摘要:為明確患根腐病的油茶在不同病情等級(jí)下根系和根際土壤內(nèi)真菌群落組成、多樣性、功能特征及與環(huán)境因子的關(guān)系,以德宏州梁河縣的油茶為研究對(duì)象,利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)5個(gè)病情等級(jí)的油茶根系及根際土壤內(nèi)真菌的轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)序列進(jìn)行測(cè)序。結(jié)果表明,染病油茶根系及根際土壤內(nèi)的真菌群落多樣性(Shannon指數(shù))降低,根系中真菌總OTUs(operational taxonomic units)、特有OTUs和豐富度(Chao1指數(shù))呈先增加后減少的趨勢(shì);根際土壤中染病油茶真菌群落的均勻度和豐富度上升。門水平上,子囊菌門(Ascomycota)和擔(dān)子菌門(Basidiomycota)為根系及根際土壤中共同的優(yōu)勢(shì)菌門,球囊菌門(Glomeromycota)和被孢囊門(Mortierellomycota)在根系中豐度表現(xiàn)為逐級(jí)遞減的趨勢(shì)。屬水平上,患病后油茶根系內(nèi)樹狀孢屬(Dendrosporium)、暗雙胞屬(Cordana)、Matsushimamyces、無柄盤菌屬(Pezicula)、黑孢盤屬(Melanconium)的豐度明顯上升。油茶林下土壤真菌群落結(jié)構(gòu)的主要影響因子為速效鉀、有機(jī)質(zhì)、pH、速效磷,真菌群落與環(huán)境因子聯(lián)合分析結(jié)果表明,部分有益菌和磷含量呈正相關(guān),部分病原菌和鉀含量呈負(fù)相關(guān)。FUNGuild 功能分析表明,油茶根系及根際土壤中真菌以腐生型為主,健康油茶中共生營養(yǎng)型真菌豐度最高,染病后逐漸降低;從Ⅱ級(jí)病害以后的油茶根系內(nèi)植物病原功能群開始成為優(yōu)勢(shì)功能群。綜上所述,油茶患病后真菌的多樣性減少,根系內(nèi)部分有益真菌豐度減少,植物病原菌和腐生菌增加,叢枝菌根真菌的定殖在調(diào)節(jié)油茶病健關(guān)系中發(fā)揮著重要的作用。針對(duì)德宏州梁河縣的油茶基地,需要多施鉀肥和磷肥,減少氮肥的施用,可提高部分有益菌的豐度,降低病原菌的豐度,從而減輕油茶根腐病的發(fā)生。
關(guān)鍵詞:油茶根腐?。徽婢鄻有?;群落結(jié)構(gòu);土壤理化性質(zhì);FUNGuild功能
doi:10.13304/j.nykjdb.2022.1006
中圖分類號(hào):S763.7;S476 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1008?0864(2024)07?0121?15
油茶(Camellia oleifera)泛指山茶科(Theacea)山茶屬(Camellia)中種子含油率較高且有利用價(jià)值的一類木本食用油料植物[1]。油茶籽富含不飽和脂肪酸,是健康型高級(jí)食用植物油,也是我國食用油的重要組成部分,被譽(yù)為“東方橄欖油”[2]。油茶在中國已有2 300年的栽植歷史,截至2020年,我國實(shí)有油茶林面積445.1 萬hm2,預(yù)計(jì)2030 年將達(dá)到618.67萬hm2[3]。油茶的種植區(qū)域主要在長江流域及其以南地區(qū)[4],云南省德宏州是油茶主要種植區(qū)域之一,但近年來多處油茶林頻發(fā)炭疽病、根腐病和灰斑病等病害,致使油茶品質(zhì)和產(chǎn)量下降,一定程度上影響了德宏州油茶產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
植物內(nèi)生菌是植物微生態(tài)系統(tǒng)的重要組成,有增強(qiáng)植株抗病蟲害等生態(tài)功能[5];根際土壤中的微生物能夠轉(zhuǎn)化土壤養(yǎng)分,參與有機(jī)質(zhì)的分解來維持土壤的健康[6]。微生物群落的組成受到環(huán)境因子和氣候的影響,植物根系會(huì)向土壤中釋放化合物招募不同的微生物,從而吸引更多有益的微生物,同時(shí)微生物能向植物提供更復(fù)雜的反饋[7]。作為土壤微生物中的重要組成,真菌比細(xì)菌更加敏感,它對(duì)植物攝取營養(yǎng)物質(zhì)、促進(jìn)生長發(fā)育、提高宿主植物抗病性以及維持根際微生態(tài)系統(tǒng)平衡等起重要調(diào)節(jié)作用[8]。土壤真菌多樣性及群落結(jié)構(gòu)是評(píng)價(jià)生態(tài)系統(tǒng)是否健康穩(wěn)定的重要指標(biāo)。因此,研究根系及根際土壤真菌有助于了解該區(qū)域植株及土壤的健康情況并提出針對(duì)性意見。
