2008年10月24日，國(guó)務(wù)院辦公廳發(fā)布開展全國(guó)糧食清倉(cāng)查庫(kù)工作的通知，重點(diǎn)檢查所有中央儲(chǔ)備糧、國(guó)家臨時(shí)存儲(chǔ)糧(含最低收購(gòu)價(jià)糧、中央臨時(shí)儲(chǔ)備和臨時(shí)儲(chǔ)存進(jìn)口糧以及國(guó)家臨時(shí)儲(chǔ)存糧，下同)、地方儲(chǔ)備糧的數(shù)量、品種和質(zhì)量情況，國(guó)有及國(guó)有控股(以下簡(jiǎn)稱國(guó)有)糧食企業(yè)儲(chǔ)存商品糧的數(shù)量、品種、質(zhì)量和糧權(quán)歸屬情況。其中，對(duì)庫(kù)存糧食質(zhì)量，重點(diǎn)檢查中央儲(chǔ)備糧、國(guó)家臨時(shí)存儲(chǔ)糧和地方儲(chǔ)備糧的質(zhì)量合格率與品質(zhì)宜存率。嚴(yán)格核查國(guó)有企業(yè)糧食庫(kù)存賬實(shí)相符、賬賬相符的情況，重點(diǎn)核查農(nóng)業(yè)發(fā)展銀行糧食貸款與糧食庫(kù)存的對(duì)應(yīng)情況、企業(yè)會(huì)計(jì)賬和統(tǒng)計(jì)賬的相符情況。嚴(yán)格檢查政策性糧食存儲(chǔ)企業(yè)的補(bǔ)貼資金下?lián)芎褪褂们闆r。全面核查納入糧食流通統(tǒng)計(jì)范圍的重點(diǎn)非國(guó)有糧食經(jīng)營(yíng)企業(yè)及轉(zhuǎn)化用糧企業(yè)執(zhí)行統(tǒng)計(jì)制度的情況，并選擇部分在當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)具有一定代表性的企業(yè)，進(jìn)行糧食庫(kù)存情況的典型調(diào)查。

查庫(kù)工作分為6階段。(一)準(zhǔn)備階段。2009年3月底前，國(guó)務(wù)院有關(guān)部門及縣級(jí)以上地方各級(jí)人民政府按照職責(zé)分工，細(xì)化并下發(fā)糧食庫(kù)存清查實(shí)施方案，并完成清查動(dòng)員、人員培訓(xùn)和相關(guān)資料、查庫(kù)器具準(zhǔn)備等工作。(二)自查階段。2009年4月5日前，縣級(jí)人民政府要督促和指導(dǎo)本行政區(qū)域內(nèi)納入清查范圍的企業(yè)完成自查工作。(三)普查階段。2009年4月20日前，市(地)級(jí)人民政府組織對(duì)本行政區(qū)域內(nèi)糧食庫(kù)存情況進(jìn)行全面普查，確保不留死角。(四)復(fù)查階段。2009年4月底前，由省級(jí)人民政府進(jìn)行重點(diǎn)復(fù)查，復(fù)查比例為本行政區(qū)域內(nèi)納入檢查范圍糧食庫(kù)存總量的20％-30％。質(zhì)量復(fù)查的抽樣代表數(shù)量為被復(fù)查企業(yè)所儲(chǔ)中央儲(chǔ)備糧、國(guó)家臨時(shí)存儲(chǔ)糧和地方儲(chǔ)備糧庫(kù)存量的25％左右。復(fù)查樣品實(shí)行跨省(區(qū)、市)交叉檢驗(yàn)。(五)抽查階段。2009年5月上中旬，國(guó)務(wù)院有關(guān)部門對(duì)重點(diǎn)省(區(qū)、市)糧食庫(kù)存情況進(jìn)行隨機(jī)抽查，抽查企業(yè)個(gè)數(shù)每省(區(qū)、市)不少于10個(gè)。質(zhì)量抽查的抽樣代表數(shù)量為被抽查企業(yè)所儲(chǔ)中央儲(chǔ)備糧、國(guó)家臨時(shí)存儲(chǔ)糧和地方儲(chǔ)備糧庫(kù)存量的25％左右。抽查樣品實(shí)行集中統(tǒng)一檢驗(yàn)。(六)匯總整改階段。2009年5月下旬，省級(jí)人民政府向發(fā)展改革委提交本地區(qū)糧食清倉(cāng)查庫(kù)工作報(bào)告和結(jié)果匯總報(bào)表，并對(duì)清查發(fā)現(xiàn)的問題進(jìn)行整改。2009年6月底前，國(guó)務(wù)院有關(guān)部門向國(guó)務(wù)院報(bào)送全國(guó)糧食清倉(cāng)查庫(kù)工作總結(jié)報(bào)告。

