倪志華, 陳景春, 張玉明, 葛大勇,趙曉輝, 王淑芳
1.河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,保定 071002;2.河北大學(xué)物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,保定 071002
蛋白質(zhì)的折疊與去折疊是結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域的重要研究方向[1]。采用物理或化學(xué)的方法改變蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu),進(jìn)而使用光譜學(xué)和生物學(xué)方法研究蛋白質(zhì)的去折疊過(guò)程,是目前結(jié)構(gòu)生物學(xué)廣泛采用的技術(shù)路線(xiàn)之一[2~6]。隨著激光生物學(xué)的發(fā)展,激光在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的應(yīng)用得到了廣泛關(guān)注。Zhang等[7]成功使用激光偏振光技術(shù)檢測(cè)了生物芯片的抗體蛋白,令激光替代傳統(tǒng)熒光標(biāo)記技術(shù)無(wú)損檢測(cè)生物芯片顯示出誘人的應(yīng)用前景,同時(shí),也使激光輻照與蛋白質(zhì)作用關(guān)系的研究顯得尤為迫切。Yasuyuki[8]和Oujja[9]分別報(bào)道了激光輻照對(duì)蠶絲蛋白和膠原蛋白的影響,結(jié)果顯示,高強(qiáng)度激光輻照會(huì)顯著改變蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu);Soustov[10]使用308 nm XeCl準(zhǔn)分子激光輻照眼晶狀體蛋白,發(fā)現(xiàn)激光引發(fā)了蛋白質(zhì)的光聚合現(xiàn)象;Yoshikawa等[11]使用飛秒激光器考察激光與葡萄糖異構(gòu)酶的相互作用,探討了不同波長(zhǎng)和能量的激光對(duì)蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的影響。目前的文獻(xiàn)多側(cè)重于報(bào)道激光輻照引起的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化,然而,蛋白質(zhì)多具有生物活性,綜合考察激光輻照引起的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、生物活性及分子水平構(gòu)效關(guān)系的變化,具有更為重要的理論意義,并且可為生物芯片檢測(cè)裝備的研制提供必要的技術(shù)支持。
溶菌酶 (lysozyme,EC3.2.1.7)是一種單體球蛋白,由129個(gè)氨基酸組成,含有4對(duì)二硫鍵,6個(gè)色氨酸 (Trp),分子中不含有其它非氨基酸的組分,在生化領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。溶菌酶的分子結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單明確,且分子內(nèi)的色氨酸可作為內(nèi)源熒光探針[12],是研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化的良好模型。本文中,我們利用308 nm的XeCl準(zhǔn)分子激光器處理溶菌酶,借助熒光光譜和核磁共振技術(shù)分析了蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)變化,并結(jié)合電泳技術(shù)及生物活性測(cè)定等生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法,考察了激光輻照對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響。
溶菌酶為 Sigma公司進(jìn)口分裝,溶菌酶活性測(cè)定試劑盒為南京建成科技有限公司產(chǎn)品,D2O為美國(guó)Cambridge Isotope Laboratories,Inc.產(chǎn)品,其它試劑均為分析純。
溶菌酶溶液用20mmol/L NaAc-HAc緩沖液 (pH5.2)配制。
XeCl準(zhǔn)分子激光器為美國(guó)Coherent公司產(chǎn)品,型號(hào)為Compex Pro205,輸出波長(zhǎng)308 nm,脈寬為20 ns;穩(wěn)態(tài)瞬態(tài)熒光光譜儀為英國(guó)Edinburgh Instruments公司產(chǎn)品,型號(hào)為FLS 920;蛋白電泳儀為美國(guó)BIO-RAD公司產(chǎn)品,型號(hào)為BIO-RAD Model 250/2.5;核磁共振光譜儀為瑞士Bruker公司產(chǎn)品,型號(hào)為Bruker AVANCEⅢ 600MHz。