油茶根腐病是危害德宏州油茶林較嚴(yán)重的一種病害,油茶受到病原菌侵染后,根部初期癥狀表現(xiàn)為褐色或黑褐色,后期癥狀表現(xiàn)為表皮腐爛脫落,嚴(yán)重時(shí)癥狀延伸到根莖交界處。地上部分植株表現(xiàn)為葉片黃化脫落,植株矮小,嚴(yán)重時(shí)整株枯死,嚴(yán)重影響油茶果的產(chǎn)量,損害經(jīng)濟(jì)效益。因此,亟需對(duì)油茶林生長環(huán)境進(jìn)行探究,明確土壤微生物對(duì)油茶生長和病害的影響。本研究以德宏州油茶林為對(duì)象,利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)不同發(fā)病程度油茶的根系及根際土壤真菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性進(jìn)行檢測(cè),并分析真菌功能多樣性以及根際土壤真菌與環(huán)境理化因子的相關(guān)性,以期為開發(fā)有益的油茶根際微生物資源、調(diào)控土壤環(huán)境因子和預(yù)防油茶病害提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 研究區(qū)概況
采樣地位于德宏州梁河縣九保鄉(xiāng)丙界村(24°48’59” N、98°19’40” E),海拔1 451 m,屬南亞熱帶季風(fēng)氣候,年均氣溫18.3 ℃,年均降水量1 396.2 mm。本研究選擇的油茶林占地44.4 hm2,是白花油茶示范基地,具有一定的代表性。經(jīng)課題組前期分離回接試驗(yàn)鑒定,本次油茶根腐病的主要病原為鐮刀菌屬的尖孢鐮刀菌(Fusariumoxysporum)。
1.2 樣品采集
研究對(duì)象為10年生的白花油茶,品種為‘德林油B1’。根據(jù)油茶地上部分發(fā)病情況進(jìn)行取樣對(duì)象選擇,共分為5個(gè)病害等級(jí),每個(gè)等級(jí)選擇長勢(shì)相近的6株油茶,共選取30棵油茶樹。每棵樹之間距離大于20 m。去除表面枯葉及雜質(zhì),在距離主干約30~50 cm的4個(gè)方向,將油茶的根系拔出,抖落并收集須根土壤樣品,充分混勻,為根際土壤樣品(S);抖落土壤后的二級(jí)側(cè)根,為根系樣品(R)。
根據(jù)油茶根系發(fā)病程度設(shè)為5個(gè)處理,每個(gè)處理分別對(duì)應(yīng)1個(gè)病情等級(jí)。0級(jí):根部健康無癥狀;Ⅰ級(jí):主根基部輕微褐變,側(cè)根正常;Ⅱ級(jí):主根部分褐變,側(cè)根輕微褐變;Ⅲ級(jí):主根及側(cè)根褐變,側(cè)根脫落;Ⅳ級(jí):根部變黑腐爛,側(cè)根脫落,整株枯死[9]。取6份同一病害等級(jí)下的不同油茶植株的根系及根際土壤,充分混合為1個(gè)樣本,最終0、Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級(jí)下根際土壤分別命名為HS0、DS1、DS2、DS3、DS4,根系分別命名為HR0、DR1、DR2、DR3、DR4。將樣本用干冰保存運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,根系樣品表面消毒流程為:75%乙醇1 min,無菌水沖洗1次,用有效氯5%(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù))的次氯酸鈉溶液表面消毒5 min,無菌水沖洗3次。吸取100 μL最后一遍清洗的無菌水涂布于PDA培養(yǎng)基觀察是否有菌落生長,依此判斷表面消毒是否徹底[10]。土壤以200目篩網(wǎng)過篩,分為2份,1份用于分子試驗(yàn),1份用于理化性質(zhì)測(cè)定。
1.3 土壤理化性質(zhì)測(cè)定
采用電位法測(cè)定土壤pH;采用重鉻酸鉀容量法測(cè)定土壤有機(jī)質(zhì)(organic matter,OM)含量;采用高錳酸鉀-還原性鐵法測(cè)定全氮(total nitrogen,TN)含量;采用氫氧化鈉熔融法測(cè)定全鉀(totalpotassium,TK)含量;采用氫氧化鈉熔融-鉬銻抗比色法測(cè)定全磷(total phosphorus,TP)含量;采用紫外分光光度法測(cè)定硝態(tài)氮(nitrate nitrogen,NO-3-N)含量;采用蒸餾后滴定法測(cè)定銨態(tài)氮(ammoniumnitrogen,NH+4-N)含量;采用醋酸銨-火焰光度計(jì)法測(cè)定速效鉀(available potassium,AK)含量;采用鉬銻抗比色法測(cè)定測(cè)定速效磷(availablephosphorus,AP)含量[11]。每個(gè)樣品重復(fù)3次。
1.4 土壤真菌總DNA 提取及高通量測(cè)序
將采集的土壤、根系樣品進(jìn)行微生物DNA的提取。采用E.Z.N.A Mag-Bind soil DNA Kit提取試劑盒(OMEGA)提取總DNA。用瓊脂糖凝膠檢測(cè)DNA 完整性,用Qubit定量測(cè)定樣本含量。以土壤和根系作為模板,用ITS1F(5’-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3’)和ITS2R(5’-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3’) 擴(kuò)增真菌內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)中長度約250 bp的ITS1區(qū)段。