郭慶,王忠躍,孔繁芳,武艷霞
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所植物病蟲害生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193)
1983年美國PE Cetus公司人類遺傳研究室的Kary Mullis發(fā)明了聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)[1],該體外核酸擴(kuò)增技術(shù)具有特異、敏感、產(chǎn)率高、快速、簡便、重復(fù)性好、易自動(dòng)化等突出優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究,成為分子生物學(xué)、鑒別遺傳疾病和快速檢測病毒和病菌感染必不可少的研究工具。1992年日本人Higuchi想實(shí)時(shí)觀察PCR反應(yīng)的全過程,最終達(dá)到檢測樣品中的DNA量的目的,最早提出了實(shí)時(shí)熒光定量PCR的設(shè)想[2,3],繼而由1996年美國Applied Biosystems公司首先推出實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)。由于傳統(tǒng)的PCR技術(shù)都是依賴于產(chǎn)物的終點(diǎn)濃度進(jìn)行分析的,存在不能準(zhǔn)確定量,且操作過程中易污染而使得假陽性率高等缺點(diǎn),使其應(yīng)用受到局限,直到近年來熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技術(shù)用于PCR定量后,上述問題才得到較好的解決[4],隨著實(shí)時(shí)熒光定量PCR的發(fā)明,此技術(shù)在不同研究領(lǐng)域都發(fā)揮出重要作用[5~8]。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,F(xiàn)Q-PCR)是在常規(guī)PCR技術(shù)基礎(chǔ)上把熒光共振能量轉(zhuǎn)移與熒光標(biāo)記探針相結(jié)合,并巧妙地把核酸擴(kuò)增、雜交、光譜分析和實(shí)時(shí)檢測技術(shù)融合在一起的一項(xiàng)創(chuàng)造性技術(shù),該技術(shù)不僅實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA模板的定量,它具有實(shí)時(shí)性、快速、靈敏、高通量、特異性強(qiáng)、自動(dòng)化程度高、重復(fù)性好、準(zhǔn)確定量等特點(diǎn)。
近年來,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)不斷完善,取得了突飛猛進(jìn)的發(fā)展。由于該技術(shù)本身的優(yōu)越性,被廣泛應(yīng)用于醫(yī)療檢測、藥物療效考核、基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究、基因檢測、病原體檢測、動(dòng)植物檢測、食品安全等不同研究領(lǐng)域[9,10]。目前,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)成為分子生物學(xué)研究中的重要工具[11~12],而在植物害蟲研究上的報(bào)道相對(duì)其他領(lǐng)域較少,但是隨著最近幾年實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的發(fā)展,有力地促進(jìn)了植物害蟲研究水平的提高,而且發(fā)揮著越來越重要的作用,已經(jīng)顯示出了極好的應(yīng)用前景。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理的基礎(chǔ)是熒光共振能量轉(zhuǎn)移原理,熒光共振能量轉(zhuǎn)移原理(fluorescence resonance energy transfer, FRET),是指當(dāng)一個(gè)熒光分子(供體分子)的發(fā)射光譜與另一個(gè)熒光分子(受體分子)的吸收光譜相重疊時(shí),且兩個(gè)集團(tuán)距離足夠近時(shí),能量可以從短波長(高能量)的熒光基團(tuán)傳遞到長波長(低能量)的熒光基團(tuán),相當(dāng)于短波長熒光集團(tuán)釋放的熒光被屏蔽,這個(gè)過程稱為FRET。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,擴(kuò)增產(chǎn)物不斷積累,熒光信號(hào)的強(qiáng)度不斷增加。