劉逸寒,路福平,王建玲,胡 博
(工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457)
中溫α-淀粉酶基因的克隆及在枯草芽孢桿菌中的高效表達(dá)
劉逸寒,路福平,王建玲,胡 博
(工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457)
利用高效表達(dá)載體pWB980,實(shí)現(xiàn)了Bacillus subtilis BF7658中溫α–淀粉酶基因amy在B. subtilis DB403中的高效表達(dá),活力達(dá)到770,U/mL.經(jīng)多步純化,重組酶AMY的比活達(dá)到35.8,U/mg,純化倍數(shù)為1.7,獲得凝膠電泳條帶單一的蛋白樣品,經(jīng) SDS-PAGE檢測,重組酶 AMY相對分子質(zhì)量為 4.8×104.對酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行分析,重組酶 AMY的最適反應(yīng)溫度為60,℃,最適反應(yīng)pH為6.0.
枯草芽孢桿菌;中溫α–淀粉酶;高效表達(dá);純化;酶學(xué)性質(zhì)
中溫α–淀粉酶的最適作用溫度和 pH分別為60,℃和 6.0,是工業(yè)中應(yīng)用最普遍的酶種之一,被廣泛應(yīng)用于淀粉糖、味精、啤酒、酒精以及紡織退漿等工業(yè)生產(chǎn)[1].1965年,我國開始應(yīng)用B. subtilis BF7658生產(chǎn)α–淀粉酶,發(fā)酵活力為 200,U/mL左右[2].我國于 20世紀(jì) 90年代后期引進(jìn)了國外生產(chǎn)中溫α–淀粉酶的優(yōu)良菌株B. amyloliquefaciens和工藝技術(shù),發(fā)酵活力平均在 400,U/mL左右.目前我國多數(shù)廠家仍采用 B. subtilis BF7658及其變異株生產(chǎn)中溫α–淀粉酶,產(chǎn)酶水平穩(wěn)定在 550,U/mL左右.但與其他酶制劑品種相比較,其發(fā)酵水平提高較慢,限制了中溫α–淀粉酶在各行業(yè)中的應(yīng)用.
目前,枯草芽孢桿菌表達(dá)系統(tǒng)已成為繼大腸桿菌之后重要的原核表達(dá)系統(tǒng).枯草芽孢桿菌遺傳背景清楚[3],蛋白分泌機(jī)制健全,生長迅速,培養(yǎng)簡便,不分泌內(nèi)毒素,具有較好的生物安全性,是美國食品藥物管理局(FDA)和中國農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)使用的安全菌株;并且它可直接將表達(dá)產(chǎn)物分泌到培養(yǎng)基中,產(chǎn)物便于提取和純化,是表達(dá)外源基因的良好受體菌.但由于枯草芽孢桿菌自身可向胞外分泌高濃度的蛋白酶,以致影響了表達(dá)產(chǎn)物的產(chǎn)量和穩(wěn)定性.
本研究將獲得的B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶基因,利用表達(dá)載體pWB980[4]和宿主菌株B. subtilis DB403[5],對中溫α–淀粉酶進(jìn)行表達(dá).表達(dá)載體pWB980具有高拷貝數(shù)(121個(gè)/細(xì)胞)且含有可高效表達(dá)外源基因的 P43啟動子以及可將外源蛋白分泌到細(xì)胞外的信號肽 sacB基因;同時(shí),B. subtilis DB403為 3個(gè)蛋白酶缺陷菌株,可減少胞外蛋白酶的分泌量,以期獲得中溫α–淀粉酶的高效表達(dá),為以淀粉為原料深加工工業(yè)的發(fā)展提供有力的支撐.
