郇 靖 苗德光 陸玉成 鄭 昊
(1.臨沂市人民醫(yī)院針灸科,山東 臨沂 276003;2.臨沂市人民醫(yī)院中醫(yī)門診,山東 臨沂 276003;3.臨沂市人民醫(yī)院生物標(biāo)本庫,山東 臨沂 276003;4.臨沂市人民醫(yī)院康復(fù)科,山東 臨沂 276003)
功能性消化不良(Functional dyspepsia,F(xiàn)D)是臨床常見的功能性胃腸疾病,具有起病緩慢、時(shí)輕時(shí)重、反復(fù)發(fā)作、病程纏綿等特點(diǎn),多表現(xiàn)為餐后飽脹、早飽感、上腹部疼痛、上腹部燒灼感等癥狀,無生化異常,且不能用器質(zhì)性、系統(tǒng)性或代謝性疾病等來解釋,嚴(yán)重影響患者生活質(zhì)量[1]。本病歸屬于中醫(yī)學(xué)“胃脘痛”“痞滿”等范疇,世界中醫(yī)藥學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)消化病專業(yè)委員會(huì)在痞滿中醫(yī)臨床實(shí)踐指南中推薦使用的柴胡舒肝散起主要作用的是柴胡-枳殼(CH-ZQ)。據(jù)《中華人民共和國藥典》[2]記載,柴胡味辛、苦,性微寒,歸肝、膽、肺經(jīng),能疏散退熱、疏肝解郁、升舉陽氣,用于感冒發(fā)熱、寒熱往來、胸脅苦滿等病證;枳殼味苦、辛、酸,性微寒,歸脾、胃經(jīng),能理氣寬中、行滯消脹,用于胸脅苦滿、食積不化、痰飲內(nèi)停等病證,二者共用治療肝氣郁滯的慢性胃炎、FD[3]等脾胃病,效果確切。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是建立在數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ)上的一種新方法,為預(yù)測(cè)藥物作用于疾病的關(guān)鍵靶點(diǎn)和通路提供了可靠的研究平臺(tái)[4]。文章擬采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究方法預(yù)測(cè)柴胡-枳殼藥對(duì)治療FD的作用機(jī)制。
1.1 軟件與數(shù)據(jù)庫本研究主要采用Cytoscape 3.7.1 軟件及插件構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)可視化圖和數(shù)據(jù)分析,主要使用數(shù)據(jù)庫包括TCMSP、GeneCards、STRING等。
1.2 柴胡-枳殼藥對(duì)活性成分篩選通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫搜集柴胡-枳殼藥對(duì)的所有化學(xué)成分,時(shí)間截至2022年4月,篩選OB≥30%、DL≥0.18,得到有效活性成分。
1.3 柴胡-枳殼活性成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建通過GeneCards 以“Functional dyspepsia”為關(guān)鍵詞檢索收集疾病相關(guān)的基因。運(yùn)用韋恩圖進(jìn)行疾病靶點(diǎn)與中藥活性成分作用靶點(diǎn)交集,然后運(yùn)用Cytoscape 3.7.1 軟件構(gòu)建柴胡-枳殼活性成分-靶點(diǎn)和疾病-靶點(diǎn)的可視化網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)圖。
1.4 蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建將獲得的靶點(diǎn)基因上傳至在線STRING 11.0 數(shù)據(jù)庫,蛋白質(zhì)參數(shù)評(píng)分值>0.57,根據(jù)結(jié)果對(duì)靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行分析。
1.5 富集分析本研究將已經(jīng)獲得的柴胡-枳殼與疾病共有的關(guān)鍵靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行功能注釋和富集分析,進(jìn)一步探討藥物治療FD的作用靶點(diǎn)及其信號(hào)通路。
2.1 柴胡-枳殼活性成分篩選獲得主要化學(xué)成分柴胡349 個(gè)、枳殼17 個(gè)。篩選后得到22 個(gè)有效活性成分,藥物靶點(diǎn)蛋白471個(gè)。
2.2 柴胡-枳殼活性成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建FD的相關(guān)靶點(diǎn)1561 個(gè),通過韋恩圖獲得柴胡-枳殼藥對(duì)與疾病共有靶點(diǎn)59個(gè),運(yùn)用Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建柴胡-枳殼活性成分-疾病-靶點(diǎn)的可視化網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)圖,見圖1。
