安勝欣 江章應(yīng) 彭成松
摘 要: 構(gòu)建S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(sam2)的基因工程菌,為S-腺苷甲硫氨酸(S-ade nosylmethionine,SAM)的工業(yè)化生產(chǎn)提供參考。應(yīng)用PCR技術(shù)從釀酒酵母的總DNA中擴(kuò)增出 1.2 kb的sam2,構(gòu)建重組載體pET28a-sam2,將其轉(zhuǎn)入大腸桿菌進(jìn)行表 達(dá)和分析。SDS-PAGE顯 示重組克隆表達(dá)的SAM2分子量約47 kD,重組蛋白量約細(xì)菌總蛋白的20.1% ,酶活達(dá)到19.6 nmol/(h?mL),大腸桿菌表達(dá)出了具有生物活性的sam2。
關(guān)鍵詞:釀酒酵母;SAM;克隆
中圖分類號:Q786 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1672-1098(2008)03-0065-04
SAM是生物體內(nèi)一種重要的生理活性物質(zhì),參與體內(nèi)40多種生化反應(yīng)[1-4],對關(guān) 節(jié) 炎、抑郁癥、肝功能紊亂等均有較好的療效,而且還是預(yù)防癌癥、心血管疾病和抗衰老的高 級保健品[5]。因此,研制、開發(fā)SAM具有重要理論和實(shí)際意義。
盡管SAM的療效已得到人們的認(rèn)可,但生產(chǎn)成本昂貴使其應(yīng)用受到限制。目前國內(nèi)外都 在競相開發(fā)廉價的SAM合成工藝。SAM的制備主要有發(fā)酵法和酶促合成法[6-8], 后者雖具有終產(chǎn)物積累量高,易分離純化等優(yōu)點(diǎn),但因原料ATP成本高,已很少使用。發(fā)酵 法因其生產(chǎn) 工藝簡單、成本低成為較為有效的工業(yè)化生產(chǎn)方法,但受微生物自身?xiàng)l件的限制,如SAM 合成酶含量少、酶活不高[9],而且分離純化困難。隨著基因工程技術(shù)的發(fā)展,利 用高活力的腺苷甲硫氨酸合成酶基因工程菌發(fā)酵生產(chǎn)SAM以提高其產(chǎn)量成為可能。而釀酒酵 母sam2的活力較其它微生物高成為理想的酶源[10]。就目前已經(jīng)構(gòu)建的基因工 程菌[11-13]來說,大腸桿菌具有生產(chǎn)周期短、工藝操作簡單、原料成本低等優(yōu)點(diǎn) ,是較為理想的宿主來源。本文以釀酒酵母作為出發(fā)菌株,克隆sam2,并將其轉(zhuǎn)入大腸 桿菌中進(jìn)行表達(dá),旨在為SAM的廉價工業(yè)化生產(chǎn)提供參考。
1 材料和方法
1.1 材料
釀酒酵母、E.coli DH5 a、E.coli BL21(DE3)均為實(shí)驗(yàn)室保存;pUCm-T 載體表 達(dá)載體p ET28a購自上海生物工程有限公司。各種限制性內(nèi)切酶、Taq DNA聚合酶、T4 DNA連接酶及DN A ladder、各種試劑盒均為TaKaRa公司產(chǎn)品;IPTG、氨芐青霉素、卡那霉素為Merck公司產(chǎn) 品;低分子量蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)為上海生物化學(xué)研究所產(chǎn)品;丙烯酰胺,2N′-亞甲基雙丙烯酰胺 為欣經(jīng)科公司產(chǎn)品;SAM標(biāo)準(zhǔn)品為Sigma公司產(chǎn)品;其他生化試劑或常規(guī)試劑均為分析純或者 超純。
1.2 方法
(1) 釀酒酵母基因組DNA的提取方法 按照基因組DNA提取試劑盒說明 書進(jìn)行制備。
(2) PCR擴(kuò)增sam2 參考GenBank中(登錄號M23368)sam2的 基因序列設(shè)計(jì)軟件PCR引物:
上游引物P1: 5′-CGGAATTCATGTCCAAGAGCAAAACTTT-3′
下游引物P2: 5′-CCAAGCTTAGCATAAAGAAAGGGATTGA-3′
