王汝佳 孫靜華 侯玉微 馬夢華 王海平 董博文 李秀君 朱啟航
唐山市人醫(yī)院磁共振室(河北 唐 063000)
膠質(zhì)瘤是最常見的顱內(nèi)原發(fā)腫瘤,2 0 1 6 年世界衛(wèi)生組織(w o r d h e a l t h organization,WHO)重新對膠質(zhì)瘤進(jìn)行了組織學(xué)分類[1],將分子基因表型與病理組織學(xué)分類聯(lián)系起來,2021年分類標(biāo)準(zhǔn)中進(jìn)一步強調(diào)了分子診斷學(xué)在顱內(nèi)原發(fā)性腫瘤分類中的重要性[2]。膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(glioblastoma,GBM)是顱內(nèi)常見的原發(fā)性惡性腫瘤,預(yù)后極差[3-5]。不同分子表型的GBM磁共振紋理特征及預(yù)后有很大差異,其中以異 檸 檬 酸 脫氫 (isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)最值得大家所關(guān)注[6]。IDH1狀態(tài)是GBM分子標(biāo)記物之一,IDH1突變導(dǎo)致了原生物酶活性的丟失,生物酶的變化改變了生物體的表觀遺傳學(xué)[7]。隨著近年來治療手段及方法的改進(jìn),雖然GBM患者的預(yù)后較以前有所改善,但是因為GBM有較高的惡性程度以及侵襲性,患者預(yù)后較差。相對于GBM患者而言,對不同分子表型的GBM進(jìn)行精準(zhǔn)化的個體治療,是十分必要的。但是因為病理活檢屬于有創(chuàng)檢查技術(shù)以及IDH1狀態(tài)的昂貴檢測費用,很少有患者自愿進(jìn)行基因檢測。本研究主要是在GBM中利用3D slicer軟件提取的磁共振紋理特征,分析IDH1突變型GBM與其磁共振紋理特征的聯(lián)系。
1.1 研究對象納入標(biāo)準(zhǔn):所有納入病例均有詳細(xì)的臨床、病理及影像資料;術(shù)前未進(jìn)行輔助治療,比如放化療等;術(shù)后經(jīng)病理確診為GBM。 排除標(biāo)準(zhǔn):患者同時患有其他系統(tǒng)的腫瘤;相關(guān)的術(shù)后并發(fā)癥,如顱內(nèi)形成血腫,顱內(nèi)感染等;死于其他疾病的患者。
1.2 一般資料共納入118例GBM,從2015年9月至2018年6月均通過病理確診為GBM。GBM患者都進(jìn)行了術(shù)前的MRI平掃及增強檢查。
1.3 I D H 1 狀態(tài)檢測方法收集符合納入標(biāo)準(zhǔn)的蠟塊,然后采用P C R(n e ste d methylation-specific,PCR)方法對GBM中IDH1狀態(tài)進(jìn)行檢測。判斷標(biāo)準(zhǔn):將IDH1原始序列與測序結(jié)果序列,兩者進(jìn)行比較,分析特定的堿基位置是否突變[8]。其中,45例IDH1突變型GBM,73例IDH1野生型GBM。
1.4 檢查方法采用飛利浦3.0T磁共振掃描儀,8通道SENSE頭部線圈,所有GBM患者均進(jìn)行了術(shù)前MRI平掃及增強檢查,其中包含以下幾種序列:橫軸位以及矢狀位T1WI、橫軸位T2WI、橫軸位T2-FLAIR、T1WI增強序列。掃描參數(shù):橫軸位T1WI : TR 2280ms,TE 20ms,F(xiàn)OV 196mm×196mm,矩陣288×190,激勵次數(shù)2,層厚6mm,層間距1mm。橫軸位以及矢狀位T2WI:TR 2400ms,TE 90ms,F(xiàn)OV 230mm×230mm,矩陣420×306,激勵次數(shù)2,層厚6mm,層間距1mm。橫軸位T2-FLAIR:TR 7000ms,TE 120ms,F(xiàn)OV 230mm×230mm,矩陣304×216,激勵次數(shù)2,層厚6mm,層間距1mm。以注射流率3ml/s,劑量0.1ml/kg,經(jīng)靜脈注入釓噴葡胺(gadopentetate dimeglumine,Gd-DTPA)進(jìn)行MRI增強掃描檢查,T1WI增強:TR 200ms,TE 2ms,F(xiàn)OV 230mm×230mm,矩陣256×256,激勵次數(shù)2,層厚6mm,層間距1mm。
1.5 圖像后處理(1)圖像選?。和ㄟ^PACS工作站導(dǎo)出所有患者的MRI圖像,并以DICOM格式進(jìn)行保存,然后利用3D slicer軟件(version 4.4.0; available at: http://slicer.org/)進(jìn)行分析。(2)磁共振紋理分析 利用3D slicer軟件的editor模塊,通過從橫軸位T1WI增強圖像中提取的磁共振紋理特征,由3名具有豐富經(jīng)驗的神經(jīng)影像學(xué)專家進(jìn)行分析,手動勾畫出腫塊的感興趣區(qū)(regions of interest,ROI),準(zhǔn)確地勾畫出腫塊的邊界,最后3名神經(jīng)影像學(xué)專家得出一致結(jié)論,構(gòu)建出完整的腫塊三維模型(圖1)。通過Hetergeneity CAD擴展模塊,從而來提取腫塊的MRI紋理特征,只有保證3名神經(jīng)影像學(xué)專家勾畫的腫塊的ROI組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(intraclass correlation coefficient,ICC)>0.75,才能進(jìn)行下面的圖像分析。最終得出以下四方面具體內(nèi)容,包括:形態(tài)、形狀;一階統(tǒng)計量;灰度長度矩陣;灰度共生矩陣。
