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VDR基因TaqI位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與寧夏回漢人群中重度慢性牙周炎易感性的相關(guān)性

2011-08-02 05:20:40彭明勇寧夏回族自治區(qū)第三人民醫(yī)院口腔科寧夏銀川7500
中國老年學(xué)雜志 2011年18期
關(guān)鍵詞:牙周炎多態(tài)性基因型

張 慶 彭明勇 馬 敏 (寧夏回族自治區(qū)第三人民醫(yī)院口腔科,寧夏 銀川 7500)

牙周炎是一種由多因素引起的感染性疾病,牙周細(xì)菌和機(jī)體防御機(jī)能的相互作用決定疾病的過程和進(jìn)展〔1〕。維生素D受體(VDR)在維持機(jī)體鈣、磷代謝,調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、分化等方面起著重要的作用。關(guān)于VDR基因多態(tài)性的研究,目前發(fā)現(xiàn)與個體生長發(fā)育及人類疾病相關(guān)的基因多態(tài)性分別對應(yīng)限制性內(nèi)切酶TaqⅠ、BsmⅠ、ApaⅠ、FokⅠ的酶切位點(diǎn)。本研究采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法,探討VDR基因TaqⅠ位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與寧夏回漢人群中重度CP的相關(guān)性。

1 資料與方法

1.1 研究對象 收集病例組178例患者2007年10月至2009年10月就診于寧夏醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院口腔科的患者和健康對照者187例(健康志愿者)。以上研究對象均為寧夏本地人群,并且均知情同意參加本實(shí)驗(yàn),簽署知情同意書。病例組納入標(biāo)準(zhǔn):3代均為漢族或回族,未與其他民族通婚;口內(nèi)至少有14顆牙存在其中包括4顆磨牙(不含第三磨牙);無明顯的錯牙合畸形及不良修復(fù)體等;無糖尿病、心血管病等系統(tǒng)性疾病;不吸煙或戒煙5年以上;全口至少3個象限內(nèi),每1象限內(nèi)至少有兩顆牙齒的探診深度(PD) >4 mm、附著喪失(CAL)≥3 mm;X線顯示牙槽骨吸收≥根長的1/3。對照組納入標(biāo)準(zhǔn):3代均為漢族或回族,未與其他民族通婚,牙周健康,全身健康無系統(tǒng)性疾病。由同一名醫(yī)師對所有受檢者進(jìn)行全口牙周檢查,記錄口腔中所有余留牙的6個位點(diǎn)的牙周袋深度(probing depth,PD)及臨床附著喪失(clinic attachment loss,CAL),參照ARMITAGE等〔2〕推薦標(biāo)準(zhǔn):健康對照組:平均CAL≤0.5 mm,無鄰面位點(diǎn)CAL≥3 mm;缺失牙≤2顆(第三磨牙、正畸拔牙、外傷性失牙、大面積齲壞失牙及先天性缺失牙除外)。對病例組和對照組的年齡和性別分布進(jìn)行χ2檢驗(yàn),各組一般資料比較均無統(tǒng)計學(xué)差異,見表1。

1.2 主要試劑 血液基因組 DNA提取試劑盒、2×Taq PCRMasterMix、DNA markerⅠ(北京 TIANGEN 公司)、引物由北京奧科生物技術(shù)有限公司合成(F:5'-GGAGAAGTCACTG-GAGGGC-3',R:5'-GGATCATCTTGGCATAGAGC-3'〔3〕)、Taq Ⅰ限制性內(nèi)切酶(MBI公司提供)、PCR儀、電泳儀、全自動凝膠圖像分析儀,電熱恒溫水浴箱、臺式離心機(jī)。

表1 各組年齡性別比較(n)