PCR 反應(yīng)為30 μL體系:15 μL 2×Hieff? Robust PCR Master Mix、1 μL Bar-PCR primerF、1 μL Primer R、10~20 ng PCR產(chǎn)物、9~12 μL H2O補(bǔ)足30 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,45 ℃退火20 s,65 ℃延伸30 s,5個(gè)循環(huán);94 ℃變性20 s,55 ℃退火20 s,72 ℃延伸30 s,20個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物用于構(gòu)建微生物多樣性測(cè)序文庫,送至生物工程(上海)股份有限公司使用Illumina Miseq高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。
1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)生物信息學(xué)及統(tǒng)計(jì)分析
利用Cutadapt(version1.18)、PEAR (version 0.9.8)、PRINSEQ(version 0.20.4)等軟件對(duì)Illumina Miseq測(cè)序獲得的序列進(jìn)行質(zhì)控和過濾,得到各樣本的高質(zhì)量序列。利用Usearch 軟件(version11.0.667),按照97% 相似性對(duì)非重復(fù)序列進(jìn)行OTUs(operational taxonomic units)聚類,在聚類過程中去除嵌合體,得到OTUs的代表序列。采用RDP classifier 貝葉斯算法(version 2.12)對(duì)97% 相似度水平的OTUs代表序列進(jìn)行分類學(xué)分析,并在門、綱、目、科、屬、種水平統(tǒng)計(jì)各個(gè)樣品的菌落組成,繪制不同分類水平真菌類群的相對(duì)豐度圖。利用Mothur(version1.43.0)軟件計(jì)算各樣本的Chao1 指數(shù)、Ace 指數(shù)、Shannon 指數(shù)、Simpson 指數(shù),分析樣本真菌的Alpha 多樣性。利用R 的gplots package繪制不同分類的相對(duì)豐度熱圖。采用冗余分析(redundancy analysis, RDA)進(jìn)行環(huán)境因子與微生物群落分布的關(guān)聯(lián)分析?;诠采⒏筒±?種營養(yǎng)型來劃分[12]真菌的生態(tài)功能類群。運(yùn)用FUNGuild 數(shù)據(jù)庫對(duì)5組根系樣品和5組根際土壤樣品真菌群落進(jìn)行功能預(yù)測(cè),置信水平選用highly probable 和probable。應(yīng)用Excel2010 對(duì)各分類單元數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),使用Word2010進(jìn)行表格制作,使用SPSS進(jìn)行差異顯著性分析,運(yùn)用Duncan法(Plt;0.05)進(jìn)行單因素方差分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 油茶植被土壤理化性質(zhì)分析
由表1 可知,油茶土壤為酸性土壤,pH 在4.50~4.90。土壤中有機(jī)質(zhì)和全氮含量隨著油茶病害等級(jí)的上升呈現(xiàn)出逐級(jí)遞增的趨勢(shì),病害等級(jí)為0級(jí)的油茶土壤的有機(jī)質(zhì)和全氮含量最低,患病后升高;全鉀含量隨著油茶病害等級(jí)的上升呈現(xiàn)出逐級(jí)遞減的趨勢(shì),病害等級(jí)為0級(jí)的油茶土壤的全鉀含量最高,患病后降低。
2.2 不同病害等級(jí)油茶根系及根際土壤內(nèi)真菌的α 多樣性分析
Alpha 多樣性分析結(jié)果如表2 所示,在根系中,0 級(jí)油茶真菌的Shannon 指數(shù)(3.07)最高,Simpson指數(shù)(0.09)最低,表明健康油茶根系中真菌的多樣性最高,患病后真菌多樣性下降;而豐富度指數(shù)(Chao1指數(shù))則是隨著病害等級(jí)的增加,呈現(xiàn)先增加后減少的趨勢(shì),Ⅱ級(jí)油茶根系中真菌的豐富度(790.30)最高。
根際土壤中,油茶真菌的Shannon 指數(shù)隨病害等級(jí)的升高而降低,Simpson指數(shù)隨病害的升高而升高,說明油茶根際土壤中真菌的多樣性隨病害的加重而降低;同時(shí),0級(jí)油茶根際土壤中真菌的Chao1指數(shù)(871.34)和Ace指數(shù)(844.51)最低,感病后的油茶根際土壤中真菌的Chao1指數(shù)和Ace指數(shù)均有不同程度的升高,說明感病后真菌的物種豐富度上升。
2.3 不同病害等級(jí)油茶土壤及根系樣品細(xì)菌的OTUs 分類
