王 丹,鄒 莉,楊民寶,伊洪偉,羅 麗,王 義
(東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150040)
“桑黃”是擔(dān)子菌中針層孔菌屬 (Phellinus Quel.)一類具有重要藥用價(jià)值的大型真菌,近幾年來成為傳統(tǒng)中藥研究和開發(fā)的熱點(diǎn),但由于這類真菌在藥用功效上確實(shí)相同或相似,因此在學(xué)術(shù)和市場交流中出現(xiàn)了多種同種異名、同名異種的混亂 “桑黃”物種[1]。
通過對(duì)東亞地區(qū) “桑黃”物種[2]進(jìn)行了詮釋,在傳統(tǒng)的形態(tài)分類的基礎(chǔ)上,試圖通過ITS序列分析,對(duì)中國的鮑氏針層孔菌 (桑黃)(Phellinus baumii)過去定名為裂蹄針層孔菌 (P.linteus)與朝鮮桑黃 (Phellinus linteus)、韓國桑黃 (Phellinus linteus)進(jìn)行同源性比對(duì),確定其親緣關(guān)系,證明是否是同一物種鮑氏針層孔菌 (桑黃)(P.baumii),為其分類鑒定提供參考依據(jù)。
菌株朝鮮桑黃 (Phellinus linteus)、韓國桑黃 (Phellinus linteus)、中國桑黃 (Phellinus baumii)、中國桑黃火木針層孔菌 (Phellinus igniarius)、斜生褐孔菌 (Phaeoponus obliquus)由東北林業(yè)大學(xué)潘學(xué)仁教授提供,文中分別以sh1、sh2、sh3、sh4、sh5表示,其中朝鮮桑黃和韓國桑黃其產(chǎn)地和形態(tài)特征是不同的。
DNA提取和檢測:用接種鉤刮取培養(yǎng)基表面適量菌絲,置于研缽中用液氮冷卻,迅速研磨成細(xì)粉,將其放入1.5 mL離心管中,加入少量的 PVP、500 μL預(yù)熱的 2%CTAB提取緩沖液及20 μL β-疏基乙醇,輕輕混勻,置65℃水浴鍋中溫浴30 min,其間不時(shí)輕輕搖動(dòng)離心管,使材料充分混勻。取出放至室溫,加入500 μL氯仿:異戊醇(體積比 24∶1), 緩慢顛倒混勻, 12 000 r·min-1離心 10 min。將上清液轉(zhuǎn)入另一離心管中,棄下層。重復(fù)抽提2次,直至中間層透明。吸取上清液放入1.5 mL離心管中,加入3 mol·L-1NaAc,混勻后,加入2/3體積的異丙醇,室溫沉淀1 h以上,12 000 r·min-1離心10 min,棄上清。加入1 mL預(yù)冷的70%乙醇洗滌1次,再加入1 mL預(yù)冷的無水乙醇洗滌,以除去DNA表面附著的鹽或試劑小分子物質(zhì)。室溫干燥后,加入30 μL的無菌去離子水溶解DNA,放于-20℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
ITS1:5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG -3’; ITS4: 5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’,引物由上海生工生物公司合成。
制備 25 μL 反應(yīng)體系, 其中 ddH2O 18.375 μL、 模板DNA 1 μL、 10×buffer (Mg2+)2.5 μL、 濃度為 10 μmol·L-1正 反 向 引 物 (ITS1 和 ITS4)各 0.5 μL、 dNTP 2 μL、TaqDNA 聚合酶 0.125 μL。
94℃預(yù)變性 5 min, 95℃變性 30 s, 58℃退火 45 s,72℃延伸2 min,30個(gè)循環(huán),72℃延伸7 min,4℃保存。
取5 μL PCR產(chǎn)物,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,委托上海生工生物公司測序后,將測序的ITS序列在NCBI Genbank進(jìn)行BLAST,對(duì)獲得的同源序列進(jìn)行序列分析。利用BioEdit的Sequence工具下的Nucleotide Compisition分析各菌株ITS序列的長度及核苷酸G+C含量,采用MEGA3.1系統(tǒng)發(fā)育分析軟件中的UPGMA法和Clustal X1.83構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
圖1 PCR產(chǎn)物電泳效果圖
供試菌株ITS分布情況見表1,G+C的含量比較見表2,同源性比較見表3。
表1 供試菌株ITS分布長度的比較
表2 供試菌株ITS的G+C含量分布情況
表3 供試菌株ITS同源性比較
擴(kuò)增結(jié)果見圖1。
從圖1可看出,引物ITS1和ITS4能成功擴(kuò)增出5個(gè)菌株的ITS區(qū)段,經(jīng)測序5個(gè)菌株的ITS序列片段長度分別為704 bp、669 bp、681 bp、588 bp、738 bp,所得序列結(jié)果經(jīng)堿基比對(duì)和分析后提交NCBI中的Genbank數(shù)據(jù)庫,并獲得Genbank中的登錄號(hào),分別為FJ190410、FJ190411、 FJ190412、 FJ190413、 FJ190414。
從表2可以看出,5個(gè)供試菌株中其中sh1、sh2、sh3之間的5.8S rDNA的G+C具有100%的同源性,說明其保守性和親緣關(guān)系均相當(dāng)強(qiáng)。從以上數(shù)據(jù)可以看出,作為對(duì)照的針孔菌屬 (Phaeoponus)的sh5明顯和針層孔菌屬(Phellinus)的sh1、sh2、sh3親緣關(guān)系較遠(yuǎn),這說明桑黃菌株親緣關(guān)系的鑒定可以采用ITS序列分析的方法,sh1、sh2和sh3是同一物種,sh4和sh5是另外2個(gè)不同的物種。