圖1 柴胡-枳殼活性成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖
2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將獲得的59 個(gè)共有靶點(diǎn)上傳至在線STRING 11.0數(shù)據(jù)庫,設(shè)置蛋白質(zhì)參數(shù)評(píng)分值>0.57,獲得55個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)蛋白,具體作用關(guān)聯(lián)見圖2。
圖2 柴胡-枳殼治療FD靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 富集分析在2.3 步驟中得到關(guān)鍵靶蛋白以后,利用在線STRING 11.0 對(duì)這些關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體論(GO)功能富集分析,在GO富集分析中,確定了生物過程(BP)1052 個(gè)、細(xì)胞組分(CC)71 個(gè)、分子功能(MF)134 個(gè),確定了149 條相關(guān)信號(hào)通路,涉及抗癌、炎癥、細(xì)胞凋亡、內(nèi)分泌、免疫調(diào)節(jié)等方面,主要有PI3K-AKT、AGE-RAGE、HIF-1等經(jīng)典信號(hào)通路,列舉了前20個(gè)條目,見圖3。
FD 是一種臨床常見病,其診斷采用羅馬Ⅳ診斷標(biāo)準(zhǔn):(1)餐后飽脹不適、早飽感、上腹痛、上腹部燒灼感;(2)無可以解釋上述癥狀的結(jié)構(gòu)性疾病的證據(jù)(包括胃鏡檢查等),必須滿足餐后不適或上腹痛綜合征的診斷標(biāo)準(zhǔn)[5]。符合以上標(biāo)準(zhǔn)中的一項(xiàng)或多項(xiàng),且診斷前癥狀出現(xiàn)至少6 個(gè)月,近3 個(gè)月符合診斷標(biāo)準(zhǔn)。目前,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)常采用促胃動(dòng)力藥、抑酸劑、抗抑郁藥對(duì)癥治療FD,但不良作用較多,并且容易復(fù)發(fā)?!吨T病源候論》認(rèn)為本病“由憂恚所致,憂恚則氣結(jié),氣結(jié)則不宣流”,病機(jī)以脾虛肝郁氣滯為主。中醫(yī)臨床常采用理氣解郁補(bǔ)脾的治法,代表方為柴胡疏肝散。管春林[6]通過臨床研究發(fā)現(xiàn),柴胡疏肝散治療肝郁氣滯型FD 效果顯著,且安全性高,無明顯不良反應(yīng)。但未闡明柴胡-枳殼藥對(duì)治療此病的靶點(diǎn)及作用機(jī)制。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對(duì)生物系統(tǒng)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號(hào)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行多靶點(diǎn)藥物分子設(shè)計(jì)的新學(xué)科[7]。PPI 網(wǎng)絡(luò)表明,柴胡-枳殼可能通過VEGFA、MAPK8、EGFR、CCND1、MYC、IL6、CASP3 等59 個(gè)潛在作用靶點(diǎn)治療FD。GO 和KEGG 富集分析表明,柴胡-枳殼治療FD 涉及多方面生物學(xué)過程和多條中藥信號(hào)通路參與,尤其在酶的活性、蛋白質(zhì)合成調(diào)控、受體活性、細(xì)胞因子活性、生物合成過程的調(diào)控、細(xì)胞周期調(diào)控等方面。FD 的發(fā)生與細(xì)胞的自噬與凋亡或許存在關(guān)系,有研究[8]表明,過度自噬可能是胃腸動(dòng)力障礙疾病發(fā)生的機(jī)制之一。在柴胡-枳殼與FD 的KEGG 富集分析中相關(guān)度最高的前10 條,除了多通路抗癌效果明顯之外,PI3K-AKT 信號(hào)通路的下游mTOR 信號(hào)通路被抑制后可通過調(diào)控細(xì)胞周期、核糖體蛋白合成等,抑制細(xì)胞自噬及增強(qiáng)細(xì)胞間縫隙連接治療FD[9]。最近的研究[10]表明,發(fā)生在細(xì)胞中的生長(zhǎng)因子、趨化因子、細(xì)胞因子和活性氧平衡的改變,可能是造成FD 的原因之一。這表明柴胡-枳殼也可能通過該途徑作用于FD。
柴胡-枳殼藥對(duì)在消化系統(tǒng)臨床應(yīng)用中非常廣泛,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的技術(shù)以及方法進(jìn)行探討,盡管存在一定的局限性,但是從藥物成分靶標(biāo)以及疾病靶標(biāo)的關(guān)系入手,初步預(yù)測(cè)了柴胡-枳殼治療FD 的關(guān)鍵作用蛋白,探討了其治療FD 的可能作用機(jī)制,為接下來進(jìn)一步用分子生物學(xué)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證提供了參考和依據(jù)。