對(duì)5個(gè)油茶根系樣本真菌進(jìn)行測(cè)序,共獲得高質(zhì)量質(zhì)控序列297 212條,平均長度243.06 bp,序列聚類共獲得1 019個(gè)OTUs,5個(gè)病情等級(jí)共有OTUs 198個(gè),占比19.43%。隨著病害等級(jí)的增加,油茶根系中的真菌總OTUs數(shù)呈現(xiàn)出先增加后減少的趨勢(shì)。就特有OTUs 而言,健康油茶(HR0)特有OTUs 60個(gè)(5.89%),Ⅰ級(jí)油茶(DR1)特有OTUs 84 個(gè)(8.24%),Ⅱ級(jí)油茶(DR2)特有OTUs 101個(gè)(9.91%),Ⅲ級(jí)油茶(DR3)特有OTUs67 個(gè)(6.58%),Ⅳ級(jí)油茶(DR4)特有OTUs 63 個(gè)(6.18%),表明特有OTUs隨病情等級(jí)增加也呈現(xiàn)出先增后減的趨勢(shì),其中Ⅱ級(jí)油茶特有的OTUs數(shù)最多(圖1A)。
對(duì)5個(gè)油茶根際土壤樣品進(jìn)行測(cè)序,共獲得高質(zhì)量質(zhì)控序列284 441條,平均長度248.94 bp,序列聚類共獲得1 585個(gè)OTUs,5個(gè)病情等級(jí)共有OTUs 246 個(gè),占比15.52%;健康油茶(HS0)根際土壤中的總OTUs數(shù)最少,患病后總OTUs數(shù)量增加, DS3 樣本中的總OTUs 數(shù)最多,占比52.18%。此外,0 級(jí)油茶(HS0)特有OTUs 110 個(gè)(6.94%),Ⅰ 級(jí)油茶(DS1)特有OTUs 115 個(gè)(7.26%),Ⅱ 級(jí)油茶(DS2)特有OTUs 108 個(gè)(6.81%),Ⅲ 級(jí)油茶(DS3)特有OTUs 121 個(gè)(7.63%),Ⅳ 級(jí)油茶(DS4)特有OTUs 120 個(gè)(7.57%)。由此可以看出,油茶患病后總OTUs數(shù)增加,但與病害等級(jí)無關(guān);而特有OTUs數(shù)與油茶的患病情況無明顯關(guān)系(圖1B)。
2.4 不同病害等級(jí)油茶根系及根際土壤的真菌物種組成
在門分類水平上對(duì)每組樣品的根系真菌相對(duì)豐度分布進(jìn)行分析并繪制優(yōu)勢(shì)物種相對(duì)豐度(gt;1%)柱形圖(圖2A),不同根系樣本中各門的相對(duì)豐度不同,子囊菌門(Ascomycota, 69.10%~93.26%)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota,3.13%~23.28%)和球囊菌門(Glomeromycota,2.24%~6.25%)在病害等級(jí)為0、Ⅰ和Ⅱ級(jí)的油茶根系樣本中為優(yōu)勢(shì)菌門(豐度前3);子囊菌門(90.01%~95.25%)、未明確地位的真菌(unclassified_fungi,3.14%~8.27%)和擔(dān)子菌門(1.24%~1.35%)在病害等級(jí)為Ⅲ和Ⅳ級(jí)的油茶根系樣本中為優(yōu)勢(shì)菌門。其中,子囊菌門相對(duì)豐度表現(xiàn)為HR0DR2gt;DR1gt;DR3gt;DR4,健康油茶根系中擔(dān)子菌門的相對(duì)豐度最高,患病后該類群相對(duì)豐度下降,Ⅳ級(jí)時(shí)相對(duì)豐度降至最低;此外,球囊菌門和被孢霉門(Mortierellomycota)的相對(duì)豐度都表現(xiàn)為HR0gt;DR1gt;DR2gt;DR3gt;DR4,呈現(xiàn)逐級(jí)遞減的趨勢(shì),健康根樣中相對(duì)豐度最高,Ⅳ級(jí)根樣中相對(duì)豐度最低。
如圖2B所示,健康根際土壤樣本與患病油茶樣本中各門的相對(duì)豐度不同,子囊菌門(Ascomycota,61.06%)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota,23.60%)和球囊菌門(Glomeromycota,4.59%)在健康油茶根際土壤樣本中為優(yōu)勢(shì)菌門(豐度前3);子囊菌門(61.06%~74.84%)、擔(dān)子菌門(5.08%~23.60%)和被孢霉門(Mortierellomycota,2.48%~20.72%)在病害等級(jí)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ級(jí)的油茶根際土壤樣本中為優(yōu)勢(shì)菌門。其中,子囊菌門相對(duì)豐度表現(xiàn)為HS0DS1gt;DS3gt;DS2gt;DS4,健康油茶根際土壤中擔(dān)子菌門的相對(duì)豐度最高,患病后該類群相對(duì)豐度不同程度地下降,Ⅳ級(jí)相對(duì)豐度降至最低;被孢霉門相對(duì)豐度表現(xiàn)為DS3gt;DS2gt;DS4gt;HS0gt;DS1,該類群在根際土壤中與病害的發(fā)生無明顯變化規(guī)律;球囊菌門相對(duì)豐度表現(xiàn)為HS0gt;DS2gt;DS1gt;DS3gt;DS4,健康油茶根際土壤中該類群的相對(duì)豐度最高,患病后相對(duì)豐度不同程度地下降,在Ⅳ級(jí)油茶中相對(duì)豐度降至最低。