每經(jīng)過一個(gè)循環(huán),收集一次熒光強(qiáng)度信號(hào),從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線,利用熒光信號(hào)積累強(qiáng)度的變化實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,在熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段,PCR產(chǎn)物量的對(duì)數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,最后在這一階段通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中有兩個(gè)非常重要的概念:熒光閾值和Ct值。熒光閾值是指在熒光擴(kuò)增曲線指數(shù)增長期設(shè)定的一個(gè)熒光強(qiáng)度標(biāo)準(zhǔn),一般這個(gè)閾值是以PCR反應(yīng)的前15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)作為熒光基礎(chǔ)信號(hào),熒光閾值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差10倍,如果檢測到的熒光信號(hào)超過閾值才被認(rèn)為是可信的信號(hào)。而在PCR擴(kuò)增過程中,擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)達(dá)到熒光閾值時(shí)所經(jīng)歷的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)被稱為Ct值,C代表循環(huán)(Cycle),T代表閾值(Threshold)[10]。對(duì)于Ct值與起始模板量關(guān)系的研究表明,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。因此只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上得到該樣品的起始拷貝數(shù)[11]。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR與傳統(tǒng)PCR相比,它具有諸多優(yōu)點(diǎn):⑴ 定量原理獨(dú)特,用產(chǎn)生熒光信號(hào)的多少來顯示擴(kuò)增產(chǎn)物的量,實(shí)現(xiàn)了動(dòng)態(tài)實(shí)時(shí)連續(xù)熒光監(jiān)測,可視性強(qiáng);⑵ 不需要PCR反應(yīng)后的處理,而且只須在加樣時(shí)打開一次蓋子,大大降低了污染的可能性;⑶ 可以在很大濃度范圍內(nèi)(>10倍)進(jìn)行定量,有較高的靈敏度、特異性和精確性;⑷ 既可以做定性分析又可以做定量分析[13~14]。同時(shí)該技術(shù)也與傳統(tǒng)的PCR技術(shù)相比還有其不足之處:⑴ 由于減少了擴(kuò)增后電泳的檢測步驟,因此不能監(jiān)測擴(kuò)增產(chǎn)物的大小。⑵ 在標(biāo)準(zhǔn)曲線定量中,由于沒有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),各實(shí)驗(yàn)室所用的生成標(biāo)準(zhǔn)曲線的標(biāo)準(zhǔn)樣品各不相同,致使試驗(yàn)結(jié)果缺乏可比性;⑶ 試驗(yàn)成本太高,也限制了其的應(yīng)用范圍;⑷ 由于該技術(shù)極其靈敏,所以對(duì)實(shí)驗(yàn)操作的精確度要求較高。
根據(jù)熒光基團(tuán)標(biāo)記和實(shí)現(xiàn)能量共振轉(zhuǎn)移方式的不同,目前實(shí)時(shí)熒光定量PCR應(yīng)用比較廣泛的為四大類,分別是熒光染料(SYBR Green)、水解探針(Tapman)、雜交探針、分子信標(biāo),除此以外還有熒光標(biāo)記引物,復(fù)合探針法,Lighf-uP、Cyclicons、LUXt、Scorpion、Amplifluor等[15~17]。