其中上、下游引物中加入EcoR I、Hind III酶切位點(diǎn)。 以1.2.1提取的基 因組DNA為 模板,以P1、 P2為引物擴(kuò)增sam2。 PCR反應(yīng)參數(shù)為: 模板 2 μL; 10× 緩沖液 5 μL;引物1、引物2(20 μM) 2 μL;四種 脫氧 核苷酸(25 mM) 0.5 μL; MgCl2(25 mM) 3 μL;DNA聚合酶0.5 μL;總體積50 μL。PCR反應(yīng)條件: 9 4 ℃ 變性5 min; 94 ℃ 30 s, 55 ℃復(fù)性45 s、 72 ℃延伸1 min, 30個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠上電泳。
(3) 重組質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定 用DNA快速純化片斷回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物中約1 .2 kb的DNA 片斷。回收片斷與載體pUCm-T連接過夜后,轉(zhuǎn)化E.coli DH5 a,菌液涂布于含有IPTG 、X-gal及氨芐青霉素(70 μg/μL)LB平板上,37 ℃培養(yǎng)24 h后將長有菌落的平板置4 ℃冰箱數(shù)小時,用消毒的牙簽挑取 白色菌落,提取質(zhì)粒,EcoR I、Xhol I雙酶切鑒定篩選陽性重組子。將篩選 的陽性重組子pUCm-sam 2送上海生物工程公司測序分析。將鑒定正確的重組質(zhì)粒pUCm-sam2切下目的片斷后,與 用此兩種酶雙酶切的表達(dá)載體pET28a連接,構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒pET-sam2,轉(zhuǎn)入E.coliBL21(DE3),涂布于含卡那霉素(30 μg/μL)的LB平板上,酶切鑒定以篩 選陽性。
(4) sam2的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE分析 將鑒定的陽性克隆單菌落 3 7 ℃培養(yǎng)過夜后以1%接種量接種于含卡那霉素(30 μg/μL)的LB 培養(yǎng) 基中擴(kuò)大培養(yǎng),繼續(xù)培養(yǎng)至A600=0.5時,添加IPTG至終濃度為1 mmo l/L 來誘導(dǎo)表達(dá)SAM2。對誘導(dǎo)表達(dá)的不同時間取樣進(jìn)行分析。樣品離心收集菌體,用100 μL的上樣緩沖液重懸。沸水煮5 min,高速離心,取10 μL 上清按常規(guī)方法進(jìn)行SDS-PAGE(分離膠質(zhì)量分?jǐn)?shù)為12%)電泳。
(5) sam2表達(dá)產(chǎn)物的鑒定及酶活測定 將轉(zhuǎn)化菌擴(kuò)大培養(yǎng)到10 0 mL LB培養(yǎng)基中, 37 ℃, IPTG 1 mmol/L誘導(dǎo)表達(dá) 一定時 間后離心收集菌體, 用PBS緩沖液洗2次,加溶菌酶至質(zhì)量濃度為1.5 mg/L,3 7 ℃緩慢振蕩3 h,用0.2 M的HCl調(diào)節(jié)pH至4.5,鏡檢的 細(xì)胞破碎情況,離心收集細(xì)胞碎片(4 ℃,12 000 g,20 min)和上清液。將細(xì)胞碎片和上清液進(jìn)行SDS-PAGE凝膠分析。
酶活力參考文獻(xiàn)[6]296進(jìn)行測定。酶的活力單位定義為:在上述反應(yīng)條件下,37 ℃,60 min催化形成1 μmolSAM所需要的酶量為一個 活力單位。
2 結(jié)果
2.1 sam2的擴(kuò)增
將PCR產(chǎn)物在1.0%的瓊脂糖凝膠上電泳,可得到一條約1.2 kb的DNA片斷,與s am2基因編碼的序列大小一致(見圖1)。
2.2 重組質(zhì)粒的鑒定
隨機(jī)挑取轉(zhuǎn)化平板上的白色菌落,37 ℃振蕩培養(yǎng)后快速提取質(zhì)粒,將經(jīng)雙酶切 鑒定篩選的陽性重組子pUCm-sam2送至上海生工測序鑒定,測序結(jié)果表明有四個核苷酸 發(fā)生突變,但由于密碼子的簡并性,氨基酸并沒有發(fā)生改變。將上述sam2基因片段與pE T28a連接后,轉(zhuǎn)入E.coli BL21(DE3),涂布于含卡那霉素(30 μg/μL) 的L B平板上,37 ℃過夜培養(yǎng)。隨機(jī)挑選菌落,抽提質(zhì)粒進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切鑒 定,經(jīng)1.0%的瓊脂糖凝膠電泳分析,分析結(jié)果表明pET28a上也插入了1.2 kb的D NA片斷見圖2。
