孫兆增,李愛學(xué),孔德強,趙 爽,趙彥斌,劉 冰,時彥勝,曾 林
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實驗動物中心,北京 100071)
印度尼西亞源食蟹猴干擾素-γ基因的克隆和序列分析
孫兆增,李愛學(xué),孔德強,趙 爽,趙彥斌,劉 冰,時彥勝,曾 林
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實驗動物中心,北京 100071)
目的 獲得印度尼西亞食蟹猴的干擾素-γ基因,為常用實驗獼猴干擾素-γ的基因工程生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。方法 根據(jù)GenBank上公布的恒河猴干擾素-γ基因序列設(shè)計特異性引物,從印度尼西亞食蟹猴的外周血液中分離單核淋巴細胞,利用Trizol試劑,提取淋巴細胞的總RNA,通過RT-PCR的方法獲得干擾素-γ基因片段,并對該片段進行克隆、鑒定和序列分析。結(jié)果 擴增到一498 bp的目的片段,經(jīng)序列測定證實為印度尼西亞食蟹猴的干擾素-γ基因,與恒河猴、人及狒狒的干擾素-γ基因相比,同源性分別為100%、96%、99%。結(jié)論 常用的兩種實驗獼猴食蟹猴與恒河猴的干擾素-γ基因完全相同。
印度尼西亞源食蟹猴;干擾素-γ;克隆;序列分析
干擾素-γ(interferon-γ,IFN-γ)是由活化的 T淋巴細胞和NK細胞在誘生劑的作用下產(chǎn)生的一種細胞因子,由于其具有抗病毒、抗腫瘤和免疫調(diào)節(jié)等獨特作用,在動物傳染性疾病的預(yù)防和治療中具有廣闊的應(yīng)用前景[1,2]。自 Isaacs 和 Lindenmann[3]于1957年首次發(fā)現(xiàn)干擾素的存在以來,各種動物和類型的干擾素相繼被發(fā)現(xiàn)并克?。?-9]。與其它干擾素類似,IFN-γ生物學(xué)作用有較嚴格的種屬特異性,如人和小鼠的IFN-γ在DNA水平上有65%左右同源性,在氨基酸水平的同源性只有40%左右[10,11]。
目前在非人靈長類動物疾病防控過程中主要應(yīng)用人源干擾素。恒河猴的IFN-γ由166個氨基酸組成,與人的同源性為96%。對于食蟹猴的干擾素-γ基因,國內(nèi)外的研究報道較少,本研究擬獲得印度尼西亞食蟹猴的干擾素-γ基因片段,并與其它種屬的干擾素-γ基因序列進行比較,為常用實驗獼猴干擾素-γ的基因工程生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
4只印度尼西亞源食蟹猴,由軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實驗動物中心提供[SCSK-(軍)2002-001]。
人淋巴細胞分離液購自天津TBD公司;Trizol購自Invitrogen公司;反轉(zhuǎn)錄酶M-MLV和DEPC為Promega公司產(chǎn)品;凝膠回收試劑盒和質(zhì)粒提取試劑盒購自杭州 BioFlux公司;LA-Taq、dNTP、Oligo(dT)、pMD18-T克隆載體、EcoRⅠ及HindⅢ內(nèi)切酶均為大連寶生物公司產(chǎn)品;E.coli DH5α感受態(tài)為北京博邁德公司產(chǎn)品。
根據(jù)GenBank上公布的恒河猴的干擾素-γ序列設(shè)計引物,其上游序列引物為:5′-atgaaatacacaagttatat-3′,下游引物序列為:5′-ttattgggatgctcttcgac-3′,由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。
無菌采取食蟹猴的外周血各4mL,肝素抗凝。取2mL抗凝血與2mL的Hank’s液充分混合,緩慢加入到2mL淋巴細胞分離液之上,1500 g離心10 min;去掉上層的水相,將包含淋巴細胞的中間層全部轉(zhuǎn)移到1.5mL的離心管中,2000 r/min離心10 min,收集淋巴細胞。用 DEPC水洗滌后,轉(zhuǎn)入到DEPC處理過的離心管中,加入1mL的Trizol,按照Trizol試劑說明書,提取總RNA。
以提取的總RNA為模版,以olig(dT)為反轉(zhuǎn)錄引物,進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。反應(yīng)條件為:42℃,1 h;95℃,5 min;4℃,5 min。以2 μL 的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模版,利用LATaq酶擴增食蟹猴干擾素-γ基因。反應(yīng)條件為:預(yù)變性95℃,4 min;30 個循環(huán),95℃,30 s,54℃,40 s,72℃,1 min;最后 72℃延伸 7 min。利用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果,并用凝膠回收試劑盒回收基因片段。
PCR產(chǎn)物回收、純化后,與pMD18-T載體連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細胞,進行藍白斑篩選。挑取單個白色轉(zhuǎn)化菌落,接種于含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,利用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,通過PCR和酶切結(jié)合的方法篩選陽性重組子,陽性重組子由北京鼎國生物工程公司測序。利用DNAMAN軟件編輯測序序列,并與GenBank上公布的恒河猴、人及狒狒的IFN-γ序列進行同源性分析。
利用Trizol試劑從食蟹猴外周血淋巴細胞中提取到總RNA,rRNA的三條帶比較明顯,沒有明顯的降解(圖1)。
圖1 外周血單核細胞總RNA的提取結(jié)果Fig.1 The results of total RNA extraction of peripheral blood mononuclear cells