從屬水平上分析(圖3A),0級(jí)油茶根系內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬( 相對(duì)豐度gt;5%)為粉褶菌屬(Entoloma,17.53%)、unclassified_Hyaloscyphaceae(13.93%)、梭鏈孢屬(Fusidium,10.01%)、規(guī)整霉屬(Codinaea,9.54%)和Alatospora(8.65%)。Ⅰ級(jí)油茶根系內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為樹狀孢屬(Dendrosporium,62.47%)和unclassified_Hyaloscyphaceae(7.48%)。Ⅱ 級(jí)油茶根系內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為樹狀孢屬(29.59%) 、Thozetella (18.78%) 、晶杯菌屬(Hyaloscypha,9.80%)和Cephalotheca(5.77%)。Ⅲ級(jí)油茶根系內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為樹狀孢屬(20.65%)、暗雙胞屬(Cordana,16.67%)、無柄盤菌屬(Pezicula,10.79%)、unclassified_fungi(8.27%)、黑孢盤屬(Melanconium, 6.91%)和樹粉孢屬(Oidiodendron,6.34%)。Ⅳ級(jí)油茶根系內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為暗雙胞屬(25.08%)、Matsushimamyces(24.42%)、樹狀孢屬(11.61%)、黑孢盤屬(5.63%)、unclassified_Dothideomycetes(5.57%)和unclassified_Hyaloscyphaceae(5.03%)。各樣本間的物種相對(duì)豐度差異較大,粉褶菌屬、Alatospora、梭鏈孢屬、規(guī)整霉屬和unclassified_Hyaloscyphaceae 在健康油茶根系內(nèi)占比最大, 在油茶患根腐病后,樹狀孢屬、暗雙胞屬、Matsushimamyces、無柄盤菌屬、黑孢盤屬、unclassified_fungi 和unclassified_Dothideomycetes 的相對(duì)豐度明顯增加。
根際土壤內(nèi)(圖3B),0級(jí)油茶真菌的優(yōu)勢(shì)屬為Fellozyma(5.91%)。Ⅰ級(jí)油茶根際土壤內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為樹狀孢屬(Dendrosporium,11.07%)、Verrucoconiothyrium (7.54%) 、原隱球菌屬(Saitozyma,6.17%)和unclassified_Sordariomycetes(5.72%)。Ⅱ級(jí)油茶根際土壤內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為被孢霉屬(Mortierella,18.42%)、毛殼菌屬(Chaetomium,11.52%)和赤霉屬(Gibberella,9.35%)。Ⅲ級(jí)油茶根際土壤內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為被孢霉屬(20.68%)、原隱球菌屬(7.86%)、Knufia(6.73%) 、錐毛殼屬(Coniochaeta,6.05%) 和Scleroconidioma(5.77%)。Ⅳ級(jí)油茶根際土壤內(nèi)真菌的優(yōu)勢(shì)屬為被孢霉屬(16.67%)、Mycofalcella(15.98%)和枝鼻菌屬(Cladorrhinum,9.16%)。各樣本間的物種相對(duì)豐度差異較大,患病情況較嚴(yán)重的3個(gè)等級(jí)下(Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ級(jí)),被孢霉屬的相對(duì)豐度明顯多于患病情況較輕(0和Ⅰ級(jí))的油茶。此外,發(fā)病情況最嚴(yán)重的油茶根際土壤中Mycofalcella 和枝鼻菌屬的相對(duì)豐度最高,且明顯多于其他病害等級(jí)下的;而在健康油茶根際土壤中Fellozyma的相對(duì)豐度最高,且明顯多于其他病害等級(jí)。
2.5 不同病情等級(jí)下油茶根系及根際土壤中真菌β 多樣性分析
在屬分類單元水平上,采用unweighted-unifrac算法對(duì)樣本進(jìn)行分析(圖4)。PCoA(principalco-ordinates analysis)分析結(jié)果顯示,PCoA1 軸解釋了關(guān)系值的31.43%,PCoA2軸解釋了關(guān)系值的20.32%,二者累計(jì)貢獻(xiàn)率為51.75%。根系樣品和根際土壤樣品在PCoA1上分開,此外,健康油茶根系內(nèi)的真菌組成與患病油茶的有明顯差異。
聚類樹顯示,健康油茶根系內(nèi)真菌群落組成處于獨(dú)立的分支,與患病油茶的根內(nèi)及根際土壤真菌組成存在較大差異;在患病油茶中,病害等級(jí)為Ⅰ級(jí)和Ⅱ級(jí)的真菌群落組成相似,病害等級(jí)為Ⅲ級(jí)和Ⅳ級(jí)的真菌群落組成相似。根際土壤中,健康油茶和Ⅰ級(jí)油茶的真菌群落組成相似,Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ級(jí)油茶的真菌群落組成相似。由此說明,健康油茶患病后,無論是根系還是根際土壤內(nèi)的真菌群落都存在過渡過程,真菌結(jié)構(gòu)隨病害程度的加重逐漸發(fā)生變化。
