徐瑩瑩,崔崇士,屈淑平
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院,哈爾濱 150030)
大白菜(Brassica campestris L.ssp.pekinensis)是二年生的十字花科蕓薹屬蔬菜作物,原產(chǎn)于中國,是我國栽培面積最大的蔬菜作物之一,在蔬菜周年供應(yīng)中占有重要地位。軟腐病是大白菜生產(chǎn)中的細(xì)菌性病害,因其危害性也被稱為大白菜三大病害之一。該病害是由胡蘿卜軟腐歐文氏菌胡蘿卜亞種(Erwinia.carotovora.subsp.carotovora Ecc.)引起的[1]。該病害在前期干旱、后期多雨或灌水不當(dāng)情況下,很容易在生產(chǎn)中大面積流行,從而造成嚴(yán)重減產(chǎn),該病是影響大白菜優(yōu)質(zhì)、穩(wěn)產(chǎn)的重要因素[2]。由于大白菜種質(zhì)資源中缺少抗源材料,以及對植物抗病機(jī)制認(rèn)識的匱乏,軟腐病抗病育種一直是大白菜育種中的重大難題。
近年來,基因組研究的迅速發(fā)展為許多農(nóng)作物提供了大量分子標(biāo)記技術(shù)和多種多樣的檢測手段,使分子標(biāo)記輔助選擇(Marker-assisted selection,MAS)應(yīng)用于作物遺傳改良成為現(xiàn)實(shí),并取得了一系列成就,MAS是通過利用與目標(biāo)性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記對目標(biāo)性狀進(jìn)行早期、間接、準(zhǔn)確選擇的現(xiàn)代育種技術(shù)[3]。SRAP分子標(biāo)記是MAS的一種方法,它是一種新型的基于PCR的標(biāo)記系統(tǒng)[4],主要針對基因外顯子里GC含量豐富,而啟動子和內(nèi)含子里AT含量豐富的特點(diǎn)來設(shè)計引物進(jìn)行擴(kuò)增,因不同個體的內(nèi)含子、啟動子與間隔區(qū)長度不等而產(chǎn)生多態(tài)性。SRAP具有試驗(yàn)操作簡單,擴(kuò)增譜帶清晰,結(jié)果穩(wěn)定,多態(tài)性好等優(yōu)點(diǎn),應(yīng)用較廣[5-6],本研究將SRAP應(yīng)用于大白菜抗軟腐病性狀的分子標(biāo)記輔助選擇中,為建立大白菜軟腐病抗性育種分子標(biāo)記輔助選擇系統(tǒng)和開展抗軟腐病分子生物技術(shù)育種奠定技術(shù)基礎(chǔ)。
以高抗軟腐病的大白菜高代自交系A(chǔ)32-2和感病自交系A(chǔ)19-2雜交后代構(gòu)建F2代分離群體,共計225個單株。2007年5月在東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝實(shí)驗(yàn)站將親本、F1、F2代種子種于防蟲溫室內(nèi)。
1.2.1 抗病性鑒定
親本材料及F2代分離群體采用史國立等的苗期抗性鑒定方法[7],當(dāng)幼苗長至7~8片真葉時進(jìn)行人工接種,接種時先用鋒利的刀片在葉柄基部輕輕劃4道小傷口,接種濃度為1013cfu·mL-1,然后用注射器慢慢地把0.01 mL菌液注入到傷口表面,形成懸浮滴。發(fā)病溫度28℃,相對濕度100%,接種后7 d調(diào)查病情。
1.2.2 DNA的提取和SRAP分析
結(jié)果見表1。
表1 供試驗(yàn)分析的SRAP引物Table 1 SRAP primers for analysis
采用CTAB法[8]提取親本及每個單株的DNA,參照張書芬等使用的引物[9],從中選出10條正向引物和17條反向引物(見表1),正向引物和反向引物兩兩搭配成170個引物組合,引物由上海生工生物技術(shù)服務(wù)有限公司合成。擴(kuò)增條件為:94℃變性3 min;94℃變性30 s,35℃復(fù)性30 s,72℃延伸1.5 min,5個循環(huán);94℃變性30 s,50℃復(fù)性30 s,72℃延伸1.5 min,35個循環(huán);72℃延伸7 min;4℃保存。SRAP-PCR反應(yīng)體系參見文獻(xiàn)[10],擴(kuò)增產(chǎn)物在6%的變性聚丙烯酰胺凝膠上采用恒功率80 W電泳2 h,電泳儀采用Bio-rad垂直電泳儀,加樣量為7.5 μL。然后進(jìn)行銀染,掃描或照相保存。