溶菌酶溶液的濃度為2.5 g/L。使用XeCl準(zhǔn)分子激光器 (激光波長(zhǎng)308 nm,能量密度0.3m J/mm2,頻率5 Hz,光斑面積1 cm×4 cm)輻照處理,脈沖數(shù)分別為25、50、100、200、600、1200、1800、3600和7200,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中保持25℃的恒溫。輻照處理后,立即進(jìn)行分析檢測(cè),取未經(jīng)輻照處理的樣品為對(duì)照。
激發(fā)波長(zhǎng)定為295 nm, (25±1)℃下掃描3次,掃描波長(zhǎng)范圍為300~450 nm。熒光光譜激發(fā)光譜分辨率為3 nm,發(fā)射光譜分辨率為1 nm。
依檢測(cè)試劑盒中的空白對(duì)照法測(cè)定溶菌酶輻照處理后的生物活性,與未經(jīng)輻照處理的對(duì)照樣品進(jìn)行比較分析。
為研究激光輻照后溶菌酶的存在形式和分子間的作用機(jī)制,參考邊六交等人[13]的方法,以還原和非還原SDS-PAGE法檢測(cè)溶菌酶結(jié)構(gòu)的變化。SDS-PAGE分析使用常規(guī)的蛋白質(zhì)電泳方法[14]。
以含5%D2O的20mmol/L NaAc-HAc緩沖液配置1mmol/L的溶菌酶溶液,分別輻照處理1800、3600和7200個(gè)脈沖后,分析溶菌酶1H譜的變化。操作參考Bachmann等[15]的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行。
圖1 溶菌酶溶液在280~350 nm波長(zhǎng)的吸收光譜Fig.1 Absorption spectrum of lysozym e so lution at the wavelength of 280~350 nm
圖2 XeCl輻照后溶菌酶體系的熒光光譜 從上到下依次是溶菌酶溶液經(jīng)XeCl激光輻照25、50、100、200、0(對(duì)照)、600、1200、1800、3600和7200個(gè)脈沖后,蛋白激發(fā)光譜的變化情況 (激發(fā)光波長(zhǎng)為295 nm)Fig.2 lntrinsic relative fluorescence intensity(RFI)of lysozym e after laser irradiation From top to bottom:changes of protein excitation spectrum of lysozyme solution after XeCl laser irradiation of 25,50, 100,200,0(control),600,1200,1800,3600 and 7200 pulse(excitation light wavelength is 295 nm)
圖1為2.5 g/L溶菌酶溶液的吸收光譜。由于溶菌酶分子內(nèi)含有色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸,其最大吸收波長(zhǎng)為295 nm,且在308 nm處有較強(qiáng)吸收,其摩爾吸收系數(shù)ε分別為5645和3240。
圖2顯示了激光輻照后溶菌酶熒光光譜的變化。由圖可見(jiàn),其333 nm處的內(nèi)源熒光強(qiáng)度出現(xiàn)了有規(guī)律的變化,與未經(jīng)輻照處理的對(duì)照樣品相比,在25個(gè)脈沖的激光輻照后,溶菌酶的內(nèi)源熒光強(qiáng)度有所加強(qiáng),之后,隨著輻照脈沖數(shù)的增大,內(nèi)源熒光強(qiáng)度又逐漸減弱,但在200個(gè)脈沖以?xún)?nèi),熒光強(qiáng)度均高于對(duì)照組。在高于200個(gè)脈沖的激光處理后,溶菌酶的內(nèi)源熒光強(qiáng)度進(jìn)一步減弱,并且出現(xiàn)了紅移 (36 nm),這在圖3中也可以看到。
內(nèi)源熒光探針色氨酸的最大發(fā)射波長(zhǎng)為334 nm左右,熒光強(qiáng)度的大小與色氨酸微環(huán)境的疏水性相關(guān)[16]。當(dāng)溶菌酶的分子結(jié)構(gòu)發(fā)生去折疊變性,即肽鏈由緊密有序的球狀結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)為松散的長(zhǎng)鏈狀態(tài),色氨酸所處微環(huán)境的疏水性降低,熒光強(qiáng)度也隨之降低。經(jīng)200個(gè)及以上脈沖的激光處理后,熒光強(qiáng)度的變化及最大發(fā)射波長(zhǎng)的紅移現(xiàn)象,也驗(yàn)證了這一點(diǎn)。