以食蟹猴外周血單核細胞中提取的總RNA為模版,進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。利用反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模版,從兩只食蟹猴的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中擴增到IFN-γ的基因片段,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,得到長度約為500 bp的特異性DNA片段(圖2),與預(yù)期片段的大小一致。
圖2 食蟹猴IFN-γ基因RT-PCR擴增結(jié)果Fig.2 RT-PCR results of IFN-γ gene of Cynomolgus monkeys
用EcoRⅠ、HindⅢ進行重組克隆質(zhì)粒的雙酶切分析,并以重組克隆質(zhì)粒為模板進行PCR鑒定,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,獲得了兩個陽性重組質(zhì)粒(圖3)。
圖3 IFN-γ陽性質(zhì)粒的鑒定結(jié)果Fig.3 Identification of the IFN-γ positive plasmids
兩個陽性質(zhì)粒序列測定的結(jié)果表明,食蟹猴IFN-γ全長為 498 bp,編碼 166個氨基酸,與GenBank上公布的恒河猴IFN-γ的同源性為100%(序列比對圖略),不存在種間差異。與人的IFN-γ相比,同源性為96%;與狒狒的同源性為99%,僅有5個堿基不同。
目前國內(nèi)共有食蟹猴飼養(yǎng)場39家,其存欄量超過20萬只。食蟹猴的疾病防控在其規(guī)?;a(chǎn)中具有重要作用。目前在非人靈長類獸醫(yī)臨床中多應(yīng)用抗生素等常規(guī)藥物,基因工程藥物應(yīng)用基礎(chǔ)薄弱。基因工程干擾素與血源性干擾素相比,具有無污染、安全性高、純度高、比活性高、成本低、療效確切等優(yōu)點,是應(yīng)用最成功的基因工程藥物。但目前國內(nèi)外對食蟹猴干擾素的研究報道較少,本研究通過PT-PCR方法對食蟹猴IFN-γ的序列進行了克隆,并進行了序列分析,為下一步食蟹猴IFN-γ的基因工程生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
序列分析結(jié)果表明食蟹猴IFN-γ基因序列與恒河猴IFN-γ基因序列完全相同,與人的同源性為96%,與狒狒的同源性為99%,僅有5個堿基不同。國內(nèi)外用于實驗的非人靈長類動物主要包括恒河猴和食蟹猴,本研究表明食蟹猴與恒河猴的IFN-γ基因不存在種間差異,利用本研究獲得的IFN-γ序列進行基因工程生產(chǎn),可廣泛應(yīng)用到非人靈長類的獸醫(yī)臨床中。
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Cloning and Sequence Analysis of Interferon-γ of Indonesian Cynomolgus Monkeys
SUN Zhao-zeng,LI Ai-xue,KONG De-qiang,ZHAO Shuang,ZHAO Yan-bin,LIU Bing,SHI Yan-sheng,ZENG Lin
(Laboratory Animal Center of the Academy of Military Medical Science,Beijing 100071,China)
Objective To obtain the IFN-γgene of Indonesian Cynomolgus monkeys and provide a theoretical and material basis for the production of the recombinant IFN-γ.Method Based on the published nucleotide sequence of IFN-γ gene of rhesus monkey in GenBank,a pair of RT-PCR primers were designed and synthesized.Total RNA,isolated from the peripheral blood mononuclear cells by Trizol,was used as template to amplify the IFN-γgene by RT-PCR.The gene was identified by endonuclease,PCR and DNA sequencing.Result A 498 bp DNA fragments were amplified.DNA sequencing confirmed that the fragment was IFN-γof Cynomolgus monkeys.Compared with rhesus monkeys,humans and baboons,the homology of nucleotide sequence of IFN-γgene were 100%,96%and 99%respectively.Conclusion The IFN-γ gene of cynomolgus monkey was identical to that of rhesus monkey.
Indonesian Cynomolgus monkeys;IFN-γ;Cloning;Sequence analysis
R349.64
A
1671-7856(2010)10-0003-03
10.3969/j.issn.1671.7856.2010.10.002
2010-06-12
國家自然基金(30970416),國家科技部基礎(chǔ)平臺項目(2005DKA21500)。
孫兆增(1977-)男,博士,研究方向:實驗動物學(xué)。
曾林(1965-)男,研究員,研究方向:實驗動物科學(xué)與管理。