1.2.3 連鎖圖譜構(gòu)建及QTL分析
統(tǒng)計在親本之間產(chǎn)生的多態(tài)性并且在F2群體中有分離的條帶。與親本A32-2帶型相同者賦值為1,與親本A19-2帶型相同者賦值為0,由于各種原因造成的數(shù)據(jù)不清楚或數(shù)據(jù)缺失者賦值為“-”。采用Mapmaker3.0進(jìn)行分析,利用Kosambi函數(shù)將重組率轉(zhuǎn)化為遺傳圖距(cM),以最大圖距50 cM作為劃分連鎖群和排列Markers的基準(zhǔn)距離。運(yùn)用軟件Windows QTL Cartographer V2.5和復(fù)合區(qū)間作圖法對所考察的性狀進(jìn)行全基因組掃描,掃描區(qū)間為1 cM,以LOD≥3.0為閾值,檢測軟腐病性狀相關(guān) QTL的存在(P<0.05)。
結(jié)果表明,本研究所選抗性材料對軟腐病具較強(qiáng)抗性。對抗病親本A32-2、感病親本A19-2以及兩者雜交所產(chǎn)生的F1代接種軟腐病菌后發(fā)現(xiàn),兩個親本和F1代的平均病情指數(shù)分別為17.54,82.86和23.54。F1代的平均病情指數(shù)低于雙親病情指數(shù)的平均值,其抗性介于雙親之間,趨向抗病親本。
根據(jù)F2代病情分級和各病級的株數(shù)利用SAS 8.2 univariate程序進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn)。結(jié)果表明,F(xiàn)2代單株人工接種軟腐病菌后癥狀表現(xiàn)為連續(xù)分布,呈現(xiàn)出數(shù)量遺傳學(xué)特征,其偏度為0.1836,小于0.5,峰度為0.1358,符合正態(tài)分布,適于進(jìn)行QTL定位。
用父母本對170對SRAP正、反引物組合進(jìn)行篩選,得到24對條帶清晰、多態(tài)性高的引物組合,檢測到139個多態(tài)性位點(diǎn)。不同引物擴(kuò)增的多態(tài)性條帶差異很大,最多的11條,少的只有3條,平均每對引物5.8條。在139個SRAP標(biāo)記中,來自A32-2的標(biāo)記有79個,占56.8%,來自A19-2的標(biāo)記有60個,占43.2%,比例大致持平,基本符合1:1的分離比。群體在總體上未出現(xiàn)嚴(yán)重的偏分離,為理想的作圖群體。結(jié)果見表2。
表2 24對SRAP引物組合產(chǎn)生的多態(tài)性條帶數(shù)Table 2 Numbers of polymorphic bands generated using 24 SRAP primer pairs
以225個F2代單株為作圖群體,共獲得139個SRAP多態(tài)標(biāo)記,用Mapmaker/EXP3.0構(gòu)建遺傳連鎖圖。共獲得10個連鎖群(見圖1),編號為LG1到LG10,包含103個標(biāo)記,總長1 223.6 cM,每個連鎖群有4~25個標(biāo)記,最長的連鎖群為348.0 cM,最短的連鎖群為40.5 cM。標(biāo)記間最大間距為33.1 cM,最小間距為2.2 cM,標(biāo)記間平均間距11.9 cM。
圖1 連鎖圖譜及QTL分布Fig.1 Linkage map and distribution of QTL for resistant to the soft rot of Chinese cabbage