B. subtilisBF7658和B. subtilisDB403,均為本實(shí)驗(yàn)室保存.質(zhì)粒 pWB980由加拿大 Calgary大學(xué)Dr. Sui-Lam Wong惠贈.
LB培養(yǎng)基用于細(xì)菌培養(yǎng),篩選培養(yǎng)基為含卡那霉素 30,μg/mL的 LB/瓊脂培養(yǎng)基,酶活力初步檢測培養(yǎng)基為含 1%淀粉的 LB/瓊脂培養(yǎng)基,用作透明圈選擇.枯草芽孢桿菌轉(zhuǎn)化培養(yǎng)基為 GMI、GMII培養(yǎng)基[6].
基因組提取試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、限制性內(nèi)切酶、T4DNA 連接酶、高保真 TaqDNA 聚合酶,TaKaRa公司;DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、蛋白相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、卡那霉素,上海英駿生物技術(shù)有限公司;引物合成及測序由TaKaRa 公司完成.
根據(jù) NCBI網(wǎng)站公布的 B. subtilisα–淀粉酶基因序列,經(jīng)比對后設(shè)計(jì)引物,以B. subtilisBF7658總 DNA為模板,PCR擴(kuò)增獲得B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶基因 amy,上游引物 P1:5′-CCC AAGCTTTTGCGCTTACAGCACCGTCGATCAA-3′(下劃線部分為 HindIII酶切位點(diǎn)),下游引物 P2:5′-CGCGGATCCTTGAAAGAATGTGTTACACCT-3′(下劃線部分為BamHI酶切位點(diǎn)).將PCR產(chǎn)物及提取的質(zhì)粒pWB980,分別用HindIII和BamHI進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)純化回收后,用T4 DNA連接酶于16,℃連接過夜,構(gòu)建重組質(zhì)粒 pWB-amy,參照文獻(xiàn)[7]轉(zhuǎn)化B.subtilisDB403,將含卡那霉素的酶活初步檢測平板上的轉(zhuǎn)化子逐一點(diǎn)接在含卡那霉素的 LB/瓊脂平板上保存,碘液熏蒸檢測平板,確定透明圈與菌落直徑比值大的轉(zhuǎn)化子后,在 LB/瓊脂保存平板上挑取相應(yīng)轉(zhuǎn)化子,分別進(jìn)行 PCR和雙酶切法鑒定并進(jìn)行測序.
將獲得的工程菌株 pWB-amy/DB403和對照菌株 pWB980/DB403分別接種于 5,mL的含卡那霉素LB培養(yǎng)基中,37,℃振蕩培養(yǎng)過夜,按1%的接種量轉(zhuǎn)接于裝有50,mL含卡那霉素LB培養(yǎng)基的250,mL三角瓶中,37,℃培養(yǎng) 36,h,12,000,r/min 離心 10,min,收集上清液,SDS-PAGE(分離膠濃度為 10%,濃縮膠濃度為 5%)檢測蛋白的表達(dá)情況,同時(shí)測定酶活力.采用Lowry法測定蛋白含量[8].
種子培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基.
發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):玉米粉 55,豆餅粉 45,淀粉2,硫酸銨 4,磷酸氫二鈉 8,氯化銨 1.3,氯化鈣 2.7,pH自然.
7 L發(fā)酵罐培養(yǎng)條件參照文獻(xiàn)[9].
中溫α–淀粉酶活性測定方法和其他溶液的配制參照 QB/T 1803—1993《工業(yè)酶制劑通用試驗(yàn)方法》.酶活計(jì)算:X=c×n.式中:X為樣品的酶活力,U/mL(U/g);c為測試酶的濃度,U/mL;n為樣品的稀釋倍數(shù).