SYBR Green是一種能與dsDNA特異結(jié)合的染料,在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR Green,SYBR Green特異地與dsDNA結(jié)合,發(fā)出熒光信號(hào)[18]。DNA結(jié)合染色的方法不需要使用特異性熒光標(biāo)記的探針,相對(duì)簡便,同時(shí)也降低了檢測的成本,其特異性完全由PCR的引物所決定。其主要不足是:染料與DNA雙鏈分子的結(jié)合是非特異性的,它可以和反應(yīng)體系中所有DNA分子結(jié)合,易受到非特異性擴(kuò)增和引物二聚體的影響,產(chǎn)生熒光干擾,實(shí)驗(yàn)容易產(chǎn)生假陽性信號(hào),使定量結(jié)果不可靠。不過目前可以用熔解曲線分析來區(qū)分特異性和非特異性擴(kuò)增,引物的設(shè)計(jì)和反應(yīng)條件的優(yōu)化對(duì)消除非特異性熒光也有很大幫助。
目前在實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中應(yīng)用較多的水解探針是Tapman探針。探針5’端標(biāo)記一個(gè)熒光基團(tuán),3’端一個(gè)淬滅基團(tuán)。探針完整時(shí)熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),所以檢測不到該探針5’端熒光基團(tuán)發(fā)出的熒光。在PCR擴(kuò)增過程中,由于Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針的熒光基團(tuán)切下,熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)遠(yuǎn)離,不能發(fā)生FRET而產(chǎn)生熒光信號(hào),每擴(kuò)增一條DNA鏈就有一個(gè)游離的熒光分子形成,可通過檢測系統(tǒng)觀察到信號(hào)的變化,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。利用標(biāo)準(zhǔn)品模板系列繪制出標(biāo)準(zhǔn)曲線,結(jié)合各樣品的Ct值,可確定樣品的起初模板量[19]。美國ABI公司推出另外一種水解探針為Tapman-MGB探針,它與Taqman探針相比能更好地穩(wěn)定探針與模板的雜交,升高探針Tm值[20],使較短的探針同樣能達(dá)到較高的Tm值,簡化了探針的設(shè)計(jì),更有益檢測單堿基突變。另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是由于其長度短于Taqman探針,熒光和淬滅基團(tuán)的距離更近,淬滅效果更好,而使熒光背景更低。
雜交探針技術(shù)主要是使用兩個(gè)特異的探針,其中上游的探針的3’端標(biāo)記供體熒光基團(tuán),而下游的探針的5’端標(biāo)記有受體熒光基團(tuán)。在PCR模板退火階段,兩探針同時(shí)與目的基因發(fā)生頭尾結(jié)合形式的特異性結(jié)合,使供體和受體熒光基團(tuán)距離非常接近,兩者產(chǎn)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移,使得受體熒光基團(tuán)發(fā)出熒光,當(dāng)兩探針處于游離狀態(tài)時(shí),無熒光產(chǎn)生。由于反應(yīng)中運(yùn)用了兩個(gè)探針,因此增加了方法的特異性,但兩個(gè)探針結(jié)合于模板上影響擴(kuò)增效率。
分子信標(biāo)技術(shù)是在同一探針的兩末端分別標(biāo)記熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán),為一種標(biāo)記熒光的發(fā)夾探針。在未與模板發(fā)生雜交前該探針分子呈發(fā)夾結(jié)構(gòu),結(jié)合在其兩端的熒光基團(tuán)距離上接近,產(chǎn)生能量轉(zhuǎn)移效應(yīng),不發(fā)生熒光。當(dāng)該探針與模板雜交,使熒光基團(tuán)與淬滅熒光基團(tuán)彼此在空間上產(chǎn)生足夠的分離,熒光基團(tuán)脫離了淬滅基團(tuán)的影響,從而產(chǎn)生可被檢測到的熒光。熒光的強(qiáng)度與溶液中模板的量成正比,因此可用于PCR定量分析[21],若目標(biāo)DNA序列同分子信標(biāo)不能完全配對(duì),雜交過程和信號(hào)不會(huì)出現(xiàn)。若在發(fā)夾結(jié)構(gòu)中熒光標(biāo)記物不能緊靠淬滅基團(tuán),會(huì)產(chǎn)生很強(qiáng)的背景信號(hào)。若分子信標(biāo)內(nèi)雜交過強(qiáng),會(huì)妨礙同目標(biāo)DNA分子的雜交,使得熒光信號(hào)不能充分釋放。最佳的分子信標(biāo)應(yīng)有合適的熔鏈特性。分子信標(biāo)可檢測單個(gè)核苷酸的突變,適于SNP分析和等位基因突變分析。但設(shè)計(jì)較難,既要避免產(chǎn)生強(qiáng)的背景信號(hào),又要避免莖部雜交過強(qiáng),影響其與模板退火,從而影響熒光生成。