1.3 方法

1.3.1 DNA提取 采取外周靜脈血5 ml,采集管中加入EDTA抗凝,4℃保存。采用上述DNA提取試劑盒提取外周血總基因組DNA,-20℃保存。

1.3.2 PCR 擴(kuò) 增 模 板 DNA 2 μl,dNTP 2.5 μl(2.5 mmol/L),10 × 緩沖液 2.5 μl(含 Mg2+),引物 S、A 各1.0 μl(15 pmol/L),TaqDNA 聚合酶 0.25 μl,用無菌去離子水補(bǔ)足總體積至25 μl。反應(yīng)條件為:預(yù)變性94℃ 5 min;94℃30 s,62℃ 45 s,72℃ 45 s,35 個循環(huán),最后 72℃延伸 5 min。擴(kuò)增片段長度為307 bp。

1.3.3 TaqⅠ酶切 酶切總體系20 μl,其中PCR擴(kuò)增產(chǎn)物8 μl,相應(yīng)緩沖液 1.5 μl,TaqⅠ內(nèi)切酶 1 U,加無菌去離子水補(bǔ)足總體積,于37℃水浴消化過夜。不含TaqⅠ(T^CGA)酶切位點(diǎn),只出現(xiàn)307 bp一個片段;含有該酶切位點(diǎn),被切成2個片段(209 bp、98 bp)。

1.3.4 多態(tài)性分析 取酶切產(chǎn)物10 μl,用2.5%的瓊脂糖凝膠(含溴乙啶)電泳,凝膠成像分析系統(tǒng)觀察結(jié)果并分析基因型。分型標(biāo)準(zhǔn):CC基因型為307 bp 1個片段,CT基因型為307、209、98 bp 3 個片段,TT 基因型為209 bp、98 bp 2 個片段。

1.3.5 PCR質(zhì)量控制措施 所有實(shí)驗(yàn)標(biāo)本的測定均在盲法下進(jìn)行,并隨機(jī)抽取10%樣本作重復(fù)性實(shí)驗(yàn),檢測PCR結(jié)果的可靠性。隨機(jī)選擇10%的標(biāo)本進(jìn)行PCR擴(kuò)增后直接測序,以驗(yàn)證酶切所得的基因型數(shù)據(jù)結(jié)果的準(zhǔn)確性。

1.4 統(tǒng)計學(xué)分析 (1)Hard-Weinberg Equilibrium分析(H-W平衡):本研究應(yīng)用H-W平衡軟件計算基因型的分布,P>0.05,則說明研究人群符合 H-W 平衡。(2)病例-對照分析(Case-Control Test):用SPSS13.0統(tǒng)計軟件處理數(shù)據(jù),采用 χ2檢驗(yàn),對病例組和對照組的一般資料(年齡、性別)及兩組基因型和等位基因頻率的分布進(jìn)行比較。

2 結(jié)果

樣品提取、PCR擴(kuò)增和酶切均獲成功,基因型測定的典型電泳結(jié)果見圖1,測序圖見圖2?;?、漢族兩組VDR基因TaqⅠ位點(diǎn)基因型和等位基因頻率的分布見組間有顯著差異(均P<0.05),但兩民族的CP組基因型和等位基因頻率分布無差異(χ2=0.074,P=0.785;χ2=0.072,P=0.788),表2、表3。

圖1 VDR基因rs731236位點(diǎn)限制性片段長度多態(tài)性

圖2 VDR基因TaqⅠ(rs731236)位點(diǎn)測序結(jié)果

表2 回族TaqⅠ(rs731236)位點(diǎn)基因型及等位基因頻率的分布〔n(%)〕

表3 漢族TaqⅠ(rs731236)位點(diǎn)基因型及等位基因頻率的分布〔n(%)〕

3 討論

牙周炎是發(fā)生在牙周支持組織上的慢性感染性疾病,是造成老年人失牙的最主要的原因〔3〕。其發(fā)病率因國家、地區(qū)和種族的不同而有所差別〔4〕并且早期臨床表現(xiàn)不明顯,就診時牙周組織往往已經(jīng)發(fā)生了不可逆的變化,進(jìn)而嚴(yán)重影響牙合系統(tǒng)的完整性和咀嚼功能,同時牙周炎會成為病灶影響全身的健康及加重一些全身疾病的進(jìn)展。隨著我國進(jìn)入老齡化社會,牙周病將成為突出的健康問題。