收集工程菌 pWB-amy/DB403發(fā)酵上清液100,mL,加硫酸銨至 70%,4,℃靜置過夜,6,000,r/min離心20,min,蛋白沉淀用10,mL 0.02,mol/L磷酸緩沖液(pH,7.0)溶解.得到的活性組分上樣到用濃度為0.02,mol/L磷酸緩沖液(pH 7.0)平衡過的 DEAESepharose Fast Flow(2.4,cm×30,cm)離子交換層析柱,用同樣的緩沖液先洗脫未吸附的蛋白,再用含0~1,mol/L,NaCl的 0.02,mol/L磷酸緩沖液(pH,7.0)線性梯度洗脫,收集活性組分.將得到的活性組分上樣到用 0.02,mol/L磷酸緩沖液(pH,7.0)平衡過的Sephadex G-75(1.6,cm×80,cm)凝膠層析柱,再用同樣的緩沖液洗脫,收集活性組分.每步收集到的活性組分進(jìn)行活力檢測,并采用 Lowry法測定蛋白含量[8].
1.8.1 溫度對酶活力的影響
純酶最適反應(yīng)溫度的測定:在不同溫度(30、40、50、60、70、80、90、100,℃)、pH 6.0 條件下保溫5,min,測定重組酶純酶液的酶活力,將最高酶活力定為100%.
純酶的熱穩(wěn)定性測定:將重組酶純酶液置于不同溫度(40、60、80、100,℃)、pH,6.0 條件下保溫 1,h,每隔10,min取出,各自測定其殘余酶活力,以未保溫的酶液活力為100%,繪制熱穩(wěn)定性曲線.
1.8.2 pH對酶活力的影響
純酶最適反應(yīng) pH 的測定:在不同 pH(4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5)、60,℃條件下保溫 5,min,測定重組酶純酶液的酶活力,將最高酶活力定為100%.
純酶的 pH穩(wěn)定性測定:將重組酶純酶液在不同pH(4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5)條件下 60,℃保溫 60,min,各自測定其殘余酶活力,將最高殘余酶活力定為100%,繪制pH穩(wěn)定性曲線.
以提取的B. subtilisBF7658總DNA為模板,利用 PCR擴(kuò)增出中溫α–淀粉酶基因片段(GenBank 的登錄號為 FJ463162).測序結(jié)果表明中溫α–淀粉酶的信號肽含有 41個(gè)氨基酸,成熟肽含有 436個(gè)氨基酸.將中溫α–淀粉酶成熟肽基因片段amy經(jīng)HindIIIBamHI雙酶切,與HindIII-BamHI線性化的質(zhì)粒pWB980連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pWB-amy.將構(gòu)建的重組質(zhì)粒pWB-amy轉(zhuǎn)化B. subtilisDB403,通過水解透明圈與菌落直徑比篩選活力高的重組菌株,在含有卡那霉素的 LB/瓊脂平板上挑取該陽性轉(zhuǎn)化子,提取質(zhì)粒分別用HindIII和HindIII-BamHI進(jìn)行單酶切和雙酶切驗(yàn)證,電泳檢測結(jié)果(圖 1)表明重組子質(zhì)粒中已帶有目的基因amy,獲得重組菌株pWB-amy/DB403.
圖1 pWB-amy重組質(zhì)粒酶切圖Fig.1 Verification of recombinant plasmids with single and double enzyme digestion
將pWB-amy/DB403、B. subtilisBF7658和pWB980/DB403分別點(diǎn)接到含 1%淀粉的 LB/瓊脂平板上,如圖 2所示.pWB-amy/DB403的水解透明圈與菌落直徑的比值明顯大于B. subtilisBF7658和pWB980/DB403.
將pWB-amy/DB403和pWB980/DB403在37,℃分別培養(yǎng) 36,h,收集上清液,SDS-PAGE檢測蛋白的表達(dá)情況(圖 3),pWB-amy/DB403的上清液中發(fā)現(xiàn)有相對分子質(zhì)量為 4.8×104的表達(dá)蛋白 AMY(泳道1),與經(jīng)過純化的B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶(泳道 4)的大小一致,在 pWB980/DB403(泳道 3)上清液中未發(fā)現(xiàn)同樣的表達(dá)產(chǎn)物.同時(shí),測定 pWB–amy/DB403上清液中溫α–淀粉酶 AMY的酶活力可達(dá)530,U/mL,而B. subtilisBF7658的中溫α–淀粉酶活力僅為 200,U/mL.按照方法 1.5所述對 pWB–amy/DB403進(jìn)行 7,L發(fā)酵罐放大培養(yǎng),中溫α–淀粉酶AMY的酶活力可達(dá)770,U/mL.