根據(jù)美國生物中心 (NCBI)網(wǎng)站提供的真菌ITS1和ITS2的相關(guān)序列來確定供試菌株的親緣關(guān)系,經(jīng)BLAST比對(duì),下載了與供試菌株同源性較高的ITS序列,通過Clustal X軟件對(duì)其進(jìn)行比對(duì),并用分子進(jìn)化遺傳分析軟件(Clustal X1.83,Mega 3.1)構(gòu)建分子系統(tǒng)樹,如圖2所示。
圖2 5個(gè)菌株的UPGMA系統(tǒng)發(fā)育樹
從系統(tǒng)發(fā)育圖中可以看出,與sh1、sh2、sh3親緣關(guān)系較近的是基因庫中提供的Phellinus linteus、Phellinus baumii、 Inonotus linteus, 而sh4與Phellinus laevigatus較近、sh5與Inonotus obliquus較近。經(jīng)BLAST比對(duì),基因庫中與sh1同源性高于90%以上的DNA序列有61個(gè)菌株,其中Phellinus linteus 25個(gè),Phellinus baumii 15個(gè);與sh2同源性高于90%以上的有73個(gè),其中Phellinus linteus 27個(gè),Phellinus baumii 23個(gè);與sh3同源性高于90%以上的有54個(gè),其中Phellinus linteus 23個(gè),Phellinus baumii 17個(gè);而與sh4同源性高于90%以上的菌株大多數(shù)為Phellinus laevigatus;與sh5同源性高于90%以上的菌株大多數(shù)為Inonotus obliquus。
從上述分析可看出,sh1、sh2、sh3是同一物種,名稱混亂的 “桑黃”,而sh4和sh5分別是火木針層孔菌和斜生褐孔菌。
親緣關(guān)系較近的sh1、sh2、sh3的ITS序列與基因庫中提供的Phellinus linteus、Phellinus baumii都有較高的同源性,在這些菌株中,Phellinus linteus占多數(shù)。從數(shù)據(jù)顯示中可以認(rèn)為sh1、sh2、sh3與Phellinus linteus的親緣關(guān)系較近,因此sh1、sh2、sh3的拉丁學(xué)名應(yīng)為Phellinus linteus。但是對(duì)于這些Phellinus linteus的ITS序列,都是由韓國和中國學(xué)者提供,并沒有發(fā)現(xiàn)有中美洲和南美洲學(xué)者提供的,戴玉成等從形態(tài)學(xué)角度研究確定Phellinus linteus的自然分布僅在中美洲和南美洲,而中國、韓國、印度、俄羅斯以及日本等國家并沒有自然分布,這些國家學(xué)者所描述的菌物 “Phellinus linteus”,其正確的物種名稱應(yīng)為Phellinus baumii[3,4]。所以基因庫中由韓國和中國學(xué)者提供的與供試菌株同源性較高的的Phellinus linteus,其真正拉丁學(xué)名應(yīng)為Phellinus baumii,也就是與供試菌株sh1、sh2、sh3同源性較高、親緣關(guān)系較近的菌株應(yīng)為Phellinus baumii。經(jīng)上述分子生物學(xué)分析,筆者支持戴玉成的觀點(diǎn),中國、朝鮮、韓國交流的 “桑黃”的物種為鮑氏針層孔菌(P.baumii Pilat),而桑黃、桑耳、針裂蹄、裂蹄針層孔菌均為鮑氏針層孔菌的異名[5]。
對(duì)于分類混亂的、學(xué)名不定的菌株,經(jīng)BLAST分析比較時(shí),不能只看基因庫中顯示的菌株名稱來確定其親緣關(guān)系,因?yàn)?,基因庫中學(xué)者提供的菌株學(xué)名有些是在分類比較混亂的時(shí)候提供的,這個(gè)時(shí)候提供的并不一定是其真正的學(xué)名,例如筆者在提供 “桑黃”菌株時(shí),并不確定其真正學(xué)名為Phellinus linteus,只是目前大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為的,所以在提交時(shí)就以Phellinus linteus提交,結(jié)果在基因庫中最后顯示的為Phellinus linteus。
從本試驗(yàn)結(jié)果來看,由于ITS片斷較小和短,因此對(duì)于菌株之間的區(qū)分有一定的局限性,但對(duì)一些大的區(qū)段如18S rDNA效果會(huì)更好。筆者建議,結(jié)合形態(tài)特征對(duì)中國的 “桑黃”與中美洲和南美洲的Phellinus linteus ITS序列進(jìn)行比較分析,進(jìn)一步確定其真正的親緣關(guān)系。遺憾的是,筆者沒有在基因庫中發(fā)現(xiàn)與 “桑黃”菌株相似度較高的由中美洲和南美洲學(xué)者提供的Phellinus linteus的ITS序列,且沒有收集到中美洲和南美洲的Phellinus linteus作為對(duì)照菌株。
[1]曾念開,王秋穎,蘇明聲.桑黃基原物種的探討[J].中國食用菌,2008, 27(2): 56-59.
[2]潘學(xué)仁,鄒莉.東亞地區(qū) “桑黃”物種問題探討[J].中國食用菌,2008, 27(1): 63-64.
[3]張小青,戴玉成.中國真菌志第二十九卷銹革孔菌科[J].北京:科學(xué)出版社,2005.
[4]Dai YC,Xu MQ.Studies on the medicinal polypore,Phellinus baumii,and itskin,P.linteus[J].Mycotaxon,1998,67(1):191-200.
[5]戴玉成.藥用擔(dān)子菌-鮑氏層孔菌 (桑黃)的新認(rèn)識(shí)[J].中草藥,2003, 34(1): 94-95.