圖1 3D slicer軟件中感興趣區(qū)測量示意圖(膠質(zhì)母細(xì)胞瘤)
1.6 統(tǒng)計分析使用SPSS 26.0版本進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,凡是屬于方差齊、正態(tài)分布的變量,均進(jìn)行獨立樣本T檢驗;凡是屬于方差不齊、非正態(tài)分布的變量,均進(jìn)行Mann-Whitney檢驗,分析IDH1突變型GBM與其磁共振紋理特征、預(yù)后的聯(lián)系,以P<0.05有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 GBM中IDH1狀態(tài)與其磁共振紋理特征的聯(lián)系IDH1突變型GBM與IDH1野生型GBM相比較,在利用3D slicer提取的31種紋理特征中(表1-2),其中有18種磁共振紋理特征差異顯著,分別是運行百分比(run percentage,RP)、表面∶體積比(surface: volume ratio) 、能量(energy)、熵(entropy)、統(tǒng)一性(uniformity)、自相關(guān)(autocorrelation)、集群突出(cluster prominence)、聚類趨勢(cluster tendency)、差值熵(difference entropy)、能量(energy):灰度共生矩陣(gray level co occurrence matrix,GLCM)、熵(entropy):灰度共生矩陣(gray level co occurrence matrix,GLCM)、同質(zhì)性1(homogeneity 1)、平均總和(sum average)、熵和(sum entropy)、方差和(sum variance)、方差(variance):灰度共生矩陣(gray level co occurrence matrix,GLCM)、GLN、集群陰影(cluster Shade)。
表1 ID1突變型與ID1野生型GBM磁共振紋理特征的差異性(均值±標(biāo)準(zhǔn)差,獨立樣本T檢驗)
表1 ID1突變型與ID1野生型GBM磁共振紋理特征的差異性(均值±標(biāo)準(zhǔn)差,獨立樣本T檢驗)
磁共振紋理特征 突變型(n=45) 野生型(n=73) P F1 sphericity 0.378±0.063 0.381±0.115 0.943 F2 SRE 0.214±0.087 0.283±0.099 0.066 F3 RP 0.11±0.028 0.171±0.050 0.001 F4 SRLGLE 0.214±0.087 0.283±0.099 0.066 F5 surface area mm2 15528.118±7005.771 12962.068±8910.516 0.368 F6 surface:volume ratio 0.405±0.118 0.528±0.242 0.030 F7 compactness 1 37.155±13.515 29.384±15.583 0.650 F8 maximum 3D diameter 79.534±35.255 69.386±33.845 0.430
表2 IDH1突變型與ID1野生型GBM紋理特征的差異性(均值,Mann-Whitney U檢驗)
GBM是常見的惡性顱內(nèi)腫瘤,5年生存率不超過5%,患者預(yù)后較差[8-9]。磁共振紋理特征分析通過研究影像中的像素的分布和聯(lián)系,能夠打破人們?nèi)庋蹍^(qū)別GBM異質(zhì)性的局限,屬于一種特殊分析影像的算法[10];而且利用計算機技術(shù)從而定量地提取與腫塊密切相關(guān)的信息參數(shù),量化了紋理分析的結(jié)果[11-15]。到目前為止,探討GBM中磁共振紋理特征的研究稀少,所采用的計算機軟件標(biāo)準(zhǔn)不一,比如一些常見的計算機軟件,其中包括MaZda、OsiriX、3D slicer等計算機軟件。3D slicer屬于一個免費開源軟件,主要是用來研究醫(yī)學(xué)影像資料。同時,3D slicer可擴展很多插件,用于不同領(lǐng)域的研究。通過3D slicer不但能夠完整地重建出腫塊的體積,而且涵蓋了腫塊的全部細(xì)節(jié)信息。
在本研究中,通過3D slicer中的其中一個擴展模塊,稱之為Hetergeneity CAD,總共提取到了31種磁共振紋理特征,在IDH1突變型GBM與IDH1野生型GBM之間有18種磁共振紋理特征差異顯著,包括運行百分比、表面:體積比、能量、熵、一致性、自相關(guān)、集群突出、聚類趨勢、差值熵、能量:灰度共生矩陣、熵:灰度共生矩陣、同質(zhì)性1、平均總和、熵和、方差和、方差、GLN、群集陰影,以上磁共振紋理特征能夠為判斷在GBM中IDH1的狀態(tài)提供可靠的依據(jù)。
由于本研究是單中心研究,樣本例數(shù)偏少,不可避免地出現(xiàn)選擇偏倚,因此在以后的研究中需要納入多中心數(shù)據(jù)來支持。在今后的研究中,會繼續(xù)納入更多的GBM病例,避免出現(xiàn)選擇偏倚。