2.6 環(huán)境因子對(duì)油茶根系及根際土壤真菌群落組成的影響
通過方差膨脹因子分析,去掉多重共線性較強(qiáng)的因子,將剩余因子用于冗余分析(redundancyanalysis,RDA)。將油茶根際土壤真菌群落豐度前10(屬水平)以及4種環(huán)境因子進(jìn)行RDA分析,結(jié)果顯示(圖5),第1、第2 軸的解釋率分別為46.86%和23.24%,累計(jì)總解釋率達(dá)70.10%,表明該結(jié)果較好地反映了對(duì)真菌群落的影響,從大到小依次為:速效鉀gt;有機(jī)質(zhì)gt;pHgt;速效磷。選取豐度gt;1%的屬水平下根際土壤真菌,相關(guān)性類型為spearman,顯著性P 值為0.05,對(duì)油茶根際土壤真菌群落組成與土壤理化性質(zhì)相關(guān)性做熱圖分析(圖6)發(fā)現(xiàn),原隱球菌屬(Saitozyma)與速效磷(AP)呈顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.05),與pH 呈顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.05);Mycofalcella 與pH和全氮(TN)呈顯著正相關(guān)(Plt;0.05),與全鉀(TK)呈顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.05);毛殼菌屬(Chaetomium)與pH和全磷(TP)呈顯著正相關(guān)(Plt;0.05);暗雙孢屬(Cordana)與速效鉀(AK)呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01);Echria 與速效鉀呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01);粗糙孔菌屬(Trechispora)與pH和全磷呈顯著正相關(guān)(Plt;0.05)。
2.7 根系和根際土壤真菌群落的功能多樣性特征
運(yùn)用FUNGuild數(shù)據(jù)庫對(duì)5組根系樣品和5組根際土壤樣品真菌群落進(jìn)行真菌功能預(yù)測(cè)分析,得到真菌營養(yǎng)型在不同樣本中的相對(duì)豐度信息(圖7A、B),樣本中的真菌類群主要為病理營養(yǎng)型、腐生營養(yǎng)型、共生營養(yǎng)型、病理-腐生營養(yǎng)型等營養(yǎng)類型。其中,根系內(nèi)腐生營養(yǎng)型、病理-腐生營養(yǎng)型和共生營養(yǎng)型的相對(duì)豐度較高;根際土壤內(nèi)腐生營養(yǎng)型、腐生-共生營養(yǎng)型和共生營養(yǎng)型的相對(duì)豐度較高。
5個(gè)根系樣本和5個(gè)根際土壤樣本預(yù)測(cè)得到的生態(tài)共位群相對(duì)豐度如圖7C、D所示(選擇豐度gt;1%)。根系中,HR0的優(yōu)勢(shì)菌群(豐度gt;10%)包括叢枝菌根功能群(arbuscular mycorrhizal,39.95%)和木腐功能群(wood saprotroph,31.45%);DR1的優(yōu)勢(shì)菌群包括未定腐生功能群(undefinedsaprotroph,52.74%)、外生菌根-未定腐生功能群(ectomycorrhizal-undefined saprotroph,14.12%)和叢枝菌根功能群(arbuscular mycorrhizal,12.60%);DR2的優(yōu)勢(shì)菌群包括植物病原-木腐功能群(plant saprotroph-wood saprotroph,41.05%)和未定腐生功能群(undefined saprotroph,31.38%);DR3 和DR4 的優(yōu)勢(shì)菌群都為未定腐生功能群(undefined saprotroph,19.98%和22.23%)、植物病原- 植物腐生功能群(plant pathogen-plantsaprotroph,25.74% 和11.21%)、內(nèi)生-植物病原-植物腐生功能群(endophyte-plant pathogen-plantsaprotroph,16.47%和29.30%)、藻類寄生-苔蘚寄生-真菌寄生-未定腐生功能群(algal parasitebryophyteparasite-fungal parasite-undefined saprotroph,19.33%和14.66%)和外生菌根-未定腐生功能群(ectomycorrhizal-undefined saprotroph,13.92% 和12.98%)。