2.3 sam2的SDS-PAGE
SDS-PAGE檢測結(jié)果如圖3, IPTG誘導(dǎo)1 h, 2 h,4 h ,6 h,8 h,10 h,外源蛋白S-腺苷甲 硫氨酸合成酶均有表達(dá),且隨著時間的延長表達(dá)量增大。對電泳結(jié)果掃描顯示,在8 h時表達(dá)量最大,可達(dá)到細(xì)菌總蛋白20.1%。外源蛋白的相對分子量約為47 kD,其中包含了利用該載體在重組蛋白N端附加的34個氨基酸的相對分子量,附加的氨基 酸含有6個組氨酸的標(biāo)記蛋白。所測得的相對分子量減去載體自帶的34個氨基酸的相對分子 量與釀酒酵母中sam2表達(dá)的蛋白的相對分子量43 kD是相符的。
2.4 sam2表達(dá)產(chǎn)物的鑒定及酶活測定
將經(jīng)1.2(5)處理后的上清和細(xì)胞碎片進(jìn)行SDS-PAGE凝膠分析(見圖4)。由圖4可以看出 sa m2表達(dá)蛋白大多存在于細(xì)胞碎片中,以包涵體形式存在,以水溶形式存在的量很少。
圖4 SDS-PAGE檢測目的蛋白的表達(dá)形式 將上述處理得到包涵體用洗滌液洗滌,然后溶解在含8 mol/L的尿素變性緩沖液 中,4 ℃放置過夜后稀釋20倍,加入還原型谷胱甘肽(2 mmol/L) 和氧化型谷胱甘肽(0.5 mmol/L)于4 ℃復(fù)性24 h。 最后用0.45 μm膜過濾后, 用鎳離子親和層析濃縮純化重組蛋白。 用純化后 的蛋 白測定酶活力。 高效液相色譜測定結(jié)果表明: 純化蛋白的酶活達(dá)到19.6 nmol /(h?mL), 大腸桿菌表達(dá)出有活性的S-腺苷甲硫氨酸合成酶。
3 討論
大腸桿菌是基因工程中采用最多的蛋白質(zhì)表達(dá)體系,因其遺傳背景清楚、技術(shù)操作簡便 、培養(yǎng)條件簡單、大規(guī)模發(fā)酵經(jīng)濟(jì),常常作為外源基因高效表達(dá)的首選體系。但是因大腸桿 菌結(jié)構(gòu)簡單,細(xì)胞缺少真核細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄后加工系統(tǒng),并且作為大腸桿菌原核表達(dá)載體不具備 識別內(nèi)含子、外顯子的能力。根據(jù)釀酒酵母的蛋白數(shù)據(jù)庫及其基因組數(shù)據(jù)庫的信息表明,釀 酒酵母的sam2不具備內(nèi)含子,所以可以直接以釀酒酵母的染色體DNA為模板,為工業(yè)化 生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
本文通過一系列的分子生物學(xué)操作,成功的構(gòu)建了重組表達(dá)載體pET-sam2并將其轉(zhuǎn)入大 腸桿菌BL21(DE3)中進(jìn)行了誘導(dǎo)表達(dá)。SDS-PAGE圖顯示外源蛋白分子量的大小約為47 kD,而理論值為43 kD,是除了sam2基因得以正常表達(dá)外,表達(dá)載體 自身的102個堿基也得到了表達(dá)。外源蛋白減去表達(dá)載體上的102個堿基所翻譯的34個氨基酸 的相對分子量后大約為43 kD,與理論相符。
基因表達(dá)產(chǎn)物能否在宿主細(xì)胞中穩(wěn)定積累而不被內(nèi)源蛋白水解酶所水解是克隆基因的有 效表達(dá)的一個重要因素。某些外源蛋白可以在宿主細(xì)胞中以包涵體的形式表達(dá),這種不溶性 的沉淀復(fù)合物可以抵抗宿主細(xì)胞蛋白酶的降解,也便于純化。然而經(jīng)包涵體純化的重組蛋白 必須經(jīng)過變性-復(fù)性的處理,才能獲得具有生物活性的蛋白。但在變性-復(fù)性的處理中可能對 蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象造成不可預(yù)知的影響[14]。有本實(shí)驗(yàn)結(jié)果,sam2酶活力為19 .6 nmol/(h?mL)可以看出,酶活力相對較低,這可能就是在變性-復(fù)性的處理 中,其天然構(gòu)象發(fā)生變化,使 活性降低;另外,包涵體是也是蛋白高效表達(dá)的結(jié)果,低溫培養(yǎng)可以防止包涵體的生成,以 后實(shí)驗(yàn)可以在低溫條件下進(jìn)行,避免形成包涵體影響酶活力。也可以通過優(yōu)化發(fā)酵條件,提 高sam2的酶活以提高蛋白的產(chǎn)量。