在實(shí)時(shí)熒光定量PCR中,有兩種定量模板的方法:絕對(duì)定量和相對(duì)定量。絕對(duì)定量指用已知的標(biāo)準(zhǔn)曲線來推算未知的樣本量;相對(duì)定量指在一定樣品中靶序列相對(duì)于另一參照序列的量的變化[22]。
相對(duì)定量指的是在一定樣本中靶序列相對(duì)于另一參照樣本的量的變化。此方法與絕對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)曲線法基本相似,不同之處是未知樣品的量是相對(duì)于某個(gè)參照物的量而言。因此,相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)曲線比較容易制備,對(duì)于所用的標(biāo)準(zhǔn)品只需知道其稀釋度即可。
絕對(duì)定量指的是用已知的標(biāo)準(zhǔn)曲線來推算未知的樣本的量。此方法標(biāo)準(zhǔn)品的量是預(yù)先已知的。將標(biāo)準(zhǔn)品稀釋成不同濃度的樣品,并作為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。以標(biāo)準(zhǔn)品拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)值為橫坐標(biāo),以測得的Ct值為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。對(duì)未知樣品進(jìn)行定量時(shí),根據(jù)未知樣品的Ct值,即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線中得到樣品的拷貝數(shù)。質(zhì)粒DNA和體外轉(zhuǎn)錄的RNA常作為絕對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品。
即△Ct值法,此方法是同時(shí)擴(kuò)增待測靶基因片段和一個(gè)作為內(nèi)參照的基因片段,一般是一個(gè)內(nèi)源性管家基因片段。通過測兩者的Ct值之差(△Ct),比較不同待測標(biāo)本DNA的△Ct值與正常標(biāo)本DNA的△Ct值的變化,可對(duì)未知標(biāo)本靶基因的原始拷貝數(shù)作出判斷。
目前,實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)應(yīng)用于植物害蟲鑒定、防治等研究相對(duì)其他領(lǐng)域較少,但該技術(shù)在植物害蟲、植物病原線蟲和害螨研究中已經(jīng)顯示出了極好的應(yīng)用前景。
傳統(tǒng)的植物害蟲鑒定方法依賴于形態(tài)特征和寄主范圍等特征來區(qū)分,但是對(duì)于一些植物害蟲之間的區(qū)分比較困難,尤其是檢疫性植物害蟲實(shí)蠅類,薊馬類等,而實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)是解決這一問題的可靠手段。余道堅(jiān)[23]應(yīng)用TaqMan探針和SYBR Green實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),分別建立了兩種快速鑒定重要檢疫性害蟲辣椒實(shí)蠅(Bactrocera latifrons)的方法。同時(shí)余道堅(jiān)等[24]還應(yīng)用SYBR Green實(shí)時(shí)定量熒光PCR技術(shù),分別建立了SYBR Green實(shí)時(shí)熒光PCR快速鑒定菲立濱實(shí)蠅(bactrocera philippinensis)和芒果實(shí)蠅(bactrocera occiptalis)的方法。實(shí)現(xiàn)了對(duì)檢疫性實(shí)蠅快速準(zhǔn)確的鑒定。徐浪等[25]應(yīng)用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法,實(shí)現(xiàn)了對(duì)形態(tài)學(xué)方法很難鑒別的大洋臀紋粉蚧(Planococcus minor)和南洋臀紋粉蚧(Planococcus lilaciu)進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定,從而達(dá)到快速鑒定檢疫性粉蚧的目的。K.Walsh等[26]利用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),建立了快速鑒定重要檢疫性害蟲南黃薊馬(Thrips palmi)的方法。K.S.Huang等[27]也應(yīng)用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)建立了快速鑒定重要檢疫性害蟲西花薊馬(Frankliniella occidentalis)的方法。