2009年3月25日，國(guó)務(wù)院召開全國(guó)糧食清倉(cāng)查庫(kù)工作電視電話會(huì)議。中共中央政治局常委、國(guó)務(wù)院副總理李克強(qiáng)出席會(huì)議并講話。他強(qiáng)調(diào)，糧食是關(guān)系國(guó)計(jì)民生的基礎(chǔ)性產(chǎn)品，開展清倉(cāng)查庫(kù)是科學(xué)規(guī)劃糧食生產(chǎn)、合理配置資源、保障糧食安全的重要舉措。要以對(duì)國(guó)家和人民高度負(fù)責(zé)的精神做好這項(xiàng)工作，全面準(zhǔn)確客觀真實(shí)地掌握庫(kù)存實(shí)情，做到心中有數(shù)、群眾放心、管理改善。

李克強(qiáng)指出，黨中央、國(guó)務(wù)院高度重視糧食問題。我國(guó)是一個(gè)擁有十幾億人口的發(fā)展中大國(guó)，糧食始終是治國(guó)安邦的頭等大事，始終是現(xiàn)代化建設(shè)中必須把握好的重大戰(zhàn)略問題。近年來，我國(guó)糧食生產(chǎn)穩(wěn)定發(fā)展，連續(xù)五年豐收。在好的形勢(shì)下，要防止放松糧食生產(chǎn)的傾向。糧食庫(kù)存一頭連著生產(chǎn)，一頭連著消費(fèi)，是保障糧食安全的重要環(huán)節(jié)。只有準(zhǔn)確掌握糧食庫(kù)存狀況，才能正確把握糧食收儲(chǔ)和調(diào)控、統(tǒng)籌考慮糧食資源配置和利用、保證發(fā)展改革的需要。搞好清倉(cāng)查庫(kù)，對(duì)于夯實(shí)庫(kù)存基礎(chǔ)、應(yīng)對(duì)各種風(fēng)險(xiǎn)、提高糧食保障能力，對(duì)于穩(wěn)定糧食市場(chǎng)、促進(jìn)農(nóng)民增收、保持經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)，對(duì)于完善糧食制度、改進(jìn)監(jiān)督管理、提高整個(gè)糧食工作水平，都具有重要意義。

李克強(qiáng)強(qiáng)調(diào)，全面準(zhǔn)確是清倉(cāng)查庫(kù)的基本要求。要明確清查的范圍和內(nèi)容，做到有倉(cāng)必到、有糧必查、有賬必核、查必徹底，拿出一本實(shí)實(shí)在在的明白賬，確保糧食庫(kù)存數(shù)量真實(shí)、質(zhì)量良好、儲(chǔ)存安全，確保政府決策建立在可靠依據(jù)的基礎(chǔ)上，確保儲(chǔ)備糧在國(guó)家需要時(shí)調(diào)得動(dòng)、用得上。

李克強(qiáng)指出，科學(xué)清查是保障工作質(zhì)量的重要前提。要堅(jiān)持依法清查、嚴(yán)格清查、公開清查，遵循清查規(guī)定和程序，落實(shí)本地回避、交叉檢查制度，加強(qiáng)全程監(jiān)督，提高清查工作的透明度和公信力，向人民群眾交上一份滿意的答卷。