200個(gè)脈沖的激光輻照前,333 nm處的熒光強(qiáng)度出現(xiàn)了增高現(xiàn)象,這可能是由于低劑量的激光處理使溶菌酶的分子結(jié)構(gòu)發(fā)生“微調(diào)”,色氨酸遠(yuǎn)離了周?chē)臒晒獯銣缁鶊F(tuán),從而使熒光強(qiáng)度暫時(shí)增加。這與潘婷婷等[17]對(duì)溶菌酶的研究結(jié)果一致,說(shuō)明激光輻射對(duì)蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的變化具有階段性作用。
如圖3所示,隨著輻照脈沖數(shù)的增加,溶菌酶的活力出現(xiàn)先上升再下降的趨勢(shì)。低于200個(gè)脈沖的激光輻照,對(duì)溶菌酶的生物活性具有激活作用。隨著輻照脈沖數(shù)的繼續(xù)增加,溶菌酶的活力迅速降低。說(shuō)明高強(qiáng)度的激光破壞了溶菌酶分子的高級(jí)結(jié)構(gòu),導(dǎo)致其生物活性的逐步喪失。
溶菌酶的生物活性以200個(gè)脈沖輻照為臨界點(diǎn)變化的趨勢(shì),與熒光光譜分析的結(jié)果相互印證。說(shuō)明低劑量熒光輻照引起的分子結(jié)構(gòu)的“微調(diào)”,有助于增強(qiáng)溶菌酶的生物活性,這與楊芳等[18]鹽酸胍處理溶菌酶的試驗(yàn)結(jié)果一致。而且,此結(jié)果還間接支持了被廣泛認(rèn)可的低能量激光輻照具有臨床醫(yī)療價(jià)值的理論[19]。
圖3 溶菌酶體系在XeCl輻照后熒光光譜的紅移及酶活變化情況Fig.3 Red shift and relative activity of lysozym e after XeCl laser irradiation
取激光輻照后的溶菌酶樣品,分別與還原樣品液和非還原樣品液混合,進(jìn)行SDS-PAGE電泳。結(jié)果顯示,隨著輻照脈沖數(shù)的增加,溶菌酶分子出現(xiàn)了聚合現(xiàn)象。溶菌酶在被50個(gè)脈沖的激光輻照后出現(xiàn)二聚體,200個(gè)脈沖輻照后出現(xiàn)二聚體和三聚體,600個(gè)脈沖輻照后,又逐漸出現(xiàn)了四聚體,如圖4、圖5所示;經(jīng)巰基乙醇還原后,溶菌酶在100個(gè)脈沖的激光輻射后才出現(xiàn)二聚體,1800個(gè)脈沖輻照后出現(xiàn)三聚體,3600個(gè)脈沖輻照后出現(xiàn)四聚體。在兩種情況下,二聚體的數(shù)量都隨著輻照脈沖數(shù)的增加而增加。
由此可知,一部分聚合是由于溶菌酶形成了分子間的二硫鍵,也有一部分二聚體是由于溶菌酶形成了淀粉樣沉淀,這些聚合體在加入巰基乙醇還原劑后不能打開(kāi),說(shuō)明可能有其他的結(jié)合方式參與了聚合體的形成,比如強(qiáng)的非共價(jià)相互作用等。邊六交等[13]在研究變性溶菌酶的稀釋復(fù)性過(guò)程時(shí),也有過(guò)類(lèi)似的報(bào)道。
1H-NMR譜的結(jié)果表明,溶菌酶的Trp111、Trp63和Trp62經(jīng)激光輻照后的化學(xué)位移發(fā)生了變化 (圖5),且隨著輻照脈沖數(shù)的增加而加大。因溶菌酶在308 nm處有較強(qiáng)的吸收,對(duì)此波長(zhǎng)的激光敏感,高級(jí)結(jié)構(gòu)易于被破壞。因此,推測(cè)激光輻照后溶菌酶的空間結(jié)構(gòu)受到了影響。
圖4 溶菌酶經(jīng)XeCl激光輻照后的SDS-PAGE (A)SDS-非還原電泳結(jié)果;(B)SDS-還原電泳結(jié)果。M:蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)分子量;1~10:依次是溶菌酶溶液經(jīng)XeCl激光輻照0(對(duì)照)、25、50、100、200、600、1200、1800、3600和7200個(gè)脈沖后的結(jié)果Fig.4 SDS-PAGE of lysozym e a fter XeCl laser irradiation (A)Non-reducing SDS-PAGE; (B)Reducing SDS-PAGE.M:Protein marker;1~10:Results of lysozyme solution after XeCl laser irradiation of 0(control),25,50,100,200,600,1200,1800,3600 and 7200 pulse