根際土壤中,HS0的優(yōu)勢(shì)菌群(相對(duì)豐度gt;10%)包括未定腐生功能群(undefinedsaprotroph,19.95%)、內(nèi)生-植物病原-木腐功能群(endophyte-plant pathogen-wood saprotroph,16.19%) 和叢枝菌根功能群(arbuscularmycorrhizal,13.83%);DS1的優(yōu)勢(shì)菌群包括未定腐生功能群(undefined saprotroph,25.60%)和動(dòng)物病原-植物病原-未定腐生功能群(animal pathogenplantpathogen-undefined saprotroph,23.20%);DS2的優(yōu)勢(shì)菌群包括未定腐生功能群(undefinedsaprotroph,18.99%);DS3的優(yōu)勢(shì)菌群包括未定腐生功能群(undefined saprotroph,26.74%%)和動(dòng)物病原- 真菌寄生- 未定腐生功能群(animalpathogen-fungal parasite-undefined saprotroph,12.66%);DS4 的優(yōu)勢(shì)菌群包括未定腐生功能群(undefined saprotroph,28.59%)和內(nèi)生-凋落物腐生-土壤腐生-未定腐生功能群(endophyte-littersaprotroph-soil saprotroph-undefined saprotroph,20.05%)。可以看出,隨著病害等級(jí)的增加,植物病原菌和腐生菌增加,而叢枝菌根真菌的定殖可能在調(diào)節(jié)油茶病健關(guān)系中發(fā)揮著重要作用。
3 討論
真菌是土壤生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,是凋落物降解、養(yǎng)分周轉(zhuǎn)循環(huán)等多種生態(tài)系統(tǒng)過程或功能的核心介導(dǎo)及驅(qū)動(dòng)者[13]。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)德宏州油茶5個(gè)發(fā)病等級(jí)下根系及根際土壤中的真菌進(jìn)行測(cè)定,了解真菌多樣性、組成及功能的差異。根系內(nèi),真菌總OTUs數(shù)、特有的OTUs 數(shù)以及豐富度指數(shù)(Chao1 指數(shù))隨病害等級(jí)的上升呈先增加后減少的變化趨勢(shì),推測(cè)是由于油茶根部防御機(jī)制被破壞,原有內(nèi)生菌的結(jié)構(gòu)比例失衡,使得其他的病原及腐生微生物更容易侵入,導(dǎo)致根系中的微生物種類逐漸增多,到病級(jí)為Ⅱ級(jí)時(shí)最多,根系腐爛程度繼續(xù)加重后,腐生微生物成為優(yōu)勢(shì)類群,此消彼長,部分微生物類群消失,導(dǎo)致種類逐漸減少,因而呈現(xiàn)出先增加后減少的趨勢(shì)。研究還發(fā)現(xiàn),健康油茶根系內(nèi)真菌的多樣性指數(shù)(Shannon 指數(shù))最高,不同病害等級(jí)油茶根系內(nèi)真菌多樣性發(fā)生了不同程度的下降,這與戴瑞卿等[14]的研究結(jié)果一致。根際土壤中,多樣性指數(shù)(Shannon指數(shù))隨發(fā)病程度的加重呈逐級(jí)遞減趨勢(shì),說明病害越嚴(yán)重,根際土壤內(nèi)真菌的多樣性越低,這與李婷婷等[15]的研究結(jié)果一致,病原菌的入侵能降低土壤微生物的多樣性,可能是因?yàn)榛几∮筒韪H土壤中病原菌豐度增加,占據(jù)了更多的生態(tài)位,抑制了其他真菌的生存,導(dǎo)致真菌多樣性降低;同時(shí),土壤內(nèi)患病油茶真菌群落的豐富度指數(shù)(Chao1指數(shù))和均勻度指數(shù)(Ace指數(shù))較健康油茶有不同程度上升,這與向立剛等[16]的研究結(jié)果一致,可能是因?yàn)榛疾『笥筒璺烙芰档停烁嗤饨绛h(huán)境中的真菌侵入植株。
羅鑫等[17]在貴州7個(gè)地區(qū)油茶土壤樣品中共獲得634個(gè)OTUs,隸屬于9門、32綱、73目、141科和213屬,優(yōu)勢(shì)門為擔(dān)子菌門和子囊菌門,與本研究結(jié)果一致。本研究發(fā)現(xiàn),德宏州油茶根區(qū)內(nèi)有豐富的真菌類群,根系內(nèi)真菌共劃分為1 019個(gè)OTUs,根際土壤內(nèi)真菌共劃分為1 585個(gè)OTUs。子囊菌門有大量的腐生真菌[18],油茶患病后根系內(nèi)和根際土壤中子囊菌門的相對(duì)豐度增加。擔(dān)子菌門在健康油茶根系及根際土壤中的相對(duì)豐度最高,該類群可與植物共生形成菌根,有利于植物生長發(fā)育[19]。本研究還發(fā)現(xiàn),油茶根系內(nèi)的球囊菌門和被孢霉門豐度與病害呈負(fù)相關(guān),球囊菌門包含許多叢枝菌根(AM)真菌,AM 真菌能夠與植物根系形成互惠共生體,可提高植物的抗逆性[20];被孢霉門是很多植物的內(nèi)生菌,可幫助植物抵御病原的侵染,能夠促進(jìn)植物生長[21],它們的定殖能減輕油茶根腐病的發(fā)生。