圖2 α–淀粉酶活性的平板檢測Fig.2 Plate assay for activities of alpha amylase
圖3 表達(dá)產(chǎn)物的聚丙烯凝膠電泳分析Fig.3 SDS-PAGE analysis of proteins secreted by B. subtilis DB403
收集 pWB-amy/DB403發(fā)酵上清液 100,mL,經(jīng)硫酸銨鹽析、DEAE-Sepharose Fast Flow(2.4,cm×30,cm)離子交換層析、Sephadex G-75(1.6,cm×80,cm)凝膠層析,進(jìn)行純化.通過對重組酶 AMY 整個(gè)提純工藝各純化步驟的總蛋白、總酶活、比活、純度及回收率等指標(biāo)的跟蹤測定,得到 100,mL重組酶發(fā)酵上清液的純化表,見表 1.重組酶 AMY發(fā)酵上清液經(jīng)分離純化后,純度提高了 1.7倍,回收率為74.3%.重組酶AMY的粗酶液經(jīng)純化后,得到相對分子質(zhì)量為 4.8×104的單一電泳條帶(圖 3,泳道 2),與經(jīng)過純化的B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶(圖3,泳道4)的大小一致.
表1 重組酶AMY純化表Tab.1 Summary of purification of recombinant AMY
2.4.1 酶的熱穩(wěn)定性
重組酶AMY及B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶反應(yīng)的最適溫度均為 60,℃.分別對 AMY及B.subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的熱穩(wěn)定性進(jìn)行分析,結(jié)果表明在 40,~80,℃保溫 60,min,殘余酶活分別為初始活力的90%、80%及50%(圖4和圖5);在100,℃保溫30,min,完全失活.
圖4 重組酶AMY的熱穩(wěn)定性曲線Fig.4 Thermostability curve of recombinant AMY
圖5 B. subtilis BF7658中溫α -淀粉酶熱穩(wěn)定性曲線Fig.5 Thermostability curve of the medium-temperature alpha amylase in B. subtilis BF7658
2.4.2 酶的pH穩(wěn)定性
重組酶AMY及B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的最適 pH為 6.0.分別對 AMY及B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的pH穩(wěn)定性進(jìn)行分析(如圖6所示),結(jié)果表明在60,℃保溫60,min,pH在5.5~7.5范圍內(nèi)較穩(wěn)定.
圖6 B. subtilis BF7658中溫α-淀粉酶及AMY的pH穩(wěn)定性曲線Fig.6 Stability curve of pH of recombinant AMY and the medium temperature alpha amylase in B. subtilis BF7658
本項(xiàng)研究中,利用高效表達(dá)載體 pWB980,以 3個(gè)蛋白酶缺陷的B. subtilisDB403作為宿主菌株,實(shí)現(xiàn)了B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的高效表達(dá),經(jīng)發(fā)酵工藝優(yōu)化后,活力可達(dá)到770,U/mL,明顯高于出發(fā)菌株B. subtilisBF7658的中溫α–淀粉酶活力200,U/mL.董晨等[10]利用強(qiáng)啟動子 P43實(shí)現(xiàn)了地衣芽孢桿菌耐高溫α–淀粉酶在B. subtilis1A752S中的高水平表達(dá),比原始菌株提高了 8.9倍.劉逸寒等[11]利用質(zhì)粒 pWB980與 6個(gè)蛋白酶缺陷的 B. subtilis WB600實(shí)現(xiàn)了突變耐酸性高溫α–淀粉酶的高效表達(dá),活力可達(dá)到 4,700,U/mL.可見,由強(qiáng)啟動子高拷貝載體質(zhì)粒及本身胞外蛋白酶減少的枯草芽孢桿菌宿主菌株構(gòu)建的表達(dá)體系可有效提高產(chǎn)酶量.