圖5 激光輻照后溶菌酶結(jié)構(gòu)變化的1H-NMR譜 從上到下的輻照脈沖數(shù)分別是0、1800、3600和7200Fig.5 1H-NMR study of lysozym e a fter laser irradiation Numbers of laser irradiation pulse (from top to bottom)are 0,1800,3600 and 7200
溶菌酶經(jīng)308 nm XeCl準(zhǔn)分子激光輻照后,其熒光光譜、活性和電泳行為都發(fā)生了改變。低脈沖數(shù)的激光輻照對(duì)溶菌酶有一定的激活作用,表現(xiàn)為熒光強(qiáng)度增高和活性增強(qiáng),但是,隨著輻照脈沖數(shù)的繼續(xù)增加,溶菌酶分子發(fā)生了聚合,熒光強(qiáng)度降低,活性喪失,色氨酸1H的化學(xué)位移也發(fā)生了變化,說(shuō)明高級(jí)結(jié)構(gòu)的變化使得溶菌酶的功能逐漸喪失。
本實(shí)驗(yàn)就激光輻照對(duì)酶的影響機(jī)制作了初步探索,為激光輻照誘導(dǎo)蛋白質(zhì)去折疊機(jī)制的研究提供了實(shí)驗(yàn)參考。
1. Baker TA.Protein unfolding trapped in the act.Nature, 1999,401:29~30
2.Tan CY,Xu CH,Ruan KC.Folding studies of two hydrostatic pressure sensitive proteins. Biochim Biophys Acta,2006,1764(3):481~488
3.鐘葵,胡小松,吳繼紅,陳芳,廖小軍.高壓脈沖電場(chǎng)對(duì)脂肪氧化酶二級(jí)和三級(jí)構(gòu)象的影響效果.光譜學(xué)與光譜分析,2009, 29(3):765~768 Zhong K,Hu XS,W u JH,Chen F,Liao XJ.Effects of high pulsed electric field on the secondary and tertiary structure of lipoxygenase.Spectrosc Spect Anal,2009, 29(3):765~768
4.Subhankar P,Madhuchhanda K,Kali PD,Saroj M,Tapan KC. Unfolding studies of Escherichia co li m altodextrin glucosidase monitored by fluorescence spectroscopy.J Bio l Phys,2008,34:539~550
5.John JB,Elizabeth JJ,Robert JL.Nonresonant fem tosecond laser vaporization of aqueous protein preserves folded structure. Proc Natl Acad Sci USA, 2011, 108(30): 12217~12222
6.Salvetti G,Tombari E.The endotherm ic effects during denaturation of lysozyme by temperature modulated calorimetry and an intermediate reaction equilibrium.J Phys Chem B,2002,106(23):6081~6087
7.Zhang HY,Lu H,LiW,Liang RQ,Jin KJ,Zhou YL,Ruan KC,Yang GZ.Detection of m icroarray protein biomolecules by oblique-incidence reaectivity difference technique without labelling agents.Chin Physics B,2008,17(6):2288~2291
8. Yasuyuki T,Masaharu G,Akira I.Pulsed laser deposition of silk protein: Effect of photosensitized-ablation on the secondary structure in thin deposited film s.J Appl Phys, 2001,89(12):7917~7923
9. Oujja M,Rebollar E,Abrusci C,Am o AD,Catalina F, Castillejo M. UV, visible and IR laser interaction w ith gelatine.J Phys:Conf Ser,2007,59:571~574