表3 大白菜F2群體軟腐病抗性復(fù)合區(qū)間作圖定位QTLTable 3 Genetic parameters estimated by interval mapping of the QTLs identified in the F2population from cross A32-2×A19-2
用Windows QTL Cartographer V2.5軟件進(jìn)行分析,采用復(fù)合區(qū)間作圖法,LOD值大于3.0作為QTL存在的閾值。通過對抗軟腐性狀QTL分析發(fā)現(xiàn)4個不同的QTL位點(diǎn)(見表1)。4個QTL位點(diǎn)分別位于LG2、LG6和LG7連鎖群上,如圖1所示,暫時命名為 QE1、QE2、QE3和 QE4。QE1位于M06E1404和M06E1405之間,與最近的標(biāo)記M06E1404的距離為12.3 cM,加性效應(yīng)為9.17,可以解釋表型變異的14.23%;QE2位于M02E1407和M02E1409之間,與最近的標(biāo)記M02E1407的距離為4.7 cM。加性效應(yīng)為10.56,可解釋表型變異為22.73%;QE3位于M02E0301和M02E0302之間,與最近的標(biāo)記M02E0301的距離為2.9 cM,加性效應(yīng)為5.24,可解釋表型變異為9.33%;QE4位于M05E0607和M09E0202之間,與最近的標(biāo)記M05E0607的距離為16.4 cM,加性效應(yīng)為4.35,可解釋的表型變異為8.52%;當(dāng)QE1、QE2、QE3和QE4表現(xiàn)親本A32-2的基因型時,分別能降低病情指數(shù)9.17%、10.56%、5.24%、4.35%。由此推斷大白菜抗軟腐病抗性為不完全顯性基因控制,支持?jǐn)?shù)量性狀基因控制軟腐病抗性的觀點(diǎn)。
本研究選用大白菜高抗軟腐病A32-2自交系和高感軟腐病A19-2自交系為親本,用24對SRAP引物對兩親本產(chǎn)生的F2群體進(jìn)行SRAP分析,共檢測到139個多態(tài)性位點(diǎn)。不同引物擴(kuò)增的多態(tài)性條帶差異很大,最多的11條,少的只有3條,平均每對引物5.8條,其多態(tài)性產(chǎn)生的頻率與已報道的大致相同[11],可以滿足遺傳圖譜的構(gòu)建。
目前,關(guān)于大白菜軟腐病的遺傳規(guī)律和抗性機(jī)制的報道很少,遺傳規(guī)律與抗病機(jī)制目前還不是很明確。鄒學(xué)校等用一個參數(shù)和二個參數(shù)的直線回歸法研究了大白菜不同生育期軟腐病嚴(yán)重度的遺傳穩(wěn)定性[12]。結(jié)果表明,特別抗病和特別感病的雜交種穩(wěn)定性較好,中間類型的雜種穩(wěn)定性較差,一般雜種抗性穩(wěn)定性好的組合,其抗性雜種優(yōu)勢的穩(wěn)定性也較好,但也有例外情況。估算不同生育期軟腐病抗性遺傳參數(shù)表明,結(jié)球始、后期抗性表現(xiàn)較強(qiáng)的雜種優(yōu)勢,遺傳力高,選擇的遺傳進(jìn)度大,但其抗性雜種優(yōu)勢和遺傳力高低與外界環(huán)境有關(guān)。韓香婷研究表明,大白菜對軟腐病的抗性為數(shù)量性狀,受多基因控制[13]。牟晉華等以抗、感軟腐病的大白菜材料為親本,以其F2代分離群體為試材,研究其遺傳規(guī)律[14],表明該群體對軟腐病的抗性受單基因隱性控制,并采用AFLP分析技術(shù)結(jié)合BSA分組法,以E2M3引物組合篩選出一個150 bp的與感病基因連鎖的標(biāo)記。本研究結(jié)合大白菜軟腐病苗期接種鑒定及SRAP標(biāo)記分析共檢測到4個QTL位點(diǎn),由此推斷大白菜軟腐病為不完全顯性,受多對基因控制,支持?jǐn)?shù)量性狀基因控制軟腐病抗性的觀點(diǎn),與韓香婷等的研究結(jié)果一致[13]。大白菜軟腐病遺傳規(guī)律研究存在的分歧,可能是由于病原材料、抗病親本、接種程度、接種苗齡以及環(huán)境條件等差異造成的。
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