Michalowicz等〔5〕采用遺傳學(xué)經(jīng)典雙生子法揭示遺傳因素與牙周炎的發(fā)生、發(fā)展存在重要關(guān)系和近些年流行病學(xué)深入研究的雙重影響下,越來越多的證據(jù)表明不同宿主對牙周炎的易感性有很大差異,某些基因的遺傳多態(tài)性影響著牙周炎的發(fā)生、發(fā)展。文獻(xiàn)報道與牙周炎易感性有關(guān)的基因有:白細(xì)胞介素-1基因(IL-1)、VDR基因、腫瘤壞死因子α基因(TNF-α)、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)等。牙周炎的主要癥狀之一就是牙槽骨的吸收,牙槽骨是全身骨骼系統(tǒng)的一部分,也是全身骨骼系統(tǒng)中變化最為顯著的部分,其變化與牙齒的發(fā)育、萌出及乳、恒牙的替換、咀嚼功能的發(fā)揮和牙齒的移動等有關(guān)系。該變化反映出骨組織的改建過程,即破骨和成骨兩者相互平衡的生理過程〔6〕。VDR基因直接與骨密度代謝有關(guān),成為研究CP的一個熱點(diǎn)基因。

在我們的研究結(jié)果中:漢族和回族CP組及對照組均未出現(xiàn)TT基因型,這可能與TT基因型在中國漢族人群中的攜帶率低等因素有關(guān),還可能與樣本量較少有關(guān)。我國漢族人群TT基因型頻率為0.6%,與韓國人的分布頻率相似〔7〕,而遠(yuǎn)低于白種人的分布頻率(TT基因型頻率均為10% ~17%)〔6〕。關(guān)于TaqⅠ位點(diǎn)與CP的研究,國內(nèi)外學(xué)者在不同地區(qū)對不同種族的人群進(jìn)行了大量研究,結(jié)論有較大分歧。Nibali等〔8〕對英國79名CP和231名健康對照者進(jìn)行了研究;de Brito等〔9〕、Borges等〔10〕在巴西人群中分別進(jìn)行了研究;Tachi等〔11〕、Kobayashi等〔12〕在日本人群中分別進(jìn)行了該位點(diǎn)的研究;國內(nèi)王春先等〔13〕也進(jìn)行了該點(diǎn)的研究,他們的研究結(jié)果提示TaqⅠ SNP位點(diǎn)可能與CP的易感性有關(guān)。本研究結(jié)果同以上學(xué)者的研究結(jié)果一致,但與 Gunes等〔14〕、Sun 等〔15〕、還有章錦才等〔16〕的研究結(jié)果不同。對于研究結(jié)果的不一致可能與不同地區(qū)、不同種族的遺傳特征不同有關(guān),還可能與樣本量大小有關(guān)〔17〕。

關(guān)于TaqⅠ位點(diǎn)多態(tài)性的作用機(jī)制問題,有學(xué)者認(rèn)為:在基因的翻譯、表達(dá)過程中,蛋白質(zhì)的合成受mRNA 3'末端非翻譯區(qū)的調(diào)控,該區(qū)域的內(nèi)在特性影響著mRNA的穩(wěn)定性,它對RNA酶特別敏感,VDR基因TaqⅠ的酶切位點(diǎn)正位于該區(qū)域,如果該區(qū)域的堿基有任何改變,都會影響VDR基因的調(diào)控而影響VDR的表達(dá),如改變受體的數(shù)量,影響增強(qiáng)子對靶位的親和力或影響與維生素D的親和力〔18〕。

慢性牙周炎是多因素引起的炎癥性疾病,微生物是其發(fā)生的始動因子,某些全身性疾病、遺傳、環(huán)境和行為因素等也可能是其發(fā)病的危險因素。VDR基因直接與骨代謝有關(guān),不同地區(qū)、不同民族的遺傳學(xué)特征可能存在明顯差異。所以對于VDR基因多態(tài)性與CP之間的關(guān)系還需要在不同地區(qū)、不同民族之間進(jìn)行更大樣本的研究,并進(jìn)行以家系為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)研究,還要與其他可能的易感基因進(jìn)行連鎖分析。

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