重組酶 AMY經(jīng)超濾、硫酸銨鹽析、離子交換層析及凝膠層析純化后,得到的 AMY比活為35.8,U/mg,純化倍數(shù)為 1.7倍,獲得凝膠電泳條帶單一的蛋白樣品.在純化過程中,操作相對簡單且每步回收率較高,分析原因?yàn)橥庠吹鞍妆磉_(dá)量較高,同時(shí)由于宿主菌株B. subtilis DB403胞外蛋白分泌相對較少,穩(wěn)定了外源蛋白并簡化了純化過程.
重組酶AMY與B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶最適溫度均為 60,℃,在 40~80,℃保溫 60,min,殘余酶活分別為初始活力的 90%、80%及 50%;在100,℃保溫 30,min,完全失活.AMY 及B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的最適 pH 為 6.0.分別對AMY及B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶的pH穩(wěn)定性進(jìn)行分析,結(jié)果表明在 60,℃保溫 60,min,pH 在5.5~7.5范圍內(nèi)較穩(wěn)定.研究顯示,中溫α–淀粉酶經(jīng)過不同的宿主菌株表達(dá)后,催化性質(zhì)并沒有發(fā)生改變,保留原有的生物學(xué)活性.
外源基因的表達(dá)多采用大腸桿菌細(xì)胞內(nèi)表達(dá),提純蛋白需要將細(xì)胞破碎或裂解,過程繁瑣.而枯草芽孢桿菌具有將胞內(nèi)蛋白分泌到細(xì)胞外的特點(diǎn)引起人們的普遍關(guān)注,利用枯草桿菌的分泌特點(diǎn),構(gòu)建高效表達(dá)體系表達(dá)外源蛋白,可簡化生產(chǎn)工序,有效降低生產(chǎn)成本.在本研究基礎(chǔ)上,下一步探索將B. subtilisBF7658中溫α–淀粉酶分別實(shí)現(xiàn)在分泌胞外蛋白酶更少的B. subtilisWB600中的游離及整合型表達(dá),利用高拷貝質(zhì)粒或?qū)⒛康幕驑?gòu)建多個(gè)拷貝整合入宿主菌株基因組中,獲得安全高效穩(wěn)定的表達(dá),為進(jìn)一步工業(yè)化大規(guī)模生產(chǎn)應(yīng)用在不同行業(yè)中的中溫α–淀粉酶奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ).
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High-Level Expression of the Medium-Temperature Alpha Amylase inBacillus subtilis
LIU Yi-han,LU Fu-ping,WANG Jian-ling,HU Bo
(Key Laboratory of Industrial Fermentation Microbiology,Ministry of Education,College of Biotechnology,Tianjin University of Science & Technology,Tianjin 300457,China)
The medium-temperature alpha amylase gene fromBacillus subtilisBF768 was cloned into vector pWB980 and high-level expressed inB. subtilisDB403. The activity of AMY in the supernatant of the culture medium reached a maximum of 770 U/mL. By multi-step purification,the specific activity of AMY was up to 35.8 U/mg with a 1.7-fold purification. The recombinant enzyme AMY had a molecular mass of 4.8×104. The optimum pH and temperature of AMY was 6.0 and 60 ℃.
Bacillus subtilis;medium-temperature alpha amylase;high-level expression;purification;enzyme properties
Q814.4
A
1672-6510(2011)04-0001-05
2011–03–23;
2011–05–27
天津市科技攻關(guān)重點(diǎn)培育項(xiàng)目(06YFGPSH03500);天津科技大學(xué)自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(20090205)
劉逸寒(1982—),男,天津人,講師,博士,lyh@tust.edu.cn.