李克強(qiáng)說，清倉(cāng)查庫(kù)不能就事論事，而應(yīng)通過檢查更好地改進(jìn)工作。要以這次清查為契機(jī)，總結(jié)和推廣好的做法，發(fā)現(xiàn)和解決存在的問題，進(jìn)一步完善有關(guān)糧食法規(guī)和政策，建立健全長(zhǎng)效機(jī)制，推動(dòng)庫(kù)存管理和監(jiān)督水平。

李克強(qiáng)最后說，糧食清倉(cāng)查庫(kù)任務(wù)重，要求高。各地區(qū)、各有關(guān)部門和單位要切實(shí)加強(qiáng)領(lǐng)導(dǎo)和協(xié)調(diào)，落實(shí)責(zé)任制度，精心組織，周密部署，把清倉(cāng)查庫(kù)抓實(shí)抓好，更好地服務(wù)于改革、發(fā)展、穩(wěn)定的大局。

這次清倉(cāng)查庫(kù)是繼2001年之后國(guó)務(wù)院組織的又一次全國(guó)范圍的糧食庫(kù)存大檢查。據(jù)國(guó)家糧食局副局長(zhǎng)任正曉介紹，重點(diǎn)是清查對(duì)保障國(guó)家糧食安全具有決定性作用的國(guó)有糧食企業(yè)庫(kù)存，對(duì)非國(guó)有糧食企業(yè)庫(kù)存只做必要的典型調(diào)查，城鄉(xiāng)居民家庭存糧仍然不納入這次清倉(cāng)查庫(kù)的范圍。

此次清倉(cāng)查庫(kù)參與人數(shù)、部門之多是一大特點(diǎn)。在國(guó)家層面，國(guó)務(wù)院、發(fā)改委、糧食局等10個(gè)部門共同組織、聯(lián)合檢查，參與清查的人員將在10萬人以上。而且，參檢人員實(shí)行本地回避，統(tǒng)一抽調(diào)的檢查人員實(shí)行“混合編組”，不準(zhǔn)參加對(duì)本地區(qū)或本企業(yè)的檢查。

對(duì)于很多人擔(dān)心的糧食庫(kù)存不實(shí)問題，任正曉回應(yīng)稱，糧庫(kù)出現(xiàn)空倉(cāng)的現(xiàn)象是存在的。他認(rèn)為，諸如糧食正常流通，庫(kù)存隨季節(jié)變動(dòng)，執(zhí)行救災(zāi)、輪換等出庫(kù)指令等造成的空倉(cāng)都是正?，F(xiàn)象。而人為導(dǎo)致違規(guī)空庫(kù)是嚴(yán)令禁止的，個(gè)別糧庫(kù)在未經(jīng)批準(zhǔn)的情況下擅自銷售、動(dòng)用，有個(gè)別糧庫(kù)為套取貸款或補(bǔ)貼，甚至虛報(bào)庫(kù)存。對(duì)這類違規(guī)空庫(kù)和謊報(bào)庫(kù)存的行為決不姑息。

針對(duì)國(guó)家糧庫(kù)的糧食質(zhì)量問題，糧食局副局長(zhǎng)任正曉表示，從近幾年國(guó)家有關(guān)部門對(duì)庫(kù)存糧食質(zhì)量抽查結(jié)果看，庫(kù)存糧食質(zhì)量總體良好，質(zhì)量合格率和品質(zhì)宜存率逐年提高。以2008年為例，中央儲(chǔ)備糧質(zhì)量合格率達(dá)到97.9％，品質(zhì)宜存率為99.5‰地方儲(chǔ)備糧質(zhì)量合格率和品質(zhì)宜存率也較高。少數(shù)不達(dá)標(biāo)的主要是原糧的雜質(zhì)、水分、不完善粒超標(biāo)。所以從總體上看，目前庫(kù)存糧食可以放心加工、消費(fèi)。