另外,實(shí)時(shí)定量PCR還可以用來檢測土壤中的害蟲。KAREN HERBERT等[28]利用TaqMan熒光定量PCR技術(shù),結(jié)合土壤DNA的提取,對(duì)土壤中葡萄根瘤蚜(Daktulosphaira vitifoliae)若蟲進(jìn)行了檢測,表明實(shí)時(shí)熒光定量PCR在檢測土壤中植物害蟲和監(jiān)測種群動(dòng)態(tài)變化方面具有很好的前景。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在植物害蟲生理研究中也有很好應(yīng)用前景。崔旭紅等[29]利用TaqMan-MGB探針和特異性引物構(gòu)建了B型煙粉虱(Bemisia tabaci)hsp70實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測體系,對(duì)HSP70在B型煙粉虱抵抗高溫脅迫中的作用進(jìn)行研究。翟會(huì)芳等[30]也構(gòu)建了實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR體系,研究了HSP90在甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)幼蟲抗高溫中的作用。證明了該技術(shù)是研究植物害蟲抗逆性和相關(guān)基因表達(dá)的理想工具。Kanako Komaki等[31]利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR和熒光測定法對(duì)各蟲態(tài)豌豆蚜(Acyrthosiphon pisum)細(xì)胞內(nèi)共生細(xì)菌(Buchnera)的基因拷貝數(shù)進(jìn)行了研究,證明了該技術(shù)是研究植物害蟲體內(nèi)共生菌變化的靈敏工具。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR植物害蟲防治研究中也有出色的表現(xiàn)。Lei等[32]利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)酚氧化酶原-2(PxPPO2)在小菜蛾(Plutella xylostella)不同蟲態(tài)中的轉(zhuǎn)錄量進(jìn)行研究,可以通過降低PxPPO2的轉(zhuǎn)錄水平開發(fā)新型性殺蟲劑。張清平等[33]利用基于綠僵菌rDNA基因片段設(shè)計(jì)的PCR引物對(duì)、優(yōu)化的DNA制備方法以及熒光定量PCR技術(shù),對(duì)早期東亞飛蝗(Locusta migratoria manilensis)體內(nèi)的病原真菌DNA進(jìn)行簡便、快速、靈敏、準(zhǔn)確的檢測,并確定病原真菌在其內(nèi)的增殖速率和動(dòng)態(tài)變化。楊和平等[34]利用熒光定量PCR技術(shù)檢測了甜菜夜蛾病毒殺蟲劑中甜菜夜蛾核型多角體病毒有效含量。證明了熒光定量PCR技術(shù)可以用于殺蟲劑有效生物含量的測定。James A.Anstead等[35]利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)建立了準(zhǔn)確檢測導(dǎo)致桃蚜(Myzus persicae)對(duì)擬除蟲菊酯類殺蟲劑產(chǎn)生抗藥性的兩個(gè)基因突變位點(diǎn)L1014F(kdr)和 M918T(super-kdr)。Y.P.Chen等[36]利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)舞毒蛾(Lymantria dispar)被刻絨繭蜂(Glyptapanteles indiensis)寄生后不同時(shí)期不同組織中的GiPDV 1.1的表達(dá)量進(jìn)行檢測,證明該方法是一種可用于基因表達(dá)分析很好的工具。