10.Soustov LV,Chelnokov EV,Sapogova NV,Bityurin NM, Nemov VV,Sergeev YV,Ostrovsky MA.Aggregation of crystallins induced by pulsed laser UV light(308 nm). Biophysics,2008,53(4):273~282
11.Yoshikawa HY,Murai R,Hasenaka H,Takahashi Y, Maruyama M, Sugiyama S, Adachi H, Takano K, Matsumura H,Murakam i S,Inoue T,Mori Y.Influence of energy and wavelength on fem tosecond laser-induced nucleation of protein.Chem Phys Lett,2011,510:139~142 12.Tayeh N,Rungassam y T,Albani JR.Fluorescence spectral resolution of tryptophan residues in bovine and human serum album ins.J Pharm aceut Biom ed,2009,50:107~116
13.邊六交,梁長(zhǎng)利,楊曉燕,劉莉.非還原脲變性蛋白溶菌酶稀釋復(fù)性過(guò)程中集聚現(xiàn)象的研究.化學(xué)學(xué)報(bào),2007,65(24): 2891~2897 Bian LJ,Liang CL,Yang XY,Liu L.Aggregation interaction am ong non-reducing egg white lysozymes denatured by urea during their refolding.Acta Chim Sin,2007,65(24): 2891~2897
14.郭堯君.蛋白質(zhì)電泳實(shí)驗(yàn)技術(shù).北京:科學(xué)出版社,1999. 123~160 Guo YJ.Experimental technology of protein eletrophoresis. Beijing:Science Press,1999.123~160
15.Bachmann A,Segel D,Kiefhaber T.Test for cooperativity in the early kinetic intermediate in lysozyme folding. Biophys Chem,2002,96:141~151
16.Albani JR.New insights in the interpretation of tryptophan fluorescence.J Fluoresc,2007,17:406~417
17.潘婷婷,儲(chǔ)艷秋,張劍霞,吳波,吳梁,丁傳凡.電噴霧質(zhì)譜研究乙腈誘導(dǎo)的溶菌酶的構(gòu)象變化.復(fù)旦學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2008,47(4):449~460 Pan TT,Chu YQ,Zhang JX,Wu B,Wu L,Ding CF. Acetonitrile induced conformational transitions of lysozyme studied by electrospray ionization mass spectrom etry. J Fudan Univ(Nat Sci),2008,47(4):449~460
18.楊芳,梁毅,楊芳(小).脲和鹽酸胍誘導(dǎo)溶菌酶去折疊的熒光相圖法研究.化學(xué)學(xué)報(bào),2003,61(6):803~807 Yang F,Liang Y,Yang F(xiao).Unfolding of lysozym e induced by urea and guanidine hydrochloride studied by phase diagram m ethod of fluorescence.Acta Chim Sin, 2003,61(6):803~807
19.Aimbire F,de Lima FM,Villaverde AB,Albertini R,de O liveira APL, Neto HCCF. Low-level laser therapy associated to N-acetylcysteine lowers macrophage inflammatory protein-2 (MIP-2) m RNA expression and generation of intracellular reactive oxygen species in alveolar m acrophages.Photom ed Laser Surg,2010,28(6): 763~771