從屬水平上看,根系內(nèi),油茶患根腐病后樹狀孢屬、暗雙孢屬、無柄盤菌屬和黑孢盤菌屬的相對(duì)豐度明顯上升,成為不同病害等級(jí)下的優(yōu)勢(shì)菌群。研究發(fā)現(xiàn),香蕉暗雙孢菌(Cordana musae)會(huì)引起香蕉葉斑病的發(fā)生[22],該類群在本研究中發(fā)病嚴(yán)重的油茶根系內(nèi)相對(duì)豐度明顯增高,其對(duì)油茶的致病性需進(jìn)一步研究。無柄盤菌屬是植物的內(nèi)生真菌,同時(shí)也是一種植物的病原菌。Kehr[23]曾報(bào)道,無柄盤菌屬真菌(Pezicula cinnamomea)會(huì)導(dǎo)致紅櫟樹干上發(fā)生潰瘍病,因此該類群可能會(huì)引起油茶根系的腐爛。黑盤孢屬會(huì)引起胡桃科和樺木科等植物的枝枯病,甚至導(dǎo)致植株死亡[24]。本研究發(fā)現(xiàn),在根腐病嚴(yán)重的油茶根系中有大量該類群的存在,對(duì)于其是否為根腐病的的病原菌還需進(jìn)一步研究。根際土壤中,患病油茶被孢霉屬和枝鼻菌屬的相對(duì)豐度升高。被孢霉屬是一種分解纖維素能力極強(qiáng)的屬,能夠很好地抵抗根腐病[25]。枝鼻菌屬也是一類有益真菌,可改善關(guān)鍵的土壤理化因子[26]。根際土壤中這類有益菌群的相對(duì)豐度在患病后升高,可能是因?yàn)橛筒柙谑艿讲≡秩竞?,根系產(chǎn)生分泌物,招募有益菌群。研究發(fā)現(xiàn),赤霉屬在根系及根際土壤樣品中均有分布,赤霉屬為鐮刀菌屬(Fusarium)的有性階段,它是油茶根腐病的主要病原,該類群的相對(duì)豐度與病害等級(jí)之間無明顯規(guī)律性,可能是因?yàn)槌嗝箤賰?nèi)的病原真菌并非都是致病的病原菌,因此相對(duì)豐度的變化不一定與病害等級(jí)相關(guān)。
組間β多樣性分析發(fā)現(xiàn),根系樣本和土壤樣本中真菌群落存在差異,而根系真菌來源于土壤[27],說明根系招募土壤真菌具有選擇性,這與根系分泌物或者生長發(fā)育過程相關(guān),且健康油茶根系內(nèi)真菌群落組成明顯區(qū)別于其他幾組患病的,說明患病會(huì)改變根系內(nèi)真菌群落結(jié)構(gòu)。本研究還發(fā)現(xiàn),無論是根系內(nèi)還是根際土壤內(nèi),相鄰病害等級(jí)間的真菌群落都有相似性,說明真菌群落的變化都存在一個(gè)逐漸過渡過程。
油茶喜好酸性土壤,本研究所測(cè)土壤pH 在4.5~4.9,屬于酸性土壤。植物病害發(fā)生與土壤理化特性的改變有關(guān)[28]。本研究發(fā)現(xiàn),有機(jī)質(zhì)和全氮隨著病害等級(jí)的上升逐級(jí)升高。陳海念[29]研究發(fā)現(xiàn),土壤理化因子中有機(jī)質(zhì)含量高會(huì)加劇煙株青枯病的發(fā)生,與本研究結(jié)果相似。有研究指出,施用氮肥過多作物發(fā)病率會(huì)更高、病害程度會(huì)加重[30]。全鉀含量隨著油茶病害等級(jí)的上升逐級(jí)遞減,土壤中的鉀可誘導(dǎo)植物根系分泌相關(guān)物質(zhì)來抑制病原菌的生長,從而減輕植物病害的發(fā)生[31]。本研究發(fā)現(xiàn),速效鉀、有機(jī)質(zhì)、pH和速效磷是影響根際土壤真菌群落組成的主要因子,這與羅鑫等[17]的研究結(jié)果部分相似,說明這些土壤因子對(duì)于5個(gè)樣本根際土壤真菌的群落組成和豐度起著重要作用。相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),原隱球菌屬與速效磷呈顯著正相關(guān),與pH呈顯著負(fù)相關(guān);Mycofalcell與pH和全氮呈正相關(guān),與全鉀呈正相關(guān);毛殼菌屬與pH和全磷呈正相關(guān),暗雙孢屬和Echria 與速效鉀呈極顯著負(fù)相關(guān),粗糙孔菌屬與pH和全磷呈正相關(guān)。由此表明,針對(duì)德宏州梁河縣的油茶基地,需要多施鉀肥和磷肥,少施氮肥,可提高部分有益菌的相對(duì)豐度,降低病原菌的相對(duì)豐度,從而減輕油茶根腐病的發(fā)生。
FUNGuild功能預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,油茶種植基地土壤真菌功能類群中腐生營養(yǎng)型真菌比例最大,其次為病理-腐生營養(yǎng)真菌,共生營養(yǎng)型真菌比例排名第3,與患病油茶相比,健康油茶中共生營養(yǎng)型真菌比例最高。共生型營養(yǎng)真菌與病原菌之間存在拮抗關(guān)系,能夠抑制病原的生長,從而保護(hù)寄主、減輕病原菌侵染帶來的危害[32]。從功能分組上可以看出,健康油茶根系及根際土壤中叢枝菌根功能群的相對(duì)豐度比患病油茶高,說明油茶根區(qū)有豐富的叢枝菌根真菌,叢枝菌根真菌通常與植物根系建立菌根共生體,減少植物病害的發(fā)生、促進(jìn)植物生長[33]。從Ⅱ級(jí)病害以后的油茶根系內(nèi)植物病原功能群開始成為優(yōu)勢(shì)功能群,說明從這一階段開始,有大量的病原菌對(duì)油茶根系進(jìn)行了侵染導(dǎo)致油茶病害發(fā)生加重。綜上,油茶患病后,根系和根際土壤真菌多樣性下降,部分有益真菌豐度下降,植物病原菌和腐生菌增加。本研究獲得的真菌群落組成、多樣性特征、優(yōu)勢(shì)類群、環(huán)境因子以及功能特征的分析結(jié)果具有一定的實(shí)踐意義,為預(yù)防植物病害及土壤真菌資源的開發(fā)利用提供了理論依據(jù)。
參 考 文 獻(xiàn)
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基金項(xiàng)目:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2019YFD1002002);國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31860208)。