duì)照組比較差異沒(méi)有顯著性意義。這一結(jié)果表明該蛋白誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡具有腫瘤細(xì)胞選擇性,其具體的誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡的機(jī)制、途徑有待研究。
目前的抗癌藥物多是通過(guò)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡發(fā)揮其細(xì)胞毒副作用。但幾乎所有的抗癌藥物都存在不同程度的毒副作用。抗癌藥物的抑瘤效果和毒副作用對(duì)其劑量存在的依賴性,產(chǎn)生了治療與毒副作用的矛盾[12]。因此,篩選低毒或無(wú)毒副作用且抑癌效率高的抗癌藥物具有很高的臨床價(jià)值。本課題組將繼續(xù)對(duì)此蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、生物學(xué)功能進(jìn)行深入研究。
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