中國科學界的一批頂尖人士在《自然》“中國增刊2”中撰文指出，科技部實際上已經(jīng)演化成一個控制大量科技經(jīng)費的部門，中國每年大約有1000億元左右的科技經(jīng)費投入，其中約150億由科技部來支配。由于行政官員對科技經(jīng)費分配很難按項目本身優(yōu)秀程度來確定，使得科技經(jīng)費浪費與貪污情況無法避免。與此同時，大量科技人才為了爭取科技經(jīng)費，不得不繞著行政人員轉(zhuǎn)。

因此他們建議，將科技部管理科技資金的功能轉(zhuǎn)移到相對較為獨立、所受行政干擾較少、評審較為公正的國家自然科學基金委員會等部門。

此次來自《自然》“中國增刊2”的集中“發(fā)難”傳達了這樣一種信號，關(guān)于中國科技體制改革的探討目前已經(jīng)集中到科技經(jīng)費主導權(quán)這一核心問題上——誰來決定花錢，花什么錢，誰來花，怎么花。

此次圍繞經(jīng)費權(quán)的專業(yè)與行政之爭，不管其最終結(jié)果如何，有一點毋庸置疑：行政主導型的科技經(jīng)費運作體制必將迎來變革，專業(yè)精神、程序公正和透明原則將日益成為主導力量。