參考文獻(xiàn):
[1] 余志良,楊晟,蔡謹(jǐn).S-腺苷甲硫氨酸研究進(jìn)展[J].2003,34(1):49-53.
[2] KONIG B.A long-term(two years) clinical trail with S-adenosy l-methionine for the treatment of osteoarthritis[J].Am J Med,1987,83(suppl 5 A):89-69.
[3] BITTIGLIERI T.Admetionie(S-adenosyl-methionine)neurologicology:Implication for drug therapies in psychiatric and neurological disorders[J]. E xpert opin Invest Durgs,1997,6(4):417-430.
[4] MATO J M,ALBAREZ L,ORTIZ P, et al. S-ade-
nosyl-L-methionine syn th etase and methionine metabolism deficiencies in cirthosis[J].Adex Exp Med,1994 ,368:113-119.
[5] 湯亞杰,李艷等,S-腺苷甲硫氨酸的研究進(jìn)展[J].生物技術(shù)通報,200 7, 3: 76-81.
[6] LI DY,YU J,JI XS,et al.Production of SAM by recombinant Pichia pas toris[J].J Biotechnol, 2002,18(3):295-299.
[7] MATOS JR, RAUSHEL FM, WONG CH. S-ade-
nosylmethionine: Studies o n che mical and enzymatic synthsis[J].Biotechnol Appl Biochem,1987,9(1):39-52.
[8] 公劍,韋平和.S-腺苷甲硫氨酸合成酶及其在S-腺苷甲硫氨酸合成在中 的應(yīng)用[J].藥物生物技術(shù),2001,8(2):108-111.
[9] SHIOZAKI S,SHIMIZU S,YAMADA H.Unusual intracellular accumul ation of S-adenosyl-L-methionine by microorganisms[J].Agric Biol Chem,1984,48 (9):2 293-2 300.
[10] TSUTOMU KODAKIL,HINJI TSUJIL, NAOKO
OTANI.Differential tran scriptional reg ulation of two distinct S-adenosylmethionine synthetase gene(sam1 and sam2 )o f Saccharomyces cerevisiae[J].Nucl Acids Res Suppl, 2003,3:303-304.
[11] 張建國,蔡瑞,李新華.發(fā)酵重組Pichia pastoris生產(chǎn)腺苷甲硫氨酸的研 究[J].工業(yè)微生物,2004,34(4):1-5.
[12] 陶敏,干信.S-腺苷甲硫氨酸合成酶在大腸桿菌中的表達(dá)與克?。跩].生物 技術(shù),2006,16(3):20-22.
[13] 吳雪昌,應(yīng)曉屹.提高酵母S-腺苷甲硫氨酸表達(dá)量的研究[J].中國藥學(xué)雜 志,2007,42(8):564-571.
[14] 姚文斌.生物技術(shù)制藥概論[M].北京:中國醫(yī)藥出版社,2006:53-58.
(責(zé)任編輯:李 麗)