近年來,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)也開始的應(yīng)用于植物病原線蟲和害螨的研究,并獲得很好的研究成果。王焱等[37]分別用特異性引物法、ITS-PCR-RFLP法和實(shí)時(shí)熒光PCR法對(duì)松材線蟲進(jìn)行了檢測,結(jié)果表明實(shí)時(shí)熒光PCR法耗時(shí)短,靈敏度高,適合用于松材線蟲的檢驗(yàn)檢疫。國內(nèi)外多篇文獻(xiàn)均有報(bào)道了應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),不僅能快速、準(zhǔn)確的對(duì)松材線蟲(Bursaphelenchus xylophilus)進(jìn)行鑒定,也能夠?qū)€蟲進(jìn)行定性和定量分析[38~41]。王明旭等[42]利用松材線蟲(Bursaphelenchus xylophilus)和擬松材線蟲(B.mucronatus)的rDNA-ITS2種間差異顯著特性,設(shè)計(jì)TaqMan探針,用實(shí)時(shí)熒光PCR的檢測方法能準(zhǔn)確地區(qū)別2種線蟲。Berry等[43]建立了爪哇根結(jié)線蟲(Meloidogyne javanica),玉米根腐線蟲(Pratylenchus zeae)和桑大型針線蟲(Xiphinema elongatum)的實(shí)時(shí)熒光定量 PCR檢測方法,對(duì)寄生甘蔗的三種線蟲實(shí)現(xiàn)了靈敏,準(zhǔn)確的檢測和定量。王翀等[44]設(shè)計(jì)鱗球莖莖線蟲(Ditylenchus dipsaci)特異的TaqMan 探針,建立了實(shí)時(shí)熒光 PCR 檢測方法。賀俊飛等[45]利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測中華卵索線蟲(Ovomermis sinensis)體內(nèi)tra-1基因表達(dá)量,研究tra-1基因在中華卵索線蟲雌性生殖系統(tǒng)的發(fā)育、卵的形成以及胚胎的發(fā)育中的調(diào)控作用。Madani等[46]利用SYBR Green實(shí)時(shí)熒光定量,對(duì)馬鈴薯胞囊線蟲(Globodera pallida)以及甜菜胞囊線蟲(Heterodera schachtii)進(jìn)行檢測和定量。Zhang等[47]利用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR定量檢測潛在植物寄生線蟲生防菌-洛斯里被毛孢子的種群密度,研究食線蟲真菌的DNA量和被寄生線蟲的百分比之間的關(guān)系,并可結(jié)合生物測定監(jiān)測土壤真菌的生物量和活性效果。李明等[48]運(yùn)用real-time PCR分析冷激和熱激后HSP70基因TCHSP70-4在朱砂葉螨體內(nèi)的表達(dá)量,對(duì)朱砂葉螨(Tetranychus cinnabarinus(Boisduval))熱激蛋白HSP70的表達(dá)與其適應(yīng)高溫和低溫脅迫的關(guān)系進(jìn)行了研究。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是近年來發(fā)展起來的新的檢測方法,與常規(guī)RT-PCR相比具有明顯優(yōu)越的靈敏度、特異性、穩(wěn)定性和操作簡便的特點(diǎn),但仍有些問題需解決,如自動(dòng)化儀器﹑試劑及其檢測的成本等。近些年來,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)還廣泛應(yīng)用于植物營養(yǎng)學(xué)研究、植物發(fā)育學(xué)研究、植物抗逆機(jī)理研究、轉(zhuǎn)基因植物的檢測、植物與微生物互作機(jī)理研究、植物抗病性檢測、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、環(huán)境對(duì)植物基因表達(dá)的影響等方面[49]。在植物病蟲害研究的許多領(lǐng)域顯現(xiàn)出它的優(yōu)越性,并開始被廣泛應(yīng)用。
許多科研工作者基于熒光PCR的基本原理對(duì)熒光PCR技術(shù)進(jìn)行不斷深入的研究和改進(jìn),使熒光PCR技術(shù)得到了進(jìn)一步的完善,并在此基礎(chǔ)上開發(fā)出了許多新的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)。而實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)與生物基因芯片技術(shù)結(jié)合會(huì)使FQ-PCR技術(shù)進(jìn)一步完善,可提高其在生命科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用范圍和普及程度,F(xiàn)Q-PCR將成為未來植物害蟲研究的必備工具,在植物保護(hù)領(lǐng)域?qū)⒌玫礁訌V泛的應(yīng)用。
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致謝:承蒙中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所馮潔研究員審閱、修改本文。